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        應(yīng)用AMMI模型對玉米雜交組合多點試驗的穩(wěn)定性分析

        2016-11-19 08:41:24吳雯雯歐楊虹
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年4期
        關(guān)鍵詞:玉米

        吳雯雯 歐楊虹

        摘要:選育高產(chǎn)并適應(yīng)某一區(qū)域的玉米品種需要進行多年多點試驗,正確地分析多年多點試驗結(jié)果對育種家能做出正確抉擇尤其關(guān)鍵。本研究以24個玉米組合在6個地點的產(chǎn)量試驗為對象,應(yīng)用METAR和AMMI模型,對這些試驗基本參數(shù)和玉米組合的穩(wěn)定性進行分析評價。結(jié)果表明,METAR能方便地對多點試驗進行基本分析;利用AMMI模型分別以1個到多個IPCA主成分軸分析G×E交互作用效應(yīng),發(fā)現(xiàn)當(dāng)用2個主成分進行分析時,2個IPCA達(dá)極顯著水平;AMMI雙標(biāo)圖分析結(jié)果表明,24個參試玉米組合中,5號組合、8號組合和3號組合應(yīng)為本試驗中豐產(chǎn)性和穩(wěn)定性較好的組合,而組合23產(chǎn)量最低且穩(wěn)定性最差,為本試驗表現(xiàn)最差組合。

        關(guān)鍵詞:玉米;多點試驗;METAR軟件;AMMI模型

        中圖分類號:513.037 文獻標(biāo)識號:A 文章編號:1001-4942(2016)04-0024-05

        玉米是我國第一大糧食作物,2013年種植面積已經(jīng)超過3300萬公頃。玉米是常異花授粉作物,普遍種植的是雜交種,特別是單交種。玉米雜交種受環(huán)境因素影響較大,大部分玉米品種適宜種植區(qū)域有限,需要經(jīng)過嚴(yán)格的區(qū)域試驗并經(jīng)相關(guān)部門審定才能在目標(biāo)區(qū)域推廣。因此,玉米育種中配置雜交組合必須經(jīng)過多年多點試驗鑒定,表現(xiàn)穩(wěn)定的組合才會選擇性地參加當(dāng)?shù)氐男陆M合篩選試驗及后續(xù)區(qū)域試驗和生產(chǎn)試驗。對玉米新組合在多環(huán)境進行評價,可以為準(zhǔn)確評價該組合的表現(xiàn)積累寶貴的數(shù)據(jù)。多年多點試驗鑒定結(jié)果往往受基因型和環(huán)境互作效應(yīng)(G×E互作)的影響,使試驗數(shù)據(jù)分析變得困難,很難發(fā)現(xiàn)在多環(huán)境中表現(xiàn)最佳的組合。由于G×E互作的影響,在一個環(huán)境表現(xiàn)好的組合在另一個環(huán)境中不一定表現(xiàn)好。Kang等研究認(rèn)為,當(dāng)G×E互作效應(yīng)顯著時僅用產(chǎn)量來進行組合選擇是不夠的。有相當(dāng)一部分育種家在做組合多點鑒定的時候沒有充分考慮G×E互作效應(yīng)的影響,只做基本的方差分析,但方差分析只能解析G×E互作效應(yīng)是否顯著,并不能解析互作效應(yīng)的方差成分由哪一些組合或者環(huán)境貢獻。多年來,在G×E互作分析方面已經(jīng)積累了多種方法,包括聯(lián)合回歸方法、AMMI、基因型主效應(yīng)及G×E互作分析(GGE)。AMMI模型將方差分析和主成分分析結(jié)合于同一模型中,同時具有可加和可乘分量,兼具兩個模型的優(yōu)點。通過從加性模型的殘差中分離模型誤差與干擾,從而提高了估計的準(zhǔn)確性,并且借助于雙標(biāo)圖(Biplot)能直觀地描繪和分析G×E互作效應(yīng)。目前AMMI模型品種穩(wěn)定性分析法已被廣泛應(yīng)用于作物品種多年多點試驗分析。

        本研究以24個玉米育種新組合為材料,利用METAR進行基本參數(shù)分析,利用AMMI模型分析這些玉米新組合在6個環(huán)境的產(chǎn)量表現(xiàn),并在AMMI模型分析的基礎(chǔ)上定量比較參試品種的相對穩(wěn)定性,為科學(xué)評價這些玉米新組合的應(yīng)用價值提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料及設(shè)計

        試驗材料為24個玉米雜交組合,以編號1~24代替名稱。試驗點為6個,分別為E1~E6。試驗于2014年在江蘇各主要玉米產(chǎn)區(qū)設(shè)點。試驗采用不完全隨機區(qū)組試驗設(shè)計方法,行長5m,2行區(qū),3次重復(fù)。單株種植,每公頃種植密度為60000株,收獲時全小區(qū)計產(chǎn)。

        1.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析方法

        用METAR3.0進行基本的統(tǒng)計量分析,AMMI模型用于品種穩(wěn)定性分析。AMMI模型是將方差分析和主成分分析綜合于同一個模型,同時具有加性和倍加性參數(shù)的數(shù)學(xué)模型,其模型方程為:式中Yger是第g個品種在環(huán)境e的第r次重復(fù)的觀察值,μ為總平均值,αg為第g個基因型與總平均值的離差,βe為第e個環(huán)境與總平均值的離差,λn為第n個交互效應(yīng)主成分軸,γgn為第n軸的基因型特征向量值,δen為第n軸環(huán)境特征向量值,ρge為殘差,kr(e)為環(huán)境內(nèi)的重復(fù)區(qū)組(block)效應(yīng),Eger為試驗誤差。

        穩(wěn)定性參數(shù)Di為品種在所有顯著交互效應(yīng)主成分軸空間中與原點的歐氏距離,是衡量品種穩(wěn)定性的判別指標(biāo),采用張澤等推算的計算公式:其中,c為統(tǒng)計顯著的IPCA個數(shù),γis為第i個基因型在第s個IPCA上的得分,Di值越小表示基因型越穩(wěn)定。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 試驗的基本統(tǒng)計量分析

        對24個玉米組合在各試點的產(chǎn)量進行匯總,計算各試點的廣義遺傳力、平均產(chǎn)量和變異系數(shù)。從本試驗計算結(jié)果來看(見表1),6個試驗點的廣義遺傳力最小為0.50,最大為0.91;變異系數(shù)最小為8.55%,最大為13.41%。試驗結(jié)果可靠,效果較好。

        2.2 AMMI模型分析

        通過對基因型、環(huán)境和G×E互作效應(yīng)進行分解,用AMMI模型分解G×E互作效應(yīng)。分析結(jié)果表明(見表2),環(huán)境、環(huán)境內(nèi)重復(fù)、基因型和G×E互作問的差異都達(dá)到了極顯著水平,說明參試品種產(chǎn)量水平存在顯著差異,且同一品種產(chǎn)量在不同環(huán)境條件下有顯著差異。24個玉米品種在6個不同環(huán)境條件下進行的產(chǎn)量試驗存在顯著的G×E互作,其變異的平方和占了整個處理平方和的22.6%,而基因型的平方和僅占12.3%,但環(huán)境變異的平方和卻占了整個處理平方和的48.2%。此外,環(huán)境對產(chǎn)量的影響較大,G×E互作效應(yīng)平方和為基因型效應(yīng)平方和的1.8倍。

        為了深入探討G×E互作的特征和評定各基因型的相對穩(wěn)定性,利用AMMI模型分別以1個到多個IPCA主成分軸分析G×E交互作用效應(yīng),結(jié)果發(fā)現(xiàn)當(dāng)用2個主成分分析時,2個IPCA都達(dá)極顯著水平,其中IPCA1解釋G×E互作變異的46.0%,IPCA2解釋G×E互作變異的29.3%,2個主成分軸共解釋G×E互作效應(yīng)總變異的75.3%。將剩余不顯著的IPCA合并為殘差,剩余的4個主成分軸分別解釋G×E互作變異的12.5%,5.1%,4.6%和2.5%,殘差共解釋了G×E互作效應(yīng)總變異的24.7%。

        2.3 玉米組合產(chǎn)量的穩(wěn)定性分析

        利用雙標(biāo)圖能夠簡明地解釋G×E互作,綜合PCA1和PCA2的基因型和環(huán)境得分值,將所有供試玉米組合和環(huán)境的PCA1和PCA2得分值投影到一張PCA1-PCA2的對應(yīng)分析圖上。從圖1可看出,IPCA1和IPCA2解釋了G×E互作變異的75.3%,距坐標(biāo)原點最近的4個基因型分別為編號8、15、20和18的組合,距離坐標(biāo)原點較遠(yuǎn)的基因型分別編號為23、21和24。

        根據(jù)試驗數(shù)據(jù)計算各基因型平均產(chǎn)量、產(chǎn)量BLUP和Di值。從表3可看出,各基因型平均產(chǎn)量排名順序為:21>6>7>5>4>13>22>10>9>8>19>3>11>15>2>18>12>16>14>20>17>1>24>23;產(chǎn)量BLUP值順序為:21>6>5>7>4>22>10>9>13>19>3>11>8>2>15>12>18>16>20>14>17>1>24>23:Di值排名順序為:8<15<20<18<5<3<14<19<2<22<4<9<16<17<7<1<10<6<11<12<13<24<21<23。根據(jù)Di值越低品種越穩(wěn)定判斷,穩(wěn)定性最高的基因型應(yīng)為8號組合,其次是15號組合;23號組合最不穩(wěn)定,其次是21號組合,這與雙標(biāo)圖結(jié)果一致(圖1)。但如果從平均產(chǎn)量和產(chǎn)量的BLUP值來分析,穩(wěn)定性最高的8號組合的平均產(chǎn)量和產(chǎn)量BLUP值排名分別為第10和12位(見表3),屬于中間類型。但是,評價一個玉米組合的優(yōu)劣不僅要求高穩(wěn)定性,同時亦要求具有一定的高產(chǎn)性,因此結(jié)合高產(chǎn)與穩(wěn)產(chǎn)性來衡量,5號組合、8號組合和3號組合應(yīng)為本試驗中豐產(chǎn)性和穩(wěn)定性較好的組合,而組合23產(chǎn)量最低且穩(wěn)定性最差,為本試驗表現(xiàn)最差組合。因此,作物多年多點試驗并不能簡單地根據(jù)產(chǎn)量的平均值或者BLUP值來選擇,需要結(jié)合G×E互作來分析品種的穩(wěn)定性。

        3 結(jié)論與討論

        作物育種中的多年多點試驗的目的在于客觀評價新組合的豐產(chǎn)性和穩(wěn)定性,只有數(shù)據(jù)準(zhǔn)確方可得到客觀的結(jié)論。田間試驗受環(huán)境影響較大,如果試驗條件控制不好往往會造成試驗效果較差,表現(xiàn)為變異系數(shù)偏大,遺傳力偏低等。本研究計算的廣義遺傳力較大,雖然試驗點E1、E2和E3的變異系數(shù)稍微偏大,但在可接受的范圍內(nèi),試驗結(jié)果較可靠。在實際試驗統(tǒng)計中,由于遺傳力計算較復(fù)雜,部分科研人員往往忽略計算此參數(shù),從而對試驗結(jié)果的精確度把握不夠。本研究利用國際玉米小麥改良中心(CIMMYT)開發(fā)的METAR進行基本統(tǒng)計量的計算,方便快捷。METAR集成了多個R程序代碼,具有友好的JAVA圖形界面,用戶并不需要學(xué)習(xí)太多的R程序語言就可以快速地掌握多年多點試驗數(shù)據(jù)分析方法。METAR能計算完全隨機區(qū)組試驗和不完全隨機區(qū)組試驗,既能進行單點試驗數(shù)據(jù)分析也能進行聯(lián)合方差分析,能估算方差分析、計算廣義遺傳力、遺傳相關(guān)和簡單相關(guān)等多種參數(shù)。

        玉米組合的產(chǎn)量平均值、產(chǎn)量BLUP值和Di都能從某種程度反映組合的產(chǎn)量表現(xiàn),但并不是說某一組合的產(chǎn)量均值或者產(chǎn)量BLUP值最高就是最好的組合,玉米產(chǎn)量試驗受環(huán)境因素影響較大,需要同時考慮G×E互作效應(yīng)的影響。同樣,農(nóng)民地里栽培的玉米也不是某一塊地產(chǎn)量表現(xiàn)高產(chǎn)就認(rèn)為是好品種,產(chǎn)量表現(xiàn)穩(wěn)定且具有較高產(chǎn)量表現(xiàn)的玉米品種才能確保農(nóng)民增收。本研究中5號組合、8號組合和3號組合豐產(chǎn)性和穩(wěn)定性表現(xiàn)較好,但其平均產(chǎn)量表現(xiàn)卻不是最高;相反,平均產(chǎn)量表現(xiàn)最高的21號組合,其產(chǎn)量穩(wěn)定性卻是倒數(shù)第二。這些結(jié)果與前人研究結(jié)果相似。

        多年多點試驗中G×E互作是一個復(fù)雜的生物學(xué)現(xiàn)象,要揭示其規(guī)律存在較多困難。人們在解決這一類實際問題時,自然希望能從各方面來反映其實質(zhì)。由此也就產(chǎn)生了研究這一共性現(xiàn)象的許多方法。然而,迄今為止,研究多年多點試驗中G×E互作方法都還不能做到盡善盡美。因此,探索一個能比較圓滿解決這類問題的方法一直是該領(lǐng)域的一個熱點課題。AMMI模型的提出以及在這一領(lǐng)域的初步應(yīng)用結(jié)果表明,AMMI模型成功地將方差分析和主成分分析結(jié)合在一起,為研究具體的G×E互作及品種穩(wěn)定性差異評價提供了一條方便的途徑,AMMI雙標(biāo)圖不僅有助于鑒別品種的適應(yīng)性、穩(wěn)定性和豐產(chǎn)性,而且對于深入理解品種和試點互作、明確試點問的相互關(guān)系、制定育種目標(biāo)和良種的示范推廣也有重要參考價值。但從多年研究結(jié)果來看,AMMI模型還沒有形成一個統(tǒng)一的評價品種穩(wěn)定性的指標(biāo),解決這一類問題還需要不斷研究和發(fā)展新的方法,形成一個統(tǒng)一的客觀評價標(biāo)準(zhǔn)。

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