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        基于SRAP標(biāo)記的白鶴芋屬資源鑒定與親緣關(guān)系分析

        2017-03-10 01:53:12劉小飛廖飛雄李冬梅劉曉榮
        廣東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年11期
        關(guān)鍵詞:親緣白鶴園藝

        劉小飛,廖飛雄,李冬梅,劉曉榮

        (1.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境園藝研究所/廣東省園林花卉種質(zhì)創(chuàng)新綜合利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510640;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院,廣東 廣州 510642)

        白鶴芋屬植物原產(chǎn)中南美洲和東南亞[1],是國際上重要的天南星科室內(nèi)觀葉觀花植物[2],具有獨(dú)特的開花特性。目前有關(guān)白鶴芋屬的研究主要集中在組織培養(yǎng)、栽培技術(shù)、種子萌芽特性、開花習(xí)性等方面[3-4]。有關(guān)白鶴芋屬植物種質(zhì)、系統(tǒng)演化和遺傳等方面研究報道并不多,而且市場上白鶴芋屬大多數(shù)品種名稱較混亂,難以從傳統(tǒng)分類的表型特征、譜系或地理來源等信息對其進(jìn)行分類。

        序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence-Related Amplified Polymorphism,SRAP)是一種基于PCR的分子標(biāo)記技術(shù),自建立以來已應(yīng)用于種質(zhì)資源的鑒定評價、遺傳多樣性與系統(tǒng)發(fā)育分析、品種指紋圖譜繪制等方面[5-10]。目前還未見有關(guān)白鶴芋屬SRAP標(biāo)記相關(guān)方面的研究報道。本研究在建立和優(yōu)化白掌SRAP反應(yīng)體系的基礎(chǔ)上,通過SRAP標(biāo)記對 23個白鶴芋屬樣品進(jìn)行分析,以期從分子水平揭示其親緣關(guān)系,為白鶴芋屬資源的有效利用和保護(hù)提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        供試材料白鶴芋屬23個樣品包括21個栽培品種和2個原生種(表1),于2013年4月中旬采自廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院白云基地環(huán)境園藝研究所資源圃。采集供試材料的幼嫩葉片,用冰盒保存帶回實(shí)驗(yàn)室。

        1.2 試驗(yàn)方法

        采用Liu等[11]改良的CTAB-氯仿-異戊醇法,單株取嫩葉提取基因組DNA。引物、PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)程序參照劉小飛等[12],上游引物有me1~me5,下游引物有em1~em6,共30個引物組合;反應(yīng)程序中72℃延伸時間改為100 s,其他參數(shù)不變。指紋圖譜構(gòu)建及聚類分析參照劉小飛等[12]。主坐標(biāo)分析采用Nei遺傳距離[13]。

        表 1 供試白鶴芋屬材料

        2 結(jié)果與分析

        2.1 SRAP擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性分析

        30個SRAP引物組合共擴(kuò)增出343個位點(diǎn),其中多態(tài)性位點(diǎn)為214個,多態(tài)性比率達(dá)62%,平均每個引物組合擴(kuò)增出多態(tài)性條帶7.1條,其中多態(tài)性較好的有19個引物組合(表2),部分引物擴(kuò)增電泳結(jié)果見圖1。

        圖1 引物Me5/Em4對23份白鶴芋屬種質(zhì)的擴(kuò)增結(jié)果

        表2 30個引物組合在23個白鶴芋屬種質(zhì)中的多態(tài)性擴(kuò)增結(jié)果

        2.2 基于SRAP標(biāo)記的聚類分析

        從表3可以看出,23份白鶴芋屬種質(zhì)兩兩之間的遺傳相似系數(shù)分布在0.36~0.98之間。其中mo和S. cannifolium的相似系數(shù)最小、為0.36,表明兩個種質(zhì)間的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);甜糕和綠怡1號之間的相似系數(shù)最大、為0.98,表明兩個種質(zhì)間的親緣關(guān)系最近。

        從聚類結(jié)果(圖2)可以看出,以相似系數(shù)0.72為標(biāo)準(zhǔn),23份白鶴芋屬種質(zhì)可分為 3類7組。第Ⅰ、Ⅱ類主要是花序具有乳頭狀突起的種質(zhì)。以相似系數(shù)0.84為標(biāo)準(zhǔn),第Ⅰ、Ⅱ類可以進(jìn)一步分組,第Ⅰ類只有1份種質(zhì),這個種具有與其他白鶴芋屬植物差別明顯的性狀和生長特性,植株緊湊,葉片帶黃綠、具鵝絨質(zhì)感,白色脈顯著,側(cè)脈白色。這些性狀的開發(fā)將大大豐富白鶴芋屬植物的觀賞性狀從而提高其觀賞價值。第Ⅱ類分為5組:第 1 組包括S.‘Coddy color’和S.‘Parrish’等15份種質(zhì),這組種質(zhì)花序多具有乳頭狀突起;第 2 組含亮葉1份種質(zhì);第 3 組含香水1份種質(zhì);第 4組含mo和皇后2份種質(zhì);第5組為華麗1號和華麗2號,株型較大。第Ⅲ類有1份種質(zhì),為原生種S.cannifolium,花序不具有乳頭狀突起,雌蕊發(fā)育不完全,具香味。

        圖2 23份白鶴芋屬種質(zhì)SRAP擴(kuò)增譜帶的UPGMA聚類結(jié)果

        2.3 利用主坐標(biāo)分析的白鶴芋屬23份種質(zhì)親緣關(guān)系

        采用主坐標(biāo)分析對23份白鶴芋屬種質(zhì)SRAP標(biāo)記的原始矩陣進(jìn)行解析,結(jié)果表明,前3個主坐標(biāo)可以闡明的相關(guān)性分別為16.8%、8.7%和 5.8%。

        進(jìn)一步通過第一、第二主坐標(biāo)二維圖對

        23份種質(zhì)排序,以及通過前3個主坐標(biāo)三維圖對其進(jìn)行排序,結(jié)果見圖3和圖4。 由圖3可知,23份白鶴芋屬種質(zhì)可分為4類。第Ⅰ類共有19份,該組的花序多具有明顯的乳頭狀突起的種質(zhì);第Ⅱ類僅為S. floribundum1份種質(zhì),該種質(zhì)花序乳頭狀突起不明顯;第Ⅲ類僅有S.cannifolium1份種質(zhì),該組花序的乳頭狀突起不明顯,且雌蕊與雄蕊近等高;第Ⅳ類有2份種質(zhì)。

        表3 23份白鶴芋屬種質(zhì)相似性矩陣

        圖3 23份白鶴芋屬種質(zhì)SRAP標(biāo)記主坐標(biāo)分析第一、第二主坐標(biāo)散點(diǎn)圖

        在圖3分類基礎(chǔ)上,對其第三主坐標(biāo)分析,結(jié)果(圖4)發(fā)現(xiàn),23份白鶴芋屬種質(zhì)可進(jìn)一步分為5組:第Ⅰ類12份種質(zhì),第Ⅱ類7份種質(zhì),第Ⅲ類和第Ⅳ類均僅有1份種質(zhì),第Ⅴ類2份種質(zhì)歸為1組。

        圖4 23份白鶴芋屬種質(zhì)SRAP標(biāo)記主坐標(biāo)分析的三維散點(diǎn)圖

        比較分析圖2~圖4表明,系統(tǒng)聚類和主坐標(biāo)分析所得結(jié)果相近,但主坐標(biāo)分析可以更加直觀地顯示各種質(zhì)間的關(guān)系,分析結(jié)果更清晰。

        3 討論

        SRAP標(biāo)記技術(shù)已廣泛應(yīng)用于多種園藝植物[14]。本試驗(yàn)所選用的30對引物可以較好地對23份白鶴芋屬種質(zhì)進(jìn)行聚類分析,表明該方法適用于白鶴芋屬種質(zhì)資源鑒評及親緣關(guān)系分析。系統(tǒng)聚類分析可以對親緣關(guān)系較近的種質(zhì)進(jìn)行分析,而對親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的種質(zhì)分析效果不理想,主坐標(biāo)分析方法可有效解決該問題。Renganayaki等[15]和 Sun 等[16]分別在對牧草和春小麥的研究中應(yīng)用該方法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)主坐標(biāo)分析在分析主要類群間關(guān)系時可以提供充足信息。本研究中,將兩者結(jié)合起來可以更好、更全面地闡明白鶴芋屬23個種質(zhì)間的親緣關(guān)系,為后續(xù)的遺傳育種提供相關(guān)理論基礎(chǔ)。此外,應(yīng)用SRAP分子標(biāo)記分析構(gòu)建白鶴芋屬植物的指紋圖譜,可以有效解決市場上白鶴芋屬種質(zhì)命名上的混亂現(xiàn)狀,從而更好地指導(dǎo)科研和生產(chǎn)。

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