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        精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀及其可視化分析

        2017-03-21 08:45:50,,,
        關(guān)鍵詞:類團(tuán)精準(zhǔn)論文

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        1 引言

        2007年,美國系統(tǒng)生物學(xué)研究所創(chuàng)始人Leroy Hood教授提出“P4醫(yī)學(xué)模式”,后來增加第5個(gè)P,即精準(zhǔn)[1]。精準(zhǔn)醫(yī)療于2011年在美國國家研究委員會(huì)的《邁向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué):建立生物醫(yī)學(xué)與疾病新分類學(xué)的知識(shí)網(wǎng)絡(luò)》中正式提出[2],隨后制定了“百萬美國人基因組計(jì)劃”與“電子病歷與基因組網(wǎng)絡(luò)”等一系列規(guī)劃[3]。美國總統(tǒng)奧巴馬于2015年1月20日宣布“精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃”,計(jì)劃2016年投入2.15億美元,開啟“個(gè)性化醫(yī)療”的新時(shí)代[4]。2015年2月我國成立了由19名專家組成的中國精準(zhǔn)醫(yī)療戰(zhàn)略專家組,同年3月科技部組織召開了首次精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專家會(huì)議,會(huì)上提出要在2030年前投資600億人民幣用于精準(zhǔn)醫(yī)療研究[5]。英國政府于2012年提出“10萬人基因組計(jì)劃”,該計(jì)劃由英國基因組(Genomics England)的國有公司負(fù)責(zé)實(shí)施,旨在對(duì)英國國民醫(yī)療保健制度(NHS)記錄中的10萬名患者的完整基因組進(jìn)行測(cè)序研究[6]。

        精準(zhǔn)醫(yī)療著眼于個(gè)體基因、生活方式和環(huán)境等區(qū)別,融合大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)研究,個(gè)性化、精準(zhǔn)地進(jìn)行疾病預(yù)防與治療,從而有效利用醫(yī)療資源,提高醫(yī)療水平。隨著高通量生物技術(shù)、各類組學(xué)與生物信息學(xué)、系統(tǒng)學(xué)方法的快速發(fā)展,精準(zhǔn)醫(yī)療正逐漸成為未來醫(yī)療發(fā)展的新范式[7]。

        科學(xué)計(jì)量學(xué)[8-13]是以某學(xué)科領(lǐng)域?yàn)檠芯繉?duì)象,以科技文獻(xiàn)的各種外部特征(如發(fā)文趨勢(shì)、合著、來源期刊、主題詞等)為研究對(duì)象,采用數(shù)理統(tǒng)計(jì)方法,借助計(jì)量學(xué)指標(biāo)進(jìn)行定量分析,客觀地描述學(xué)科領(lǐng)域的研究成果、揭示學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展現(xiàn)狀、探討學(xué)科發(fā)展的定量規(guī)律。目前,該定量研究方法已應(yīng)用于多個(gè)領(lǐng)域,用于衡量學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展現(xiàn)狀,同時(shí)為該領(lǐng)域的發(fā)展提供數(shù)據(jù)支持和定量依據(jù)。

        伴隨著醫(yī)療大數(shù)據(jù)發(fā)展,精準(zhǔn)醫(yī)療在國內(nèi)外迅速發(fā)展,各國相繼提出精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)研究計(jì)劃。為了解近年來精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域發(fā)展情況,本文對(duì)已發(fā)表的精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)論文,從文獻(xiàn)產(chǎn)出的角度,分析該領(lǐng)域發(fā)展的演化趨勢(shì)以及該領(lǐng)域的發(fā)展現(xiàn)狀。

        2 數(shù)據(jù)與方法

        2.1 數(shù)據(jù)來源

        采用的數(shù)據(jù)為MEDLINE數(shù)據(jù)庫中有關(guān)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的文獻(xiàn)集合。MEDLINE數(shù)據(jù)庫是生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域公認(rèn)的權(quán)威數(shù)據(jù)庫,其MeSH 詞表也是醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最權(quán)威的主題詞表,該數(shù)據(jù)庫支持MeSH 詞表和 CAS 注冊(cè)號(hào)進(jìn)行精確檢索;論文可鏈接到 NCBI 數(shù)據(jù)庫與 PubMed 相關(guān)論文,文獻(xiàn)回溯至 1950 年。

        檢索方法為:選擇MeSH主題詞檢索,在主題詞表中選擇Precision Medicine,出版時(shí)間選擇2008-2016年,出版物類型限定為Article、Review,經(jīng)去重整理共獲取7263條記錄,檢索日期是2016年12月20日。

        2.2 研究方法

        本文采用Excel、Ucinet和SciMAT等數(shù)據(jù)分析及可視化軟件,從發(fā)文量變化趨勢(shì)、國家/地區(qū)分布、機(jī)構(gòu)分析、來源期刊分布、作者合作、被引分析、關(guān)鍵詞7個(gè)角度對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的文獻(xiàn)集合進(jìn)行計(jì)量分析,從而把握精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的分布特征。其中,通過發(fā)文量的變化趨勢(shì)可以了解該領(lǐng)域內(nèi)論文數(shù)量變化情況及發(fā)展速度;國家/地區(qū)、機(jī)構(gòu)分布指標(biāo)可反映出在該領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位的國家和機(jī)構(gòu);來源期刊分布可以了解該領(lǐng)域發(fā)表的核心期刊;被引分析則可以反映該領(lǐng)域內(nèi)發(fā)表的論文的影響力;利用關(guān)鍵詞統(tǒng)計(jì)及共現(xiàn)分析可以反映該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)及其主題演化趨勢(shì)。

        3 結(jié)果分析

        3.1 論文數(shù)量變化趨勢(shì)

        MEDLINE數(shù)據(jù)庫中收錄精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)領(lǐng)域的最早論文發(fā)表于2008年,2002-2010年是精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展的萌芽期,文獻(xiàn)量較少。從2011年開始,精準(zhǔn)醫(yī)療的論文量開始快速增長,2012-2015年是該領(lǐng)域迅速發(fā)展期;從2012年開始,關(guān)于精準(zhǔn)醫(yī)療的研究論文穩(wěn)定增長。

        3.2 主要國家/地區(qū)分布情況

        通過對(duì)第一作者通訊地址信息清洗,去除第一作者信息缺失,第一作者國別/機(jī)構(gòu)完整的共有6 654條記錄,這些記錄是本研究的信息源。通過統(tǒng)計(jì)分析,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域發(fā)表的論文主要來自全球57個(gè)國家或地區(qū)。排名前20的國家或地區(qū)發(fā)表的論文數(shù)據(jù)見表1。就發(fā)文量看,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域中,美國處于領(lǐng)先地位,發(fā)文量遠(yuǎn)超其他國家,占總發(fā)文量的35.3%。英國、德國、意大利、中國、荷蘭、法國、加拿大緊隨其后,占總發(fā)文量的30.0%。西班牙、日本、澳大利亞等在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域也有突出成績(jī),這20個(gè)國家共發(fā)論5 417篇,占全部論文的91.4%。在排名前20的國家中有中國、日本、韓國和印度4個(gè)亞洲國家,中國研究機(jī)構(gòu)發(fā)表的論文總數(shù)最多僅指中國內(nèi)地,未包括香港、澳門和臺(tái)灣地區(qū)。

        表1 排名前20的國家或地區(qū)發(fā)表論文數(shù)量

        3.3 研究機(jī)構(gòu)分布

        通過對(duì)研究機(jī)構(gòu)名稱進(jìn)一步規(guī)范,得到關(guān)于精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域依據(jù)發(fā)文量的研究機(jī)構(gòu)排名情況,排名前20的機(jī)構(gòu)及其發(fā)文量見表2。從表2中發(fā)現(xiàn)發(fā)文最多的機(jī)構(gòu)是斯坦福大學(xué)、德克薩斯大學(xué);緊隨其后的是美國梅奧醫(yī)學(xué)中心、加利福尼亞大學(xué)和哈佛大學(xué)。排名前20的機(jī)構(gòu)共發(fā)文561篇,占總發(fā)文量的8.45%;在排名前20的機(jī)構(gòu)中,從國家/地區(qū)分布來看,來自英國、加拿大、荷蘭的研究機(jī)構(gòu)分別有1、2、1個(gè);其余均為美國的科研院校機(jī)構(gòu),這也與美國總發(fā)文量遙遙領(lǐng)先有一定的關(guān)系。

        表2 排名前20的機(jī)構(gòu)發(fā)文量

        3.4 來源出版物分析

        分析來源期刊有助于確定研究領(lǐng)域的核心期刊或重要情報(bào)源,為該領(lǐng)域信息采集提供依據(jù),同時(shí)一定程度上也反映該領(lǐng)域的橫向研究程度、相關(guān)主題的性質(zhì)等。統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,刊載精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)領(lǐng)域論文超過14篇的期刊有92種期刊,其發(fā)文量之和約占總發(fā)文量的1/3,根據(jù)布拉德福定律,這92種期刊處于精準(zhǔn)醫(yī)療研究論文的核心區(qū),屬于該領(lǐng)域的重要情報(bào)源。其中,排名前10的均為高影響力期刊(表3),如Nature為四大名刊之一,其刊載論文的學(xué)術(shù)質(zhì)量較高、輻射影響較大,一定程度上對(duì)該領(lǐng)域的研究和發(fā)展有重要引領(lǐng)與推動(dòng)作用。

        表3 排名前10的來源出版物及其發(fā)文量

        3.5 作者合著分析

        1 460篇論文由一位作者獨(dú)立完成,占全部論文的20.1%,剩余均由多位作者合作完成。其中,2 431篇論文由2~3人合作完成,占全部論文的33.5%;1 334篇論文由4~5人合作完成,占全部論文的18.4%;作者超過5人的論文量為2 031篇,占全部論文的28.0%,而作者合作數(shù)最多的達(dá)到180人??偠灾?,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的作者合著現(xiàn)象較為普遍。本研究選取發(fā)文量超過5篇的作者,利用Bibexcel生成作者共現(xiàn)矩陣,然后將其導(dǎo)入U(xiǎn)cinet中,繪制作者合著網(wǎng)絡(luò)圖(圖1)。

        在社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析中網(wǎng)絡(luò)密度用于評(píng)價(jià)網(wǎng)絡(luò)圖中節(jié)點(diǎn)間的緊密程度。利用Ucinet,通過Network-Cohesion-Density-Old Density Procedure,計(jì)算出作者合著網(wǎng)絡(luò)圖的密度為0.0085,表明精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域作者合著的網(wǎng)絡(luò)規(guī)模較大,但其網(wǎng)絡(luò)密度稀疏,合著網(wǎng)絡(luò)圖中節(jié)點(diǎn)間未形成普遍、密切的交流關(guān)系。網(wǎng)絡(luò)的平均距離指網(wǎng)絡(luò)中所有節(jié)點(diǎn)間最短路徑的平均長度[12]。合著網(wǎng)絡(luò)的平均距離是衡量整個(gè)網(wǎng)絡(luò)聯(lián)系緊密程度和信息傳播速度的重要指標(biāo),平均距離越短,網(wǎng)絡(luò)聯(lián)系越緊密,信息傳播速度也越快。通過Network-Cohesion-Density-Geodesic Distances計(jì)算作者合著網(wǎng)絡(luò)圖的平均距離為3.7,即任意兩個(gè)作者平均只需通過4人即可建立相互聯(lián)系。一般合著網(wǎng)絡(luò)平均距離不超過10,即可認(rèn)為該網(wǎng)絡(luò)有“小世界效應(yīng)”,相對(duì)而言,3.7是一個(gè)較小的網(wǎng)絡(luò)距離,表明精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域合著網(wǎng)絡(luò)的小世界效應(yīng)顯著[13]。

        圖1 精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域作者合著網(wǎng)絡(luò)

        3.6 被引分析

        論文的被引頻次是評(píng)價(jià)論文影響力的重要指標(biāo)之一。截止至本文檢索日,被引頻次最高的論文是“Erlotinib versus standard chemotherapy as first-line treatment for European patients with advanced EGFR mutation-positive non-small-cell lung cancer (EURTAC): a multicentre,open-label,randomised phase 3 trial”,總被引頻次為1463。105篇論文的被引次數(shù)超過100次,占全部論文的1.5%;69篇為高被引論文(SCI認(rèn)定的高被引論文),排名前10的文章信息見表4;3篇為熱點(diǎn)論文(SCI認(rèn)定的熱點(diǎn)論文),文章信息見表5;被引頻次為零的論文共計(jì)1 601篇,占全部論文的22.0%。截至檢索日期,共10篇高被引文章、3篇熱點(diǎn)文章,13篇文章的總被引頻次為7 476,美國的總被引頻次最高,為2 532(占比33.9%),其次西班牙和意大利的總被引頻次分別1 463、793(占比19.6%、9.8%)。表明美國該領(lǐng)域的研究有很高的影響力。

        表4 國際精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域高被引論文列表

        表5 國際精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域熱點(diǎn)論文列表

        3.7 主題分析

        關(guān)鍵詞作為學(xué)術(shù)論文研究主題的精煉表達(dá),是論文的高度濃縮,對(duì)某研究領(lǐng)域科技文獻(xiàn)的分析中,出現(xiàn)頻次高的關(guān)鍵詞通常被認(rèn)為是某領(lǐng)域的熱點(diǎn),其關(guān)聯(lián)性一定程度上可以揭示學(xué)科領(lǐng)域中知識(shí)的內(nèi)在聯(lián)系[14]。

        3.7.1 研究領(lǐng)域分析

        Medline數(shù)據(jù)庫依據(jù)文獻(xiàn)重點(diǎn)將精準(zhǔn)醫(yī)療學(xué)科劃分為106個(gè)細(xì)分研究領(lǐng)域,分析細(xì)分研究領(lǐng)域的分布情況,了解該領(lǐng)域的重點(diǎn)研究方向。精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域研究主要集中在基因和遺傳學(xué)、藥理學(xué)與藥劑學(xué)、腫瘤學(xué)三大細(xì)分領(lǐng)域。

        統(tǒng)計(jì)主題詞詞頻,依據(jù)主題詞的相似度以及詞頻變化情況,將文獻(xiàn)分為2008-2010年、2011-2013年、2014-2016年等3個(gè)時(shí)區(qū),統(tǒng)計(jì)不同時(shí)間段內(nèi)高頻關(guān)鍵詞,表6列出排名前10的主題詞以及其詞頻。2008-2010年主題詞詞頻明顯過少是由于該時(shí)間段內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的發(fā)文量較少。

        表6 三個(gè)時(shí)間段精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域高頻關(guān)鍵詞統(tǒng)計(jì)

        3.7.2 研究主題分析

        將精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域文獻(xiàn)分為2008-2010年、2011-2013年、2014-2016年為3個(gè)時(shí)間段,通過關(guān)鍵詞變化、主題類團(tuán)演進(jìn)以及研究主題成熟度分析了解精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的主題研究現(xiàn)狀。

        3.7.2.1 關(guān)鍵詞變化

        主要關(guān)鍵詞重疊圖清晰地反映三個(gè)時(shí)間段內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域關(guān)鍵詞新生和消亡的變化情況,水平箭頭上方數(shù)字代表兩個(gè)階段均存在的主要關(guān)鍵詞數(shù)量和百分比,斜上箭頭旁數(shù)字表示消失的關(guān)鍵詞數(shù)量,斜下箭頭旁數(shù)字的涵義是新生關(guān)鍵詞數(shù)量[15]。圖2是利用SciMAT 繪制的精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域3個(gè)階段的主要關(guān)鍵詞重疊圖,從左至右分別為2008-2010年、2011-2013年、2014-2016年。圖2顯示,三階段的新生關(guān)鍵詞大于消亡關(guān)鍵詞,主要關(guān)鍵詞不斷增長,表明精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的研究?jī)?nèi)容在不斷豐富。

        圖2 精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域3個(gè)階段主要關(guān)鍵詞重疊情況

        3.7.2.2 主要關(guān)鍵詞演化分析

        類團(tuán)進(jìn)化圖反映3個(gè)階段內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域關(guān)鍵詞類團(tuán)的分裂、合并的演化,實(shí)線代表兩個(gè)類團(tuán)有共同的主要關(guān)鍵詞,虛線表示兩個(gè)類團(tuán)有共同的次要關(guān)鍵詞,其次線的粗細(xì)與兩個(gè)類團(tuán)經(jīng)過Inclusion Index標(biāo)準(zhǔn)化后值大小成正比,節(jié)點(diǎn)大小表明該類團(tuán)包含的論文數(shù)量[15]。圖3是利用SciMAT 繪制的精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域3個(gè)階段的類團(tuán)進(jìn)化圖,從左至右分別為2008-2010年、2011-2013年、2014-2016年。從圖3可以看出,類團(tuán)隨時(shí)間推移增加,表明研究?jī)?nèi)容逐漸豐富。從這些類團(tuán)可以看出精準(zhǔn)醫(yī)療研究具有以下特征:以治療為基礎(chǔ)(如drug-effects、therapy等類團(tuán));個(gè)性化群體研究(如Middle aged、male、female);強(qiáng)調(diào)以人為中心(如humans等)。從進(jìn)化來看,其中Precision medicine在3個(gè)階段中均為較大類團(tuán),并且連接線逐漸變粗,表示研究?jī)?nèi)容隨時(shí)間推移較為穩(wěn)定。

        Drug在2008-2010年和2011-2013年兩階段內(nèi)連線最粗,然而2014-2016年該類團(tuán)消亡,而drug effects類團(tuán)出現(xiàn),經(jīng)查閱相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),在2008-2010年期間,drug雖然是高頻關(guān)鍵詞,獨(dú)自成為一類團(tuán),但相關(guān)論文中是以某方面疾病的藥物治療研究為主要內(nèi)容,如以白血病為研究對(duì)象,經(jīng)過新舊不同藥物治療,證明針對(duì)異常表觀遺傳標(biāo)記是一種可行的預(yù)防和治療方法;隨著研究深入,學(xué)者著眼于某疾病的具體方面,基于臨床試驗(yàn),研究更有利于疾病治療的方法,如抗腫瘤T細(xì)胞研究,通過靶向治療,成功地瞄準(zhǔn)了免疫檢查點(diǎn),使癌癥患者釋放出抗腫瘤T細(xì)胞反應(yīng),使治療取得顯著成效;Lung neoplass(肺腫瘤)、dlabetes mellitus(糖尿病)具體疾病類團(tuán)在第三階段分化出現(xiàn),成為獨(dú)立類團(tuán),經(jīng)查閱相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),在2008-2013年兩個(gè)時(shí)間段內(nèi),類團(tuán)中雖然并未出現(xiàn)具體疾病類團(tuán),但經(jīng)過上述闡述可知,主要是以藥物和藥物治療效果為關(guān)鍵詞,但具體研究是以疾病為主要研究對(duì)象,論文關(guān)鍵詞不能以過于宏觀的詞語表達(dá),學(xué)者對(duì)于關(guān)鍵詞的提取也更加具有針對(duì)性;這些研究都表明精準(zhǔn)醫(yī)療研究是以具體疾病為導(dǎo)向,研究?jī)?nèi)容更加精細(xì)。DNA從2011-2013年出現(xiàn),2011-2013年和2014-2016年兩階段內(nèi)類團(tuán)連線最粗,表明該部分研究穩(wěn)定推進(jìn),經(jīng)查閱相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),DNA在3個(gè)階段內(nèi)關(guān)鍵詞頻次逐漸升高,并且從2011-2013年到2014-2016年期間內(nèi)增長率明顯提升,通過閱讀DNA研究相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),關(guān)于DNA的研究經(jīng)過對(duì)基因組信息的測(cè)序,發(fā)展到相關(guān)疾病的基因組信息,到目前利用疾病基因信息,利用相關(guān)技術(shù),研究發(fā)現(xiàn)相關(guān)疾病的發(fā)展,測(cè)試其篩查技術(shù),將遺傳基因與臨床結(jié)合研究,基因測(cè)試技術(shù)和基因組學(xué)與臨床的結(jié)合研究成為該領(lǐng)域新的研究方向。

        Middle aged在2011-2013年,分裂為middle aged和female,然后在2014-2016年進(jìn)化為middle aged、male、female,查閱相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),2008-2010年期間,精準(zhǔn)醫(yī)療的個(gè)性化治療研究主要內(nèi)容是不同較少數(shù)人的個(gè)性化治療,并發(fā)現(xiàn)不同性別之間存在差異,在2011-2016年內(nèi),基于基因信息的不斷完善,學(xué)者開始以不同性別人群為研究對(duì)象設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn)組,發(fā)現(xiàn)其疾病病變的不同,更加有針對(duì)性的進(jìn)行分析研究;這都表明精準(zhǔn)醫(yī)療研究對(duì)象隨著研究的深入更加細(xì)化,逐步針對(duì)不同疾病、細(xì)化研究對(duì)象而開展個(gè)性化預(yù)防治療研究。

        Humans類團(tuán)在2008-2010 年最重要的關(guān)鍵詞是“adverse effect”,在2011-2016 年最重要的關(guān)鍵詞變?yōu)榱恕癏umans”,經(jīng)查閱相關(guān)論文發(fā)現(xiàn),“adverse effect”在數(shù)據(jù)集中的主要意義為“對(duì)人體健康的不利作用”,屬于“人類”主題的關(guān)鍵方向,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域論文主要是利用現(xiàn)代醫(yī)療技術(shù),以人類的相關(guān)疾病為主要研究對(duì)象,發(fā)現(xiàn)疾病的產(chǎn)生、病變,從而運(yùn)用不同的治療方式進(jìn)行疾病的預(yù)防治療,主要是為人類的健康服務(wù),體現(xiàn)了精準(zhǔn)醫(yī)療以人為中心的研究特征。

        3.7.2.3 主題成熟度分析

        戰(zhàn)略坐標(biāo)圖主要用于描述某一研究領(lǐng)域內(nèi)部聯(lián)系情況及其細(xì)分領(lǐng)域間相互影響情況[16],可以反映精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域類團(tuán)的成熟度、核心度的演化情況,戰(zhàn)略坐標(biāo)圖中X軸的含義是向心度,衡量一個(gè)類團(tuán)與其他類團(tuán)的聯(lián)系程度;Y軸的含義是密度,衡量該類團(tuán)的成熟度;第一象限類團(tuán)代表該時(shí)間段內(nèi)該領(lǐng)域成熟度、核心度均高的研究主題。圖4-圖6是利用SciMAT 繪制的精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的主題戰(zhàn)略坐標(biāo)圖,a、b、c分別是2008-2010年、2011-2013年、2014-2016年精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)主題戰(zhàn)略圖。

        圖3 精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域3個(gè)階段類團(tuán)進(jìn)化情況

        從圖4可以看出,2008-2010年精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的核心類團(tuán)有:genetics(遺傳)、drug-therapy(藥物療法)、therapeutic use(應(yīng)用治療),這些類團(tuán)是該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),可以帶動(dòng)其余相關(guān)主題的發(fā)展;Precision-medicine(精準(zhǔn)醫(yī)療)、pathology(病理)是精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域潛力類團(tuán),是該領(lǐng)域的研究重點(diǎn),其成熟度較低;Middle aged(中年)、biomarkers(生物指標(biāo))、methods(方法)、pharmacogenetics(遺傳藥理)是精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的邊緣類團(tuán),處于該研究領(lǐng)域的邊緣地區(qū)。

        從圖5可以看出,2011-2013年精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的核心類團(tuán)有:Middle-aged 、pathology(病理)、tumor(腫瘤),其中therapeutic use繼續(xù)保持其高成熟度和核心度,pathology是由前一階段的潛力類團(tuán)發(fā)展而來。humans(人類)、Precision-medicine(精準(zhǔn)醫(yī)療)是精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域潛力類團(tuán),genetics由核心類團(tuán)演化為潛力類團(tuán),表明其核心度有所下降。drug(藥物)、DNA、polymorphism(多樣性)、therapy(治療)、methods(方法)是精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的邊緣類團(tuán)。

        從圖6可以看出,2014-2016年精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的核心類團(tuán)有:Middle-aged、pathology,該階段核心類團(tuán)并未增加。adverse effect(不利作用)、antineoplastic agents(抗腫瘤藥物)是新增潛力類團(tuán),Humans、genetics與之前所處位置相同,但其成熟度略有下降。精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域潛力類團(tuán),是該領(lǐng)域的研究重點(diǎn),其成熟度還處于較低水平;antibodies(抗體)、abetes mellitus(糖尿病)是新增邊緣類團(tuán)。從3個(gè)階段的研究熱點(diǎn)變化來看precision-medicine、Middle-aged、humans是該領(lǐng)域的研究核心,此外研究?jī)?nèi)容呈現(xiàn)出越來越豐富的趨勢(shì)。

        圖4 2008-2010年精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)主題戰(zhàn)略

        圖5 2011-2013年精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)主題戰(zhàn)略

        圖6 20141-2016年精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)主題戰(zhàn)略

        利用SciMAT繪制重疊圖、類團(tuán)進(jìn)化圖、戰(zhàn)略圖,可以了解學(xué)科領(lǐng)域發(fā)展過程中關(guān)鍵詞的新生與消亡、類團(tuán)的合并分叉及新生與消亡,以及發(fā)展階段主題的成熟度和核心度[15]。本文通過SciMAT繪制本研究的重疊圖、類團(tuán)進(jìn)化圖和戰(zhàn)略圖,對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域 2008-2016 年的主題結(jié)構(gòu)和演化進(jìn)行初步探討分析。研究發(fā)現(xiàn)2008-2016年精準(zhǔn)醫(yī)療主要關(guān)鍵詞、研究類團(tuán)都在不斷增加,其研究?jī)?nèi)容也越來越豐富。2008-2010年研究?jī)?nèi)容為藥物療法、遺傳病理、生物指標(biāo)等方面,如經(jīng)過臨床研究和試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)新舊等不同藥物對(duì)疾病預(yù)防和治療有不同的效果;分析影響結(jié)果的機(jī)理因素,通過染色質(zhì)免疫沉淀和基因表達(dá)分析相結(jié)合的測(cè)序技術(shù),繪制表觀遺傳標(biāo)記的精確圖譜;運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)深入了解腫瘤細(xì)胞內(nèi)信號(hào)的傳導(dǎo)通路,從而改進(jìn)了新藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和可能的預(yù)后指標(biāo)和對(duì)治療的疾病反應(yīng);該時(shí)間段內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療較注重宏觀研究。

        2011-2013年研究?jī)?nèi)容向腫瘤、治療方法、多樣性等轉(zhuǎn)移,如深入了解腫瘤對(duì)靶向抗腫瘤藥物的耐藥機(jī)制,通過改進(jìn)臨床治療策略,提高臨床療效,表明新技術(shù)的使用可能加速個(gè)體化癌癥醫(yī)學(xué)的發(fā)展;雖然運(yùn)用新技術(shù),改進(jìn)臨床治療策略,提高了判斷疾病分期準(zhǔn)確性、早期功能預(yù)后和生存率,但治療方案的制定還需要以現(xiàn)有檢測(cè)結(jié)果為依據(jù),為各個(gè)階段和個(gè)體臨床情況提供明確的診斷和治療措施建議;此外有學(xué)者研究人類遺傳變異在個(gè)性化醫(yī)療中發(fā)揮作用,通過實(shí)驗(yàn)觀察,發(fā)現(xiàn)小分子的變化可能引起人類疾??;相比前階段研究?jī)?nèi)容更加細(xì)化,較注重微觀研究。

        2014-2016年研究?jī)?nèi)容更多是在基因相關(guān)技術(shù)、腫瘤治療、個(gè)性化等多方面,如結(jié)合基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了大量的基因突變促使了肺癌的發(fā)展、分子譜研究確定了基因產(chǎn)物及其突變預(yù)測(cè)腫瘤反應(yīng)的靶向治療;研究某原癌基因的發(fā)現(xiàn)、基因型和表型之間的關(guān)聯(lián),發(fā)揮其在診斷和治療中的作用;由于分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展和基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究的進(jìn)步,癌癥治療的個(gè)性化策略日益增多。通過基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)提供個(gè)性化、較為準(zhǔn)確的基因診斷信息,從而更有效地制定治療方案;通過針對(duì)靶向治療,分析藥物治療的個(gè)體化差異,有針對(duì)性地提出更有效的治療方法;表明精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的研究從藥物、病理等轉(zhuǎn)向藥物影響、基因測(cè)試等微觀研究,同時(shí)結(jié)合相關(guān)疾病開拓宏觀微觀相結(jié)合的學(xué)術(shù)研究。

        中年(Middle-aged)、人類(humans)是該領(lǐng)域成熟度和核心度最高的兩個(gè)類團(tuán),表明了該領(lǐng)域以人為中心的個(gè)性化研究。從3個(gè)階段的主題演化發(fā)現(xiàn),個(gè)性化疾病診斷治療研究逐漸成為該領(lǐng)域的主要研究方向。

        4 結(jié)論

        本文以精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域2008-2016年MEDLINE文獻(xiàn)數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過多角度的計(jì)量分析,了解該領(lǐng)域的相關(guān)研究現(xiàn)狀。通過研究分析發(fā)現(xiàn),自2008-2016年間,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的文獻(xiàn)數(shù)量呈現(xiàn)穩(wěn)步上升趨勢(shì),表明該領(lǐng)域的研究逐漸受到關(guān)注和重視。

        從地區(qū)及機(jī)構(gòu)分布來看,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域研究較為領(lǐng)先的國家主要有美國、德國、英國、德國、意大利、中國,其中美國的論文數(shù)量遠(yuǎn)多于其他國家的論文數(shù)量。美國研究機(jī)構(gòu)的發(fā)文量也最多,如斯坦福大學(xué)、德克薩斯大學(xué)、美國梅奧醫(yī)學(xué)中心的論文產(chǎn)出量居于國際前列;與此同時(shí),高被引論文和熱點(diǎn)論文中美國論文居多,其總被引頻次最高,這都表明了美國該領(lǐng)域的論文影響力較高。

        從發(fā)表期刊來看,Nature精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的主要來源期刊之一,其余期刊也均為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的知名期刊。知名期刊能提升論文影響力,促進(jìn)該領(lǐng)域研究成果的傳播,從而促進(jìn)該領(lǐng)域的整體發(fā)展。

        從作者合著情況來看,精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域研究多以團(tuán)隊(duì)合作形式出現(xiàn),該領(lǐng)域合著現(xiàn)象較為普遍;分析作者合著網(wǎng)絡(luò)圖,發(fā)現(xiàn)該領(lǐng)域作者團(tuán)體間雖具有明顯小世界網(wǎng)絡(luò)效應(yīng),但學(xué)者間學(xué)術(shù)溝通交流還有提升的空間。

        從研究主題演化來看,探討精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域研究主題的發(fā)展,以及3個(gè)時(shí)間段內(nèi)的研究重點(diǎn),研究發(fā)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療的研究?jī)?nèi)容更加具體,并且運(yùn)用遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等學(xué)科的知識(shí)技術(shù),結(jié)合醫(yī)療大數(shù)據(jù),進(jìn)行精準(zhǔn)、個(gè)性化的醫(yī)療研究;該領(lǐng)域主題方向眾多,關(guān)于其主題演化還有很多內(nèi)容有待進(jìn)一步探索。

        綜上,精準(zhǔn)醫(yī)療還處于快速發(fā)展階段,論文量快速增加、研究?jī)?nèi)容不斷豐富、作者合著網(wǎng)絡(luò)已初具規(guī)模,研究者之間學(xué)術(shù)溝通交流有待加強(qiáng)。MEDLINE數(shù)據(jù)庫中該領(lǐng)域來自中國論文不多,本文并未進(jìn)行國內(nèi)外對(duì)比研究,但從發(fā)文量和被引分析可知,我國雖然論文數(shù)量處于中上水平,但其國際影響力還有提升空間,這種情況可能由于國內(nèi)醫(yī)療數(shù)據(jù)還未完全開放共享。精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)借助醫(yī)療大數(shù)據(jù)、信息挖掘分析等技術(shù),增加學(xué)術(shù)交流活動(dòng),借助時(shí)代需求更好地開展學(xué)術(shù)研究。

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