邱詠，陳大洋，夏軍，朱珠，謝林，史千玉，劉萍，董潔，陳芳，蔣慧

(深圳華大基因，深圳 518083)

混合細(xì)胞樣本不同嵌合比例檢測(cè)的參考標(biāo)準(zhǔn)

邱詠，陳大洋，夏軍，朱珠，謝林，史千玉，劉萍*，董潔，陳芳，蔣慧

(深圳華大基因，深圳 518083)

目的 制定一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的嵌合比例檢測(cè)曲線，以用于植入前篩查(PGS)中更加精準(zhǔn)地選擇健康的胚胎進(jìn)行移植，進(jìn)而提高臨床妊娠率及降低出生缺陷率。 方法 選用購(gòu)買(mǎi)的5株商業(yè)化的CNV細(xì)胞系及2株正常男女性外周血細(xì)胞系，配置100%、70%、60%、40%、20%、0%的6個(gè)梯度嵌合比例；本批樣本采用華大基因開(kāi)發(fā)的胚胎植入前檢測(cè)試劑盒(Embro-seq PGS kit)進(jìn)行WGA擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建，采用BGISEQ-500測(cè)序儀進(jìn)行全基因組低深度測(cè)序，采用自主開(kāi)發(fā)的CNV分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。 結(jié)果 5株細(xì)胞系的相應(yīng)CNV在6個(gè)嵌合梯度的平均拷貝率分別是0.98、0.89、0.83、0.76、0.73和0.57。 結(jié)論 本研究繪制了一個(gè)不同嵌合比例的拷貝率曲線，為臨床PGS檢測(cè)中胚胎的嵌合性評(píng)估提供了一種相對(duì)準(zhǔn)確的參考方法，進(jìn)而可根據(jù)具體情況選擇更加健康的胚胎進(jìn)行移植以提高臨床妊娠率及降低出生缺陷發(fā)生率。

植入前胚胎移植； 嵌合胚胎； 嵌合曲線； 混合細(xì)胞系

(JReprodMed2017，26(4)：328-330)

在輔助生殖技術(shù)中，染色體非整倍性是引起移植失敗的重要原因[1-2]。目前新一代的植入前胚胎篩查技術(shù)(PGS)比較基因組雜交和新一代測(cè)序技術(shù)都能同時(shí)檢測(cè)胚胎的24條染色體的非整倍性情況[3-9]。另外，在PGS中也經(jīng)常發(fā)現(xiàn)染色體嵌合現(xiàn)象[10]。

囊胚活檢時(shí)通常取3～10個(gè)外滋養(yǎng)層細(xì)胞，由于外滋養(yǎng)層細(xì)胞間的染色體核型異質(zhì)現(xiàn)象，所以PGS檢測(cè)的細(xì)胞樣本中可能會(huì)有嵌合現(xiàn)象。然而，不同比例的嵌合的臨床意義不同，高比例的嵌合異常通常不建議進(jìn)行移植。2016年的植入前胚胎診斷(PGD)指南定義20%以下的嵌合為正常核型，而80%以上的嵌合認(rèn)為是非整倍體，建議實(shí)驗(yàn)室對(duì)20%～80%之間的嵌合度進(jìn)行檢測(cè)[11]。但目前尚無(wú)準(zhǔn)確評(píng)估胚胎嵌合性的檢測(cè)技術(shù)。

本研究的目的是通過(guò)正常及異常核型的細(xì)胞系按不同比例混合，制定一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的嵌合比例檢測(cè)曲線，以期用于PGS中更加精準(zhǔn)地檢測(cè)胚胎的嵌合性，進(jìn)而選擇健康的胚胎進(jìn)行移植，提高臨床妊娠率及降低出生缺陷率。

材料與方法

一、材料

選用購(gòu)買(mǎi)的5株商業(yè)化的異常細(xì)胞系(Coriell Institute，美國(guó))，已知核型分別是del(7)-25.3M、del(10)-14.1M、del(13)-18.3M、del(15)-4.9M、del(17)-5.8M；以及2株正常核型男女性外周血細(xì)胞系，核型分別是46，XX和46，XY。

二、方法

1.嵌合胚胎模擬：用顯微操作儀(Eppendorf，美國(guó))，按比例挑選一定數(shù)量的異常核型細(xì)胞和正常核型細(xì)胞進(jìn)行混合，模擬的細(xì)胞嵌合比例分別是10：0、7：3、6：4、4：6、2：8和0：10；每一個(gè)混合比例的總細(xì)胞數(shù)為10，配置100%、70%、60%、40%、20%、0%的6個(gè)梯度的嵌合比例(圖1)。

圖1 不同嵌合比例混合細(xì)胞樣本檢測(cè)流程圖

2.WGA擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建：本批樣本采用華大基因開(kāi)發(fā)的胚胎植入前檢測(cè)試劑盒(Embro-seq PGS kit)進(jìn)行WGA擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建[12-13]。

3.NGS測(cè)序和信息分析：本實(shí)驗(yàn)采用華大自主開(kāi)發(fā)的BGISEQ-500測(cè)序儀進(jìn)行全基因組低深度測(cè)序，并采用自主開(kāi)發(fā)的Embro-seq PGS kit 配套CNV分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析[12-13]。

結(jié) 果

結(jié)合不同的模擬嵌合度，計(jì)算每個(gè)樣本已知CNV的拷貝率：(1)細(xì)胞系del(7)-25.3M：嵌合比例從100%到0%，目標(biāo)CNV的拷貝率分別是0.98、0.92、0.86、0.78、0.74、0.50；(2)細(xì)胞系del(10)-14.1M：嵌合比例從100%到0%，目標(biāo)CNV的拷貝率分別是0.97、0.88、0.83、0.79、0.69、0.56；(3)細(xì)胞系del(13)-18.3M：嵌合比例從100%到0%，目標(biāo)CNV的拷貝率分別是0.93、0.88、0.82、0.73、0.70、0.54；(4)細(xì)胞系del(15)-4.9M：嵌合比例從100%到0%，目標(biāo)CNV的拷貝率分別是1.00、0.81、0.72、0.72、0.69、0.62；(5)細(xì)胞系del(17)-5.8M：嵌合比例從100%到0%，目標(biāo)CNV的拷貝率分別是1.01、0.84、0.77、0.67、0.68、0.54(表1)。

綜上所述，5個(gè)細(xì)胞系嵌合比例從100%到0%，相對(duì)應(yīng)目標(biāo)CNV的平均拷貝率分別是0.98、0.89、0.83、0.76、0.73、0.57。

討 論

嵌合胚胎中同時(shí)存在整倍性細(xì)胞和非整倍性細(xì)胞，嵌合胚胎對(duì)表型的影響往往取決于三個(gè)方面：嵌合程度、所嵌合的染色體類(lèi)型、嵌合細(xì)胞的分布[14]。本研究針對(duì)嵌合程度的檢測(cè)繪制了一個(gè)不同嵌合比例和拷貝率之間的相關(guān)曲線，6個(gè)不同嵌合比例樣本的拷貝率有明顯逐漸遞減的趨勢(shì)，相鄰梯度間可明顯區(qū)分，為PGS檢測(cè)中胚胎的嵌合性評(píng)估提供了一種相對(duì)準(zhǔn)確的參考方法。

表1 不同比例嵌合度對(duì)應(yīng)CNV的拷貝率

按照2016年的PGD指南定義，20%以下的嵌合可認(rèn)為是正常核型可進(jìn)行移植，而80%以上的嵌合則認(rèn)為是非整倍體不建議移植，對(duì)20%～80%之間的嵌合度需結(jié)合實(shí)際情況考慮[11]。Greco等[15]收集了18個(gè)IVF家系，該18個(gè)家系胚胎的共同點(diǎn)是，所有胚胎均為非整倍性或嵌合胚胎，嵌合程度各不相同，在獲得受試者的知情同意后，選擇一些狀態(tài)較好、嵌合程度低(小于50%)的胚胎進(jìn)行植入，18個(gè)家系中，6個(gè)家系出生正常核型的胎兒。該研究表明，在一些較極端的情況下如多個(gè)IVF周期均無(wú)完全正常的胚胎可用時(shí)，可以考慮嵌合胚胎進(jìn)行移植。

綜上所述，雖然胚胎嵌合對(duì)移植后及胚胎發(fā)育的潛在影響尚不明確，但臨床上一般不考慮移植嵌合胚胎，通常認(rèn)為嵌合胚胎會(huì)降低IVF的成功率。本研究提供了一個(gè)檢測(cè)胚胎嵌合程度的方法，若在極端情況下需要移植嵌合胚胎，應(yīng)綜合考慮胚胎嵌合類(lèi)型和嵌合程度等因素進(jìn)行選擇，同等嵌合類(lèi)型的條件下，優(yōu)選選擇嵌合程度低的胚胎進(jìn)行移植。本研究只是細(xì)胞系混合的模擬樣本，但我們已收集了一些臨床樣本進(jìn)行檢測(cè)，正在追蹤收集臨床結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。

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[編輯：羅宏志]

Development of reference curve for different chimeric ratio by using mixed cell samples

QIUYong，CHENDa-yang，XIAJun，ZHUZhu，XIELin，SHIQian-yu，LIUPing*，DONGJie，CHENFang，JIANGHui

BeijingGenomicsInstituteinShenzhen，Shenzhen518083

Objective：To develop a standard curve of chimeric ratio for accurately selecting healthy embryos in preimplantation genetic screening (PGS) to improve clinical pregnancy rate and reduce the birth defect rate.Methods：The samples with six gradient chiming ratio of 100%，70%，60%，40%，20%，0% was configured by using 5 strains of commercial CNV cell lines and 2 strains of male and female normal peripheral blood cell lines. These samples were subjected to WGA amplification and library construction with BGI’s kit (Embro-seq PGS Kit) developed by the Beijing Genomics Institute. Whole genome sequencing was performed with BGISEQ-500 sequencer. Data were analyzed by self-developed CNV analysis software.Results：The average copy rates of the corresponding CNVs in the 6 samples with different gradient chimeric ratio were 0.98，0.89，0.83，0.76，0.73 and 0.57，respectivelyConclusions：A standard curve of chimeric ratio is developed，which can provide a relatively accurate reference method for assessment of embryo chimeric ratio in PGS. Therefore，the more healthy embryos can be chosen for transplantation in order to improve the clinical pregnancy rate and reduce the incidence of birth defects.

Preimplantation genetic screening； Chimeric embryo； Chimeric curve； Mixed cell lines

10.3969/j.issn.1004-3845.2017.04.007

2017-01-31；

2017-02-06

邱詠，女，湖北黃石人，碩士，生物化學(xué)與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè).(*

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