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        5種木蘭科植物的DNA-C值及倍性分析

        2016-11-10 02:01:40方炎明
        植物研究 2016年6期
        關(guān)鍵詞:木蘭科紫玉蘭廣玉蘭

        趙 青 張 強(qiáng) 周 鵬 林 峰 方炎明*

        (1.南京林業(yè)大學(xué)南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,生物與環(huán)境學(xué)院,南京 210037; 2.江蘇省林業(yè)科學(xué)研究院,南京 211153; 3.南京林業(yè)大學(xué)現(xiàn)代分析測試中心,南京 210037)

        5種木蘭科植物的DNA-C值及倍性分析

        趙 青1張 強(qiáng)1周 鵬2林 峰3方炎明1*

        (1.南京林業(yè)大學(xué)南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,生物與環(huán)境學(xué)院,南京 210037;2.江蘇省林業(yè)科學(xué)研究院,南京 211153;3.南京林業(yè)大學(xué)現(xiàn)代分析測試中心,南京 210037)

        以紫玉蘭為內(nèi)標(biāo)或外標(biāo),利用流式細(xì)胞術(shù)測定了雜交馬褂木(Liriodendronchinense×tulipifera)、深山含笑(Micheliamaudiae)、長蕊含笑(Michelialongistamina)、廣玉蘭(Magnoliagrandiflora)和二喬玉蘭(Magnoliasoulangeana)5種木蘭科植物的DNA-C值及倍性。結(jié)果表明,兩種含笑屬植物及雜交馬褂木均為二倍體,廣玉蘭為六倍體,二喬玉蘭為四倍體,5種植物的C值各不相同,最大的是廣玉蘭,最小的是雜交馬褂木,它們的C值大小屬于小到中等水平。

        流式細(xì)胞術(shù);DNA-C值;倍性;木蘭科

        木蘭科(Magnoliaceae)大多是第三紀(jì)古熱帶植物區(qū)系的古老孑遺植物,被認(rèn)為是現(xiàn)存被子植物中較原始的類群,對研究被子植物的起源和系統(tǒng)發(fā)育具有重要意義[1]。狹義的木蘭科分為15屬250種,分布于亞洲的熱帶和亞熱帶地區(qū),少數(shù)在北美南部和中美洲,我國現(xiàn)存12屬136種,集中分布在西南部、南部及中南半島[2]。木蘭科植物樹姿優(yōu)美多態(tài)、花大而美麗、花色清新高潔、芳香濃郁宜人,葉、果皆具有獨(dú)特的觀賞價(jià)值。由于人為影響和自身繁殖能力的限制,木蘭科植物不少種已處于瀕危或極危狀態(tài),現(xiàn)有39種被列為國家重點(diǎn)保護(hù)樹種[3]。研究木蘭科植物的C值及其倍性,可以為木蘭科植物的雜交育種、種質(zhì)資源保護(hù)、園林造景及合理的開發(fā)利用提供理論依據(jù)。

        核DNA-C值(基因組大小)的概念最早由Swift提出,指未復(fù)制的單倍體基因組的DNA含量[4]。對此定義的不同理解導(dǎo)致了之后應(yīng)用上的混淆,比如在計(jì)算芭蕉屬三倍體植物的C值時(shí),Lysák等[5]用測得的2C值除以3得到1C值,并特指一個(gè)核基因組拷貝的DNA含量;而Arumuganathan等[6]用2C值除以2計(jì)算1C值,特指未復(fù)制的單倍體基因組的DNA總量。Greilhuber等[7]更正、統(tǒng)一了C值這一術(shù)語,將其定義為全倍體基因組(Holoploid Genome,染色體數(shù)n)的DNA含量。為避免混淆且加以區(qū)分,又引入Cx值的概念,特指單倍體基因組(Monoploid Genome,染色體數(shù)x)的DNA含量。因此二倍體(2n=2x)的C值與Cx值相等,四倍體(2n=4x)的C值為Cx值的二倍,以此類推。

        C值是植物的一項(xiàng)重要特征參數(shù),與植物的種群進(jìn)化、物種分類與分布、遺傳信息總量等有密切關(guān)系[8]。C值在不同分類學(xué)水平上的變異對研究物種的親緣關(guān)系以及系統(tǒng)發(fā)育具有重要意義,同時(shí)結(jié)合倍性水平分析也可用來鑒定雜交物種[9~11]。每年對已經(jīng)測定出的C值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)并收錄到數(shù)據(jù)庫中是一項(xiàng)很有價(jià)值的工作。從2001年9月第一個(gè)被子植物DNA C-值數(shù)據(jù)庫出版以來,新測定出核DNA C-值的種數(shù)以每年高達(dá)10倍的速度不斷增加,至今該版本已更新至8.0(http://data.kew.org/cvalues/)。DNA C-值數(shù)據(jù)庫目前包含8 510種植物的數(shù)據(jù)。它結(jié)合了被子植物DNA C-值數(shù)據(jù)庫(8.0,2012年12月)、裸子植物DNA C-值數(shù)據(jù)庫(5.0,2012年12月),蕨類植物DNA C-值數(shù)據(jù)庫(5.0,2012年12月),苔蘚植物DNA C-值數(shù)據(jù)庫(3.0,2010年12月),以及藻類DNA C-值數(shù)據(jù)庫(1.0,2004)中所有的C值數(shù)據(jù),方便科研工作者查詢與分析。

        測定C值的方法主要有Feulgen顯微密度法,流式細(xì)胞術(shù)(FCM),化學(xué)提取法、復(fù)性動(dòng)力學(xué)法、脈沖場凝膠電泳以及全基因組測序等8種[12~13]。流式細(xì)胞術(shù)以其操作簡單、結(jié)果可信等優(yōu)點(diǎn)被越來越多的學(xué)者應(yīng)用到植物C值測定中[14]。由于G0/G1期的DNA含量(2C值)可反映該細(xì)胞的倍性水平,因此利用流式細(xì)胞術(shù)測得植物C值的同時(shí)可以獲得其倍性結(jié)果。在被子植物C值數(shù)據(jù)庫中,僅收錄了5種木蘭科植物的C值,包括北美鵝掌楸(Liriodendrontulipifera),日本玉蘭(Magnoliakobus),廣玉蘭(M.grandiflora),紫玉蘭(M.liliiflora)和二喬玉蘭(M.soulangiana)。其中廣玉蘭和紫玉蘭的C值通過流式細(xì)胞術(shù)測定,其他3種植物的C值由顯微密度法測定。目前對木蘭科植物倍性分析主要依靠染色體計(jì)數(shù)法。王亞玲等[15]對木蘭科13個(gè)分類群和12個(gè)雜交組合的染色體數(shù)目進(jìn)行了研究,其中落葉木蓮(Manglietiadecidua)、香港木蘭(Magnoliachampionii)、馨香玉蘭(M.odoratissima)、香玉蘭(M.guangnanensis)等12個(gè)種的染色體數(shù)目為首次報(bào)道。龔洵等[16]研究了木蘭屬和含笑屬間兩個(gè)雜交組合后代的染色體,發(fā)現(xiàn)四倍體紫玉蘭(M.liliiflora)和二倍體云南含笑(Micheliayunnanensis)的雜交后代染色體數(shù)目為2n=3x=57,從而支持含笑屬與木蘭屬玉蘭亞屬具有較近親緣關(guān)系的觀點(diǎn)。孟愛平等[17]對中國木蘭科11屬40種進(jìn)行了核型研究,所研究的20種木蓮屬(Manglietia)植物均為二倍體,已觀察的含笑屬均為二倍體?,F(xiàn)在木蘭科植物染色體計(jì)數(shù)約達(dá)13屬106種[15]。進(jìn)行木蘭科植物的C值和倍性鑒定對木蘭科的系統(tǒng)分類學(xué)、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)、生態(tài)與環(huán)境、基因組學(xué)、物種保護(hù)、細(xì)胞分子生物學(xué)以及生理學(xué)等各學(xué)科領(lǐng)域都具有十分重要的指導(dǎo)意義。本研究以紫玉蘭為內(nèi)標(biāo)或外標(biāo),利用流式細(xì)胞術(shù)測定了雜交馬褂木(Liriodendronchinense×tulipifera)、深山含笑(Micheliamaudiae)、長蕊含笑(M.longistamina)、廣玉蘭(Magnoliagrandiflora)以及二喬玉蘭(M.soulangeana)5種木蘭科植物的C值及倍性。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        以四倍體紫玉蘭為標(biāo)樣,以雜交馬褂木、深山含笑、長蕊含笑、廣玉蘭以及二喬玉蘭為研究對象,采用芽內(nèi)未展開的幼葉為供試材料,采樣后立即進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析。樣品均采自南京林業(yè)大學(xué)校園內(nèi)。

        1.2 方法

        1.2.1 細(xì)胞核懸液制備

        待測樣品和標(biāo)樣的芽內(nèi)幼葉各取0.05 g放入預(yù)冷的培養(yǎng)皿里,加入預(yù)冷的LB01解離液[18](15 mmol·L-1Tris,2 mmol·L-1EDTA-Na2,0.5 mmol·L-1四鹽酸精胺,80 mmol·L-1KCl,20 mmol·L-1NaCl,15 mmol·L-1β-巰基乙醇,0.1%(v/v)TritonX-100,pH 7.5)1 mL,用鋒利刀片將組織切碎,用40 μm的濾網(wǎng)過濾,即得細(xì)胞核懸液。整個(gè)過程在冰上完成。

        另取5個(gè)待測樣品和一個(gè)標(biāo)樣的芽內(nèi)幼葉各0.05 g,以同樣的方法制備細(xì)胞核懸液作為空白對照;以紫玉蘭作內(nèi)標(biāo)時(shí),分別取5個(gè)待測樣品各0.05 g以上述方法制備細(xì)胞核懸液后與紫玉蘭細(xì)胞核懸液混合進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析。

        1.2.2 DNA染色

        將得到的細(xì)胞核懸液于4℃,1 000 r·min-1,離心5 min,棄上清液。在沉淀中加入500 μL預(yù)冷的PI-RNase染液[19],置于4℃冰箱避光染色15~30 min;空白對照組在沉淀中加入500 μL預(yù)冷的RNA酶液,置于4℃冰箱避光放置15~30 min。

        1.2.3 流式細(xì)胞儀檢測

        利用BD InfluxTM流式細(xì)胞儀對經(jīng)染色后的細(xì)胞核懸液樣品上機(jī)檢測,采用488 nm藍(lán)光激發(fā),收集5 000~10 000個(gè)顆粒。使用BD FACSTMSortware 1.0.0.650分析軟件作圖分析。待測樣品的DNA-C值和倍性按照以下公式[20]計(jì)算:

        2 結(jié)果與分析

        2.1 目標(biāo)樣品峰的確定

        將空白對照組與樣品組在相同儀器狀態(tài)下上機(jī)檢測,以排除細(xì)胞自發(fā)熒光的干擾。如圖1所示,左圖為紫玉蘭空白對照,右圖為染色后的紫玉蘭。由圖可見,對照只有碎片峰而沒有目標(biāo)樣品峰,染色后的紫玉蘭出現(xiàn)清晰的G0/G1期峰圖,而且S期及G2/M期細(xì)胞分布狀態(tài)均可以觀察到。流式分析的準(zhǔn)確性一般以變異系數(shù)(CV)來表示,CV值越小,峰圖結(jié)果分析就越準(zhǔn)確。一般來說CV值小于5%,實(shí)驗(yàn)結(jié)果才可信,但由于植物組織的樣品制備難度較大,CV值可控制在8%以內(nèi)[21]。待測樣品的目標(biāo)峰圖確定方法同上。

        2.2 5種木蘭科植物的C值及倍性

        圖2為5種木蘭科植物的流式細(xì)胞術(shù)測定結(jié)果,分別比較各樣品與紫玉蘭的G0/G1期峰值相對位置,可以得出它們的2C值與倍性結(jié)果,進(jìn)而可以計(jì)算得到1C值與1Cx值。從被子植物C值數(shù)據(jù)庫中查得紫玉蘭的C值為4.95 pg,據(jù)此可計(jì)算得出5種木蘭科植物的C值及倍性結(jié)果(表1)。5種植物的DNA-C值各不相同,最大的是廣玉蘭,最小的是雜交馬褂木。根據(jù)植物C值大小的5個(gè)等級(jí):很小(≤1.4 pg)、小(≤3.5 pg)、中等(>3.5,<14.0 pg)、大(≥14.0 pg)、很大(≥35.0 pg)[22],該5種木蘭科植物C值大小屬于小到中等水平。由全倍體基因組大小2C值除以倍性可以得到基礎(chǔ)基因組大小1Cx值,其范圍是1.97~2.72 pg,除了深山含笑的1Cx值大小與紫玉蘭相同之外,其他種的1Cx值皆有差異,表明其基礎(chǔ)基因組大小存在一定程度的變異。

        圖1 紫玉蘭的流式直方圖Fig.1 The FCM histogram of M.liliiflora

        種名SpeciesDNA?C值DNA?Cvalue(pg)DNA?2C值DNA?2Cvalue(pg)倍性PloidylevelCx值Cxvalue(pg)已報(bào)道C值Cvalueinpreviouswork(pg)紫玉蘭Magnolialiliiflora?4.959.902n=4x2.484.56[23],5.09[24]雜交馬褂木Liriodendronchinense×tulipifera1.973.942n=2x1.97N深山含笑Micheliamaudiae2.484.962n=2x2.482.28[23],1.76[24]長蕊含笑Michelialongistamina2.725.432n=2x2.72N廣玉蘭Magnoliagrandiflora6.9213.832n=6x2.315.61[23],6.81[24],4.53?二喬玉蘭Magnoliasoulangeana4.599.182n=4x2.305.50[24],5.98?

        注:*C值數(shù)據(jù)庫(http://data.kew.org/cvalues);N.尚未報(bào)道

        Note:*the database of C-value(http://data.kew.org/cvalues);N.Has not been reported

        圖2 以紫玉蘭為對照5種木蘭科植物的流式直方圖Fig.2 Controlled by M.liliiflora,the FCM histogram of five species in Magnoliaceae

        3 討論

        對于同一種植物而言,由于采用不同的標(biāo)樣、解離液、材料類型、染色方法、流式細(xì)胞儀和畫圖軟件,C值測定值都會(huì)有所不同[25]。本研究采用的標(biāo)樣與待測樣品同屬一科,細(xì)胞核含量相近,滿足內(nèi)標(biāo)法參照樣本的選擇條件[19]。以紫玉蘭為內(nèi)標(biāo),雜交馬褂木與深山含笑的流式峰圖如圖1中A與B所示,目標(biāo)樣本峰同參照樣本峰均不重疊,且CV值均小于6%,結(jié)果比較可靠。本研究也對長蕊含笑、廣玉蘭及二喬玉蘭3種植物嘗試過紫玉蘭內(nèi)標(biāo)法,發(fā)現(xiàn)目標(biāo)樣本峰均與參照樣本峰部分重疊,故改用外標(biāo)法來測定其C值與倍性。外標(biāo)法在進(jìn)行常規(guī)的倍性分析與細(xì)胞核DNA含量測定時(shí)沒有內(nèi)標(biāo)法精確,因此通過預(yù)實(shí)驗(yàn)提高外標(biāo)法的實(shí)驗(yàn)精確度尤為重要。選擇合適的解離液、材料類型、保存方法及材料用量等可以有效提高實(shí)驗(yàn)精確度。通過預(yù)實(shí)驗(yàn)得出:解離液采用LB01,實(shí)驗(yàn)材料選擇未展開的芽內(nèi)幼葉,采樣后立即進(jìn)行實(shí)驗(yàn)且材料用量0.05 g可以有效減少實(shí)驗(yàn)誤差。為進(jìn)一步提高實(shí)驗(yàn)精度,所有樣本均采用相同染色液(PI),并加入RNA酶,以排除RNA的干擾。染色溫度控制在4℃左右,從而增強(qiáng)熒光染料結(jié)合的穩(wěn)定性,減少熒光損耗。此外,每個(gè)樣品采集5 000~10 000個(gè)細(xì)胞,變異系數(shù)最大不能超過8%,盡量控制在5%左右,以保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。國內(nèi)外對木蘭科植物的細(xì)胞學(xué)研究主要集中在核型分析上,其倍性水平大多已知,而關(guān)于DNA-C值的報(bào)道相對較少。木蘭科核型研究表明[26],除木蘭屬有二倍體、三倍體、四倍體、五倍體和六倍體外,其他屬都為二倍體。本研究所得兩種含笑屬植物以及雜交馬褂木的流式結(jié)果均為二倍體,木蘭屬植物二喬玉蘭和廣玉蘭分別為四倍體和六倍體,與報(bào)道相符。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,深山含笑的C值為2.28 pg[23]或1.76 pg[24],本研究測得的結(jié)果為2.48 pg;廣玉蘭C值測定結(jié)果為6.92 pg,文獻(xiàn)報(bào)道其值為5.61 pg[23]或6.81 pg[24],均比被子植物C值數(shù)據(jù)庫中收錄的廣玉蘭C值4.53 pg大;數(shù)據(jù)庫中收錄的二喬玉蘭C值為5.98 pg,另有文獻(xiàn)報(bào)道其值為5.50 pg[24],而本研究測得的二喬玉蘭C值偏小,為4.59 pg。究其原因,可能是由于不同的操作方法導(dǎo)致了測定結(jié)果的差異。除此之外,二喬玉蘭為雜交種,在園林上栽培品種繁多,不同品種的C值可能存在一定的差異[27]。而且不同植物材料由于生境的不同C值也可能會(huì)發(fā)生變異,如Price等[28]測定了向日葵(Helianthusannuus)在不同光照條件下植株不同器官的核DNA-C值,發(fā)現(xiàn)在裸露的有直射光照的樣地上,向日葵葉片DNA C-值為6.56±0.06 pg,半蔭條件(從附近區(qū)域接收直射光和散射光)下向日葵葉片核DNA含量為6.21±0.07 pg。

        Leitch等[29]由整個(gè)陸生植物基因組大小比較研究得出植物基因組大小進(jìn)化趨勢是朝著增大的方向進(jìn)行。從木蘭科內(nèi)各屬種的系統(tǒng)進(jìn)化角度分析,是否也符合這種趨勢呢?木蓮屬是木蘭科最原始的類群,Parris等[23]測定的10種木蓮屬植物平均C值為2.44 pg;鵝掌楸屬是木蘭科最進(jìn)化的類群,該屬3個(gè)種的平均C值為1.80 pg。木蘭屬的界限歷來是木蘭科分類中爭議的焦點(diǎn),分子研究表明玉蘭亞屬與含笑屬親緣關(guān)系較其與木蘭亞屬更近[30]。木蘭亞屬(Subgen.Magnolia,)為較原始的類群,16種該亞屬植物的平均C值為2.68 pg[23];而玉蘭亞屬(Subgen.Yulania)為較進(jìn)化的類群,14種玉蘭亞屬植物的平均C值為4.07 pg[23]。含笑屬為較進(jìn)化類群,19種含笑屬植物的C值平均數(shù)為2.31 pg[23]。2種擬單性木蘭屬植物的平均C值為6.02 pg[24],該屬是木蘭科中兩性花向單性花過渡的中間類群[31]。根據(jù)葉江林等[24]的研究,古老種蓋裂木(Talaumahodgsoni)的C值為2.95 pg,進(jìn)化種合果木(Paramicheliabaillonii)與觀光木(Tsoongiodendronodorum)的C值分別為2.67與2.09 pg。由此可見,在木蘭科中,基因組大小的進(jìn)化趨勢總體上是從大到小,但這種趨勢是否正確需要更多數(shù)據(jù)來進(jìn)一步探索。

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        introduction:ZHAO Qing(1991—),female,graduate,major in plant physiology and biochemistry.

        date:2016-09-06

        AnalysisofDNAC-valueandPloidyofFiveSpeciesinMagnoliaceae

        ZHAO Qing1ZHANG Qiang1ZHOU Peng2LIN Feng3FANG Yan-Ming1*

        (1.College of Biology and the Environment,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037;2.Jiangsu Academy of Forestry,Nanjing 211153;3.Advanced Analysis and Testing Center,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037)

        In this study, the C-value and ploidy of five species in Magnoliaceae was estimated by flow cytometry usingMagnolialiliifloraas the reference. The results showed that the two species ofMicheliaare diploid,Magnoliagrandiflorais hexaploid, andM.soulangeanais tetraploid. The C-Values of five species are different from each other. The C-value ofM.grandiflorais the largest among the five species investigated, while the C-value ofLiriodendronchinense×tulipiferais the smallest. The sizes of C-values of the five species are small to medium level.

        flow cytometry;C-value;ploidy;Magnoliaceae

        趙青(1991—),女,碩士研究生,主要從事植物生理生化方面的研究。

        * 通信作者:E-mail:jwu4@njfu.edu.cn

        2016-09-06

        * Corresponding author:E-mail:jwu4@njfu.edu.cn

        Q949.747.1

        A

        10.7525/j.issn.1673-5102.2016.06.008

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