曾凡勇,劉建軍,張雁,李南玲
遺傳性疾病疑似患兒染色體/基因相關(guān)檢測(cè)結(jié)果分析
曾凡勇,劉建軍,張雁,李南玲
目的分析疑有遺傳性疾病的患兒染色體核型分析/相關(guān)基因檢測(cè)情況。方法2014年7月至2016年7月,本科疑有遺傳性疾病的患兒47例,采用G-banding法進(jìn)行染色體核型分析或選擇相關(guān)疾病基因包進(jìn)行檢測(cè),對(duì)疑似疾病進(jìn)行篩查。結(jié)果進(jìn)行染色體核型分析38例,相關(guān)基因檢測(cè)9例,發(fā)現(xiàn)異常分別為3例和7例,共10例,檢測(cè)陽(yáng)性率為21.28%;明確診斷例數(shù)分別為1例和4例,共5例,確診率為10.64%。結(jié)論染色體核型分析/相關(guān)基因檢測(cè)是遺傳性疾病疑似患兒的病因?qū)W診斷方法。
遺傳性疾??;染色體核型分析;基因檢測(cè)
[本文著錄格式]曾凡勇,劉建軍,張雁,等.遺傳性疾病疑似患兒染色體/基因相關(guān)檢測(cè)結(jié)果分析[J].中國(guó)康復(fù)理論與實(shí)踐, 2017,23(8):965-970.
CITED AS:Zeng FY,Liu JJ,Zhang Y,et al.Karyotype analysis/genetic testing in children suspected with hereditary disease[J]. Zhongguo Kangfu Lilun Yu Shijian,2017,23(8):965-970.
遺傳性疾病(簡(jiǎn)稱“遺傳病”)是指以遺傳因素作為唯一或主要致病因素的一大類疾病,遺傳因素以細(xì)胞水平的染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)畸變和分子水平的基因改變?yōu)橹?。?jù)統(tǒng)計(jì),活產(chǎn)新生兒中患不同種類遺傳病者占4%~5%,其中單基因病占1%,多基因病占2%~3%,染色體病占0.5%;約1%新生兒患嚴(yán)重畸形,0.5%有代謝異常[1]。
智力障礙(intellectual disability,ID),又稱智力低下、精神發(fā)育遲滯(mental retardation,MR),是一組以18周歲前起病、認(rèn)識(shí)功能障礙(智商<70)、社會(huì)適應(yīng)能力缺陷為特征的疾病。群體發(fā)病率約1%~3%。智力障礙患者在學(xué)齡前(5歲前)常表現(xiàn)為語(yǔ)言、運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩,故稱之為發(fā)育遲滯(development delay,DD)。MR/DD的病因復(fù)雜,其中遺傳因素約占2/3。導(dǎo)致MR/DD的遺傳因素主要包括染色體異常、單基因病和多基因病。
臨床上以發(fā)育遲滯、智力低下、言語(yǔ)障礙等為主訴就診的患兒占兒童康復(fù)科門診量的很大一部分。本研究針對(duì)該類患兒進(jìn)行染色體分析/相關(guān)基因檢測(cè)。
1.1 一般資料
2014年7月至2016年7月,將到本科門診就診或住院康復(fù),疑有遺傳性疾病的患兒納入研究。
納入標(biāo)準(zhǔn):①臨床診斷為智力低下/精神發(fā)育遲滯、發(fā)育遲滯(或并發(fā)有先天性小頭畸形)等疑有遺傳性疾??;②明確出生后無(wú)中毒、缺氧、中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染及頭顱外傷等病史;③至少符合④⑤⑥⑦⑧⑨中一項(xiàng);④先天性畸形(如小頭畸形、顱面部畸形、手足畸形、臟器畸形、尿道下裂/隱睪等);⑤有智力低下家族史;⑥有反復(fù)流產(chǎn)、死胎、死產(chǎn)家族史;⑦宮內(nèi)發(fā)育遲緩;⑧運(yùn)動(dòng)、語(yǔ)言能力或智力水平倒退;⑨經(jīng)正規(guī)康復(fù)訓(xùn)練無(wú)效。
排除標(biāo)準(zhǔn):①已明確診斷為腦外傷、病毒性/細(xì)菌性腦炎、吉蘭-巴雷綜合征、脊髓性肌萎縮癥等原因所致運(yùn)動(dòng)、智力、語(yǔ)言等功能障礙;②已知的遺傳代謝性疾病,如脆性X綜合征、苯丙酮尿癥、半乳糖血癥、肝豆?fàn)詈俗冃浴⒔Y(jié)節(jié)性硬化、克汀病等。
病例資料收集:①詳細(xì)了解病史,包括患兒在母孕期、圍生期的情況,出生史、喂養(yǎng)史、生長(zhǎng)發(fā)育史、既往疾病史、家族史及家庭文化經(jīng)濟(jì)狀況;②盡量全面的檢查,包括臨床常規(guī)體格檢查和必要的特殊檢查;③根據(jù)病情,詳細(xì)收集患兒輔助檢查資料,如血液生化檢查、頭顱CT、MRI、腦電圖、代謝篩查、智力測(cè)試、聽(tīng)力篩查、臟器B超等。
進(jìn)行染色體核型分析/相關(guān)基因檢測(cè)患兒共47例,其中男性22例,女性25例;年齡4個(gè)月~12歲4個(gè)月,平均(2.85±2.62)歲。臨床診斷精神發(fā)育遲滯9例;發(fā)育遲滯或發(fā)育落后待查33例,其中并發(fā)小頭畸形2例,疑為孤獨(dú)癥3例;其余5例診斷分別為腦癱1例,小腦性共濟(jì)失調(diào)1例,言語(yǔ)障礙1例,孤獨(dú)癥1例,腦白質(zhì)病1例。
1.2 標(biāo)本采集
采集患兒(和部分患兒父母)的外周血3~4 ml,乙二胺四乙酸(Ethylene Diamine Tetraacetic Acid,EDTA)抗凝(由于患兒父母樣本收集不全,部分患兒的異常結(jié)果沒(méi)有進(jìn)行突變的來(lái)源分析、驗(yàn)證),常規(guī)外周血淋巴細(xì)胞培養(yǎng),制備染色體G顯帶標(biāo)本,分析核型。對(duì)于曾行染色體核型分析結(jié)果顯示正常,但臨床高度懷疑遺傳性疾病的患兒,根據(jù)臨床表型分別選擇共濟(jì)失調(diào)相關(guān)基因篩查、腦白質(zhì)病基因檢測(cè)包、外顯子芯片捕獲+高通量測(cè)序等不同的基因檢測(cè)方式。上述樣本送至北京福佑龍惠(遺傳)??崎T診部(Similan Labs)進(jìn)行染色體核型分析;其他第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu)進(jìn)行相關(guān)基因檢測(cè)。
1.3 數(shù)據(jù)分析
分析陽(yáng)性率及確診率,并總結(jié)陽(yáng)性結(jié)果的病例特點(diǎn)。
檢測(cè)總例數(shù)47例,發(fā)現(xiàn)異常10例,其中男性3例,女性7例;明確診斷5例,檢測(cè)陽(yáng)性率21.28%,確診率10.64%。異常檢測(cè)結(jié)果患兒的臨床特點(diǎn)見(jiàn)表1。
2.1 染色體核型分析
進(jìn)行染色體核型分析共38例,發(fā)現(xiàn)異常3例,其中確診1例為45,XY,der(14;15)(q10;q10),確認(rèn)出由14號(hào)染色體長(zhǎng)臂和15號(hào)染色體長(zhǎng)臂組成的Robertson型異位。
發(fā)現(xiàn)異常的另外2例為:①47,XX,+mar發(fā)現(xiàn)染色體異常,可能來(lái)自于有結(jié)構(gòu)異常的18號(hào)染色體,但無(wú)法最終確認(rèn),建議利用熒光原位雜交(Fluorescence in Situ Hybridization,FISH)檢測(cè)法,使用18號(hào)染色體探針可能可以確認(rèn);②47,XX,+mar發(fā)現(xiàn)異常染色體,確認(rèn)出來(lái)源不明的多余染色體,該不明染色體可能來(lái)自于隨體(satellite)型D群染色體(13號(hào)、14號(hào)、15號(hào)染色體)或G群染色體(21號(hào)、22號(hào)染色體),但無(wú)法最終確定,建議父母染色體檢查以檢測(cè)患兒的異常染色體是新生變異(de novo)還是父母遺傳。
2.2 基因檢測(cè)
進(jìn)行相關(guān)基因檢測(cè)共9例,發(fā)現(xiàn)異常7例,其中4例確診。
①腦白質(zhì)病基因檢測(cè)包:PLA2G6:C.109C>T p. Arg37Ter雜合,來(lái)源于父親;c.1A>G p.Met1Val雜合,來(lái)源于母親。診斷“嬰兒軸索神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)不良”(PLA2G6相關(guān)神經(jīng)變性)。
②人類4000種單基因遺傳病基因突變+拷貝數(shù)的變異(copy number variation,CNV)分析:基因變異位點(diǎn)DOCK8,染色體位置chr9:215012,核酸改變c.36C>G(E1);氨基酸改變p.12,F(xiàn)>L,雜合,蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果為有害。常染色體顯性遺傳性精神智力發(fā)育遲滯2型?;純耗赣H亦確認(rèn)該基因位點(diǎn)雜合變異。
③外顯子芯片捕獲+高通量測(cè)序:基因NKX2-1,突變信息c.560C>A chr14:36987039 p.S187X,雜合突變;其父該位點(diǎn)也為雜合突變。該基因報(bào)道與遺傳性良性舞蹈病/舞蹈病相關(guān),為常染色體顯性遺傳,理論上有一條染色體發(fā)生突變即可致病。
④外顯子芯片捕獲+高通量測(cè)序:在Rett綜合征相關(guān)基因MECP2發(fā)現(xiàn)一處雜合突變,c.789delC chrx-153296526-153296526*1 p.P263fs;突變變異類型為已知致病突變。為X染色體顯性遺傳,理論上一個(gè)突變點(diǎn)即可致病。
另外發(fā)現(xiàn)異常的3例結(jié)果如下。
①共濟(jì)失調(diào)相關(guān)基因篩查。基因位點(diǎn)變異:KCNC3基因的一個(gè)純合變異[c.188T>C,p.63D>G];GJC2基因的一個(gè)雜合變異[c.350G>T,p.117R>L];COQ2基因的一個(gè)雜合變異[c.73A>C,p.25L>V]。該患兒的臨床癥狀與脊髓小腦性共濟(jì)失調(diào)13型(屬于ACADⅠ型)、腦白質(zhì)營(yíng)養(yǎng)不良伴髓鞘發(fā)育不良2型(佩梅樣病)、原發(fā)性輔酶Q10缺乏癥Ⅰ疾病表型比較吻合。
②單基因病全外顯子組測(cè)序分析?;駽ASK,突變類型為雜合;核酸突變c.1556T>C(exon16);氨基酸突變p.M519T;突變影響:Provean軟件結(jié)果預(yù)測(cè)可能有害?;純焊改冈摶蚝怂嵬蛔僣.1556T均為野生型。
③遺傳病綜合檢測(cè)(全基因)?;駽TNNB1;核苷酸改變c.526_527insC;雜合。氨基酸改變:移碼突變。疾病/表型:精神發(fā)育遲滯19型。突變來(lái)源:新生突變。遺傳方式:常染色體顯性遺傳。未檢測(cè)到父母外周血中存在此突變,但不排除父母存在生殖細(xì)胞嵌合體的可能。
進(jìn)行基因檢測(cè)的9例患兒中,7例異常結(jié)果的患兒中6例均行血、尿代謝篩查,另1例行尿篩查,均未見(jiàn)典型代謝性疾病。這7例中的4例同時(shí)行常規(guī)染色體核型分析均正常;1例同時(shí)行線粒體病相關(guān)基因檢測(cè)(A3243G、A8344G、T8993G、T8993C),未發(fā)現(xiàn)突變;1例曾行脊髓性肌萎縮癥(Spinal Muscular Atrophy,SMA)相關(guān)基因檢測(cè),未見(jiàn)SMN1基因外顯子7純合子缺失;1例未行染色體核型分析,直接進(jìn)行共濟(jì)失調(diào)基因包檢測(cè)發(fā)現(xiàn)異常,但未行家系驗(yàn)證。剩余的2例分別進(jìn)行Prader-Willi綜合征基因檢測(cè)和Rett綜合征基因檢測(cè),未發(fā)現(xiàn)異常。
遺傳病通常分為3種類型。
①染色體病(chromosomal disorder),指由染色體數(shù)目異常或結(jié)構(gòu)畸變所引起的一類疾病,分為常染色體病和性染色體病。染色體數(shù)目異常多數(shù)由于同源染色體或姐妹染色體不分離所致,臨床上常見(jiàn)整倍體畸變、非整倍體畸變(單體綜合征、三體綜合征等)和嵌合體等表現(xiàn)形式。結(jié)構(gòu)畸變則由染色體斷裂丟失或錯(cuò)誤重接所致,如缺失、倒位、重復(fù)、易位等結(jié)構(gòu)異常。目前已報(bào)道的染色體病超過(guò)300種,分布在22條常染色體和2條性染色體上。
②單基因遺傳病(single gene disorder,monogenic disease,monogenic disorder),指單個(gè)基因突變所引起的一類疾病。致病基因存在于核基因中,亦存在于線粒體基因中;前者發(fā)病方式遵循孟德?tīng)栠z傳規(guī)律,而后者不符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律,屬于母系遺傳或細(xì)胞質(zhì)遺傳范疇。該類疾病的群體患病率約為萬(wàn)分之一,病種約有6000多種。
③多基因遺傳病(polygenic disorder,multifactorial disease),指由多個(gè)易感基因突變?cè)诃h(huán)境因素(如物理、化學(xué)或生物因素)影響下所導(dǎo)致的疾病。常見(jiàn)的多基因病有糖尿病、高血壓和唇腭裂等,群體患病率0.1%~1.0%[2]。
遺傳病的檢測(cè)方法有如下幾種。
①染色體核型分析。G顯帶核型分析是細(xì)胞遺傳學(xué)中應(yīng)用最成熟、最經(jīng)典的技術(shù),是目前國(guó)內(nèi)外診斷染色體異常的主要方法,可以觀察染色體的數(shù)目和整套染色體的主要帶形。但它的分辨率有限,高分辨染色體核型分析的分辨率大約為3~5 M,小于這個(gè)水平的亞顯微改變很難被發(fā)現(xiàn)。有統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,在由于發(fā)生了較小的染色體不平衡畸變而引起的智力低下、器官畸形和生長(zhǎng)發(fā)育遲緩的群體中,常規(guī)G顯帶技術(shù)的檢出率只有15%~40%,漏診率高達(dá)60%~85%[3]。
Van Karnebeek等[4]通過(guò)系統(tǒng)綜述發(fā)現(xiàn),MR/DD患者中染色體核型異常者占9.5%,亞端粒重組占4.4%,脆性X綜合征占2%,代謝異常占1%。通過(guò)對(duì)染色體核型分析正常的不明原因MR/DD患者,行微陣列比較基因組雜交技術(shù)進(jìn)行全基因組拷貝數(shù)分析可發(fā)現(xiàn),9%~13%患者有染色體微缺失或微重復(fù)畸變[5-6]。
②微陣列比較基因組雜交技術(shù)(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)檢測(cè)。array-CGH是新興發(fā)展起來(lái)的分子核型分析技術(shù)[7],一次實(shí)驗(yàn)可檢測(cè)待測(cè)樣本整個(gè)基因組DNA的CNV。其優(yōu)點(diǎn)在于,分辨率高(可精確到200 bp),不需要制備中期染色體,只需要1 μg的DNA量,耗時(shí)約72 h。array-CGH技術(shù)能檢測(cè)非整倍體、特征明顯的微缺失或微重復(fù)綜合征、端粒或其他染色體失衡或重排[8-9],可檢測(cè)出人類多數(shù)的染色體疾病,如chr22q11.2微缺失綜合征(與精神分裂有關(guān)),chr15q24微缺失綜合征(與智力和生長(zhǎng)發(fā)育有關(guān)),chr14q的微重復(fù)(與面部發(fā)育異常、心臟病和神經(jīng)異常有關(guān))[10],被廣泛應(yīng)用于遺傳性疾病和腫瘤基因組學(xué)的研究[11-12]。國(guó)外很多將該技術(shù)應(yīng)用于診斷和產(chǎn)前診斷染色體疾病,是一種高效率的染色體病診斷方法[13-14]。
但是它也存在一定的局限性[15]:首先,只針對(duì)基因組DNA拷貝數(shù)的變異,對(duì)于沒(méi)有發(fā)生CNV的染色體平衡畸變(平衡異位和平衡倒位)不敏感;其次,由于其分辨率高、檢測(cè)敏感,基因組中所有的CNV都會(huì)顯示出來(lái),需要熟練的遺傳學(xué)工作者查閱大量的數(shù)據(jù)庫(kù),判斷檢測(cè)出的CNV是多態(tài)性CNV還是致病性CNV。2010年,美國(guó)遺傳醫(yī)學(xué)學(xué)會(huì)發(fā)布“基因芯片在出生缺陷中的臨床應(yīng)用指南”,提出基因芯片是不明原因發(fā)育遲緩、多發(fā)畸形、非明顯遺傳綜合征及懷疑染色體病的首選檢測(cè)手段[16-17]。因此,對(duì)于不平衡染色體畸變的病例,較理想的分析流程是:先運(yùn)用G顯帶技術(shù)進(jìn)行初步分析,再行array-CGH檢測(cè)以明確診斷。對(duì)于沒(méi)有發(fā)生DNA拷貝數(shù)改變的染色體平衡易位和平衡倒位,再使用FISH或多重定量熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitative fluorescent Polymerase Chain Reaction,QF-PCR)進(jìn)一步核實(shí)。
③FISH技術(shù)。FISH技術(shù)是將熒光素直接或間接標(biāo)記的核酸探針(或生物素、地高辛等標(biāo)記的核酸探針)與標(biāo)本中的核酸序列按照堿基互補(bǔ)配對(duì)原則進(jìn)行雜交,經(jīng)洗滌后直接(或通過(guò)免疫熒光信號(hào)擴(kuò)增)在熒光顯微鏡下檢測(cè),從而對(duì)樣本中的待測(cè)核酸進(jìn)行定性、定位或定量的研究,是快速檢測(cè)染色體異常的分子細(xì)胞遺傳學(xué)方法。它不僅適用于分裂期細(xì)胞,也可用于間期核細(xì)胞。因?yàn)镕ISH技術(shù)是建立在已知的核型分析基礎(chǔ)上,有資料表明,如沒(méi)有已知的核型分析基礎(chǔ),在由于發(fā)生了較小的染色體不平衡畸變而導(dǎo)致的智力低下、器官畸形以及生長(zhǎng)發(fā)育遲緩的群體中,F(xiàn)ISH的檢出率僅為3%~5%[18]。
④多重酶連依賴探針擴(kuò)增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技術(shù)。MLPA是一種靈敏度極高的相對(duì)定量技術(shù),它利用簡(jiǎn)單的變性、雜交、連接及PCR倍增反應(yīng),于單一反應(yīng)管內(nèi)可同時(shí)檢測(cè)最多45種不同核苷酸序列拷貝數(shù)目的變化。MLPA靈敏性高、特異性強(qiáng)、再現(xiàn)性高且簡(jiǎn)單高效,能發(fā)現(xiàn)亞顯微水平的亞端粒缺失或重復(fù),且不需要細(xì)胞培養(yǎng);它的局限性在于,通常它發(fā)現(xiàn)的異常結(jié)果仍需用FISH驗(yàn)證。
⑤第二代測(cè)序技術(shù)(next-generation sequencing technology,NGS)。NGS的核心思想是邊合成邊測(cè)序(sequencing by synthesis),即通過(guò)捕捉新合成的末端標(biāo)記來(lái)確定DNA的序列。測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)是長(zhǎng)度只有幾十個(gè)堿基的序列,通過(guò)生物信息學(xué)工具將這些短的序列組裝成長(zhǎng)的連續(xù)序列甚至是整個(gè)基因組的框架,或者把這些序列比對(duì)到已有的基因組或者相近物種基因組序列上,進(jìn)一步分析基因組序列結(jié)構(gòu)信息。這種方法能夠精確地分析CNVs和其他基因組結(jié)構(gòu)變異,如倒位、平衡易位等。與微陣列方法比較,配對(duì)末端測(cè)序法可以鑒別出更小的CNVs,然而由于讀長(zhǎng)(read depth)的限制(平均35 bp),大的CNVs(特別是重復(fù))可能會(huì)漏檢。
全外顯子組測(cè)序(whole exome sequencing,WES)是以人類基因組中蛋白質(zhì)編碼序列為目標(biāo)的第二代測(cè)序技術(shù),外顯子組(exome)包含的序列不到人的整個(gè)基因組的1%,但在已發(fā)現(xiàn)的人類單基因遺傳病中,85%的致病突變位于外顯子區(qū)域,WES可作為尋找潛在的孟德?tīng)栠z傳罕見(jiàn)病基因的有效策略[19-20]。
⑥靶向目標(biāo)測(cè)序技術(shù)。在很多情況下沒(méi)必要進(jìn)行全基因組測(cè)序,只需要檢測(cè)特定區(qū)域,比如各種基因包(panel)、臨床外顯子組測(cè)序、WES等。最適合應(yīng)用捕獲測(cè)序檢測(cè)的基因變異形式是點(diǎn)突變和小的插入缺失。其局限性在于對(duì)較大范圍的雜合缺失、重復(fù),比如CNV的檢測(cè)就不是很適合;其次在于不能分辨同源序列(假基因),不能解決多聚結(jié)構(gòu)(POLY結(jié)構(gòu))及短鏈串聯(lián)重復(fù)等特殊序列;再者一般做不到100%覆蓋。因此,當(dāng)臨床懷疑的疾病捕獲序列分析結(jié)果陰性時(shí),需要考慮可能沒(méi)有完全覆蓋,或者致病突變?cè)谀繕?biāo)序列之外的情況。
目前研究多采用一定的篩查標(biāo)準(zhǔn)對(duì)疑似患兒進(jìn)行初步篩查,以提高陽(yáng)性篩查率。有學(xué)者對(duì)29例確診為亞端粒重組的MR/DD患兒及109例染色體核型正常且無(wú)亞端粒重組的不明原因MR/DD患兒的臨床表型進(jìn)行多方面比較分析后,提出5條初步篩查標(biāo)準(zhǔn)及評(píng)分原則:①陽(yáng)性家族史(符合孟德?tīng)栠z傳定律,1分;不符合,2分);②宮內(nèi)發(fā)育遲緩(2分);③生后發(fā)育異常(小頭畸形、體格生長(zhǎng)遲緩、巨頭、生長(zhǎng)過(guò)快各1分);④≥2個(gè)面部畸形(眼距寬,耳、鼻異常,2分);⑤非面部畸形和原發(fā)性畸形(手掌畸形,1分;心臟畸形,1分;尿道下裂/隱睪,1分)??傇u(píng)分≥3分時(shí)進(jìn)一步對(duì)患兒實(shí)施染色體核型分析及細(xì)胞分子生物學(xué)檢查,而且在臨床初步篩查的基礎(chǔ)上選擇合適的實(shí)驗(yàn)室檢查技術(shù),能提高陽(yáng)性檢出率。但也發(fā)現(xiàn),使用這種篩查標(biāo)準(zhǔn)會(huì)將一部分患兒排除在外,但是在更詳細(xì)的臨床篩查標(biāo)準(zhǔn)及更便捷有效的試驗(yàn)技術(shù)出現(xiàn)前,這一篩查標(biāo)準(zhǔn)仍然適用[21]。
分析本研究數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),進(jìn)行染色體核型分析的38例患兒中,發(fā)現(xiàn)異常的僅為3例;且進(jìn)行基因檢測(cè)7例異常的患兒中,有4例曾行常規(guī)染色體核型分析未發(fā)現(xiàn)異常。染色體核型分析檢出率低的原因,是由于其分辨率有限,即便是高分辨染色體核型分析的分辨率也大約為3~5 M,漏診率高達(dá)60%~85%[3],而且FISH耗時(shí),每次只能檢出1個(gè)或幾個(gè)已知的異常位點(diǎn),MLPA在一個(gè)反應(yīng)體系中只能檢出50~100個(gè)基因位點(diǎn),其與FISH均不能對(duì)一次實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的整條染色體進(jìn)行檢測(cè)[22-23]。因此,僅依靠染色體核型分析,其檢測(cè)陽(yáng)性率和確診率都很低。我們需要對(duì)高度懷疑遺傳病,尤其是根據(jù)上述臨床篩查標(biāo)準(zhǔn)評(píng)分≥3分的患兒,選擇合適的相關(guān)檢查:如果臨床上高度懷疑,但染色體核型分析顯示為正常的患兒,可以進(jìn)一步行array-CGH檢測(cè);或者根據(jù)臨床表型選擇相關(guān)的基因包或全外顯子基因檢測(cè)進(jìn)一步明確診斷。如本文中的2例染色體異常的患兒,需要行FISH或父母驗(yàn)證,甚至相關(guān)基因檢測(cè);3例基因檢測(cè)異常的患兒均需要進(jìn)行家系驗(yàn)證(trios),以明確所檢測(cè)到的突變是遺傳突變、父母生殖細(xì)胞嵌合體或是患兒的新生突變,以便最后明確診斷。
從本研究異常患兒臨床特點(diǎn)可以看出,不論是染色體核型異?;蚴腔驒z測(cè)異常,臨床上均表現(xiàn)為發(fā)育落后或智力/語(yǔ)言/運(yùn)動(dòng)能力的倒退,追問(wèn)病史、家族史、圍產(chǎn)期情況,大部分會(huì)有陽(yáng)性發(fā)現(xiàn),同時(shí)結(jié)合查體,以及頭部MRI、腦電圖、肌電圖等輔助檢查,大多數(shù)會(huì)有異常報(bào)告。因此,詳細(xì)的病史采集、查體和必要的輔助檢查對(duì)于篩查出遺傳性疾病的可疑患兒有重要幫助,也是臨床醫(yī)生應(yīng)該具備的基本功。
上述幾種檢驗(yàn)方法各有優(yōu)缺點(diǎn),需要根據(jù)患兒的實(shí)際情況結(jié)合幾種方法來(lái)綜合判斷,同時(shí)臨床醫(yī)生要熟悉常見(jiàn)或特殊的智力/運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)疾病的特征性臨床表現(xiàn)、特殊輔助檢查結(jié)果,與檢測(cè)公司技術(shù)人員積極溝通,選擇正確、合理的診斷檢測(cè)程序,為患者提供更準(zhǔn)確的診斷,并指導(dǎo)治療。明確MR/DD病因?qū)W診斷具有重要意義,它不僅能使患兒及時(shí)接受臨床和康復(fù)治療,同時(shí)根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)文獻(xiàn)資料,可以了解該疾病的既往治療經(jīng)驗(yàn)、判斷預(yù)后、目前治療進(jìn)展情況,是改善患兒生活質(zhì)量、為其家庭提供遺傳咨詢的重要依據(jù)。
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KaryotypeAnalysis/Genetic Testing in Children Suspected with Hereditary Disease
ZENG Fan-yong,LIU Jian-jun,ZHANG Yan,LI Nan-ling
1.Capital Medical University School of Rehabilitation Medicine,Beijing 100068,China;2.Beijing Bo'ai Hospital, China Rehabilitation Research Centre,Beijing 100068,China
ZENG Fan-yong.E-mail:zengfyzeng@sina.com
ObjectiveTo apply karyotype analysis/genetic testing in children suspected with hereditary disease.Methods From July, 2014 to July,2016,a total of 47 cases in our department were tested using G-banding karyotype analysis or selected the relevant genetic package,for screening the related diseases.Results 38 cases received karyotype analysis,in which three cases were abnormal,and one case was diagnosed definitely.And nine cases received related genetic testing,in which seven cases were abnormal,and four cases were diagnosed definitely.Totally,the positive rate was 21.28%,and the diagnosis rate was 10.64%.Conclusion Karyotype analysis/genetic testing is an etiological diagnosis method for highly suspected hereditary disease in children.
hereditary diseases;karyotype analysis;genetic testing
R722.11
A
1006-9771(2017)08-0965-06
2016-11-08
2017-03-19)
10.3969/j.issn.1006-9771.2017.08.020
1.首都醫(yī)科大學(xué)康復(fù)醫(yī)學(xué)院,北京市100068;2.中國(guó)康復(fù)研究中心北京博愛(ài)醫(yī)院,北京市100068。作者簡(jiǎn)介:曾凡勇(1976-),女,漢族,四川隆昌縣人,碩士,主治醫(yī)師,主要研究方向:兒童康復(fù)。E-mail:zengfyzeng@sina.com。