續(xù) 琳
(山西醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院,山西 太原 030001)
·基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)·
SF3B1在急性髓系白血病中的表達(dá)
續(xù) 琳
(山西醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院,山西 太原 030001)
目的:探討SF3B1突變在急性髓系白血病中的發(fā)生情況。方法:利用HRMA和DNA直接測序分析65例急性髓系白血病的SF3B1的突變熱點。結(jié)果: 在AML中存在SF3B1雜合突變,通過DNA直接測序發(fā)現(xiàn)1例K666T,1例K700E突變,1例同時具有NPM1和DNMT3A 突變,1例具有DNMT3A和FLT3-ITD突變。結(jié)論:SF3B1突變在AML中罕見。
SF3B1;急性髓系白血病;基因突變
急性髓系白血病(Acute myeloidleukemia, AML)是一類源于造血干祖細(xì)胞的惡性克隆性疾病,因干祖細(xì)胞分化受阻或?qū)φ5姆只{(diào)節(jié)反應(yīng)異常,導(dǎo)致骨髓或外周血中不成熟細(xì)胞增多。近年,關(guān)于和白血病相關(guān)的基因突變被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),其中有部分基因突變被證實和疾病的進(jìn)展及預(yù)后相關(guān)[1]。有些被作為世界衛(wèi)生組織對白血病進(jìn)行分型的依據(jù)[2]。
轉(zhuǎn)錄本的選擇性剪接可以發(fā)生于不同的腫瘤中[3],然而關(guān)于其在腫瘤中的致病機(jī)制卻不清楚。血液腫瘤細(xì)胞剪接體基因的體細(xì)胞突變近來被認(rèn)知[4]。RNA剪接因子3B第1亞單位(splicing factor 3B subunit 1,SF3B1)基因RNA 剪接過程中起著重要的作用,其主要由5個小核糖核蛋白(snRNP) 復(fù)合體組成,包括U1、U2、U3、U4、U5、U6等。其中,SF3B1編碼的蛋白是U2snRNP的一個組成部分。RNA的正常剪接是基于精準(zhǔn)識別外顯子-內(nèi)含子交界處的位點,然而當(dāng)剪接體組份突變時,會導(dǎo)致所翻譯蛋白質(zhì)的改變,從而導(dǎo)致剪接亞型變異和疾病的發(fā)生[5]。研究發(fā)現(xiàn)6.5%~28.1%的骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndrome, MDS)和5%~15%的慢性淋巴細(xì)胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)存在SF3B1的基因突變[4],共有4個突變熱點,分別是密碼子E622,H662,K666和 K700。并且還發(fā)現(xiàn),具有SF3B1突變的CLL預(yù)后不良[6],而在MDS中的預(yù)后價值卻存在爭議[4]。而關(guān)于SF3B1在AML中的發(fā)生情況卻鮮有報道,故本文將利用HRMA法探索SF3B1在AML中發(fā)生情況。
1.1 一般資料
65例初診急性髓系白血病的骨髓標(biāo)本來源于山西醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院2016年5~12月的住院患者,男40例,女25例,中位年齡32歲。所有患者的診斷根據(jù)FAB和2008年世界衛(wèi)生組織的診斷指南確診[2]。
1.2 方法
使用蔗聚糖基質(zhì)的密度梯度離心法分離骨髓標(biāo)本的單個核細(xì)胞,使用DNA提取試劑盒提取骨髓標(biāo)本DNA,操作參照試劑盒說明書執(zhí)行。 在25μL體積存在下,用1×PCR緩沖,0.25 mmol / L的每個dNTP,2.5 mmol/L MgCl2,0.8μmol/L正向和反向引物,1 UTaq 酶(寶生物,大連)和50 ng基因組DNA。PCR反應(yīng)使用ABI7300PCR儀。見表1 。
表1 SF3B1 引物序列及反應(yīng)條件
PCR產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到LightScanner(美國)進(jìn)行高分辨率溶解曲線分析法(High-resolution melting analysis,HRMA)分析,平板以0.10°C/s 的加熱速度從55°C 加熱到 95°C,利用儀器自帶的分析軟件,對溶解曲線進(jìn)行分析。FLT3-ITD、NPM1突變檢測按文獻(xiàn)中方法執(zhí)行[5]。
樣品表現(xiàn)出光滑和對稱的熔融曲線表示野生型純合子SF3B1。3個樣本(4.6%)存在復(fù)雜的熔解曲線形狀的變化,表明為雜合性突變。核苷酸的變化分別為C1997A>C(AAG→ACG,K666T),C1998G>C(AAG→AAC,K666N),和C2098A>G(AAA→GAA,K700E),分別為圖1。3例患者的臨床特點SF3B1突變?nèi)绫?所示。
表2 3例SF3B1突變患者的臨床及實驗室參數(shù)
注:M 男性,NA 沒有數(shù)據(jù),RS 環(huán)形鐵粒幼紅細(xì)胞。
A: K666T (C1997A>C) 和K666N (C1998G>C)突變;
B: K700E (C2098A>G) 突變; WT 野生型; 直線代表突變密碼子; 箭頭指示突變位點。
圖1 SF3B1的DNA測序結(jié)果
Fig1 Results of SF3B1DNA Direct Sequencing
在本研究中, SF3B1突變在AML有非常低的發(fā)生。此外,在檢測SF3B1K666T時 HRMA的最大靈敏度可達(dá)5%,高于直接DNA測序(10%)。雖然有報道顯示,SF3B1突變與環(huán)形鐵粒幼細(xì)胞(RS)相關(guān),在AML的突變率為(2.6%~5%)[4],原發(fā)性血小板增多癥(3%),原發(fā)性骨髓纖維化(4%~6.5%)[7],慢性粒細(xì)胞白血病(4.5%~6.5%[4,7],乳腺癌(1%),腎腫瘤(3%),多發(fā)性骨髓瘤(3%),和腺樣體囊性癌(4%)[7]。
研究中發(fā)現(xiàn)有突變的3例患者均為正常核型,1例有NPM1和DNMT3A突變,1例FLT3-ITD和DNMT3A突變。這與達(dá)姆等[8]報道的SF3B1基因突變與DNMT3A突變有關(guān)系(35%患者有SF3B1突變伴隨DNMT3A突變),相一致。最近,在大樣本研究中發(fā)現(xiàn),16%(44 / 275)的AML患者有SF3B1突變[9]。在RS≥15%患者有約31%的患者有SF3B1突變,在48.9%正常核型病例中有≥15%的鐵粒幼細(xì)胞。此外還發(fā)現(xiàn),SF3B1突變與年齡、M2和M4、FLT3-ITD,RUNX1等基因相關(guān)[9]。
因隨訪數(shù)據(jù)不足,SF3B1基因突變對AML預(yù)后的影響,在本研究中無法明確。目前有關(guān)SF3B1基因突變對預(yù)后的影響的有關(guān)報道相互矛盾[10]。
綜上所述, SF3B1在AML患者突變頻率很低。而SF3B1突變和其他基因突變的關(guān)系及在預(yù)后評價中的價值卻有待進(jìn)一步研究。
[1] 孫妍珺.急性髓細(xì)胞白血病DNMT3A基因突變的臨床研究[D].蘇州:蘇州大學(xué),2016.
[2] 馬 軍,趙東陸.WHO 2016(修訂版)急性髓系白血病分型解讀[J].臨床血液學(xué)雜志,2017,30(3):169-171.
[3] 徐敏杰,竇同海,徐佳熹.癌癥相關(guān)基因選擇性剪接進(jìn)化數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建[J].復(fù)旦學(xué)報(自然科學(xué)版),2016,55(5):649-659.
[4] Maciejewski JP, Padgett RA. Defects in Spliceosomal Machinery: a new pathway of leukaemogenesis[J]. Br J Haematol,2012,158:165-173.
[5] Yokoi A,Kotake Y,Takahashi K,et al. Biological Validation that SF3b is a Target of the Antitumor Macrolide Pladienolide[J].FEBS J,2011,278(24): 4870-4880.
[6] Rossi D, Bruscaggin A, Spina V, et al. Mutations of the SF3B1 Splicing Factor in Chronic Lymphocytic Leukemia: association with progression and fludarabine-refractoriness[J]. Blood,2011,118:6904-6908.
[7] Papaemmanuil E, Cazzola M, Boultwood J, et al.Somatic SF3B1 Mutation in Myelodysplasia with Ring Sideroblasts[J]. N Engl J Med,2011,365:1384-1395.
[8] Damm F, Kosmider O, Gelsi-Boyer V, et al. Mutations Affecting mRNA Splicing Define Distinct Clinical Phenotypes and Correlate with Patient Outcome in myelodysplastic syndromes[J].Blood,2012,119:3211-3218.
[9] Jeromin S, Bacher U, Bayer K, et al. SF3B1 Mutations Aredetectable in 48.9% of Acute Myeloid Leukemia with Normal Karyotype (AML-NK)and ≥15% Ring Sideroblasts are Closely Related to FLT3-ITD and RUNX1 Mutations[J].Blood,2012,120:406.
[10] Malcovati L, Papaemmanuil E, Bowen DT, et al. Clinical Significance of SF3B1 Mutations in Myelodysplastic Syndromes Andmyelodysplastic/myeloproliferative Neoplasms[J].Blood,2011,118:6239-6246.
本文編輯:王知平
統(tǒng)計學(xué)符號的書寫
Expression of SF3B1in Acute Myeloid Leukemia
XU Lin
(TheSecondHospitalofShanxiMedicalUniversity,Taiyuan030001,ShanxiProvince,China)
Objective: To investigate the occurrence of SF3B1mutation in acute myeloid leukemia.Methods:SF3B1mutation hot spots of 65 cases of acute myeloid leukemia were analysed using high resolution melting analysis (HRMA) and DNA direct sequencing.Results:In the AML, the SF3B1heterozygotic mutation was found. By sequencing the DNA directly, 1 case K666T, 1 case of the K700E mutation, 1 case with NPM1and DNMT3A mutation, and 1 with DNMT3A and FLT3-ITD mutation were also founded. Conclusions:SF3B1mutation is rarely found in AML.
SF3B1; acute myeloid leukemia; genetic mutations
續(xù) 琳,女,工程師,從事醫(yī)療設(shè)備工作
R733.3
A
1671-0126(2017)03-0001-03