杜 宇,李來梅,雷 瀟,杜東霞,尹紅梅,劉 標,許 雋
(湖南省微生物研究院,湖南 長沙 410009)
水稻根際固氮菌N X-2的分離鑒定及其培養(yǎng)條件優(yōu)化
杜 宇,李來梅,雷 瀟,杜東霞,尹紅梅,劉 標,許 雋
(湖南省微生物研究院,湖南 長沙 410009)
篩選高效固氮能力的植物根際促生菌是研發(fā)微生物肥料的關鍵。研究從水稻根際土壤中分離篩選得到一株固氮菌NX-2,利用乙炔還原法測定其固氮酶活可達16.18 μmol /(mL·h) (以C2H4濃度計)。通過形態(tài)觀察、生理生化特性和16S rDNA序列分析,菌株NX-2被鑒定為褐球固氮菌。進一步研究其生長特性,結(jié)果顯示最佳培養(yǎng)條件為培養(yǎng)溫度28℃、初始pH值6.5、接種量3%。
水稻根際;固氮微生物;分離;鑒定;培養(yǎng)條件優(yōu)化
氮是水稻生長發(fā)育的必要營養(yǎng)元素,自然狀態(tài)下土壤中的氮素含量很難滿足水稻對養(yǎng)分的需求。但是依照目前粗放型的施肥習慣,稻田施加的氮肥被水稻吸收利用的效率并不高,而且氮肥容易在土壤中大量殘留,進而污染環(huán)境[1]??諝庵写罅康匾杂坞x狀態(tài)存在,不能被生物體直接利用,固氮微生物能夠利用體內(nèi)特殊的固氮酶把空氣中的氮氣還原成植物可利用的分子態(tài)氨[2]。在植物根際中也存在一類能保護和促進植物生長發(fā)育的細菌,被稱為植物根際促生細菌(Plant Growth Promoting Rhizobacteria, PGPR),約有2%~5%的根際細菌是PGPR[3]。植物根際固氮菌是一類重要的PGPR,定植于根表和近根土壤中,除了固氮作用外,還具有促進土壤有機質(zhì)的礦化、分泌植物激素等促生長的作用[4]。自生固氮菌種類很多,主要包括圓褐固氮菌、貝氏固氮菌、巴斯德固氮梭菌等[5]。在法國、美國等國家已經(jīng)有研究證明把固氮螺菌接種到玉米上,可取代20%~30%的氮肥,同時增產(chǎn)10%~20%[6]。目前,固氮微生物肥料的研究方向正在從研制豆科植物根瘤菌劑轉(zhuǎn)向禾谷類作物的固氮肥料上來,其中禾谷類自生固氮菌和聯(lián)合固氮菌的選育是重點和難點[7]。因此,研究以水稻根際土壤為材料從中篩選出一株具高固氮酶活性的菌株,經(jīng)生理生化和分子生物學鑒定后,對該菌株的最適培養(yǎng)條件進行了優(yōu)化,以期為禾谷類固氮肥料的研制打下基礎。
1.1 試驗材料
水稻根際土壤樣品采自湖南寧鄉(xiāng)回龍鋪,取樣時先去掉地表土,選擇附有水稻根系的土壤。阿須貝無氮培養(yǎng)基:葡萄糖10 g,KH2PO40.2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,NaCl 0.2 g,CaSO40.1 g,CaCO35 g,雙蒸水1 000 mL,pH值為7.0;固體培養(yǎng)基加2 %的瓊脂粉,半固體培養(yǎng)基加0.5 %瓊脂粉。LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,氯化鈉10 g,酵母提取物5 g,雙蒸水1 000 mL,pH值為7.0。
1.2 試驗方法
1.2.1 固氮菌的分離篩選 取10 g附在水稻根上的松散土,溶于90 mL無菌水中,搖床振蕩30 min制成菌懸液,采用10倍稀釋法,把各稀釋倍數(shù)的菌液涂布在阿須貝無氮培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)3 d,將形態(tài)不同的單菌落通過平板劃線分離純化。
1.2.2 固氮酶活的測定 采用乙炔還原法,將固氮菌接種于含有10 mL半固體阿須貝培養(yǎng)基的25 mL血清瓶中,28℃培養(yǎng)2~3 d,把血清瓶蓋更換成橡膠塞,用無菌注射器抽取1/10體積的空氣,注入等體積的乙炔,28℃繼續(xù)培養(yǎng)1~4 d,抽取50 μL混合氣體注入氣相色譜儀,測定乙烯生成量,酶活單位用單位體積的發(fā)酵液在單位時間內(nèi)生成乙烯的微摩爾數(shù)表示,參照文獻[8]測定固氮酶活。
1.2.3 菌種鑒定 提取固氮菌總DNA,以細菌16S rDNA通用引物27-F:5'-GAGAGTTTGATCCTGGCTC AG-3';1492-R:5'-AAGGAGGTGATCCARCCGCA-3'進行PCR 擴增,PCR 產(chǎn)物純化后送樣上海生工進行DNA測序,序列通過NCBI數(shù)據(jù)庫進行Blast分析,與數(shù)據(jù)庫中的序列進行同源性比較。
1.2.4 菌種生長特性分析 按1%的接種量將菌株NX-2種子液轉(zhuǎn)接至100 mL基礎培養(yǎng)基,分別置于24、26、28、30、32℃搖床上發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測定發(fā)酵液的菌數(shù),確定最佳培養(yǎng)溫度;調(diào)節(jié)基礎培養(yǎng)基的pH值分別為6.0、6.5、7.0、7.5、8.0,在最佳培養(yǎng)溫度條件下發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測定發(fā)酵液的菌數(shù),確定最佳初始pH值;在最佳培養(yǎng)溫度和初始pH值條件下,分別按1%、2%、3%、4%、5%接種,發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測定發(fā)酵液的菌數(shù),確定最佳接種量。
2.1 水稻根際固氮菌的分離篩選
在阿須貝無氮培養(yǎng)基上初篩得到了多株形態(tài)、顏色各異的固氮菌株。其中,菌株NX-2在無氮培養(yǎng)基上長勢較好,如圖1所示,菌落為圓形半透明,邊緣整齊,表面濕潤,不易挑起,能夠產(chǎn)生粘液。在顯微鏡鏡下觀察為桿狀,有莢膜。
圖1 固氮菌株NX-2的菌落形態(tài)
2.2 菌株NX-2固氮酶活性
固氮酶活是評價固氮菌性能的重要指標,固氮酶可以催化乙炔還原成乙烯,用氣相色譜儀檢測乙烯的生成量,間接測定固氮酶活性。在密封的血清瓶中注入乙炔后,分別培養(yǎng)1、2、3、4 d檢測酶活性,結(jié)果如圖2所示。由圖2可知,培養(yǎng)1~4 d檢測固氮酶活分別為0.87、4.30、15.13、16.18 μmol/(mL·h) (以C2H4濃度計),說明菌株NX-2具有較高的固氮酶活性。
圖2 固氮菌株NX-2的固氮酶活性
2.3 菌種鑒定
對菌株NX-2進行常規(guī)的生理生化特性分析,結(jié)果表明該菌株革蘭氏染色和氧化酶反應為陰性,淀粉水解、過氧化氫酶、M.R.、V.P.、硫化氫反應均為陽性,表明該菌株可以利用葡萄糖、果糖、甘露醇等碳源。這些生理生化特性與《伯杰氏細菌鑒定手冊》中對褐球固氮菌(Azotobacter chroococcum)的描述一致。提取菌株NX-2的基因組DNA,PCR擴增16 S rDNA片段,將測序結(jié)果在NCBI網(wǎng)站上進行BLAST分析,發(fā)現(xiàn)NX-2與Azotobacter chroococcum AM12A菌株(GenBank:AB430880)的同源性為99.6%,結(jié)合生理生化特性確定NX-2菌株為褐球固氮菌。
2.4 NX-2菌株的最適培養(yǎng)條件
2.4.1 最佳培養(yǎng)溫度 分別在24~32℃溫度條件下對菌株NX-2培養(yǎng)24 h,如圖3所示,在28~32℃條件下活菌數(shù)均超過108CFU/mL,其中當溫度為28℃時達到2.73×108CFU/mL,活菌數(shù)最高。故可認為菌株NX-2的最佳培養(yǎng)溫度為28℃。
圖3 培養(yǎng)溫度對菌株NX-2生長的影響
2.4.2 最佳初始pH值 分別在初始pH值為6.0、6.5、7.0、7.5、8.0的條件下對菌株NX-2進行培養(yǎng),如圖4所示,菌株NX-2在pH值6.0~7.0范圍內(nèi)生長較好,說明該菌株有一定的耐酸能力。因此,將初始pH值設定為6.5,菌株NX-2活菌數(shù)最高,達到3.4×108CFU/mL。
圖4 初始pH值對菌株NX-2生長的影響
2.4.3 最佳接種量 如圖5所示,當接種量為1%~5%時,活菌數(shù)分別為2.93×108、4.83×108、6.10×108、6.57×108、6.53×108CFU/mL。隨著接種量的增加,菌株NX-2的活菌數(shù)呈上升趨勢;但當接種量超過3%時,活菌數(shù)增加不明顯,因此選擇3%作為菌株NX-2的最佳接種量。
圖5 接種量對菌株NX-2生長的影響
從水稻根際土壤中分離篩選得到一株固氮菌NX-2,利用乙炔還原法測定其培養(yǎng)4 d時固氮酶活為16.18 μmol /(mL·h) (以C2H4濃度計),具有較高的固氮酶活性。通過生理生化特性和16 S rDNA序列分析,菌株NX-2被鑒定為褐球固氮菌。褐球固氮菌屬于假單胞菌目假單胞菌科褐球固氮菌屬,已經(jīng)有研究表明褐球固氮菌可以用于微生物肥料。對固氮菌NX-2的最適培養(yǎng)條件進行了優(yōu)化,結(jié)果表明最適培養(yǎng)條件為培養(yǎng)溫度28℃、初始pH值6.5、接種量3%。菌株NX-2有一定的耐酸能力,而目前湖南稻田土壤普遍為弱酸性和酸性,十分有利于菌株NX-2的定植。同時,該研究為水稻固氮促生微生物菌肥的研發(fā)提供了菌種資源。研究顯示,大部分根際固氮微生物還有促進作物生長的能力,后續(xù)將朝著這一方向努力,研究菌株NX-2對水稻的促生效果。
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(責任編輯:成 平)
Isolation, Identification and Optimization of culture conditions of Nitrogen-Fixing Bacteria NX-2 from Rice Rhizosphere
DU Yu,LI Lai-mei,LEI Xiao,DU Dong-xia,YIN Hong-mei,LIU Biao,XU Jun
( Hunan Academy of Microbiology, Changsha 410009, PRC)
It is a key issue to screen the rhizosphere promoting bacteria of high efficient nitrogen fixing ability for the development of microbial fertilizer. In this study a nitrogen-fixing bacteria NX-2 was isolated from rice rhizosphere soil. Nitrogenase activity was measured by acetylene reduction at 16.18 μmol/(mL·h) calculated C2H4concentration. Through morphological observation, physiological and biochemical characteristics and 16S rDNA sequence analysis, the strain NX-2 was identi fi ed as Azotobacter. Its growth characteristics were further studied, the results showed that the optimal fermentation condition was the initial temperature 28℃, pH 6.5, inoculum size 3%.
rice rhizosphere; nitrogen- fi xing bacteria; isolation; identi fi cation; optimization of culture conditions
S144.5
:A
:1006-060X(2017)07-0001-03
10.16498/j.cnki.hnnykx.2017.007.001
2017-05-08
湖南省自然科學基金(2015JJ3084)
杜 宇(1979-),男,湖南長沙市人,工程師,主要從事農(nóng)業(yè)微生物相關研究。
許 雋