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        兩個人工選擇奧利亞羅非魚群體系統(tǒng)發(fā)育及其遺傳多樣性分析

        2017-05-30 23:23:49何福玲凌正寶肖俊郭忠寶鐘歡楊弘陳文治唐瞻楊單丹梁軍能甘西羅永巨
        南方農業(yè)學報 2017年2期
        關鍵詞:遺傳多樣性

        何福玲 凌正寶 肖俊 郭忠寶 鐘歡 楊弘 陳文治 唐瞻楊 單丹 梁軍能 甘西 羅永巨

        摘要:【目的】了解人工選擇偏好對奧利亞羅非魚遺傳多樣性的影響,為今后人工選育及生產提供參考依據(jù)?!痉椒ā繉蓚€奧利亞羅非魚群體(那馬群體和武鳴群體)各70尾個體的線粒體DNA的D-loop區(qū)序列、CoI基因和Cytb基因進行測序及系統(tǒng)進化研究,并選用20對微衛(wèi)星標記對其遺傳多樣性進行分析?!窘Y果】基于D-loop區(qū)序列兩個群體共檢測出32個單倍型,其中共享單倍型6個;基于CoI基因共檢測出23個單倍型,其中共享單倍型16個;基于Cytb基因共檢測出14個單倍型,其中共享單倍型10個。基于D-loop區(qū)序列、CoI基因和Cytb基因單倍型分別構建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹顯示,武鳴群體和那馬群體的個體交錯在一起,地理差異不明顯,且采用NJ法和ME法構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹的進化拓撲結構基本相似。20對微衛(wèi)星引物均能在奧利亞羅非魚中獲得穩(wěn)定有效的擴增條帶,其中有18個微衛(wèi)星位點呈多態(tài)性;那馬、武鳴群體的平均等位基因數(shù)(Na)分別為6.5000和7.9444,平均有效等位基因數(shù)(Ne)分別是3.9857和4.7268,平均觀測雜合度(Ho)分別為0.7123和0.7752,平均期望雜合度(He)分別為0.9614和0.9711、平均Nei期望雜合度分別為0.7017和0.7636,均表現(xiàn)為武鳴群體略高于那馬群體。兩個群體的遺傳分化系數(shù)(Fst)在不同微衛(wèi)星位點間差異明顯,其變化范圍為0.0173(GM241)~0.2318(UNH868),平均0.0997;從單群體近交系數(shù)(Fis)和總群體近交系數(shù)(Fit)來看,所有微衛(wèi)星位點的數(shù)值均為負值?!窘Y論】經短期人工選擇的武鳴群體奧利亞羅非魚遺傳多樣性較被長期人工選擇的那馬群體遺傳多樣性豐富,即短期內的不同人工選擇偏好對線粒體DNA的遺傳影響較小。

        關鍵詞: 奧利亞羅非魚;人工選擇;線粒體DNA;微衛(wèi)星標記;遺傳多樣性

        中圖分類號: S965.125 文獻標志碼:A 文章編號:2095-1191(2017)02-0341-09

        Abstract:【Objective】Influences of artificial selection preference on Oreochromis aureus genetic diversity were studied to provide some reference for O. aureus breeding and production. 【Method】Sequence and phylogeny of mitochondrion DNA D-loop region, Cytb gene and COI gene from 140 individuals of two O. aureus populations(70 from Nama population and 70 from Wuming population) were studied. Meanwhile, 20 pairs of microsatellite primers were applied to analyze the genetic diversity. 【Result】Thirty haplotypes were detected based on D-loop region and six of them were shared haplotypes; twenty-three were detected based on CoI gene and sixteen were shared haplotypes; fourteen were detected based on Cytb gene and ten were shared haplotypes. Phylogenetic trees based on D-loop region sequence, CoI gene and Cytb gene indicated that the individuals from Wuming population and Nama population interveined and showed no obvious geographical difference. Evolution topology of phylogenetic trees based on Neighbor-joining(NJ) method and Minimum-evolution(ME)method were similar. All 20 pairs of microsatellite primers could obtain stable and effective amplified bands from O. aureus, and 18 microsatellite loci presented polymorphism. Average allele numbers(Ne) for Nama population and Wuming population were 6.5000 and 7.9444 respectively, average effective allele numbers(Ne) were 3.9857 and 4.7268, average observed heterozygosity(Ho) were 0.7123 and 0.7752, average expected heterozygosity(He) were 0.9614 and 0.9711, average Nei expected heterozygosity were 0.7017 and 0.7636. All the indexes for Wuming population were higher than those of Nama population. There was obvious difference of coefficient of genetic differentiation(Fst) at different microsatellite loci, ranging from 0.0173(GM241)-0.2318(UNH868) with an average of 0.0997. From the perspective of inbreeding coefficient of single group(Fis) and inbreeding coefficient of total groups(Fit), the values of all microsatellite loci were negative. 【Conclusion】Genetic diversity of Wuming population which was artificially selected for short term is more abundant than that of Nama population which was artificially selected for long time. In another words, influence of artificial selection on mitochondria DNA is small in short term.

        Key words: Oreochromis aureus; artificial selection; mitochondria DNA; microsatellite marker; genetic diversity

        0 引言

        【研究意義】奧尼雜交羅非魚是以尼羅羅非魚為母本、奧利亞羅非魚為父本雜交獲得的優(yōu)良品種,因具有雄性率高、抗寒力強、抗病力好、餌料系數(shù)低、耐運輸?shù)葍?yōu)點而深受廣大養(yǎng)殖戶青睞。但由于生產奧尼雜交羅非魚苗種技術難度和管理要求較高,導致目前國內保存奧利亞羅非魚種質資源的苗種場較少。廣西水產科學研究院于20世紀90年代從中國水產科學研究院淡水漁業(yè)研究中心引進奧利亞羅非魚,并以尾鰭條紋為主選性狀選育至今(保存于廣西水產科學研究院那馬基地,下稱那馬群體)。2010年,廣西水產科學研究院再次從中國水產科學研究院淡水漁業(yè)研究中心引進奧利亞羅非魚(保存于廣西水產科學研究院武鳴基地,下稱武鳴群體)。通過對比這兩個群體的遺傳差異,了解不同人工選擇偏好對群體遺傳結構的影響,對今后人工選育及生產實踐具有重要意義?!厩叭搜芯窟M展】線粒體DNA因其結構簡單、呈母性遺傳、進化速度快且不發(fā)生重組,作為一種生物遺傳標記已廣泛用于系統(tǒng)進化研究(Van Goethem et al.,2001)。其中,線粒體D-loop區(qū)是線粒體內高度變異的控制區(qū),多態(tài)性較高,廣泛應用于群體遺傳分析(Lai et al.,2005);Cytb基因進化速度適中,很大程度傾向于轉換、顛換,適用于分析種間系統(tǒng)發(fā)育差異(Li et al.,2006);CoI基因相對保守同時有足夠的變異,序列長度適宜,且可用通用引物進行擴增和測序,常作為一種可靠的分子標記應用于種屬系統(tǒng)進化研究(Matsumoto,2003)。微衛(wèi)星DNA又被稱為短串連重復(Short tandem repeats,STRs),是以少數(shù)幾個核苷酸(1~6個)為單位組成的串聯(lián)重復序列,多態(tài)性高且呈共顯性遺傳,被認為是研究群體遺傳變異的最佳標記之一,已廣泛應用于物種起源進化、遺傳多樣性分析和動植物遺傳育種等研究領域(張濤等,2010)。近年來,越來越多學者將分子標記技術應用到羅非魚的相關研究中。郭奕惠等(2009)通過分析我國主要養(yǎng)殖羅非魚的COI基因,探討了其種間親緣關系,并證實線粒體COI基因可作為羅非魚種類鑒別和親緣關系分析的重要標記;馬慶男等(2013)在馬來西亞紅羅非魚、奧尼羅非魚、吉富羅非魚、新吉富羅非魚4群體中建立了TRAP分子標記體系,該體系可用于羅非魚遺傳多樣性研究及種類鑒定;李建林等(2015)利用微衛(wèi)星分子標記分析來自中國水產科學研究院淡水漁業(yè)研究中心和廣西水產科學研究院兩個吉富羅非魚群體的遺傳差異,結果表明,兩個吉富羅非魚群體遺傳多樣性水平較高,均存在雜合子過?,F(xiàn)象,群體間遺傳分化程度中等,具有較強的環(huán)境適應能力,且選育空間大?!颈狙芯壳腥朦c】至今,鮮見利用線粒體DNA結合微衛(wèi)星DNA的分子遺傳標記技術研究不同奧利亞羅非魚群體系統(tǒng)發(fā)育及其遺傳多樣性的相關報道?!緮M解決的關鍵問題】基于線粒體D-loop區(qū)、Cytb基因和CoI基因測序進行系統(tǒng)進化研究,并通過微衛(wèi)星DNA技術對兩個人工選擇奧利亞羅非魚群體進行遺傳多樣性分析,旨在了解人工選擇偏好對奧利亞羅非魚遺傳多樣性的影響,為今后人工選育及生產提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1. 1 試驗材料

        試驗用的兩個奧利亞羅非魚群體(那馬群體和武鳴群體)來源一致,均由中國水產科學研究院淡水漁業(yè)研究中心以同一祖先群體繁衍獲得,但二者選擇偏好不同,且分隔之后再無基因交流。分別采集那馬群體和武鳴群體奧利亞羅非魚鰭條(各70尾個體),采集樣本分別剪尾鰭于95%乙醇固定,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1. 2 奧利亞羅非魚總DNA提取

        奧利亞羅非魚總DNA的提取采用標準蛋白酶K裂解法(Sambrook et al.,1989)結合Tris飽和酚+氯仿/異戊醇抽提法。

        1. 3 線粒體相關片段引物合成

        從GenBank中導出奧利亞羅非魚的線粒體DNA全序列(登錄號GU370125.1),利用Primer Premier 5.0設計3對引物(表1)分別用于擴增線粒體D-loop區(qū)、Cytb基因和CoI基因,所有引物由上海英濰捷基生物公司合成。

        1. 4 PCR擴增及測序分析

        PCR擴增程序:94 ℃預變性5 min;94 ℃ 40 s;5 ℃ 35 s;72 ℃ 50 s,進行35個循環(huán);72 ℃延伸8 min。將PCR擴增產物進行膠回收后送至上海立菲生物技術有限公司測序。

        1. 5 線粒體序列相關數(shù)據(jù)分析

        原始測序峰圖文件首先利用拼接軟件Phred進行處理,使每個堿基的質量值在20以上,然后在默認參數(shù)條件下以Phrap進行拼接。拼接結果和堿基質量通過Consed檢查,手工去除錯誤拼接,再用ClustalX對序列進行對位排列,由MEGA 5.0計算序列堿基組成、密碼子使用頻率和群體間遺傳距離,并計算出其變異位點數(shù),最后采用鄰接法(Neighbor-joining method,NJ法)、最小進化法(Minimum-evolution method,ME法)分別構建系統(tǒng)進化樹。另外,采用DnaSp v5.10計算單倍型數(shù)、單倍型間核苷酸差異數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)及核苷酸多樣性指數(shù)。

        1. 6 微衛(wèi)星引物合成

        從已發(fā)表文獻(張庭等,2009;曹祥,2010)查找奧利亞羅非魚的微衛(wèi)星引物20對(表2),分別對每對引物的擴增體系和擴增條件進行優(yōu)化,并委托上海英濰捷基生物工程技術有限公司進行引物合成。

        1. 7 微衛(wèi)星檢測

        以20對微衛(wèi)星引物對兩個奧利亞羅非魚群體的DNA進行PCR擴增,擴增產物用8%非變性聚丙烯酰胺(PAGE)凝膠電泳進行分離,電泳緩沖液1×TBE,電壓280 V,電泳3 h左右。用0.5%冰醋酸固定3 min,2%硝酸銀染色5 min,雙蒸水漂洗2次(第1次20 s,第2次2 min),0.54%甲醛顯影約5 min,最后用預冷的0.5%冰醋酸終止反應。顯色后用GD S7500凝膠成像分析系統(tǒng)進行掃描,再以GelWorks1D 3.0對每對微衛(wèi)星引物擴增獲得的DNA分子量進行估算。

        1. 8 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析

        以電泳凝膠板上的10 bp DNA ladder Marker為參照,然后用Map Gene讀取PCR產物的片斷大小,記錄并錄入Excel 2007。使用Microsatellite Analyser(MSA)統(tǒng)計每個微衛(wèi)星位點的期望雜合度(He)、觀測雜合度(Ho)和等位基因數(shù)(Na)(Dieringer and Schl-tterer,2003);并以CERVUS 4.0分析每個微衛(wèi)星位點(Marshall et al.,1998),了解其多態(tài)信息含量(PIC)。

        2 結果與分析

        2. 1 線粒體序列分析結果

        基于D-loop區(qū)序列,那馬群體的單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為0.795、0.00176和1.640,武鳴群體的分別為0.822、0.00191和1.788;基于COI基因,那馬群體的單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為0.711、0.00057和0.911,武鳴群體的分別為0.770、0.00075和1.197;基于Cytb基因,那馬群體的單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為0.494、0.00065和0.739,均低于武鳴群體的0.677、0.00090和1.022。

        2. 2 序列單倍型分析結果

        基于D-loop區(qū)序列對兩個奧利亞羅非魚群體進行單倍型分析,結果表明,從武鳴群體和那馬群體的140尾奧利亞羅非魚中共檢測出單倍型32個。其中,共享單倍型6個,占所定義單倍型總數(shù)的18.75%。在所有定義的單倍型中,分布最廣泛的單倍型是Hap_24,那馬群體中有16尾、武鳴群體中有15尾均共用此單倍型。其余的26個單倍型均為獨享單倍型,且分布較均勻。

        基于CoI基因序列對兩個奧利亞羅非魚群體進行單倍型分析,結果表明,從兩個群體的140尾奧利亞羅非魚中共檢測出單倍型23個。其中共享單倍型16個,占所定義單倍型總數(shù)的69.57%,其比例遠高于基于D-loop區(qū)序列得出的結果。分布最廣泛的共享單倍型為Hap_1,那馬群體中有14尾、武鳴群體中有17尾均共用此單倍型。其余的7個單倍型為獨享單倍型,在兩個群體中呈不規(guī)則分布。

        基于Cytb基因序列對兩個奧利亞羅非魚群體進行單倍型分析,結果表明,從兩個群體的140尾奧利亞羅非魚中共檢測出單倍型14個。其中,共享單倍型10個,占所定義單倍型總數(shù)的71.43%。單倍型Hap_2分布最廣泛,那馬群體中有20尾、武鳴群體中有25尾均共用此單倍型,在各自群體中出現(xiàn)的比例分別為57.14%和71.43%。

        2. 3 單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹構建

        2. 3. 1 基于D-loop區(qū)序列的單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹 從GenBank下載薩羅羅非魚(Sarotherodon melanotheron)、尼羅羅羅非魚(Oreochromis niloticus)、鱸魚(Lateolabrax japonicus)、香魚(Plecoglossus altivelis)、虹鱒(Oncor-

        hynchus mykiss)、鯉魚(Cyprinus carpio)和斑馬魚(Danio rerio)的D-loop區(qū)序列,對應的GenBank登錄號詳見表3。結合已測得的奧利亞羅非魚D-loop區(qū)序列單倍型,利用MEGA 5.1基于Kimura雙參數(shù)模型分別應用NJ法和ME法構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹。由圖1和圖2可知,采用NJ法和ME法構建的奧利亞羅非魚D-loop區(qū)序列單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹顯示出相似的進化拓撲結構,各單倍型在個體間均勻交錯分布,未出現(xiàn)明顯的分支。兩個群體的個體交錯在一起,未體現(xiàn)出差異性,表明群體間遺傳距離較近,并出現(xiàn)一定的遺傳分化。系統(tǒng)發(fā)育進化樹均顯示,奧利亞羅非魚與尼羅羅非魚、薩羅羅非魚有很近的親緣關系,與鯉魚、斑馬魚的親緣關系較遠,即與傳統(tǒng)的形態(tài)生物學分類一致。

        2. 3. 2 基于COI基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹 由從圖3和圖4可看出,兩種方法構建的奧利亞羅非魚COI基因單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹顯示出相似的進化拓撲結構,各單倍型在個體間均勻交錯分布,未出現(xiàn)明顯分支。武鳴群體和那馬群體的個體交錯在一起,地理差異不明顯,表明這兩個群體間遺傳距離很近,并出現(xiàn)一定的遺傳分化。兩個群體的奧利亞羅非魚先與尼羅羅非魚聚為一支,再與薩羅羅非魚聚為一支,最后才與鱸魚、香魚、虹鱒、鯉魚和斑馬魚聚為一支。該結果與本研究的D-loop區(qū)序列單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析結果一致。

        2. 3. 3 基于Cytb基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹 由圖5和圖6可知,基于NJ法和ME法構建的奧利亞羅非魚Cytb基因單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹顯示出相似的拓撲結構。各單倍型在個體間均勻交錯分布,未出現(xiàn)明顯分支。武鳴群體和那馬群體的個體交錯在一起,地理差異不明顯,表明這兩個群體間遺傳距離很近,并出現(xiàn)一定的遺傳分化。兩個群體的奧利亞羅非魚先與薩羅羅非魚聚為一支,再與尼羅羅非魚聚為一支,與本研究的D-loop區(qū)序列、CoI基因單倍型系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析結果略有不同。

        2. 4 PAGE凝膠電泳結果

        運用20對微衛(wèi)星引物對兩個奧利亞羅非魚群體各30尾個體的基因組DNA進行PCR擴增,擴增產物經PAGE凝膠電泳,結果表明,20對微衛(wèi)星引物均能在奧利亞羅非魚中獲得穩(wěn)定有效的擴增條帶。其中,有18個微衛(wèi)星位點呈多態(tài)性,占總數(shù)的90%;而微衛(wèi)星GM542和GM376位點在兩個奧利亞羅非魚群體中表現(xiàn)出單態(tài)性,占總數(shù)的10%。部分微衛(wèi)星引物在奧利亞羅非魚中的PAGE凝膠電泳結果見圖7。

        2. 5 奧利亞羅非魚群體位點多態(tài)性分析結果

        從表4可看出,兩個群體的Na存在一定差異,武鳴群體的平均Na(7.9444)明顯高于那馬群體(6.5000)。在那馬群體中,Na最低的是位點UNH868,最高的是位點GM221;在武鳴群體中,Na最低的是位點UNH860和GM603,最高的是位點UNH104。那馬、武鳴群體的平均有效等位基因數(shù)(Ne)分別是3.9857和4.7268,平均Shannon指數(shù)(I)分別為1.4453和1.6777,平均Ho分別為0.7123和0.7752,平均He分別為0.9614和0.9711、平均Nei期望雜合度分別為0.7017和0.7636,均表現(xiàn)為武鳴群體略高于那馬群體,但二者間差異不明顯,說明兩個奧利亞羅非魚群體間的遺傳多態(tài)性水平差異并不明顯。在PIC方面,那馬、武鳴群體的PIC變化范圍分別為0.375(UNH868)~0.853(GM221)和0.457(UNH957)~

        0.888(UNH995),說明這18個微衛(wèi)星位點在奧利亞羅非魚群體中具有較高的多態(tài)性。

        2. 6 奧利亞羅非魚群體的遺傳分化與基因流

        由表5可看出,兩個群體的遺傳分化系數(shù)(Fst)在不同微衛(wèi)星位點間差異明顯,其變化范圍為0.0173 (GM241)~0.2318(UNH868),平均0.0997。這表明僅有9.97%的變異存在于群體間,而90.03%的變異存在于群體內,進一步說明奧利亞羅非魚群體內的遺傳變異是其總變異的主要來源。此外,奧利亞羅非魚群體間的基因流(Nm)變化范圍為0.8285(UNH868)~14.1990(GM241),不同位點間的Nm差異明顯,群體間的平均Nm為2.2568,數(shù)值較高,與奧利亞羅非魚群體間遺傳分化程度較小相一致。而從單群體近交系數(shù)(Fis)和總群體近交系數(shù)(Fit)來看,所有微衛(wèi)星位點的數(shù)值均為負值,說明這兩個奧利亞羅非魚群體無論是在總體水平還是群體內個體間,均表現(xiàn)出雜合體過?,F(xiàn)象。

        3 討論

        3. 1 兩個奧利亞羅非魚群體的D-loop區(qū)、CoI基因和Cytb基因比較分析

        本研究結果表明,在那馬群體線粒體DNA的D-loop區(qū)、CoI基因、Cytb基因發(fā)現(xiàn)變異位點分別為24、15和12個,在武鳴群體線粒體DNA的對應變異位點分別為25、20和16個,說明線粒體D-loop區(qū)序列、CoI基因、Cytb基因均可作為檢測奧利亞羅非魚群體遺傳多樣性的有效分子標記。核苷酸位點變異主要分為顛換和轉換。李娜等(2008)對閩浙地區(qū)線粒體Cytb基因和D-loop區(qū)序列進行多態(tài)性分析,結果在D-loop區(qū)序列中檢測到5個變異位點,在Cytb基因僅檢測到1個變異位點,且所有的變異位點均為轉換,未發(fā)生顛換。梁宏偉等(2009)對3種中國鯉線粒體DNA D-loop區(qū)進行研究,結果在3種中國鯉上共檢測到37個變異位點,包含2個插入、28個轉換和7個顛換,堿基的替換有明顯偏倚。動物線粒體DNA在漫長的進化過程中,發(fā)生轉換的頻率遠高于發(fā)生顛換的頻率。本研究發(fā)現(xiàn)的變異位點也是以轉換為主,沒有顛換發(fā)生,符合魚類線粒體DNA進化的特點。

        3. 2 兩個奧利亞羅非魚群體的遺傳多樣性比較分析

        遺傳多樣性參數(shù)主要由單倍型多樣度和核苷酸多樣度構成,單倍型多樣度和核苷酸多樣度越高,表明群體的遺傳多樣性越豐富,變異程度更高(張瑞光等,2010)。本研究根據(jù)D-loop區(qū)、CoI基因、Cytb基因分析得出的群體遺傳多樣性結果一致,結果顯示武鳴群體的單倍型多樣度、核苷酸多樣度均高于那馬群體,表明武鳴群體的奧利亞羅非魚遺傳多樣性更豐富,其群體變異程度更高。生物群體的變異程度與其進化速率呈正比,遺傳變異越豐富,群體對環(huán)境的適應能力越強,進化潛力就越大(Webster et al.,2003;Makarieva and Gorshkov,2004;Spielman et al.,2004;Garant et al.,2005;Postma and van Noordwijk,2005)。這對遺傳育種工作提出了新要求,如何在保持選育效率的同時盡可能地避免遺傳多樣性降低是今后育種工作的一個重要問題。本研究發(fā)現(xiàn),基于D-loop區(qū)序列檢測出的遺傳多樣性參數(shù)比基于CoI基因和Cytb基因檢測出的遺傳多樣性參數(shù)高,說明D-loop區(qū)序列作為反映奧利亞羅非魚群體遺傳多樣性的敏感度優(yōu)于CoI基因和Cytb基因,也進一步證明D-loop區(qū)序列變異性更高。

        3. 3 兩個奧利亞羅非魚群體的微衛(wèi)星位點多態(tài)性比較分析

        從微衛(wèi)星位點的檢測結果可看出,兩個奧利亞羅非魚群體的遺傳多樣性偏高(Ne=4.3563,Ho=0.7438,He =0.9663,PIC=0.697),略高于宋紅梅等(2008)利用尼羅羅非魚微衛(wèi)星引物對橙色莫桑比克羅非魚進行遺傳多樣性分析的結果。本研究中,武鳴群體的平均Ne、Ho、He均高于那馬群體,也說明武鳴群體的奧利亞羅非魚遺傳多樣性更豐富。此外,兩個群體的遺傳分化系數(shù)(Fst)在不同微衛(wèi)星位點間差異明顯,其變化范圍為0.0173(GM241)~0.2318(UNH868),平均為0.0997,表明僅有9.97%的變異存在于群體間,而90.03%的變異存在于群體內。究其原因,可能是由于武鳴群體的奧利亞羅非魚引進時間較短,經人工選育的次數(shù)較少,其遺傳多樣性水平更高;而那馬群體由于引進時間較長,經過多次人工選育,遺傳多樣性水平相對較低。李大宇等(2009)通過對黃顙魚的遺傳多樣性進行分析,發(fā)現(xiàn)高強度的人工選育會使經濟性狀優(yōu)良的基因型頻率上升并在群體中進一步純化均一,導致其遺傳多樣性水平有所降低。因此,如何在保持選育效率的同時盡可能地避免遺傳多樣性降低是今后育種工作的重點。

        4 結論

        經短期人工選擇的武鳴群體奧利亞羅非魚遺傳多樣性較被長期人工選擇的那馬群體遺傳多樣性豐富,即短期內的不同人工選擇偏好對線粒體DNA的遺傳影響較小。

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        (責任編輯 蘭宗寶)

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