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        淺析SSR分子標記實驗操作

        2017-04-14 00:13:19張肖逢
        山西農經 2017年10期
        關鍵詞:玻璃板混合液硫酸銨

        □張肖逢 劉 姍

        (河北農業(yè)大學農學院 河北 保定 071000)

        淺析SSR分子標記實驗操作

        □張肖逢 劉 姍

        (河北農業(yè)大學農學院 河北 保定 071000)

        SSR是新興起的一種較為理想的遺傳標記技術,在科學研究中已經得到廣泛的應用。本文簡單介紹了SSR分子標記的實驗過程,以期為SSR分子標記技術的普及而服務。

        SSR;PCR擴增;步驟

        1SSR實驗步驟

        常用的DNA提取主要有:CTAB法和SDS法。提取過程中要減少物理、化學等因素對核酸結構的破壞,也要防止核酸自身的生物降解。

        1.2 引物的篩選

        為了提高PCR擴增的效率,引物分為正、反兩類?,F(xiàn)在可直接從公司購買。

        1.3 PCR擴增

        擴增反應體系為15μl,包含3μl模板DNA、7.5μlMIX、正反引物各0.5μl和超純水3.5μl(在冰板上進行)。反應程序:①95℃預變性5min②94℃變性30s③55℃退火30s④72℃延伸30s,②③④這三個步驟循環(huán)35次,⑤72℃延伸10min,可在4℃過夜。

        1.4 電泳(以變性聚丙烯胺凝膠電泳為例)

        1.4.1 實驗中所用試劑及其配制。變性膠的配制:40%丙烯酰胺150ml、5×TBE200ml、尿素420.24g三種試劑混合,加蒸餾水至1 000ml,用玻璃棒攪拌至溶液變澄清即可。變性膠不需要現(xiàn)配現(xiàn)用。丙烯酰胺有毒,配制過程中要戴手套。

        學校教師不僅是知識的提供者,也承擔著培養(yǎng)和提高大學生綜合素質的重要任務。不管是院校的領導還是工作在一線的教師,無論是教學管理人員還是后勤服務人員,都必須意識到自己在禮儀教育上的重要作業(yè),在教學活動和日常生活中注重自己的言行,不斷加強禮儀修養(yǎng)、以身作則。這種氛圍不可避免地會影響每個大學生的言行。

        過硫酸銨的配制:超純過硫酸銨2g在超純水18ml中溶解并混合均勻,可放置在4℃中保存。

        TEMED:購買后可直接使用。

        銀染溶液:取4g硝酸銀充分溶于2 000ml蒸餾水,實驗過程中可重復使用,染色9~12塊板換一次。

        顯色溶液:取30g氫氧化鈉充分溶于2 000ml蒸餾水中,放入膠板前加入8ml甲醛。甲醛具有揮發(fā)性且有毒,實驗時帶好口罩并打開通風扇。

        1.4.2 實驗步驟。

        1.4.2.1 玻璃板準備及灌膠

        1)玻璃板擦拭:將玻璃板放置于水平界面,將待用的兩面玻璃板用2ml95%無水酒精擦拭一遍。取1.5ml95%無水酒精、10μl0.5%冰醋酸和10μl親和硅烷于2mlEP管內,混合均勻(現(xiàn)配現(xiàn)用)倒在親水玻璃板(平板)用紙巾涂抹均勻。同理,將500μl剝離硅烷在疏水玻璃板(凹板)上用同樣的方法均勻涂抹。之后進行玻璃板的組裝。

        2)玻璃板的組裝:在平板的兩邊邊緣各放置一個配套的塑料條,再將凹板涂有剝離硅烷的一面蓋在平板上,兩邊各用兩個大夾子夾住兩塊玻璃板。

        3)配制凝膠:100ml變性膠、過硫酸銨200μl和100μlTEMED(兩塊板)迅速輕輕搖晃混合均勻,混勻后立即灌膠。此過程中的過硫酸銨和TEMED分別是加速劑和催化劑,適當的增加可以加速混合液的凝結,建議初學者適當減少過硫酸銨和TEMED的用量。

        4)灌膠:用50ml大注射器吸取配制好的膠的混合液,將注射器里面的空氣排出,直接用注射器注入,注入時,控制推動力度均勻防止產生氣泡,可拍打凹板上面加速混合液的流動。若有剩余的混合液不可倒入水池內,以免膠凝后堵塞下水道。

        5)靜置:待灌膠完成后,迅速在兩個玻璃板之間插入梳子無齒端,在插入過程中要注意不要產生氣泡。靜置至少1h。

        1.4.2.2 凝膠電泳

        1)待膠凝好后,拔下梳子和去除大夾子,用水清洗玻璃板兩面,以去除殘余的凝膠。插上梳子的另一端。插好后,放在電泳槽內,正負極槽內加入適宜的1×TBE。

        2)為清除凝膠內的雜質,預電泳10min,電壓2000V、電流200mA、功率120W、TIME模式(兩塊板)。

        3)預電泳結束后,關閉電源,用100μl的槍將膠內的氣泡打出。

        4)點樣:加入3μlPCR擴增之后的DNA樣品和1~3個Marker。

        5)電泳:電壓2 000V、電流200mA、功率120W(兩塊板)電泳1.5h(指示帶跑完整個膠板)。

        1.4.2.3 銀染

        電泳完畢之后,先將上槽液回收,取下膠板,小心分開兩塊膠板。將平板放入染色液中染色7min,將平板取出用蒸餾水清洗一下,然后放入顯色液中,待膠顯出條帶后取出,為使染色和顯影均勻,將染色液和顯影液放在搖床上。將銀染好的膠板讀板并進行拍照記錄。

        結束語

        SSR分子標記操作簡單,實驗重復性好,結果可靠。作為當今社會新興起的一種較為理想的遺傳標記技術,我們應盡可能的了解它的優(yōu)點,使它在科研中發(fā)揮最大的用處。

        1004-7026(2017)10-0101-01

        S511

        A

        10.16675/j.cnki.cn14-1065/f.2017.10.072

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