羅春芬,黎勝苗,潘志文,許嘉川,劉征吉,於林軍
(1.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬臺(tái)州醫(yī)院 小兒外科,浙江 臺(tái)州 317000;2.浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院 細(xì)胞生物研究所,浙江 杭州 310058)
散發(fā)性先天性巨結(jié)腸與SOX10基因多態(tài)性的關(guān)聯(lián)性
羅春芬1,黎勝苗1,潘志文2,許嘉川1,劉征吉1,於林軍1
(1.溫州醫(yī)科大學(xué)附屬臺(tái)州醫(yī)院 小兒外科,浙江 臺(tái)州 317000;2.浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院 細(xì)胞生物研究所,浙江 杭州 310058)
目的:探討先天性巨結(jié)腸(HD)患者SOX10基因多態(tài)性與HD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。方法:收集散發(fā)性HD患者外周血標(biāo)本95例為病例組,同時(shí)選取健康無(wú)便秘史患者80例作為對(duì)照組。提取外周血DNA,采用PCR和直接測(cè)序法分析SOX10基因多態(tài)性在病例組和對(duì)照組的分布情況。結(jié)果:直接測(cè)序發(fā)現(xiàn)SOX10基因有4個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),這些位點(diǎn)在病例組和對(duì)照組中分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,關(guān)聯(lián)分析未發(fā)現(xiàn)SOX10基因的4個(gè)SNP位點(diǎn)與HD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。結(jié)論:SOX10基因的4個(gè)SNPs位點(diǎn)與散發(fā)HD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有顯著相關(guān)性,SOX10基因可能不是散發(fā)性HD患者的易感基因。
SOX10基因;先天性巨結(jié)腸;多態(tài)性,單核苷酸
Abstract: Objective:To determine the association between the variations ofSOX10gene and sporadic HD in Zhejiang province.Methods:Blood from 95 sporadic HD cases and 80 normal cases were collected. Direct sequencing and polymerase chain reaction amplification were used to analyze 4 exons of theSOX10gene for mutations and polymorphisms.Results:In this study, 4 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified. NoSOX10gene mutations was found with sporadic HD.Conclusion:There is no association between these 4 SNPs of theSOX10gene and HD. TheSOX10gene may not be the susceptibility gene of HD.
Key words:SOX10gene; hirschsprung disease; polymorphism, single nucleotide
先天性巨結(jié)腸(hirschsprung disease,HD)又稱(chēng)無(wú)神經(jīng)節(jié)細(xì)胞性巨結(jié)腸(aganglionar megacolon)或腸無(wú)神經(jīng)節(jié)細(xì)胞癥(aganglionosis),是小兒常見(jiàn)的先天性消化道畸形,主要組織病理改變?yōu)椴∽兌文c管黏膜下層和肌層神經(jīng)節(jié)細(xì)胞缺如,造成該段腸管呈持續(xù)性痙攣狀態(tài),導(dǎo)致近端腸管代償性擴(kuò)張,從而出現(xiàn)便秘、腸梗阻、小腸結(jié)腸炎等一系列消化道癥狀,發(fā)病率約為1/5 000[1]。其發(fā)病與遺傳因素有關(guān),一些與腸神經(jīng)發(fā)育有關(guān)的基因突變可導(dǎo)致HD發(fā)生。RET基因是主要的易感基因,由RET編碼區(qū)突變引起的HD占家族性HD的50%和散發(fā)性HD的7%~35%;其他基因如EDNRB、EDN3等也與HD發(fā)病相關(guān),是HD的易感基因[2-3]。
SOX10基因位于染色體22q13,編碼466個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄因子,是調(diào)控神經(jīng)嵴細(xì)胞發(fā)育的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子[4],主要調(diào)節(jié)神經(jīng)嵴源性細(xì)胞包括黑色素細(xì)胞和腸神經(jīng)細(xì)胞的正常發(fā)育[5]。Shah-Waardenburg綜合征(WS4)患者中有SOX10基因雜合突變檢出,患者除了有HD的癥狀,還表現(xiàn)為色素缺陷、耳聾等。迄今已發(fā)現(xiàn)有多例綜合征型HD病例中檢測(cè)出有攜帶SOX10基因突變[6-10],但SOX10基因與散發(fā)性HD的相關(guān)性研究較少。本研究通過(guò)對(duì)照分析浙江省散發(fā)性HD病例和正常人群的SOX10基因多態(tài)性,探討SOX10基因是否與散發(fā)性HD的發(fā)病相關(guān)。
1.1 材料
1.1.1 血樣收集:收集2011年至2015年間經(jīng)溫州醫(yī)科大學(xué)附屬臺(tái)州醫(yī)院和浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院臨床和病理確診的95例散發(fā)性HD患兒血樣為病例組,其中男71例,女24例,年齡2個(gè)月~13歲,漢族,按Rome分型標(biāo)準(zhǔn)[11]分為:短段型36例,常見(jiàn)型28例,長(zhǎng)段型24例,全結(jié)腸型7例。所有病例直系親屬無(wú)HD患者,無(wú)其他合并癥。收集同期健康兒童80例血樣為對(duì)照組。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)審核批準(zhǔn),患者監(jiān)護(hù)人知情同意。
1.1.2 PCR引物序列:根據(jù)SOX10基因的外顯子使用primer5.0軟件設(shè)計(jì)引物,引物序列見(jiàn)表1。
表1 SOX10基因4個(gè)外顯子引物序列
1.2 方法 取病例組和對(duì)照組外周血2 mL,根據(jù)DNA提取試劑盒說(shuō)明進(jìn)行DNA抽提。PCR反應(yīng)體系:95 ℃預(yù)變性5 min,以94 ℃ 1 min,56~62 ℃(第1外顯子56 ℃,第2外顯子62 ℃,第3外顯子58 ℃,第4外顯子56 ℃)30 s,72 ℃ 45 s,循環(huán)30次,最后72 ℃延伸10 min。測(cè)序之前,聚丙烯酰胺凝膠電泳純化所有引物,C18柱回收。應(yīng)用ABI3000自動(dòng)測(cè)序儀進(jìn)行突變篩查。所有目的基因的測(cè)序結(jié)果重復(fù)3次。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法 采用SPSS17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用卡方檢驗(yàn)檢測(cè)對(duì)照組基因型頻率是否符合Hardy-Weinberg平衡,P>0.05表示符合Hardy-Weinberg平衡。運(yùn)用邏輯回歸方法,在顯性、共顯性、超顯性、隱性、加性五種不同遺傳模式下分析單個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)和HD是否相關(guān)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
通過(guò)PCR擴(kuò)增目的片段后測(cè)序,與基因庫(kù)SOX10序列比對(duì),結(jié)果在SOX10基因上發(fā)現(xiàn)4個(gè)SNPs(見(jiàn)圖1)。SNP1在第2外顯子編碼區(qū),基因序列改變?yōu)镚AC→GAT;SNP2位于第2外顯子編碼區(qū),基因序列改變?yōu)镚GC→GTC,引起第41位甘氨酸變?yōu)槔i氨酸;SNP3位于第2內(nèi)含子區(qū)域,基因序列改變?yōu)镃>G;SNP4位于第4外顯子編碼區(qū),基因序列改變?yōu)镃AT→CAC,是第309位組氨酸的同義突變。
在對(duì)照組中,4個(gè)SNP位點(diǎn)的基因型頻率均符合Hardy-Weinberg平衡(P值分別為0.39、0.96、0.82、0.39)?;蛐头植己?個(gè)SNP的等位基因頻率在病例組和對(duì)照組之間差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2分別為1.15、0.19、0.38、0.12,P分別為0.28、0.67、0.54、0.73),見(jiàn)表2。
HD發(fā)病率約為1/5 000,占先天性消化道畸形疾病的第2位,以腸神經(jīng)嵴細(xì)胞遷移障礙導(dǎo)致腸道局部神經(jīng)節(jié)細(xì)胞缺失為主要病理特征,臨床上表現(xiàn)為便秘、腸梗阻、小腸結(jié)腸炎等消化道癥狀,嚴(yán)重影響患兒的生活質(zhì)量及生長(zhǎng)發(fā)育,嚴(yán)重者甚至危及生命[12]。近年來(lái),HD的發(fā)病率呈逐漸上升趨勢(shì),其發(fā)病機(jī)制已成為研究熱點(diǎn)。目前認(rèn)為,HD是由遺傳、腸壁內(nèi)微環(huán)境改變、環(huán)境等多因素共同作用引起的,而遺傳因素最為重要。RET基因及其配體GDNF、NTN,EDNRB基因及其配體EDN3,BMP信號(hào)通路,KBP,L1CAM黏附分子,KIAA1279,轉(zhuǎn)錄因子PHOX2B、SOX10、MASH1、HAND2和ZFHX1B等在HD發(fā)病中起重要作用[13-14],它們的異常引起信號(hào)傳導(dǎo)的異常,從而進(jìn)一步影響神經(jīng)嵴細(xì)胞的分化、增殖以及移行,最后導(dǎo)致HD的發(fā)生[15-16]。近年來(lái),有關(guān)SOX10基因的研究逐漸增多,但未發(fā)現(xiàn)相關(guān)突變熱點(diǎn),僅對(duì)合并有HD相關(guān)綜合征如WS4(Shah-Waardenburg syndrome,OMIM 277580)及PCWH(peripheral demyelinating neuropathy,central dysmyelinating leukodystrophy,WS,and HD,OMIM 609136)等患者有較多的報(bào)道,而對(duì)HD患者的研究鮮有報(bào)道[6-10]。
SOX10基因位于染色體22q13,屬于SOX基因家族成員。SOX基因家族編碼一系列SOX家族轉(zhuǎn)錄因子,主要特征是含有一個(gè)高度保守的HMG-box DNA結(jié)合域,參與胚胎發(fā)育和細(xì)胞分化的調(diào)控[17-18]。SOX10基因編碼466個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄因子,參與調(diào)節(jié)多能神經(jīng)嵴細(xì)胞的基因表達(dá),在神經(jīng)嵴細(xì)胞增殖、遷移、分化及發(fā)育等過(guò)程中起著非常重要的作用[5,8,19-20]。PINGAULT等[21]在1998年首先報(bào)道了WS4患者存在SOX10基因的突變。2010年,SáNCHEZMEJíAS等[10]報(bào)道在西班牙HD人群中發(fā)現(xiàn)了SOX10缺失(c.153-155del),并且認(rèn)為在HMG結(jié)構(gòu)域上游的SOX10的缺失在功能上等同于無(wú)效突變。本研究選取散發(fā)性HD患兒及健康兒童進(jìn)行病例對(duì)照研究,未發(fā)現(xiàn)SOX10相關(guān)位點(diǎn)的突變與HD發(fā)病相關(guān),表明SOX10不是散發(fā)性HD患者發(fā)病的主要原因。然而,我們?cè)赟OX10基因中檢測(cè)了4個(gè)SNP位點(diǎn),SNP1檢測(cè)結(jié)果與SáNCHEZ-MEJíAS等[10]的報(bào)道一致,不改變氨基酸編碼序列;SNP2是本研究新發(fā)現(xiàn)的SNP位點(diǎn),使得編碼的氨基酸從甘氨酸變?yōu)槔i氨酸,突變位點(diǎn)位于SOX10 HMG保守區(qū)域上游,且無(wú)一例患者具有WS4、PCWH等其他相關(guān)臨床表現(xiàn),此多態(tài)性位點(diǎn)在國(guó)內(nèi)尚未見(jiàn)報(bào)道,其多態(tài)性引起的氨基酸序列對(duì)SOX蛋白功能的影響仍不清楚,需要進(jìn)一步的研究;SNP3是內(nèi)含子多態(tài)性位點(diǎn);SNP4在SNP數(shù)據(jù)庫(kù)中序號(hào)是rSl39884,該位點(diǎn)是一個(gè)同義突變點(diǎn),編碼氨基酸為組氨酸。在4個(gè)位點(diǎn)的分析中,盡管正常對(duì)照組符合Hardy-Weinberg平衡,但分析顯示4個(gè)SNP位點(diǎn)在病例組和對(duì)照組中分布無(wú)顯著性差異,表明這4個(gè)SNP位點(diǎn)與HD的發(fā)病不存在相關(guān)性。由4個(gè)SNP位點(diǎn)組成的單體型在HD病例組和正常組中的分布也未見(jiàn)顯著性差異,這些單體型與HD發(fā)病不具有相關(guān)性。以上研究結(jié)果表明,SOX10基因可能不是HD發(fā)病的易感基因。
圖1 SOX10基因測(cè)序結(jié)果
表2 SOX10基因4個(gè)SNP位點(diǎn)在病例組和對(duì)照組的頻率分布(%)
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(本文編輯:丁敏嬌)
Association analysis of theSOX10polymorphism and Hirschsprung
LUO Chunfen1, LI Shengmiao1, PANZhiwen2, XU Jiachuan1, LIU Zhengji1, YU Linjun1. 1.Department of Pediatric Surgery, Taizhou Hospital Affiliated to Wenzhou Medical University, Taizhou, 317000; 2.Institute of Cell Biology, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, 310058
R726.2
A
10.3969/j.issn.2095-9400.2017.09.008
2016-12-26
臺(tái)州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(121ky08)。
羅春芬(1962-),女,浙江臺(tái)州人,主任醫(yī)師。
於林軍,副主任醫(yī)師,Email:yulj@enzemed.com。