周洪經(jīng),郭明日,馮 爽,張麗霞△
(1.天津市海河醫(yī)院檢驗科 300350;2.國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)防治傳染病重點研究室,天津 300350)
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·論著·
Xpert MTB/RIF在快速診斷肺結(jié)核及利福平耐藥中的臨床應(yīng)用
周洪經(jīng)1,2,郭明日1,馮爽1,張麗霞1△
(1.天津市海河醫(yī)院檢驗科300350;2.國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)防治傳染病重點研究室,天津 300350)
目的探討利福平耐藥實時熒光定量核酸擴(kuò)增檢測技術(shù)(Xpert MTB/RIF)在肺結(jié)核診斷及其耐藥性檢測中的臨床應(yīng)用價值。方法收集408例結(jié)核患者標(biāo)本,同時采用抗酸染色法、固體培養(yǎng)法及Xpert MTB/RIF檢測,并對其結(jié)果進(jìn)行分析比較。結(jié)果408例標(biāo)本抗酸染色法、固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測出結(jié)核分枝桿菌的陽性率分別為25.00%(102/408)、42.16%(172/408)和58.09%(237/408)。經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析,Xpert MTB/RIF陽性率高于抗酸染色法和固體培養(yǎng)法,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。其中,固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測均為陽性的標(biāo)本共168例,經(jīng)比例法藥物敏感試驗與Xpert MTB/RIF檢測利福平耐藥率分別為26.19%(44/168)和27.38%(46/168),2種方法耐藥率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),以比例法藥敏試驗作為金標(biāo)準(zhǔn),Xpert MTB/RIF檢測利福平耐藥的敏感度為97.73%(43/44),特異性為97.58%(121/124)。結(jié)論Xpert MTB/RIF可快速、準(zhǔn)確檢測結(jié)核分枝桿菌及利福平耐藥性,具有重要的臨床應(yīng)用價值。
結(jié)核分枝桿菌;Xpert MTB/RIF;耐藥
結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(MTB)引起的嚴(yán)重危害人類健康的慢性傳染性疾病,據(jù)2010年全國第5次結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查結(jié)果顯示,全國活動性肺結(jié)核患者高達(dá)499萬例,每年新發(fā)結(jié)核患者約100萬例[1]。實驗室檢查為結(jié)核病的確診提供病原學(xué)證據(jù),也是確診傳染性結(jié)核尤其是耐多藥結(jié)核病的重要依據(jù)。目前,我國對結(jié)核病的診斷主要依賴于傳統(tǒng)的抗酸染色法和培養(yǎng)法,這些診斷方法的敏感度及特異度較低,且耗時耗力,無法滿足臨床需要,因而,迫切需要1種早期、快速、準(zhǔn)確診斷結(jié)核病及其耐藥性的方法。新型的實時熒光定量核酸擴(kuò)增檢測技術(shù)(Xpert MTB/RIF)全自動檢測系統(tǒng)以全自動半巢式實時聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)為基礎(chǔ),以rpoB基因為靶基因,可在2 h內(nèi)同時檢測MTB和利福平耐藥,該方法于2010年12月世界衛(wèi)生組織批準(zhǔn)用于MTB及多重耐藥MTB(MDR-TB)的快速診斷。本文采用Xpert MTB/RIF系統(tǒng)對肺結(jié)核患者M(jìn)TB及其對利福平耐藥性進(jìn)行檢測,并與傳統(tǒng)的檢測方法進(jìn)行對比分析,評價Xpert MTB/RIF技術(shù)在結(jié)核病快速診斷中的應(yīng)用價值。
1.1一般資料收集2015年1月至2016年1月期間在海河醫(yī)院治療的結(jié)核病患者408例,其中,痰標(biāo)本276例,灌洗液132例。
1.2儀器與試劑Xpert MTB/RIF反應(yīng)盒及SR標(biāo)本處理液(美國Cepheid公司); 分枝桿菌涂片鏡檢萋尼染色液、酸性羅氏培養(yǎng)基(珠海貝索生物技術(shù)有限公司)。
1.3方法所有標(biāo)本均同時進(jìn)行萋尼抗酸染色、固體培養(yǎng)和Xpert MTB/RIF檢測。
1.3.1抗酸染色法采用離心濃縮法,參照《結(jié)核病實驗室標(biāo)準(zhǔn)化操作與網(wǎng)絡(luò)建設(shè)》[2]。鏡檢結(jié)果根據(jù)抗酸菌量多少判讀為4+、3+、2+、1+、1~8條、陰性。
1.3.2固體培養(yǎng)法采用中和離心法。痰標(biāo)本置于50 mL離心管中,加入2倍體積4% NaOH渦旋振蕩1 min,室溫靜置20 min,加入磷酸鹽緩沖液(pH6.8)至50 mL,3 000 r/min離心20 min,棄上清;灌洗液直接3 000 r/min離心20 min,棄上清。沉淀加入1~2 mL磷酸鹽緩沖液,混懸接種于羅氏固體培養(yǎng)基,于37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng),接種后第3、7天觀察培養(yǎng)情況,以后每周觀察1次,并記錄生長情況。
1.3.3藥物敏感性試驗制備1 mg/mL菌懸液,梯度稀釋為10-2和10-4mg/mL,接種到含RIF(40 μg/mL)的羅氏固體培養(yǎng)基和空白對照管培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)4周,觀察結(jié)果。每批藥物敏感性試驗用H37Rv作為敏感對照,以評價含藥培養(yǎng)基質(zhì)量。
1.3.4Xpert MTB/RIF核酸擴(kuò)增檢測取1 mL痰標(biāo)本加入前處理管中,視樣本性狀加入2倍樣本體積的SR處理液,灌洗液經(jīng)離心后加入2 mL SR處理液,渦旋振蕩15~30 s,靜置15 min。吸取2 mL處理后樣本緩慢加入反應(yīng)盒,放入檢測模塊開始進(jìn)行自動化檢測。對MTB結(jié)果判讀根據(jù)DNA拷貝的高低分為高、中、低、極低和未檢測出5個等級;RIF藥敏結(jié)果分為:RIF Resistance檢出,RIF耐藥和RIF Resistance未檢出,RIF敏感。
1.4統(tǒng)計學(xué)處理用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,率之間比較采用χ2檢驗和確切概率法,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.13種檢測方法陽性結(jié)果比較408例標(biāo)本均同時采用抗酸染色法、固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測,其陽性率分別為25.00%(102/408)、42.16%(172/408)和58.09%(237/408),經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析,Xpert MTB/RIF與抗酸染色法陽性率比較(P<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義;與固體培養(yǎng)法陽性率比較(P<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義,Xpert MTB/RIF檢測MTB的陽性率高于抗酸染色法和固體培養(yǎng)法,結(jié)果見表1。
276例痰標(biāo)本經(jīng)抗酸染色法、固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測的陽性率分別為27.53%(76/276)、43.84%(121/276)、57.61%(159/276);132例灌洗液經(jīng)3種方法檢測的陽性率分別為19.70%(26/132)、38.63%(51/132)、59.09%(78/132)。Xpert MTB/RIF檢測痰標(biāo)本與灌洗液標(biāo)本陽性率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
表1 3種檢測方法陽性結(jié)果比較(n)
2.2Xpert MTB/RIF與抗酸染色法檢出菌量比較276例痰標(biāo)本中,Xpert MTB/RIF檢測高、中、低、極低、未檢測出5個量級的例數(shù)和抗酸染色檢測為4+、3+、2+、1+、1~8條、陰性的例數(shù)詳見表2。Xpert MTB/RIF檢測“高”量級25例中涂片染色有2例為陰性,“中”量級69例中涂片染色有21例為陰性,“低”量級42例中涂片染色有37例為陰性,“極低”量級23例中涂片染色檢測全部為陰性。
表2 痰標(biāo)本中Xpert MTB/RIF與抗酸
132例灌洗液標(biāo)本中Xpert MTB/RIF檢測高、中、低、極低、未檢測出5個量級的例數(shù)以及抗酸染色法檢測為4+、3+、2+、1+、1~8條、陰性的例數(shù)見表3。Xpert MTB/RIF檢測“高”量級5例中涂片染色全部為陽性,“中”量級16例中涂片染色有4例為陰性,“低”量級24例中涂片染色有16例為陰性,“極低”量級33例中涂片染色檢測全部為陰性。
表3 灌洗液標(biāo)本中Xpert MTB/RIF法與
表4 Xpert MTB/RIF與比例法檢測利福平耐藥性比較(n)
2.3Xpert MTB/RIF與比例法檢測利福平耐藥性比較固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測均為陽性的標(biāo)本共168例,比例法藥物敏感試驗與Xpert MTB/RIF檢測利福平耐藥菌分別為44例和46例,耐藥率分別為26.19%(44/168)和27.38%(46/168),Xpert MTB/RIF檢測利福平耐藥率與比例法相比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。2種方法檢測利福平都耐藥的菌株有43例,均為敏感的菌株121例,以比例法藥物敏感試驗作為金標(biāo)準(zhǔn),Xpert MTB/RIF檢測利福平耐藥的敏感度為97.73%(43/44),特異性為97.58%(121/124),檢測結(jié)果見表4。
傳統(tǒng)的結(jié)核病診斷方法的敏感度和特異度較低且耗時耗力,無法滿足臨床需要,近年來,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,越來越多的分子診斷技術(shù)不斷涌現(xiàn),Xpert MTB/RIF技術(shù)便是其中之一。該技術(shù)是將PCR所需的3個步驟即樣本準(zhǔn)備、擴(kuò)增、檢測集于一體的實時熒光定量核酸擴(kuò)增檢測技術(shù),操作簡便,試驗中基本不產(chǎn)生氣溶膠,極大程度地減少了操作中污染的可能性。該方法自動運(yùn)行并檢測是否為MTB及是否對RIF耐藥,快速、簡便完成整個試驗約2 h。
本文對408例結(jié)核患者標(biāo)本同時采用抗酸染色法、固體培養(yǎng)法和Xpert MTB/RIF檢測,Xpert MTB/RIF法具有更高的敏感度及特異度[3-4]。Xpert MTB/RIF檢測痰標(biāo)本與灌洗液標(biāo)本陽性率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),這與相關(guān)的報道基本一致[5-6]。表2、3顯示,Xpert MTB/RIF檢測為“低”和“極低”2個量級的標(biāo)本,抗酸染色法的陽性率極低,這與國外報道類似[7-8]。表1中有1例抗酸染色法和培養(yǎng)陽性而Xpert MTB/RIF檢測為陰性的標(biāo)本,后經(jīng)菌種鑒定為胞內(nèi)分枝桿菌。
傳統(tǒng)的MTB藥敏試驗需要進(jìn)行菌株的分離培養(yǎng),耗時長達(dá)2個月,而Xpert MTB/RIF可快速測定對利福平的耐藥情況,并且具有較高的符合率,為臨床選擇藥物治療提供重要依據(jù)。對于Xpert MTB/RIF與比例法檢測RIF耐藥結(jié)果不一致的4株菌,可能與藥物敏感性試驗的控制條件不良有關(guān),也可能與某些基因位點突變的低水平耐藥相關(guān)[9]。
綜上所述,Xpert MTB/RIF具有敏感度及特異度高、檢出時間短的優(yōu)勢,適用于抗酸染色陰性的可疑結(jié)核病患者的快速診斷,并且與參考方法的藥敏試驗結(jié)果有較高的符合率。
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Application of Xpert MTB/RIF assay on rapid detection of MTB and rifampin-resistant
ZHOUHongjing1,2,GUOMingri1,F(xiàn)ENGShuang1,ZHANGLixia1△
(1.LaboratoryMedicalofHaiheHospital,Tianjin300350;2.StateAdministrationofTraditionalChineseMedicineKeyLaboratoryofInfectionsDiseasePreventionandControl,Tianjin300350)
ObjectiveTo investigate clinical value of Xpert MTB/RIF assay on rapid detection of MTB and rifampin-resistant.Methods408 cases of tuberculosis were detected by acid-fast stain,Solid culture and Xpert MTB/RIF,the results were compared.ResultsAll the samples were detected by acid-fast stain,culture and Xpert MTB/RIF assay,the positive rates were 25.00%(102/408),42.16%(172/408) and 58.09%(237/408),respectively.The positive rates of Xpert MTB/RIF assay were higher than acid-fast stain and culture method,and the difference is statistically significant(P<0.05).There are 168 cases of specimen which were tested positively by both culture and Xpert MTB/RIF,the RIF resistance rates from standard drug susceptibility testing and Xpert MTB/RIF assay respectively were 26.19%(44/168) and 27.38%(46/168),and had no statistical significance(P>0.05).According to the result of drug susceptibility with proportion method,the sensitivity and specificity of Xpert MTB/RIF in detecting RIF resistance were 97.73%(43/44) and 97.58%(121/124).ConclusionXpert MTB /RIF can quickly and accurately detect MTB and RIF resistance,it has important clinical significance.
Mycobacterium tuberculosis;Xpert MTB/RIF;drug-resistance
周洪經(jīng),女,技師,主要從事病原微生物學(xué)方面的研究。△
,E-mail:zhouhj85@126.com。
10.3969/j.issn.1673-4130.2016.18.024
A
1673-4130(2016)18-2568-03
2016-04-27
2016-07-05)