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        TEM-1型β內(nèi)酰胺酶的原核表達純化及活性驗證

        2017-06-09 08:58:16李靜徐建余寧年智劉傳杰黃潔劉雪超李濤王慧
        生物技術(shù)通訊 2017年3期
        關(guān)鍵詞:耐藥

        李靜,徐建余,寧年智,劉傳杰,黃潔,劉雪超,李濤,王慧

        1.華北理工大學,河北 唐山 063009;

        2.軍事醫(yī)學科學院 微生物流行病研究所,病原微生物生物安全國家重點實驗室,北京 100071

        TEM-1型β內(nèi)酰胺酶的原核表達純化及活性驗證

        李靜1,徐建余1,寧年智2,劉傳杰2,黃潔2,劉雪超2,李濤2,王慧2

        1.華北理工大學,河北 唐山 063009;

        2.軍事醫(yī)學科學院 微生物流行病研究所,病原微生物生物安全國家重點實驗室,北京 100071

        目的:產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶是大腸桿菌、肺炎克雷伯菌等對β內(nèi)酰胺類抗生素耐藥的主要機制之一,該酶能水解青霉素、頭孢菌素、碳青酶烯類等多種抗生素,其中TEM型是發(fā)現(xiàn)最早且種類最多的β內(nèi)酰胺酶。探討TEM-1型β內(nèi)酰胺酶原核表達載體的構(gòu)建、酶的純化及活性驗證。方法:利用PCR技術(shù),以大腸桿菌全基因組為模板釣取TEM-1基因,構(gòu)建pET22b(+)-TEM-1表達質(zhì)粒,經(jīng)測序鑒定后,轉(zhuǎn)入大腸桿菌Transetta(DE3),IPTG誘導表達、親和純化,并通過抗生素水解實驗驗證其酶活性。結(jié)果:構(gòu)建了可溶性表達TEM-1的工程菌,通過親和純化最終獲得純度達90%以上的TEM-1型β內(nèi)酰胺酶,該酶可水解氨芐西林。結(jié)論:獲得了對氨芐西林具有水解活性的TEM-1型β內(nèi)酰胺酶,并對其進行了酶動力學參數(shù)檢測,驗證其抗生素水解特性,有利于對臨床抗生素的合理應(yīng)用做出指導。

        TEM-1;β內(nèi)酰胺酶;表達;純化;酶動力學

        自從1965年英國首次報道至今,已發(fā)現(xiàn)900余種β內(nèi)酰胺酶[1],其中TEM型是發(fā)現(xiàn)最早且種類最多的,在世界范圍內(nèi)廣泛流行,國內(nèi)的檢出率亦較高。產(chǎn)β內(nèi)酰胺酶是大腸桿菌、肺炎克雷伯菌等對β內(nèi)酰胺類抗生素產(chǎn)生耐藥的主要機制之一[2],該酶能水解青霉素、頭孢菌素、碳青酶烯類等多種抗生素。同時,產(chǎn)β內(nèi)酰胺酶的細菌常常還帶有氨基苷類、喹諾酮類等抗菌藥物的多重耐藥基因[3],增加了臨床用藥和抗感染治療的難度。β內(nèi)酰胺酶的表達純化,是研究抗生素最小抑菌濃度、了解其耐藥規(guī)律的基礎(chǔ),有利于指導臨床抗生素的合理應(yīng)用。在本研究中,我們對TEM-1型β內(nèi)酰胺酶進行了原核表達、純化及活性驗證。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        大腸桿菌為臨床分離菌株;pET-22b(+)質(zhì)粒購自Novagen公司;NdeⅠ、XhoⅠ限制性核酸內(nèi)切酶購自 New England Biolab公司;大腸桿菌Trans5α、Transetta(DE3),質(zhì)粒pEASY-T1,高保真TaqDNA聚合酶,T4DNA連接酶,Trans2K DNA ladder,Protein RulerⅠ(12~80 kD)購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;快速瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自北京康為世紀生物科技有限公司;PCR產(chǎn)物純化試劑盒、質(zhì)粒小提試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;PCR引物由北京天一輝遠公司合成。

        1.2 TEM-1的基因克隆與鑒定

        根據(jù)GenBank中TEM-1序列設(shè)計引物P1(5'-CATATGCACCCAGAAACGCTGGTG-3')、P2(5'-C TCGAGCCAATGCTTAATCAGTGA-3'),引入的酶切位點為NdeⅠ、XhoⅠ(分別為P1、P2的下劃線部分)。以臨床分離的經(jīng)VITEK 2 GN鑒定的大腸桿菌為模板,PCR擴增獲得目的基因TEM-1。50μL PCR體系擴增條件:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,62℃退火30 s,72℃延伸1 min,35次循環(huán);72℃終延伸10 min。

        1.3 pET-22b(+)-TEM-1表達質(zhì)粒的構(gòu)建與誘導表達

        利用NdeⅠ和XhoⅠ分別雙酶切鑒定正確的TEM-pEASY-T1 Trans5α克隆菌,抽提質(zhì)粒和表達載體pET-22b(+),在T4DNA連接酶的作用下進行連接,并轉(zhuǎn)入大腸桿菌Trans5α感受態(tài)細胞,經(jīng)藍白斑實驗初步篩選后,挑取白色陽性菌株進行PCR鑒定及酶切鑒定,產(chǎn)物送北京天一輝遠公司進行測序鑒定。

        挑取PCR、酶切和測序鑒定均正確的陽性菌落擴大培養(yǎng),抽提質(zhì)粒pET-22b(+)-TEM-1轉(zhuǎn)入大腸桿菌Transetta(DE3)感受態(tài)細胞,經(jīng)PCR鑒定后,將陽性菌株接種至含有氨芐西林的新鮮LB培養(yǎng)基中(氨芐西林終濃度為0.1 mmol/L),37℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)至D600nm為0.6,取部分菌液作為未誘導對照后,加入IPTG(終濃度為0.1 mmol/ L),18℃、150 r/min振蕩過夜誘導表達(實驗摸索的最適表達條件)。

        4℃、5000 r/min離心菌液20 min,棄上清,用蒸餾水洗滌菌體后,用A液(Na3PO47.6 g,NaCl 29.2 g,咪唑 4.08 g,溶于800 mL蒸餾水,用HCl滴定pH值至6.5,定容至1 L)重懸菌體,超聲波破碎(工作2 s、間隔5 s,循環(huán)99次)至清亮,離心收集上清。

        1.4 TEM-1蛋白的純化

        采用親和層析方法。將帶有組氨酸標簽的TEM-1蛋白用鎳柱吸附后,用含高濃度咪唑的B液(Na3PO47.6 g,NaCl 29.2 g,咪唑 27.2 g,溶于800 mL蒸餾水,用HCl滴定pH值至7.4,定容至1 L)洗脫,將吸附于鎳柱上的TEM-1洗脫下來。

        1.5 TEM-1蛋白的透析濃縮

        公路橋梁建設(shè)過程中,設(shè)計方案、工程計量、設(shè)計變更等都是其施工檔案的重要組成部分。確保這些基礎(chǔ)資料的充分、完善,能夠為具體養(yǎng)護的實施提供有效的指導。在檔案完善中,實現(xiàn)檔案內(nèi)容的精確性和完善性保證是其管理的內(nèi)容在要求,工程管理人員只有注重這些材料的規(guī)范,并以其為指導,進行養(yǎng)護工作的有效開展,才能確保工程養(yǎng)護質(zhì)量的有效提升。

        純化的蛋白經(jīng)SDS-PAGE檢測純度,剔除含有較多雜蛋白和蛋白含量較少的管,其余各管合并,加入100倍樣本體積的PBS,于4℃進行透析(透析袋前處理:透析袋放入蒸餾水中,沸水煮5~10 min,煮3次),12 h換一次PBS,共計3次。

        1.6 TEM-1蛋白的活性驗證

        根據(jù)TEM-1的酶特性,用0.01 mmol/L、pH7.2的PBS配置0.25 mmol/L氨芐西林溶液,以終濃度為70 ng/mL的TEM-1溶液在37℃下進行氨芐西林水解實驗(實驗摸索的最佳反應(yīng)條件),用Gen5軟件測定D229nm值(本實驗室儀器測定的最大吸收波長)隨時間的變化,并計算其酶動力學參數(shù)。

        2 結(jié)果

        2.1 TEM-1基因的調(diào)取、擴增

        釣取基因PCR擴增后,以1.5%瓊脂糖凝膠電泳,在約792 bp處有單一條帶,與設(shè)計的目的條帶一致(圖1)。

        2.2 TEM-1基因連接pEASY-T1克隆載體后的酶切鑒定

        將TEM-1-pEASY-T1酶切后,以1.5%的瓊脂糖凝膠電泳,在約792 bp處有單一條帶,與目的片段大小相符(圖2)。

        2.3 構(gòu)建TEM-1-pET-22b表達質(zhì)粒并鑒定

        圖1 釣取TEM-1基因的瓊脂糖凝膠電泳圖

        圖2 TEM-1-pEASY-T1酶切鑒定

        挑取TEM-1-pET22b Trans5α單克隆,經(jīng)PCR擴增后行1.5%的瓊脂糖凝膠電泳,可見在792 bp處有單一條帶,與目的片段大小相符(圖3)。TEM-1連接pET22b后的測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫對比,一致性為100%。

        2.4 將測序正確的TEM-1-pET-22b轉(zhuǎn)入表達菌Transetta(DE3)中IPTG誘導前后SDS-PAGE對照

        15%的SDS-PAGE檢測表達菌誘導前后的表達情況,蛋白相對分子質(zhì)量約為31×103(圖4)。

        2.5 目的蛋白TEM-1的純化

        12%的SDS-PAGE檢測親和純化洗脫后的各管蛋白,結(jié)果如圖5。

        2.6 酶活性驗證

        圖3 目的基因連接表達載體后PCR鑒定

        圖4 IPTG誘導前后克隆的表達情況

        圖5 目的蛋白TEM-1洗脫后鑒定

        以氨芐西林為底物進行酶蛋白溶液最適反應(yīng)濃度篩選,選擇氨芐西林的終濃度為0.25mmol/L,TEM-1終濃度為70 ng/mL,并以此進行酶蛋白水解抗生素實驗。緩沖液為PBS(pH7.2),37℃檢測10 min,結(jié)果如圖6,TEM-1對氨芐西林呈現(xiàn)較強的催化活性,其催化常數(shù)Kcat為2.12。

        圖6 TEM-1對氨芐西林的水解作用

        3 討論

        進入抗生素時代以來,在不同的抗生素選擇壓力下,細菌形成了不同的耐藥機制,以逃避抗生素的攻擊。為了控制耐藥菌的感染,人們不斷開發(fā)和使用新型抗生素,但耐藥菌的產(chǎn)生不但沒有得到預(yù)期的控制,反而出現(xiàn)愈演愈烈之勢。細菌對抗生素的耐藥機制主要包括以下幾點[4-5]:①產(chǎn)生滅活酶或鈍化酶,通過水解乙?;?、磷酸化等修飾抗生素從而使之失活,如β內(nèi)酰胺酶、氨基糖苷類鈍化酶等;②作用靶位改變,使細菌逃避或減弱抗生素作用,如喹諾酮類靶位基因突變;③細菌主動外排機制,加強了細菌在抗生素壓力下的生存能力;④細菌膜通透性改變,影響細菌對抗生素的敏感性;⑤細菌生物被膜的形成。這些適應(yīng)當前環(huán)境的有利突變在抗生素的壓力下被選擇出來,并經(jīng)過各種方式傳播。分析這些突變,對耐藥基因的分子進化、流行病學及耐藥機制等研究都具有重要意義。

        自1965年TEM-1在英國被報道以后[1],在世界范圍內(nèi)陸續(xù)出現(xiàn)了許多關(guān)于TEM-1的流行病學及其亞型的報道。目前,由TEM-1編碼基因突變而來的超廣譜β內(nèi)酰胺酶(extended spectrum β-lactamases,ESBL)已達155種以上。TEM型β內(nèi)酰胺酶是革蘭陰性菌中最常見的β內(nèi)酰胺酶[6],在國內(nèi)外普遍存在。因此,研究其導致的各種突變等對其本身耐藥機制的改變具有重要意義。

        TEM型β內(nèi)酰胺酶是由廣譜酶TEM-1和TEM-2的編碼基因發(fā)生突變造成若干氨基酸改變而形成的一系列酶,活性部位均為絲氨酸殘基。TEM-2型是TEM-1的第1個衍生物,區(qū)別在于4094位置上堿基A突變?yōu)镃,兩者的生化特性幾乎完全相同。目前發(fā)現(xiàn)的TEM酶至少有183種(http://www.lahey.org/studies/temtable.asp),其中 90余種明確具有超廣譜酶活性,均為TEM-1或TEM-2的衍生物,其突變位點主要集中在104位谷氨酸突變?yōu)橘嚢彼帷?64位精氨酸突變?yōu)榻z氨酸或組氨酸、238和240位谷氨酸突變?yōu)橘嚢彼?。突變可以同時發(fā)生在1~5個位點,使酶的等電點升高,同時發(fā)生構(gòu)象改變,從而擴大了原有底物譜,提高了其對三代頭孢菌素類抗生素的親和力,使其能水解頭孢噻肟、頭孢他啶等三代頭孢菌素類及單環(huán)類抗生素[7-11]。在TEM-1高表達聯(lián)合膜孔蛋白缺失時,亦可引起對酶抑制劑(如頭孢哌酮/舒巴坦)耐藥。鑒于TEM型ESBL的許多亞型都是由TEM-1突變而來,因此對TEM-1蛋白的研究較為深入[12-14]。我們將TEM-1基因克隆到原核表達載體,為下一步通過定點突變研究β內(nèi)酰胺酶水解頭孢菌素藥物的關(guān)鍵位點,以及探索應(yīng)用反義核酸、核酶等技術(shù)干擾耐藥基因表達,逆轉(zhuǎn)細菌對第三代頭孢菌素的耐藥性等研究奠定了一定的基礎(chǔ)。

        TEM-1為質(zhì)粒介導的耐藥基因,極易在細菌間傳播,引起醫(yī)院感染的暴發(fā)流行,甚至水平播散至腸桿菌科以外的細菌而導致耐藥,給臨床抗感染治療帶來嚴峻挑戰(zhàn)。TEM-1型ESBL為胞內(nèi)酶且表達有限,目前TEM-1型β內(nèi)酰胺酶的原核表達方式基本都是包涵體表達,本研究實現(xiàn)了其可溶性表達,且純化效果較好,活性實驗證明純化后的蛋白具有較高活性,可很好地用于后續(xù)對于抗生素及抑制劑的篩選等,指導臨床合理用藥,在青霉素酶的應(yīng)用上,如青霉素過敏的治療,替代辣根過氧化物酶、堿性磷酸酶在酶聯(lián)反應(yīng)上的應(yīng)用等都有一定的價值[15]。

        [1]Datta N,Kontomichalou P.Penicillinase synthesis con-trolled by infectious R factors in Enterobacteriaceae [J].Nature,1965,208(208):239-241.

        [2]Crowder M W,Spencer J,Vila A J.Metallo-beta-lactamases:novel weaponry for antibiotic resistance in bacteria[J].Acc Chem Res,2006,39(10):721-728.

        [3]陳淑貞,石蓉林,姚芬,等.肺炎克雷伯菌產(chǎn)ESBLs基因型分析[J].中國感染與化療雜志,2006,6(4):236-239.

        [4]夏永祥,陳杰.細菌耐藥性分子機制的研究進展[J].中國實驗診斷學,2010,11:1866-1869.

        [5]呂吉云,曲芬.多重耐藥微生物及防治對策[M].北京:人民軍醫(yī)出版社,2011.

        [6]Bradford P A.Extended-spectrum beta-lactamases in the 21st century:characterization,epidemiology,and detection of this important resistance threat[J].Clin Microbiol Rev,2001,14(4):933-951.

        [7]李虹玲,劉文恩.SHV型超廣譜β-內(nèi)酰胺酶的研究進展[J].實用預(yù)防醫(yī)學,2007,14(1):253-255.

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        [10]Dellus-Gur E,Elias M,Caselli E,et al.Negative epistasis and evolvability in TEM-1 β-lactamase--The thin line between an enzyme's conformational freedom and disorder[J].J Mol Biol,2015,427(14):2396-2409.

        [11]S?ndergaard A,N?rskov-Lauritsen N.Contribution of PBP3 substitutions and TEM-1,TEM-15,and ROB-1 beta-lactamases to cefotaxime resistance in Haemophilus influenzae and Haemophilus parainfluenzae [J].Microb Drug Resist,2016,22(4):247-252.

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        [14]Figliuzzi M,Jacquier H,Schug A,et al.Coevolutionary landscape inference and the context-dependence of mutations in beta-lactamase TEM-1[J].Mol Biol Evol,2016,33(1):268-280.

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        Prokaryotic Expression,Purification and Biological Activity ofβ-Lactamase TEM-1

        LI Jing1,XU Jian-Yu1,NING Nian-Zhi2,LIU Chuan-Jie2, HUANG Jie2,LIU Xue-Chao2,LI Tao2*,WANG Hui2*

        1.North China University of Science and Technology,Tangshan 063009;2.State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity,Institute of Microbiology and Epidemiology,Beijing 100071;China

        *Co-corresponding authors,WANG Hui,E-mail:geno0109@vip.sina.com;LI Tao,E-mail:litaobmi@126.com

        Objective:The production of hydrolytic enzymeβ-lactamase is one of the most important mechanisms ofEscherichia coliandKlebsiella pneumoniaeto resistβ-lactam antibiotics.TEM is the first reportedβ-lactamase and has most varieties of subtypes.Our study aim at the construction of TEM-1 prokaryotic expression vector,the purification and the biological activity measurement of this enzyme.Methods:By using microbiological technology,we amplified TEM-1 gene from a clinicalE.colistrain and constructed the expression plasmid pET22b(+)-TEM-1.The expression vector was confirmed by sequencing and was then transformed intoE.coliTransetta(DE3)strain.The recombinant TEM-1 expressed by induction of IPTG,and then the product was purified.We investigated the activity of this enzyme by performing antibiotic hydrolyzing experiment.Results:TEM-1 was expressed in prokaryotic expression system.After purification,the purity of the target protein is up to 90%and the protein could hydrolyze ampicillin efficiently.Conclusion:We obtained the TEM-1 protein withe the verified ability of hydrolyzing ampicillin,and calculated its hydrolysis dynamical parameter.Studies about the characteristics ofTEM-1 enzyme will contribute to the reasonable use of clinical antibiotics.

        TEM-1;β-lactamase;expression;purification;enzyme kinetics

        Q78

        A

        1009-0002(2017)03-0319-05

        10.3969/j.issn.1009-0002.2017.03.015

        2016-12-12

        國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(2015CB554202)

        李靜(1984-),女,碩士研究生,主管檢驗師,(E-mail)lijing_lab@163.com

        王慧,(E-mail)geno0109@vip.sina.com;李濤,(E-mail)litaobmi@126.com

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