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        柑橘黑斑病反射光譜特性與染病果實檢測方法研究

        2017-06-05 15:08:20趙川源何東健LEEWonSuk
        農(nóng)業(yè)機械學報 2017年5期
        關鍵詞:特征癥狀

        趙川源 何東健 LEE Won Suk

        (1.西北農(nóng)林科技大學機械與電子工程學院, 陜西楊凌 712100; 2.農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)重點實驗室, 陜西楊凌 712100;3.佛羅里達大學農(nóng)業(yè)與生物工程學院, 蓋恩斯維爾 FL 32611)

        柑橘黑斑病反射光譜特性與染病果實檢測方法研究

        趙川源1,2何東健1,2LEE Won Suk3

        (1.西北農(nóng)林科技大學機械與電子工程學院, 陜西楊凌 712100; 2.農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)重點實驗室, 陜西楊凌 712100;3.佛羅里達大學農(nóng)業(yè)與生物工程學院, 蓋恩斯維爾 FL 32611)

        通過對光譜儀采集的340~1 030 nm柑橘健康與感染黑斑區(qū)域光譜進行分析,在探明健康和黑斑病不同癥狀光譜特性的基礎上,提出主成分分析結合特征排序的方法,選擇出可識別染病與健康樣本的最優(yōu)波長(525 nm)建立SMO分類模型;基于序列浮動前向選擇方法優(yōu)選出4個特征波長(678、740、794、879 nm),建立C4.5算法識別柑橘黑斑病3種癥狀的方法。試驗結果表明,用525 nm波長建立的SMO分類模型對健康和染病果樣本的識別率達99.37%,硬斑型、破裂型和黑斑型癥狀的識別率分別為81.85%、71.88%和67.57%, 3種癥狀的平均識別率為73.77%,比前人方法提高了12.77個百分點。

        柑橘黑斑病; 光譜特性; 特征選擇; 識別模型; 主成分分析

        引言

        柑橘是美國佛羅里達州的重要果類,占全美柑橘總產(chǎn)量的65%[1]。在柑橘生產(chǎn)中,由柑橘球座菌(Guignardiacitricarp)引起的柑橘黑斑病(Citrus black spot,CBS)是常見病害之一,幾乎所有柑橘品種都會受到黑斑病的感染。雖然目前無報告顯示黑斑病會對柑橘內(nèi)部果實品質(zhì)造成影響,但其影響果實的外觀品質(zhì),從而影響果實在市場上的銷售價格。黑斑病也會造成果實在成熟期前落果,嚴重影響柑橘產(chǎn)量,還會導致儲藏期果實腐爛,對新鮮柑橘市場造成潛在影響[2-4]。若能在果園中有效地控制黑斑病,及時移除被感染果實,則可減少柑橘生產(chǎn)損失。因此,尋求一種能夠快速、無損檢測黑斑病的方法具有實際意義。

        機器視覺技術的應用對食品和農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量評價和無損檢測提供了巨大的潛力[5-10]。PYDIPATI等[11]提出在實驗室環(huán)境下,利用基于HSI顏色空間的共生矩陣紋理特征識別不同柑橘葉片病害的方法, 識別準確率最高達到100%。BLASCO等[12]研究基于近紅外、紫外線等機器視覺技術檢測柑橘果實常見損傷,結合不同光譜信息對不同損傷類型果實進行分類,結果表明,與彩色圖像檢測結果相比,用近紅外光譜圖像可將缺陷的識別精度從86%提高到95%。

        黑斑病在果實表皮上有多種不同癥狀,使得對黑斑病的檢測造成一定困難。硬斑型黑斑病是黑斑病中最常見且最典型的一種癥狀,它多呈凹陷的小圓形,周邊呈紅棕色而中間為褐色。破裂型黑斑病在果皮表面表現(xiàn)為大而平的深棕色病斑,有些會有凸起的裂痕。黑斑型黑斑病通常是多種病斑的融合,并且在果實表面占據(jù)很大部分[13]。黑霉病癥狀類型的識別,對研究黑斑病菌誘因與黑斑病形態(tài)之間關系具有重要意義。近年來,基于光譜技術來檢測食品和農(nóng)產(chǎn)品內(nèi)部或外部品質(zhì)取得了不少成果[14-19]。QIN等[20]獲取450~930 nm的柑橘高光譜圖像,用基于光譜信息散度(SID)分類方法對柑橘潰瘍病進行檢測,識別率達到96.2%。BULANON等[21]研究了基于高光譜圖像的柑橘黑斑病檢測,根據(jù)波長比與波長差特性,選取了493、629、713、781 nm作為最佳波長,通過人工神經(jīng)網(wǎng)絡和線性判別分析檢測黑斑病,檢測準確率達到92%。為了進一步探索不同癥狀柑橘黑斑病的檢測,ZHAO等[22]應用高光譜圖像對柑橘黑斑病不同表現(xiàn)癥狀進行檢測,對5種癥狀在396~1 010 nm進行光譜特性分析后,通過特征選擇選取最佳波長,黑斑病的識別準確率可達到98%,但對每種癥狀的識別率較低,只有61%左右。

        高光譜圖像技術可以較好地識別柑橘黑斑病,但各種癥狀的識別率較低,且高光譜設備價格昂貴,性能受復雜環(huán)境因素影響,使用條件要求嚴格使得高光譜系統(tǒng)難以在田間實際應用和推廣,迫切需要研究能用于柑橘黑斑病田間實時檢測的技術和方法。

        本文以開發(fā)果園中實際應用的柑橘黑斑病實時檢測多光譜技術為目標,用便攜式光譜儀采集橘柑果實光譜數(shù)據(jù),探明健康和黑斑病不同癥狀的光譜特性,研究有效識別健康與染病柑橘的模型與方法,以及3種常見黑斑病癥狀的識別方法,為果園快速檢測柑橘黑斑病提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試柑橘樣本

        供試柑橘于2015年4月在美國佛羅里達州Immokalee附近的果園采摘。135個柑橘樣本中,黑斑病感染的柑橘果實105個,未染病的健康柑橘果實30個。采摘的柑橘樣本被送往佛羅里達大學精準農(nóng)業(yè)實驗室用于試驗。

        數(shù)據(jù)采集之前,用水對柑橘樣本進行清洗,并將表面擦拭干凈。為了后續(xù)研究方便,在每個染病柑橘的表面,隨機選取最多5個病斑,并以病斑為中心,用黑色記號筆標記出直徑約為10 mm的圓形。為了與染病樣本進行對比,在每個健康柑橘的表面也隨機標記出5個直徑約10 mm的圓形。本文供試數(shù)據(jù)為標記的150個健康樣本區(qū)域以及487個黑斑病區(qū)域,其中,487個黑斑病樣本中,硬斑型、破裂型和黑斑型樣本分別為270、32和185個。標記后的健康果實與黑斑病中常見癥狀病斑樣本圖像如圖1所示。

        1.2 光譜數(shù)據(jù)采集

        本研究采用USB2000+微型光纖光譜儀 (Ocean Optics公司)獲取柑橘的光譜反射值,光譜儀系統(tǒng)連接如圖2所示。

        圖1 標記的健康果實和3種黑斑病癥狀示例Fig.1 Representative images for marked healthy fruit and fruits with three CBS symptoms

        圖2 便攜式USB2000+微型光纖光譜儀Fig.2 Portable USB2000+spectrometer1.光源 2.RPH-1型反射探頭架 3.光纖反射探頭 4.光譜儀

        USB2000+微型光纖光譜儀的光譜范圍為340~1 030 nm,光譜分辨率為0.3 nm,光學分辨率為0.1 nm。光譜儀由USB 2.0的接口與計算機連接,通過內(nèi)徑為600 μm的QR600-7-SR-125F型光纖反射探頭(Ocean Optics公司)與光譜儀連接,手持光纖反射探頭與待檢測物體接觸,測得接觸點340~1 030 nm的光譜信息,并通過計算機進行保存。

        為了保證探頭在接觸物體表面時保持45°不變,使用RPH-1型反射探頭架(Ocean Optics公司),將反射探頭架與待檢測物體表面相接觸,再將光纖反射探頭從45°孔中深入,對物體進行光譜檢測。在每次測量前,用反射率為99%的SRS-99-020標準參考板(Labsphere公司)對光譜儀進行校正。采集數(shù)據(jù)時,保持室內(nèi)溫度25℃左右,相對濕度為65%~70%。為降低光譜檢測中產(chǎn)生的噪聲,在開始試驗前45 min,提前將光源(LS-1型鹵鎢光源,Ocean Optics公司)打開,以確保在試驗過程中,光源處于平穩(wěn)狀態(tài)。

        獲取柑橘的光譜數(shù)據(jù)后,在Matlab R2012a和懷卡托智能分析環(huán)境下,按照數(shù)據(jù)預處理、特征波段選擇及分類器的構建等步驟,識別健康和染病果實,進一步選擇特征波長并構建最優(yōu)分類器以識別染病果實的不同癥狀。

        1.3 數(shù)據(jù)預處理

        由USB2000+微型光纖光譜儀采集到的柑橘樣本光譜數(shù)據(jù),包含340~1 030 nm區(qū)間共2 048個波長。為了減少儀器及外界環(huán)境等因素對光譜數(shù)據(jù)的影響,舍去前160個噪聲較大波長的光譜值,用剩余400~1 030 nm的1888個波長的光譜值進行分析。

        為消除光譜數(shù)據(jù)中的噪聲,需要對光譜數(shù)據(jù)進行平滑處理??紤]到Savitzky-Golay平滑濾波器[23]可在消除光譜數(shù)據(jù)噪聲的同時,保持光譜形狀和相應的光譜特性,故本文采用Savitzky-Golay平滑濾波器對光譜數(shù)據(jù)進行平滑去噪。該方法基于低維線性最小二乘法多項式,實現(xiàn)相鄰連續(xù)數(shù)據(jù)點的擬合。根據(jù)經(jīng)驗,應用四階最小二乘多項式,選擇平滑點左、右各20個點。

        1.4 特征波段選擇

        光譜數(shù)據(jù)包含豐富的信息含量,但是光譜各波段之間信息的關聯(lián)性導致冗余信息也相應較多。為了準確識別健康與染病樣本,需要特征波段選擇等降維處理,以減少光譜數(shù)據(jù)的特征維數(shù),剔除不相關或冗余的特征,降低計算時間,增強模型的泛化能力,提高不同染病癥狀的識別率。常用特征波段選擇方法主要有主成分分析(Principal component analysis,PCA)、序列浮動前向選擇(Sequential floating forward selection,SFFS)及互信息(Mutual information,MI)等,考慮到各種方法在特征選擇時的局限性,本文通過分析不同方法選擇特征的識別效果,探明適合柑橘黑斑病識別的特征波段。

        (1)主成分分析

        主成分分析(PCA)通過正交線性變換將原始相關變量轉換成一組不相關的新變量,即主成分。將預處理后637×1 888的Temp數(shù)據(jù)分為健康與染病2類樣本作PCA分析,分別得到特征向量矩陣COEF、對原始數(shù)據(jù)解析生成的新的數(shù)據(jù)Score以及新生成的數(shù)據(jù)對應的貢獻率(協(xié)方差矩陣的特征值)LATENT。通過計算數(shù)據(jù)Temp與新生成的主成分數(shù)據(jù)Score之間的相關系數(shù),得到各主成分的載荷,選取前幾個表示了大部分信息的主成分載荷做進一步的分析。

        (2)序列浮動前向選擇

        序列浮動前向選擇算法(SFFS)是在序列前向選擇(SFS)基礎上的改進[24-25]。結合本研究所處理的高維數(shù)據(jù),這里選擇K最近鄰分類器(KNN)作為選擇特征的評價函數(shù),K取值設置為5。從空集開始,每當選擇1個特征波長加入特征子集時,均用評價函數(shù)KNN判斷其識別率,若新的特征子集的準確率高于未加入此特征且此時的準確率最優(yōu),則確定將該特征加入特征子集,否則剔除該特征,繼續(xù)評估下一個特征波長。

        在初步確定特征子集后,考慮到該算法是一種貪心算法,即在特征選擇過程中,只能加入特征而不能剔除已選擇的、多余的特征,所以在最終確定特征子集前加入1步回溯,即排除初步選擇的特征子集中的1個特征,找到最沒有用處的那個特征波長。重復該步驟,直到評估分數(shù)優(yōu)于之前根據(jù)相同大小的特征子集得到的最高準確率,最優(yōu)子集選擇停止。

        (3)互信息

        互信息描述了2個系統(tǒng)之間的相關性,或互相包含信息的多少,是信息理論中一種衡量2個變量間相互關系的方法?;バ畔⑼ㄟ^熵以及聯(lián)合熵來反映對象之間信息的相互包容程度[26]。

        熵(Entropy)反映系統(tǒng)本身的總能量,其表達式為

        (1)

        其中

        X={x1,x2,…,xN}

        式中X——隨機變量xj——系統(tǒng)中變量中的元素p(xj)——變量出現(xiàn)的概率

        聯(lián)合熵反映了隨機變量的相關性,設2個隨機變量X和Y,則X和Y的聯(lián)合信息熵H(X,Y)表示為

        H(X,Y)=-∑pX,Y(x,y)lgpX,Y(x,y)

        (2)

        式中x、y——隨機變量X、Y各取值的概率pX,Y——隨機變量出現(xiàn)的概率

        對隨機變量Ta、Te來說,其互信息表示為

        MI(Ta,Te)=H(Ta)+H(Te)-H(Ta,Te)

        (3)

        式中H(Ta)、H(Te)——變量Ta、Te的熵

        互信息的特征選擇方法是一種衡量特征值與對應類別的依賴關系,是2個特征之間距離的一種非線性度量方法。根據(jù)每個特征的概率分布,對特征進行量化。本研究中設特征量化等級為15,計算量化后的特征與對應類別的互信息,并按照互信息的降序輸出最終特征波長的選擇結果。

        1.5 分類器的構建

        選擇出區(qū)分健康和不同癥狀染病樣本的特征波長后,需要構建分類器進行識別。構建分類器的方法很多,考慮到樣本的維數(shù)較多,需要處理的數(shù)據(jù)量較大,而且是非線性可分問題,因此本文用序列最小優(yōu)化算法(Sequential minimal optimization, SMO)[27]、徑向基網(wǎng)絡(Radical basis function, RBF)[28]、數(shù)據(jù)挖掘C4.5算法[29-30]構建分類器,對健康和染病樣本進行分類,通過分類性能對比,優(yōu)選出適合柑橘黑斑病檢測的分類器??紤]到供試樣本數(shù)量有限,故分類過程中采用10折交叉驗證方法,以增強分類器的魯棒性。

        2 結果與分析

        2.1 光譜特性分析

        從135個供試柑橘中共獲得487個黑斑病染病樣本數(shù)據(jù)和150個健康樣本數(shù)據(jù),對樣本數(shù)據(jù)進行平滑濾波預處理后,分別計算各波長下健康和染病樣本的平均反射率,2類樣本在400~1 030 nm范圍內(nèi)的光譜特性如圖3所示。

        圖3 健康和黑斑病染病樣本光譜特性分析Fig.3 Spectral characteristics analysis of healthy fruit and fruits with three CBS symptoms

        從圖3中可以看出,在400~800 nm光譜范圍內(nèi),健康樣本表面的光譜反射率較高,而黑斑病染病樣本的光譜反射率則較低。健康樣本的反射率在740 nm后幾乎保持不變,而在800 nm以后,黑斑病的光譜反射率高于健康樣本。從標準差可以看出,在500~930 nm光譜范圍內(nèi),健康和CBS染病樣本的光譜反射率相差較大。從圖3可以看出,在500~710 nm光譜范圍內(nèi),健康和黑斑病光譜反射率的一階導數(shù)差別較大;在500~590 nm和690~930 nm范圍內(nèi),一階導數(shù)值為正,健康樣本在525 nm和694 nm處一階導數(shù)分別達到局部最大;在590~690 nm區(qū)域內(nèi),健康樣本的一階導數(shù)值為負;在930 nm之后,健康與黑斑病樣本的一階導數(shù)值曲線幾乎重疊,表明在該光譜區(qū)域內(nèi)健康和黑斑病的光譜反射率變化趨勢相差不多,對應的反射率曲線,2類樣本在該區(qū)域的反射率均值重疊較多。

        由圖3可知,3種黑斑病癥狀的光譜反射率曲線與健康樣本的差別較大,破裂型癥狀的光譜特性曲線與其他2類(硬斑型和黑斑型)有較為明顯的區(qū)別,在整個光譜范圍內(nèi),該癥狀的光譜反射率整體呈現(xiàn)上升趨勢,且沒有拐點。而硬斑型和黑斑型的光譜反射率曲線較為相似,結合圖1中的彩色圖像,可以看出這2類病狀表現(xiàn)相似。

        對健康和染病樣本光譜反射特性的分析表明,用位于500~930 nm的光譜區(qū)間特征波長,可以對健康和黑斑病樣本進行識別。

        2.2 特征波長選擇結果

        分別用主成分分析、基于序列浮動前向選擇和互信息等方法選擇特征波長,基于序列最小優(yōu)化(SMO)、徑向基函數(shù)網(wǎng)絡(RBF)和C4.5算法建立分類模型,以檢測不同特征波長選擇方法所選波長的識別效果,并采用10折交叉驗證方法以增強分類器的魯棒性。

        2.2.1 健康與染病樣本的特征波長選擇結果

        (1)基于PCA的特征波長選擇結果

        對健康和染病柑橘2類樣本在400~1 030 nm的平均反射率進行PCA分析,其結果如圖4所示。圖4a為487個黑斑病樣本和150個健康樣本經(jīng)過主成分分析后,在前3個主成分空間的分布情況,由圖可以看出,用3個PCA分量即可將健康與染病樣本分為2類。前3個主成分包含了超過全部數(shù)據(jù)97.4%的變量,故用前3個主成分代替全部數(shù)據(jù)。

        圖4 主成分分析結果Fig.4 Results of PCA analysis

        雖然前4個主成分包含了超過97%的數(shù)據(jù),但本研究的最終目的是利用選擇的若干個特征波長,構建價格較低的多光譜系統(tǒng),以降低檢測儀器的成本。而主成分分析僅將原始數(shù)據(jù)進行了壓縮,故需要進一步從全部數(shù)據(jù)中選擇少而優(yōu)的特征波長。圖4b為前3個主成分在光譜范圍內(nèi)的載荷情況,載荷值反映了主成分在光譜范圍內(nèi)不同波長時的相關系數(shù),圖中呈現(xiàn)出波峰或波谷極值點對應的波長即為待選的特征波長。根據(jù)圖4b共選出525、675、700、740 nm 4個特征波長。

        為進一步優(yōu)化選擇出的最優(yōu)波長,基于T檢驗、KL散度、切諾夫界和ROC曲線共4種不同評價標準的特征排序方法,對選擇出的特征波長子集進行分析。為便于對比將各方法得到的相關系數(shù)歸一化為0~1范圍,用衡量特征波長對分類重要性的相關系數(shù)進行排序,最終選擇出最優(yōu)的特征波長為525 nm。

        (2)基于SFFS的特征波長選擇結果

        通過SFFS特征選擇方法,對健康和染病樣本進行特征波長的選擇。通過10次選擇后,最終選擇出2個最優(yōu)特征波長,分別為527 nm和917 nm。

        (3)基于互信息的特征波長選擇結果

        對2類數(shù)據(jù)采用MI方法,得分前10的波長分布在513~531 nm區(qū)間內(nèi),因此選取513~531 nm光譜區(qū)域作為MI方法選擇的特征波長區(qū)域。

        2.2.2 黑斑病3種不同癥狀的特征波長選擇結果

        通過對黑斑病3種不同癥狀的光譜特性進行觀察研究,破裂型與其他2種癥狀的光譜特性完全不同,故先將硬斑型和黑斑型看作同一類,因此問題變成了2類樣本的分類識別。采用SFFS特征選擇方法選擇特征波長,并選擇出740、794、897 nm 3個特征波長,用以區(qū)分破裂型和其他癥狀。

        為對硬斑型和黑斑型進行分類,采用SFFS方法選擇區(qū)分該2類病癥的特征波長為678 nm。因此,區(qū)分3種不同癥狀的特征波長為678、740、794、897 nm共4個特征波長。

        2.3 識別結果及分析

        2.3.1 健康與黑斑病樣本識別結果

        基于PCA和特征排序方法選擇的特征波長525 nm和全波段的3種分類器,對健康和黑斑病染病樣本的識別結果如表1所示。由表1可知,用525 nm特征波長建立的SMO模型分類準確率最高(99.37%),RBF和C4.5模型分類準確率分別為99.21%和99.06%,也取得了較好的識別效果。采用全波段建立的SMO、RBF和C4.5模型對健康和染病樣本識別準確率分別為99.84%、97.80%和98.59%,SMO的識別準確率略高于單一波長,但采用單一波長與全波段相比,SMO分類器處理時間從0.2 s減少到0.01 s。而RBF和C4.5分類器基于單一波長的識別準確率均略高于基于全波段的識別率。

        通過SFFS和MI 2種特征選擇方法選擇特征波長后,分別用SMO、RBF和C4.5分類器構建識別模型,對健康和黑斑病樣本分類,結果如表2所示。

        表1 525 nm特征波長和全波段建立的3種分類器識別結果Tab.1 Identification results of healthy and CBS infected fruits using three classifiers based on selected wavelength of 525 nm and whole range of spectral data

        表2 SFFS和MI選擇的特征波段對健康和染病樣本的分類結果Tab.2 Classification results of healthy and CBS infected fruits using three classifiers based on selected wavelengths with SFFS and MI methods

        由表2可以看出,由SFFS方法選擇的2個特征波長527 nm和917 nm,對健康和黑斑病的識別準確率均高于MI的特征子集,RBF分類識別率最高達到99.06%,最低的識別率為基于MI特征子集的95.92%。

        對比表1和表2可知,本文提出的PCA載荷結合特征排序方法選擇的525 nm特征波長,對健康和黑斑病染病樣本的識別準確率高,優(yōu)于SFFS和MI方法所選特征子集的識別率,且數(shù)據(jù)維數(shù)更低,即僅用1個特征波長525 nm就可將健康和黑斑病樣本區(qū)分出來。

        2.3.2 黑斑病不同癥狀的分類結果

        為了識別破裂型、硬斑型和黑斑型3種黑斑病癥狀,用SFFS方法依次選擇出能區(qū)分破裂型、硬斑型和黑斑型的特征波長,結合健康和黑斑病特征波長525 nm與678、740、794、897 nm,采用數(shù)據(jù)挖掘C4.5算法對健康與黑斑病3種癥狀識別結果的混淆矩陣如表3所示。

        從表3可以看出,健康樣本的識別率最高,達到98.67%,150個樣本中有2個樣本被誤識別為硬斑型樣本。對3種癥狀的分類識別中,硬斑型的識別率最高,達到81.85%,破裂型和黑斑型的識別率均較低,分別為71.88%和67.57%,3種病害癥狀平均識別率為73.77%,比文獻[21]采用高光譜分析方法(61.00%)提高了12.77個百分點。3種癥狀分類識別率并不理想,這是因為硬斑型和黑斑型的光譜反射特性曲線(圖3)趨勢相似,故難以高精度識別;破裂型樣本數(shù)較少(32個),雖然在分類過程中采用了10折交叉驗證方法,但樣本數(shù)仍太少,使得分類準確率較低。

        表3 基于5個特征波長對健康和黑斑病3種癥狀識別結果的混淆矩陣Tab.3 Confusion matrix of accuracy rates using selected five optimal wavelengths for healthy fruit and fruits with three CBS symptoms classification

        3 結論

        (1)提出主成分分析結合特征排序選擇最優(yōu)波長構建SMO分類器識別健康和染病樣本的方法,試驗結果表明,用525 nm波長SMO分類器對健康和染病樣本識別率為99.37%,僅比基于全波段的分類識別率低0.47個百分點,但分類器處理時間從0.2 s減少到0.01 s,大大提高了識別效率。

        (2)用SFFS和MI特征選擇方法分別選擇出2個特征波長(527 nm和917 nm)和513~531 nm光譜區(qū)域,對健康和黑斑病的識別率均低于PCA結合特征排序方法選擇的最優(yōu)波長的識別率,但也達到滿意的識別準確率。

        (3)用優(yōu)選的特征波長建立C4.5算法分類器對健康果和黑斑病3種癥狀樣本進行識別,健康樣本識別率達98.67%,黑斑病3種癥狀的平均識別率為73.77%,比前人方法提高了12.77個百分點。

        1 Florida Department of Agriculture and Consumer Services. Florida citrus statistics 2009—2010[M]. Maltland, FL: USDA NASS Florida Field Office, 2011.

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        Reflectance Spectral Characteristics of Black Spot Disease and Disease Detection Method for Citrus

        ZHAO Chuanyuan1,2HE Dongjian1,2LEE Won Suk3
        (1.CollegeofMechanicalandElectronicEngineering,NorthwestA&FUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China2.KeyLaboratoryofAgriculturalInternetofThings,MinistryofAgriculture,Yangling,Shaanxi712100,China3.DepartmentofAgricultural&BiologicalEngineering,UniversityofFlorida,GainesvilleFL32611,USA)

        Citrus black spot (CBS), which is one of the most common fungal diseases of citrus, causes lesions on the rind and early fruit drop before its mature stage. This disease can significantly reduce crop yield, making blemished fruit unsuitable for market. The objective of this research was to study the reflectance spectral characteristics of healthy and infected citrus fruits to identify diseased fruit from healthy ones. A portable USB2000+spectrometer was used to acquire spectral reflectance of citrus fruit in the laboratory with wavelength ranged from 340 nm to 1 030 nm. However, the spectra contained thousands of wavelengths, and many of them would be considered as redundant, which may even decrease the classification accuracy. To reduce the data dimensionality and select the useful bands for further application, principal components analysis (PCA) and four band ranking methods, i.e.,T-test, Kullback-Leibler distance, Chernoff bound and receiver operating characteristic (ROC) were applied. One important wavelength (525 nm) was selected and used to classify healthy and CBS infected fruits. Sequential minimal optimization (SMO), radical basis function network (RBF), and C4.5 classification methods were used to evaluate the performance of the selected band, and SMO achieved the highest accuracy of 99.37%. In order to compare the performance of classification accuracies according to optimal wavelengths selected by using different methods, two other methods, i.e., sequential floating forward selection (SFFS) and mutual information (MI), were applied. Wavelengths of 527 nm and 917 nm were selected based on SFFS, while the MI method selected 513~531 nm as the optimal wavelength range, and the highest recognition accuracy was 99.06%, which was lower than that of using 525 nm. Then SFFS was applied to find the optimal wavelengths for further distinguishing three CBS symptoms. C4.5 method was used to evaluate the performance of distinguishing CBS infected and healthy fruits based on selected wavelengths, and the highest overall classification accuracy was 73.77%.

        citrus black spot disease; spectral characteristics; feature selection; identification model; principal components analysis

        2017-02-13

        2017-03-17

        國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)項目(2013AA102304)和國家自然科學基金項目(61473237)

        趙川源(1988—),女,博士生,主要從事計算機視覺、圖像處理和模式識別研究,E-mail: zhaochuanyuan@hotmail.com

        何東健(1957—),男,教授,博士生導師,主要從事生物圖像分析、智能化檢測與控制研究,E-mail: hdj168@nwsuaf.edu.cn

        10.6041/j.issn.1000-1298.2017.05.045

        S123

        A

        1000-1298(2017)05-0356-07

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