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        基于主分量分析的蘋果葉部3種常見病害識別方法

        2016-11-28 16:03:52師韻王旭啟張善文
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年9期
        關(guān)鍵詞:BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)特征提取

        師韻+王旭啟+張善文

        摘要:蘋果葉部的3種常見病害(斑點落葉病、花葉病和銹病)嚴(yán)重影響蘋果的產(chǎn)量和質(zhì)量。病害識別是病害防治的基礎(chǔ),傳統(tǒng)的蘋果病害識別方法不能有效選擇病害的分類特征?;谥鞣至糠治鏊惴?,提出一種葉片顏色、形狀和紋理特征相結(jié)合的蘋果病害識別方法。首先對蘋果病害葉片圖像進行預(yù)處理,降低圖像干擾;然后利用改進的分水嶺方法分割病斑,提取病斑圖像的顏色、形狀和紋理特征,組成特征矩陣;再利用主分量分析(PCA)對該矩陣進行維數(shù)約簡,得到低維分類特征;最后利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)識別蘋果的3種病害類型。結(jié)果表明,該方法能夠有效識別蘋果的3種病害,平均識別率超過94%。

        關(guān)鍵詞:蘋果病害識別;特征提??;主分量分析(PCA);BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

        中圖分類號: S126; TP391. 41 文獻標(biāo)志碼: A

        文章編號:1002-1302(2016)09-0337-04

        蘋果含有豐富的碳水化合物、維生素、微量元素和果膠等,是世界水果中產(chǎn)量和消費以及益處最多的水果之一。但是,蘋果病害嚴(yán)重影響了蘋果的產(chǎn)量和質(zhì)量[1-3]。當(dāng)前,西部廣大果農(nóng)病害防治技術(shù)水平不高,防治粗放,農(nóng)藥亂配濫用現(xiàn)象比較普遍,造成果品農(nóng)藥殘留超標(biāo),果品質(zhì)量下降,且防治成本大。要防治蘋果病害,首先要識別病害類型[4-8]。葉片是很容易觀察、采集和處理的部位,也是一般蘋果病害癥狀首先出現(xiàn)的部位。因此,多年來蘋果葉片癥狀是果農(nóng)和植保人員診斷病害的重要依據(jù)之一。目前蘋果病害診斷大多采用經(jīng)驗定性診斷方法。該方法的主觀性較強,對專家的依賴性較高,容易混淆癥狀相似的病害。為了準(zhǔn)確識別病害,計算機圖像處理是一種很好的方法,但由于蘋果病害種類多,病害葉片形狀及葉片病斑的顏色、紋理和形狀的差異性大,呈現(xiàn)出復(fù)雜、多樣、無規(guī)則的特點,使得目前很多病害識別方法的效果不理想[5,9-11]。

        本研究提出一種基于主分量分析(PCA)的蘋果病害葉片的顏色、形狀和紋理特征相結(jié)合的蘋果病害識別方法,該方法綜合提取蘋果病害葉片圖像的多種分類特征,然后利用PCA進行維數(shù)約簡,再利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行訓(xùn)練,實現(xiàn)對蘋果病害的快速分類識別。

        1 材料與方法

        為了研究基于蘋果病害葉片圖像處理的蘋果病害識別的方法,選用了3 種易混淆的常見蘋果病害:斑點落葉病、花葉病和銹病為研究對象。蘋果斑點落葉病危害葉片,造成早落,葉片染病初期出現(xiàn)褐色圓點,其后逐漸擴大為紅褐色;蘋果花葉病主要在葉片上形成環(huán)斑型、狼斑型等各種類型的鮮黃色病斑;蘋果銹病葉片初患病正面出現(xiàn)油亮的橘紅色小斑點,逐漸擴大,形成圓形橙黃色的病斑,內(nèi)含大量褐色粉末狀銹孢子。肉眼不容易區(qū)分斑點落葉病和銹病2種病害。本研究所使用的這3種蘋果病害葉片圖像均是在西北農(nóng)林科技大學(xué)蘋果園利用佳能EOS 700D單反數(shù)碼相機在上午10:00—11:00時間段采集得到。為了便于后續(xù)處理,以灰色紙片作為背景色,在自然光照的非強光條件下對自然發(fā)病的蘋果葉片進行活體圖像采集,得到蘋果病害葉片數(shù)字圖像。拍攝時盡量使相機的鏡頭與蘋果葉面所在的平面平行,使光線在蘋果葉片上均勻分布,避免產(chǎn)生明顯的形變。為了使測量準(zhǔn)確,每次采集葉片圖像時,盡量使蘋果葉片充滿整個畫面。由于拍攝環(huán)境的影響,采集到的有些葉片圖像難免存在陰影和大量噪聲。因此,在采集到的數(shù)字葉片圖像中挑選出光照較均勻的圖像各50幅作為試驗的樣本圖像。圖1為試驗中采集到的蘋果常見3種病害葉片圖像實例,圖像格式為BMP,圖像寬度為320像素、高度為240像素。

        2 蘋果病害葉片圖像預(yù)處理

        蘋果病害葉片圖像的質(zhì)量直接影響后續(xù)的病害識別率。在葉片圖像采集過程中,由于受到采集設(shè)備、環(huán)境等影響,圖像存在分辨率低、背景復(fù)雜、病斑邊緣模糊等特點。所以,需要對病害葉片圖像進行預(yù)處理。常用的病害葉片圖像預(yù)處理操作有圖像格式轉(zhuǎn)化、圖像去噪、圖像增強、削弱圖像中顏色、葉柄、蟲洞等無用或干擾信息,使病斑區(qū)域的特征更明顯。為了有效去除噪聲,較好地保留圖像的細節(jié)并突出病斑特征,在試驗對比的基礎(chǔ)上,首先選用自適應(yīng)直方圖均衡化方法,擴展葉片圖像灰度范圍,對葉片圖像進行對比度增強,然后選用葉片彩色圖像中值濾波方法,即在葉片圖像的R、G、B通道上分別應(yīng)用中值濾波方法濾波后,再進行通道融合,得到濾波后的彩色圖像,較好地抑制葉片圖像的噪聲,保留葉片圖像的分類信息。再利用Top-Hat方法與歸一化彩色空間法相結(jié)合,可使不同光照度下所采集的葉片圖像的R、G、B通道數(shù)據(jù)處理結(jié)果差異很小,以此降低圖像亮度對色彩的影響。圖2為葉片圖像預(yù)處理流程。

        3 蘋果葉片圖像病斑分割

        病斑圖像分割是病害葉片圖像分析與模式識別中一個重要的環(huán)節(jié),病斑分割的好壞直接影響后續(xù)特征提取與識別結(jié)果。本研究的對象是自然環(huán)境下拍攝的蘋果病害葉片圖像,背景復(fù)雜、分辨率低,不能直接用于病害分類特征提取[3,10-11]。因此,采用改進的水平集彩色圖像分割方法,即基于區(qū)域和邊緣的變分水平集彩色圖像分割方法[12-13]。該方法充分利用了目標(biāo)圖像的區(qū)域信息和邊緣信息,并用歐氏距離代替了灰度加權(quán)值,使得彩色圖像的顏色空間信息得到充分利用。首先,用N1個水平集函數(shù)將圖像分割成N(N﹥1)個區(qū)域,每個水平集函數(shù)代表1個分割區(qū)域,通過建立獨立多水平集函數(shù)可以消除冗余的輪廓,從而避免分割區(qū)域的重疊和漏分,獲得更加精確的顏色邊緣。為了避免水平集函數(shù)在每次迭代后需重新初始化符號距離函數(shù),增加的能量懲罰項能使水平集函數(shù)在演化過程中保持為逼近的符號距離函數(shù)。再將分割的病斑歸一化圖像轉(zhuǎn)化為灰度圖。最后,采用形態(tài)學(xué)中的開運算和閉運算處理,得到不受葉片蟲洞和葉柄等影響的二值化圖像。3種蘋果病害葉片原圖與病斑分割結(jié)果如圖3所示。

        4 特征提取

        由于蘋果病害葉片的病斑圖像復(fù)雜、多樣、無規(guī)律,且隨時間而變換,不能用數(shù)學(xué)模型來表示[14]。很多基于圖像維數(shù)約簡的人臉、掌紋和步態(tài)等識別方法不能用于蘋果病害識別。由于不同類型病害葉片的病斑圖像的顏色、形狀和紋理之間存在差異,可以提取病斑圖像的分類特征,構(gòu)成特征向量,進行病害識別。下面介紹從分割后蘋果病斑圖像中提取病害的顏色、形狀和紋理的分類特征計算方法[9,11,15-16]。

        4.1 顏色特征

        由RGB顏色模型轉(zhuǎn)換到HIS和YCbCr顏色模型,利用歸一化直方圖的統(tǒng)計特征分別計算顏色R、G、B、H、I、S、Y、Cb和Cr的均值、方差、偏度、能量、熵等5個統(tǒng)計特征參數(shù),作為病害葉片圖像分類的顏色特征。

        4.2 形狀特征

        計算病害葉片病斑圖像的面積、周長、周長直徑比、周長長寬比、圓形度、縱橫軸比等6個無量綱的量,作為病斑圖像的形狀分類特征,具體如下:

        由以上分析可以得到每幅病斑圖像的45個顏色特征、6個形狀特征和4個紋理特征,由此組成一個維數(shù)為55的特征向量。

        5 基于主分量分析(PCA)的蘋果病害識別

        盡管可以提取病斑圖像的很多分類特征,但這些特征之間可能存在相關(guān)性,而且各個特征對病害分類的貢獻大小不同,一些特征可能降低病害的識別率。所以,需要對得到的眾多特征進行特征提取或維數(shù)約簡。但當(dāng)特征維數(shù)較大時,不容易快速地提取出對分類結(jié)果貢獻大、獨立、不相關(guān)的特征。

        主分量分析(PCA)考慮了各個特征之間的相互關(guān)系,利用維數(shù)約簡的思想,在損失很少信息的前提下將多個特征轉(zhuǎn)換為少數(shù)幾個互不相關(guān)的特征,成為主成分。每個主成分均是原始變量的線性組合,且各個主成分之間互不相關(guān),這就使得主成分比原始變量具有某些更優(yōu)越的性能,從而進一步使病害類型識別過程變得簡單、快速、準(zhǔn)確[17]。

        主成分分析常常通過以下5步解決:

        第1步,將提取的特征進行標(biāo)準(zhǔn)化處理,以消除各個特征在數(shù)量級或量綱上對后續(xù)分類結(jié)果的影響。

        第2步,將訓(xùn)練集中每個病斑圖像標(biāo)準(zhǔn)化后的特征組成1個特征向量,再將所有的特征向量組成1個特征矩陣,計算相關(guān)系數(shù)矩陣。

        第3步,計算特征矩陣的特征值及對應(yīng)的單位特征向量。特征值在某種程度上可以看成表示主成分分類力度大小。如果特征值小于1,說明該主成分的解釋力度還不如直接引入原變量的平均解釋力度大。因此一般可以用特征值大于1作為納入標(biāo)準(zhǔn)。

        第4步,計算主成分的方差貢獻率和累積方差貢獻率。一般來說,提取主成分的累積方差貢獻率超過85%就可以,由此確定需要提取多少個主成分。

        第5步,計算主成分。由具有最大特征值的特征向量構(gòu)成映射矩陣。大量實際情況表明,如果根據(jù)累積貢獻率來確定主成分個數(shù)往往較多,而用特征值來確定又往往較少,很多時候應(yīng)當(dāng)將兩者結(jié)合起來,以綜合確定合適的個數(shù)。

        由以上分析,可以歸納出PCA的蘋果病害識別的過程為:

        (1)對蘋果病害葉片圖像進行預(yù)處理;(2)對病害葉片圖像分割,得到病斑圖像;(3)提取病斑圖像的顏色、形狀和紋理特征,進行歸一化處理,得到特征向量矩陣,再構(gòu)造特征矩陣;(4)利用PCA得到主分量,構(gòu)造映射矩陣A;(5)由A對待識別的病斑的特征向量進行維數(shù)約簡;(6)利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類識別病害類型。

        BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器包括輸入層、隱層和輸出層。輸入層神經(jīng)元個數(shù)由葉片病斑特征矩陣主分量的個數(shù)決定,輸出層神經(jīng)元個數(shù)為病害類別數(shù)。試驗時需要人工設(shè)定BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的隱層個數(shù)、隱層神經(jīng)元數(shù)量和學(xué)習(xí)率等參數(shù)。待識別的病斑圖像進行預(yù)處理、特征提取、基于PCA的維數(shù)約簡等步驟后得到待分類低維向量,再輸入訓(xùn)練好的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器可得到病害識別結(jié)果。

        6 驗證試驗

        為了驗證所提出的方法的有效性,對常見的3種蘋果病害斑點落葉病、花葉病和銹病的葉片圖像數(shù)據(jù)庫上各50幅葉片圖像進行病害識別試驗。每種病害葉片的前30 幅,共90 幅作為訓(xùn)練樣本,其余的60幅作為測試集,依次編號。對所有葉片圖像進行預(yù)處理和病斑分割,然后提取每幅蘋果圖像的顏色、形狀和紋理等共55個特征值,組成特征向量;由所有訓(xùn)練集中的特征向量組成1個60×55的特征矩陣A;利用統(tǒng)計產(chǎn)品與服務(wù)解決方案軟件(Statistical Product and Service Solutions,SPSS)中的PCA過程:“分析→降維→因子分析”,求A的協(xié)方差矩陣,取前M個特征值所對應(yīng)的特征向量,構(gòu)成一個55×M的矩陣B,這個矩陣為映射矩陣,A乘以B,就得到了1個60×M的新的降維后的低維矩陣C,作為BP分類器的訓(xùn)練集數(shù)據(jù)。由B可以得到任一待識別病害葉片的病斑圖像的低維特征向量,輸入BP分類器,進行類別識別。試驗中采用Matlab軟件進行BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練。在利用訓(xùn)練數(shù)據(jù)集訓(xùn)練BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)前,先將訓(xùn)練數(shù)據(jù)C進行歸一化處理,以避免數(shù)據(jù)飽和,加快網(wǎng)絡(luò)收斂。網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練的輸出目標(biāo)矩陣大小為1×60,每個元素分別對應(yīng)于60個輸入樣本的類別。訓(xùn)練BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),直至總誤差小于給定值,認為網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練完畢。本試驗中,PCA的主分量數(shù)取為10,其累計方差貢獻率在90%以上。BP分類器的誤差取為0.001,試驗重復(fù)進行50次,計算識別結(jié)果的平均值,試驗結(jié)果見表1。為了說明本研究算法的有效性,與文獻[5]和[10]的蘋果葉片病害識別方法進行比較。這2種方法都是提取分類特征和Hu提出的7個不變矩,再分別利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和支持向量機進行病害識別。表1中給出了3種算法的識別結(jié)果。

        試驗結(jié)果表明,在3種蘋果病害識別中,本研究算法的平均識別率達到94.34%,高于其他2種算法,其中蘋果花葉病的識別率超過98%。

        7 討論與結(jié)論

        文獻[5]應(yīng)用二值圖像標(biāo)記法提取病斑邊緣,計算出病斑個數(shù)、面積、圓形度、與葉片面積比、復(fù)雜度和葉子的面積等6個形狀特征參數(shù),以及Hu的7個不變矩共13個參數(shù),再利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行識別;文獻[10]提取病害葉片病斑圖像的顏色直方圖、顏色矩、灰度共生矩陣、常規(guī)形狀和Hu的7個不變矩等特征,并對提取特征進行比較,選擇了15類特征參數(shù),再利用支持向量機進行識別。這2種方法沒有考慮提取的特征對病害分類的貢獻大小。而本研究算法提取55個特征,不是進行特征選擇,而是利用PCA快速得到主分量,再在新的低維特征空間進行識別。所以,該方法適用于提取很多特征情況下,而且考慮了各個特征的重要程度。

        3種算法對斑點落葉病的識別率都比較高,是因為該病害的特征與另外2種病害葉片的區(qū)別較大。出現(xiàn)錯分的原因是斑點落葉病與早期的銹病病斑很像,只是顏色有所差異,在紋理特征和形狀特征方面很相近,而文獻[5]中沒有選用顏色特征,所以識別率不高。

        本研究利用SPSS進行PCA。由于在SPSS中并沒有完整的主成分分析過程,其主成分分析過程集成在因子分析過程中,但并不完善。而主成分的得分需要對因子得分情況進行進一步計算,所以在SPSS中不需保存因子得分情況。對于提取因子的個數(shù)問題,一般遵循2個標(biāo)準(zhǔn),一是累計方差貢獻率大于80%;二是其特征值大于1。本試驗中之所以設(shè)置因子數(shù)目為10,是因為通過預(yù)先分析,發(fā)現(xiàn)前10個主成分可以解釋總體信息的99%。

        本研究探討了蘋果病害葉片圖像預(yù)處理、病斑分割、病害特征提取和特征降維方法,分析了基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的病害識別過程。訓(xùn)練后BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可實現(xiàn)對蘋果的斑點落葉病、花葉病和銹病3種病害識別,平均準(zhǔn)確率達到94.33%。試驗結(jié)果表明,該算法對蘋果葉部病害識別是可行的。進一步的研究重點是基于農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)視頻傳感器得到的蘋果病害葉片圖像分割和病害識別方法。

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