張振坤,王玉嬌,霍玲玲,袁小轉(zhuǎn),孫 瑩,吳建峰*
(1.江蘇今世緣酒業(yè)股份有限公司,江蘇 漣水 223400;2.南京工業(yè)大學(xué) 生物與制藥工程學(xué)院,江蘇 南京 210000)
一株產(chǎn)纖溶酶芽孢桿菌的分離鑒定與產(chǎn)酶特性
張振坤1,2,王玉嬌1,霍玲玲1,袁小轉(zhuǎn)1,孫瑩1,吳建峰1*
(1.江蘇今世緣酒業(yè)股份有限公司,江蘇 漣水 223400;2.南京工業(yè)大學(xué) 生物與制藥工程學(xué)院,江蘇 南京 210000)
從大曲中分離到一株產(chǎn)纖溶酶的芽孢桿菌,命名為B4。該菌革蘭氏染色呈陽(yáng)性,菌體桿狀,專(zhuān)性好氧,能夠利用甲醇作唯一碳源。通過(guò)形態(tài)特征觀察、生理生化特性并結(jié)合基于16S rDNA序列比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育分析,鑒定菌株B4為甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillus methylotrophicus)。該菌最適生長(zhǎng)溫度為35℃,最適發(fā)酵初始pH值為7.0,發(fā)酵42 h酶活力最高可達(dá)649 U/mL。
大曲;纖溶酶;甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌;鑒定;產(chǎn)酶特性
血栓是一種常見(jiàn)的心腦血管類(lèi)疾病。鏈激酶(streptokinase,SK)、尿激酶(urokinase,UK)、葡激酶(staphylokinase,SAK)等是臨床上治療該類(lèi)疾病的常用藥物,但這些藥物存在著特異性差、半衰期短、需大劑量連續(xù)用藥等缺點(diǎn)[1-2]。1987年日本學(xué)者從納豆中分離到一種高效纖溶酶——納豆激酶[3],引起了各界的廣泛關(guān)注,產(chǎn)蛋白酶微生物成為重要的產(chǎn)纖溶酶潛在菌種。此后國(guó)內(nèi)外研究人員先后從豆豉、豆醬、魚(yú)蝦醬等材料中分離到多株具有產(chǎn)纖溶酶能力的菌株,這些菌株絕大多數(shù)屬于枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)及其近緣種群[4-6]。
目前研究篩選纖溶酶產(chǎn)生菌多以高蛋白發(fā)酵食品為對(duì)象,較少涉及其他材料。大曲是一種傳統(tǒng)的固態(tài)發(fā)酵酶制劑,是白酒釀造過(guò)程中微生物和酶的主要來(lái)源。經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的培養(yǎng)篩選,大曲中富集了多種產(chǎn)酶性能優(yōu)良的微生物,其中包括大量產(chǎn)中性或堿性蛋白酶的芽孢桿菌,其所產(chǎn)蛋白酶一般具有活力較高、溫度耐受性較強(qiáng)等特性[7-8]。本研究以釀酒大曲這一傳統(tǒng)固態(tài)發(fā)酵酶制劑為材料,分離其中的芽孢桿菌,采用酪蛋白平板法初篩、瓊脂糖-纖維蛋白平板法復(fù)篩,篩選產(chǎn)纖溶酶能力較強(qiáng)的芽孢桿菌,為挖掘大曲微生物資源、開(kāi)發(fā)高效的纖溶酶提供參考。
1.1材料與試劑
1.1.1大曲及試劑
分菌樣品中高溫大曲:今世緣酒業(yè)股份有限公司;牛纖維蛋白原、凝血酶(430 U/瓶)、尿激酶(1 240 U/支):中國(guó)食品藥品檢定研究院;擴(kuò)增引物27F、1492R:上海生工生物工程有限公司。
1.1.2培養(yǎng)基
斜面與平板培養(yǎng)基采用營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基:蛋白胨10.0g/L,牛肉浸出粉3.0g/L,氯化鈉5.0g/L,瓊脂粉20.0g/L,121℃滅菌15 min。
酪素培養(yǎng)基:葡萄糖1.0g/L,酵母膏1.0g/L,酪素5.0g/L,K2HPO41.0g/L,KH2PO40.5g/L,MgSO40.5g/L,瓊脂15.0g/L,pH7.0~7.2,121℃滅菌15 min。
種子培養(yǎng)基:葡萄糖10.0 g/L,蛋白胨10.0 g/L,NaCl 5.0 g/L,pH 7.0~7.2,121℃滅菌15 min。
發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖20.0 g/L,蛋白胨20.0 g/L,KH2PO42.0 g/L,K2HPO44.0 g/L,MgSO40.5 g/L,pH 7.0~7.2,121℃滅菌15 min。
1.2儀器與設(shè)備
GHP-9160隔水式恒溫培養(yǎng)箱:上海一恒科學(xué)儀器有限公司;HHS214電熱恒溫水浴鍋:江蘇省醫(yī)療器材廠;SHZ-82恒溫振蕩器:金壇市杰瑞爾電器有限公司;BX-41顯微鏡:日本OLYMPUS公司;KGSX500高壓蒸汽滅菌器:日本TOMY公司;GelDoc2000凝膠成像儀:美國(guó)BIO-RAD公司;UV-2550分光光度計(jì):日本島津公司。
1.3實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1菌種的分離與篩選
大曲用無(wú)菌研缽研碎,取10 g放入無(wú)菌三角瓶,加入90mL無(wú)菌水,搖床振蕩30min后將三角瓶置于80℃水浴鍋中保溫10min。取1mL菌液逐級(jí)稀釋?zhuān)總€(gè)梯度吸取0.1mL涂布營(yíng)養(yǎng)瓊脂平板37℃條件下培養(yǎng)48 h,根據(jù)菌落形狀、大小、表面形態(tài)等特征挑取不同的單菌落多次劃線獲得純培養(yǎng)[9]。
粗酶液的制備[10]:將分離獲得的純培養(yǎng)采用稀釋涂布法涂布酪素培養(yǎng)基平板,挑取有明顯溶解圈的菌落接入試管并編號(hào)保藏。初篩得到的菌種挑取一環(huán)分別接入種子培養(yǎng)基,37℃條件下150 r/min培養(yǎng)18 h,按照4%接種量接到發(fā)酵培養(yǎng)基(裝液量60 mL/250 mL)中振蕩培養(yǎng)48 h。發(fā)酵液8 000 r/min離心10 min得粗酶液。
菌種篩選:凝血酶和纖維蛋白原作用生成交聯(lián)纖維蛋白,呈乳白色,不透明。交聯(lián)纖維蛋白被纖溶酶分解后乳白色消失,在瓊脂糖-纖維蛋白平板上形成半透明的溶解圈,以溶解圈的大小反映纖溶酶活力。制作的瓊脂糖-纖維蛋白平板,用直徑3 mm的打孔器打孔[11]。用微量進(jìn)樣器吸取10 μL粗酶液注入瓊脂糖-纖維蛋白平板上的孔中,同時(shí)以不接菌的發(fā)酵培養(yǎng)基離心上清液作空白對(duì)照,以尿激酶溶液作陽(yáng)性對(duì)照,于37℃條件下溫育并觀察記錄溶解圈情況。
1.3.2纖溶酶活力測(cè)定
瓊脂糖-纖維蛋白平板法是測(cè)定尿激酶、蚓激酶、納豆激酶等纖溶酶活力的常用方法,纖溶酶活力通常以已知活力值的尿激酶來(lái)衡量。將尿激酶溶液梯度稀釋?zhuān)?24 U/mL、248 U/mL、496 U/mL、744 U/mL、992 U/mL、1240 U/mL),各取10 μL點(diǎn)樣于瓊脂糖-纖維蛋白平板上,于37℃條件下溫育15 h后用游標(biāo)卡尺測(cè)量溶解圈垂直的兩個(gè)直徑,以溶解圈面積(以互相垂直的兩直徑之積表示,下同)為橫坐標(biāo),以尿激酶活力為縱坐標(biāo)繪制尿激酶標(biāo)準(zhǔn)曲線,得出標(biāo)準(zhǔn)曲線線性方程。同時(shí)測(cè)定樣品的溶解圈面積,按照尿激酶標(biāo)準(zhǔn)曲線線性方程計(jì)算出纖溶酶活力[12]。
1.3.3形態(tài)觀察與生理生化鑒定
將分離菌株在營(yíng)養(yǎng)瓊脂平板上劃線,37℃條件下培養(yǎng)24 h后觀察菌落形態(tài)并拍照;參照《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[13]中芽孢桿菌屬鑒別特征選擇生理生化實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)行初步鑒定。結(jié)合分子生物學(xué)鑒定結(jié)果參照相關(guān)文獻(xiàn)對(duì)分離菌株作進(jìn)一步鑒定[14]。
1.3.4菌株基于16S rDNA的分子生物學(xué)鑒定[9,15]
菌株基因組的提取與16S rDNA的擴(kuò)增:用煮沸法提取的菌株脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)作為模板,采用通用引物27F和1492R進(jìn)行聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后送上海生工測(cè)序。16S rDNA序列比對(duì)與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建:將測(cè)序結(jié)果在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)上進(jìn)行基本局部聯(lián)配搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)同源序列比對(duì)分析,下載同源性高的模式菌株16S rDNA序列,與試驗(yàn)菌株的序列一起用ClustalX1.8和MEGA4.0采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
1.3.5菌株B4產(chǎn)纖溶酶條件
最適產(chǎn)酶溫度:發(fā)酵培養(yǎng)基接種后分別于25℃、30℃、35℃、40℃、45℃恒溫振蕩培養(yǎng)48 h后,按照1.3.1所述方法制備粗酶液并測(cè)定溶解圈面積。最適產(chǎn)酶pH:發(fā)酵培養(yǎng)基初始pH分別調(diào)為5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5,于最適溫度下恒溫振蕩培養(yǎng)48 h后,按照1.3.1所述方法制備粗酶液并測(cè)定溶解圈面積。生長(zhǎng)曲線及最佳產(chǎn)酶時(shí)間:在最適溫度、最適pH條件下培養(yǎng),每隔6 h取發(fā)酵液按照1.3.1所述方法制備粗酶液并測(cè)定溶解圈面積,并以未接菌的培養(yǎng)基做參比測(cè)定波長(zhǎng)600 nm處的OD600nm值。
2.1產(chǎn)纖溶酶芽孢桿菌的分離篩選
用酪蛋白平板法初篩得到菌株9株,采用瓊脂糖-纖維蛋白平板法對(duì)上述菌株進(jìn)行復(fù)篩,結(jié)果見(jiàn)圖1。由圖1可知,有7株菌的粗酶液在瓊脂糖-纖維蛋白平板上產(chǎn)生溶解圈,其編號(hào)分別為A3、B2、B4、B6、B7、B8和C6。
圖1 粗酶液在瓊脂糖-纖維蛋白平板上產(chǎn)生的溶解圈Fig.1 Lysis zone of the crude enzyme on agarose-fibrin plates
尿激酶活力與其在纖維蛋白平板上的溶解圈面積呈線性關(guān)系,實(shí)驗(yàn)得其標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程為y=2.824x-875.9,相關(guān)系數(shù)R2=0.991 0。按照回歸方程計(jì)算各菌株發(fā)酵液的纖溶活性,結(jié)果如表1所示。由表1可知,菌株B4產(chǎn)纖溶酶活力最高,為524 U/mL。菌株B7、菌株B2及菌株B6產(chǎn)纖溶酶活力分別為494 U/mL、436 U/mL、380 U/mL,而菌株A3、菌株B8及菌株C6產(chǎn)纖溶酶活力較低(<124 U/mL)。因此,選擇菌株B4用于后續(xù)試驗(yàn)。
表1 分離菌株產(chǎn)纖溶酶活力的比較Table 1 Comparison of fibrinolytic enzyme activity produced by isolated strains
2.2菌株B4形態(tài)特征
菌株B4的菌落形態(tài)及革蘭氏染色結(jié)果見(jiàn)圖2。
圖2 菌株B4的菌落形態(tài)(A)與革蘭氏染色(B)Fig.2 Colony morphology(A)and gram staining(B)of strain B4
由圖2A可知,菌株B4的菌落近圓形,直徑4~8 mm,扁平,邊緣有缺刻,表面干燥,呈灰白色。由圖2B可知,菌株B4的革蘭氏染色呈陽(yáng)性,菌體桿狀。
2.3菌株B4生理生化特性
按照《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》中芽孢桿菌屬鑒別特征,選擇生理生化實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)行初步鑒定,結(jié)果見(jiàn)表2。
表2 生理生化實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table 2 Results of physiology and biochemistry experiments
由表2可知,菌株B4能夠分解酪素和淀粉,液化明膠,V-P測(cè)定與觸酶實(shí)驗(yàn)呈陽(yáng)性,專(zhuān)性好氧,可以利用檸檬酸鹽,不能利用丙酸鹽,發(fā)酵D-木糖、D-甘露醇產(chǎn)酸,能夠利用甲醇作唯一碳源。形態(tài)特征與生理生化特性符合文獻(xiàn)中關(guān)于枯草芽孢桿菌及其近源種的描述[13]。
2.4菌株B4的分子生物學(xué)鑒定
選擇產(chǎn)纖溶酶活最高的菌株B4進(jìn)行16S rDNA序列鑒定,提取菌株B4基因組DNA,將得到的基因組作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果見(jiàn)圖3。由圖3可知,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列長(zhǎng)度為1500bp左右。
圖3 菌株B4 16S rDNA PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig.3 PCR amplification products electrophoresis of 16S rDNA of strain B4
將菌株B4的16S rDNA序列信息遞交到GenBank上獲得登錄號(hào)KU059179。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)菌株B4與枯草芽孢桿菌亞種及其近緣種同源性較高,其中與甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillus methylotrophicus)的同源性最高,達(dá)到99.38%。下載同源性高于97%的前14株菌的16S rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果見(jiàn)圖4。由圖4可知,菌株B4與甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌聚為一支且自展值達(dá)到95,與文獻(xiàn)中關(guān)于甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌生理生化特性和形態(tài)特征的報(bào)道一致[14],因此將菌株B4鑒定為甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillus methylotrophicus)。
圖4 基于16Sr DNA構(gòu)建的株菌B4系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.4 Phylogenetic tree of strain B4 based on the 16S rDNA
2.5菌株B4的產(chǎn)酶特性分析
2.5.1發(fā)酵溫度對(duì)菌株B4產(chǎn)酶的影響
由圖5可知,發(fā)酵溫度為35℃時(shí),溶解圈面積最大,溫度過(guò)低或過(guò)高酶活性均有所下降,尤其發(fā)酵溫度>35℃時(shí),溶解圈面積下降明顯。發(fā)酵溫度<35℃不利于B4的生長(zhǎng)繁殖,產(chǎn)酶量少;而發(fā)酵溫度過(guò)高容易導(dǎo)致纖溶酶失活。因此,確定最佳發(fā)酵溫度為35℃。
圖5 發(fā)酵溫度對(duì)菌株B4產(chǎn)酶的影響Fig.5 Effect of fermentation temperature on enzyme production of strain B4
2.5.2初始pH對(duì)菌株B4產(chǎn)酶的影響
由圖6可知,培養(yǎng)基初始pH值為7.0時(shí),溶解圈面積最大,說(shuō)明中性條件有利于菌株B4產(chǎn)酶,初始pH<6.5或>7. 5均對(duì)菌株B4產(chǎn)酶不利。因此,最佳初始pH值為7.0。
圖6 初始pH對(duì)菌株B4產(chǎn)酶的影響Fig.6 Effect of initial pH on enzyme production of strain B4
2.5.3發(fā)酵時(shí)間對(duì)菌株B4產(chǎn)酶的影響
圖7 發(fā)酵時(shí)間對(duì)菌株B4生長(zhǎng)和產(chǎn)酶的影響Fig.7 Effect of fermentation time on the growth and enzyme production of strain B4
由圖7可知,菌體生長(zhǎng)的延滯時(shí)間很短,接種后很快進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,發(fā)酵至第18小時(shí)時(shí)菌體生長(zhǎng)達(dá)到穩(wěn)定期,24 h后進(jìn)入衰退期。接種后0~6 h無(wú)溶解圈產(chǎn)生,從第6小時(shí)開(kāi)始大量產(chǎn)生纖溶酶,18 h后產(chǎn)酶速率趨緩,至第42小時(shí)發(fā)酵液中溶解圈面積達(dá)到最高,此后酶活力逐漸下降??芍闎4發(fā)酵產(chǎn)纖溶酶屬于部分生長(zhǎng)偶聯(lián)型,產(chǎn)酶滯后于菌體生長(zhǎng)。因此,最佳發(fā)酵時(shí)間為42 h。
采用酪蛋白平板法初篩、瓊脂糖-纖維蛋白平板法復(fù)篩,從釀酒大曲中分離到一株產(chǎn)纖溶酶活力較高的芽孢桿菌B4。對(duì)菌株B4進(jìn)行了形態(tài)學(xué)觀察和生理生化試驗(yàn),同時(shí)進(jìn)行16SrDNA序列比對(duì)并構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),將菌株B4鑒定為甲基營(yíng)養(yǎng)型芽孢桿菌(Bacillus methylotrophicus)。產(chǎn)酶特性實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該菌最適產(chǎn)酶溫度為35℃,最適初始pH值為7.0,發(fā)酵42 h產(chǎn)酶活力最高為649 U/mL。
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Isolation and identification of a fibrinolytic enzyme-producingBacillusand its enzyme-production characteristics
ZHANG Zhenkun1,2,WANG Yujiao1,HUO Lingling1,YUAN Xiaozhuan1,SUN Ying1,WU Jianfeng1*
(1.JiangSu King's Luck Brewery Co.,Ltd.,Lianshui 223400,China;2.College of Biological and Pharmaceutical Engineering,Nanjing Tech University,Nanjing 210000,China)
A fibrinolytic enzyme-producingBacillusnamed B4 was isolated fromDaqu.The strain was a Gram-positive,rod-shaped,obligate aerobic bacterium and could use methanol as sole carbon source.According to morphology observation,physiological-biochemical characteristic and phylogenetic analysis based on 16S rDNA sequence,the strain B4 was identified asBacillus methylotrophicus.The optimum growth temperature of strain B4 was 35℃,the optimum fermentation initial pH was 7.0 and fermentation time was 42 h.Under the conditions,the fibrinolytic enzyme activity could be up to 649 U/ml.
Daqu;fibrinolytic enzyme;Bacillus methylotrophicus;identification;enzyme-production characteristics
Q939.9
0254-5071(2016)09-0064-04doi:10.11882/j.issn.0254-5071.2016.09.015
2016-05-05
張振坤(1985-),男,助理工程師,碩士研究生,研究方向?yàn)閼?yīng)用微生物。
吳建峰(1966-),男,教授級(jí)高級(jí)工程師,博士,研究方向?yàn)獒劸瓶茖W(xué)。