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        基因檢測(cè)不是用來(lái)講故事的

        2016-10-14 04:09:57陳飛
        東西南北 2016年18期
        關(guān)鍵詞:高通量基因組位點(diǎn)

        陳飛

        淘寶店銷(xiāo)售的基因檢測(cè)套餐,不僅宣稱(chēng)能預(yù)測(cè)疾病風(fēng)險(xiǎn),還能測(cè)小孩的天賦,以及為男女性格配對(duì)。把基因檢測(cè)吹得萬(wàn)能,是對(duì)基因檢測(cè)的傷害。

        “一口唾沫就能測(cè)出來(lái)容易得什么病,這不是神棍嗎?反正我是覺(jué)得不靠譜?!弊罱?,家住北京市海淀區(qū)的黃先生與妻子鄭女士發(fā)生了口角,起因是,妻子花5400元做了一套疾病易感基因檢測(cè),做完以后還推薦他也去。

        鄭女士選擇的是北京三博基因檢測(cè)公司。理由是“性?xún)r(jià)比高”,還有專(zhuān)門(mén)定制的“女性套餐”。在網(wǎng)站上向客服簡(jiǎn)單咨詢(xún)之后,她通過(guò)淘寶下了訂單,過(guò)了幾天就收到了寄來(lái)的檢測(cè)包。

        “就是一個(gè)棉簽,你在自己嘴里轉(zhuǎn)一圈放進(jìn)容器寄回去就行了,很簡(jiǎn)單,沒(méi)幾天報(bào)告就寄回來(lái)了。一開(kāi)始我就是感覺(jué)新鮮,想試試,現(xiàn)在覺(jué)得,基因檢測(cè)很有意義。結(jié)果也很準(zhǔn)確,自己平時(shí)心腦血管方面不太好,檢測(cè)報(bào)告中顯示這方面的基因確實(shí)有缺陷!”

        鄭女士收到的報(bào)告書(shū)上,不僅列出了乳腺癌、宮頸癌、冠心病、糖尿病等常見(jiàn)疾病的發(fā)病率,還包括雌激素水平、酒精代謝能力、青春痘等方面的風(fēng)險(xiǎn)狀況。

        “不光這些,那淘寶店我看了,還能測(cè)小孩天賦,還有男女性格配對(duì),你說(shuō)這跟算命的有什么區(qū)別?”黃先生和妻子的態(tài)度不同,他對(duì)這樣的高科技毫不“感冒”。

        托精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的福

        作為一種被推向市場(chǎng)的服務(wù),基因檢測(cè)這門(mén)技術(shù)看起來(lái)很神奇,而實(shí)際上它并非什么新技術(shù)。

        基因檢測(cè)是通過(guò)血液、其他體液或細(xì)胞對(duì)DNA序列進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)。從1977年Sanger發(fā)明第一代測(cè)序技術(shù)開(kāi)始,至今已有近30年,這一技術(shù)在基因病,特別是單基因病的基因診斷和產(chǎn)前診斷中已經(jīng)廣為使用。

        即使從2007年高通量測(cè)序技術(shù)(Highthroughput sequencing,又稱(chēng)NGS)的發(fā)明算起,也有9年的時(shí)間了。但公眾對(duì)這一領(lǐng)域的廣泛關(guān)注,可能要從2013年安吉莉娜·朱莉測(cè)出自己攜帶乳腺癌易感基因BRCA1、2后切除乳腺開(kāi)始。

        2015年1月20日,美國(guó)總統(tǒng)奧巴馬在國(guó)情咨文中提出“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃”后,以基因檢測(cè)為基礎(chǔ)的精準(zhǔn)醫(yī)療概念成為覆蓋全球的熱門(mén)話(huà)題。目前應(yīng)用最廣泛的基因檢測(cè)是通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)開(kāi)展新生兒遺傳性疾病的檢測(cè)、遺傳病的診斷和癌癥的輔助診斷。

        廣州中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室副教授郭奕斌介紹說(shuō),第一代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用非常廣泛,在基因病方面,特別是單基因病現(xiàn)癥病人和攜帶者的基因診斷方面,都是不可或缺的診斷手段,從發(fā)明至今,一直作為基因診斷的金標(biāo)準(zhǔn)。目前,臨床應(yīng)用中涉及基因診斷較多的基本都是采用這一技術(shù),主要用于地中海貧血、血友病,白化病、苯酮尿癥等病的診斷。

        目前遺傳機(jī)制明確的單基因病約有5000種,但單基因病在人群中比較少見(jiàn),“幾千多種單基因疾病,總的發(fā)病率在2%左右?!惫缺笳f(shuō),而在受多個(gè)基因影響的疾病中,像乳腺癌這樣鑒定了確切的致病基因的,并不多見(jiàn)。

        “首先,一個(gè)病的發(fā)生,遺傳和后天環(huán)境的影響都是有的。對(duì)于復(fù)雜疾病來(lái)說(shuō),不一定你有易感基因就一定得病。在首先理解了遺傳因素在致病中的作用以后,才能來(lái)討論多致病基因的問(wèn)題。假如我們能夠找到靠譜的致病基因,那都能發(fā)很厲害的論文了。怎么可能你隨便測(cè)幾個(gè)位點(diǎn),就這么確鑿地給出一個(gè)患病率呢?更別提‘天賦基因這個(gè)事兒了,跟你說(shuō)能測(cè)天賦的,那就是騙子?!币晃徊辉竿嘎缎彰难芯咳藛T說(shuō)。

        郭奕斌表示,“對(duì)于多基因影響的復(fù)雜疾病來(lái)說(shuō),第一代測(cè)序其實(shí)并不是最合適的技術(shù)手段。因?yàn)椴僮鞣爆嵡也荒茏詣?dòng)化,即使是現(xiàn)在,也無(wú)法保證測(cè)序公司一定能在24小時(shí)之內(nèi)給出所測(cè)片段的結(jié)果,哪怕只是數(shù)百個(gè)堿基對(duì)?!笨蒲兄?,尋找多基因疾病的致病基因或易感基因,基本都是用高通量測(cè)序技術(shù)。對(duì)于疑難病癥,在第一代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)不出的情況下,也可考慮采用NGS。

        可以在單細(xì)胞、單分子水平上對(duì)基因組進(jìn)行測(cè)序的第三代測(cè)序技術(shù)應(yīng)用范圍則更為廣闊?!安贿^(guò),這種技術(shù)適合測(cè)全基因組,測(cè)試少數(shù)幾個(gè)位點(diǎn)反而沒(méi)有性?xún)r(jià)比?!?/p>

        盲人摸象

        確切地說(shuō),目前面向一般消費(fèi)者的所謂基因檢測(cè)技術(shù),大部分并非是基因測(cè)序,而是基因芯片篩查。

        人類(lèi)基因組一共有大約30億對(duì)堿基,其中99.9%是相同的。而在那0.01%的不同中,最常見(jiàn)和最普遍的一種叫做單核苷酸多態(tài)性(SNP),也就是單個(gè)堿基的不同。它是人類(lèi)可遺傳的變異中最常見(jiàn)的一種。正是這些基因上的不同之處,定義了我們每個(gè)人的人種、皮膚、頭發(fā)、眼晴顏色等等所有性狀,也定義了不同的人對(duì)疾病不同的敏感性。

        由于成本的原因,多數(shù)測(cè)序公司提供的并非是全基因組的完整測(cè)序,而是基于定制化的SNP分型芯片來(lái)做的。而這些分型的依據(jù),就是針對(duì)特定疾病或性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果。測(cè)序公司所能做的,是將測(cè)得的SNP與特定疾病人群的SNP進(jìn)行比較,并據(jù)此做出推測(cè)。換句話(huà)說(shuō),如果某人的SNP與某疾病高發(fā)人群的對(duì)應(yīng)SNP相似,他就有可能患病。

        “一張芯片上有幾千、上萬(wàn)個(gè)位點(diǎn),一旦檢測(cè)到其中你某些位點(diǎn)的基因型與文獻(xiàn)報(bào)道中的某病有關(guān)的基因型一致,就會(huì)告訴你,患有某病的風(fēng)險(xiǎn)增加。整個(gè)患病風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)方法,就是符合的位點(diǎn)越多,算出的風(fēng)險(xiǎn)越高?!鄙鲜鲅芯咳藛T介紹說(shuō)。

        但是,這些測(cè)序公司選擇的SNP位點(diǎn)可能來(lái)自于不同研究報(bào)告的結(jié)論。而且,他們采用的檢測(cè)技術(shù)和分析方案也各有不同,同一個(gè)SNP位點(diǎn)的同一種狀態(tài),根據(jù)不同的分析方法也許就會(huì)出現(xiàn)不同的概率。一脈基因創(chuàng)始人郝向穩(wěn)說(shuō):“現(xiàn)在國(guó)內(nèi)做基因檢測(cè)的公司并沒(méi)有一個(gè)統(tǒng)一的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),所以不同的基因檢測(cè)公司往往給出不同的分析結(jié)果。用不同的技術(shù)、不同的數(shù)據(jù)庫(kù)做出來(lái)的結(jié)果肯定會(huì)不一樣?!?

        事實(shí)上,尋找致病基因最大的難點(diǎn),不是測(cè)序的技術(shù)過(guò)程,而是對(duì)序列意義的解讀。單基因或染色體突變的遺傳病比較容易確定,比如鐮刀型紅細(xì)胞貧血癥,只要有一個(gè)堿基突變,就會(huì)造成紅血球形態(tài)失常。但是冠心病、癌癥等常見(jiàn)病,一般都是由多個(gè)基因共同變異以及環(huán)境因素累積而導(dǎo)致,病人不一定有家族史,其遺傳機(jī)制都是尚不消楚的。而且在相關(guān)研究中,遺傳分析的假設(shè)也有所不同,即使有很多研究發(fā)現(xiàn)一些基因高度相關(guān),卻因?yàn)槿巳?、地域等很多因素不具備普適性。

        上述匿名研究人員說(shuō):“說(shuō)白了,疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)估是建立在基因組大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上的。很多時(shí)候,科研報(bào)告的數(shù)據(jù)都不夠多、不夠全,只能給出一個(gè)相關(guān)性結(jié)論,這種情況下討論復(fù)雜疾病患病風(fēng)險(xiǎn),基本就是盲人摸象,不同人摸出來(lái)的都不一樣?!?/p>

        “安吉麗娜·朱莉同款”

        在基因測(cè)序技術(shù)領(lǐng)先的美國(guó),也有人表示過(guò)對(duì)測(cè)序準(zhǔn)確性的懷疑。2013年12月,《紐約時(shí)報(bào)》報(bào)道過(guò)相關(guān)的事例。

        基拉·皮克福因?yàn)榧易宄蓡T的疾病關(guān)系,對(duì)自己未來(lái)的健康表示擔(dān)憂(yōu),她希望能從基因測(cè)序里面找到一些提示和建議。于是,她在包括23andMe在內(nèi)的三家不同的基因測(cè)序公司做了檢測(cè)。但最后拿到的各家的分析結(jié)論卻大相徑庭。

        23andMe是一家獲谷歌投資的基因檢測(cè)公司,也是這一領(lǐng)域開(kāi)發(fā)大眾消費(fèi)市場(chǎng)的先驅(qū)。2007年,23andMe就開(kāi)始面向普通大眾提供基因檢測(cè)服務(wù),而當(dāng)時(shí)人類(lèi)基因組計(jì)劃僅僅完成兩年時(shí)間。他們的99美元個(gè)人基因測(cè)序產(chǎn)品能提供與24種遺傳障礙有關(guān)的58種基因突變信息,預(yù)測(cè)200多種其他健康癥狀風(fēng)險(xiǎn),如糖尿病、脂瀉病等。

        但2013年,F(xiàn)DA叫停了23andMe向消費(fèi)者提供與健康分析有關(guān)的基因檢測(cè),要求他們只能提供始祖分析、基因?qū)びH檢測(cè)服務(wù)。

        一直到2015年10月22日,F(xiàn)DA才給23andMe發(fā)放通行證,一次性批準(zhǔn)了36項(xiàng)遺傳病的基因檢測(cè)。被批準(zhǔn)的內(nèi)容都是相對(duì)來(lái)說(shuō)因果關(guān)系比較明確的遺傳病,有爭(zhēng)議的疾病風(fēng)險(xiǎn)分析則不包括在內(nèi)。與之前不同,23andMe不再給消費(fèi)者提供疾病風(fēng)險(xiǎn)信息,也就是說(shuō),報(bào)告上不會(huì)出現(xiàn)患病風(fēng)險(xiǎn)率的數(shù)字,而是僅僅關(guān)注消費(fèi)者攜帶36個(gè)致病基因的狀況。

        在此期間,23andMe公司轉(zhuǎn)向?yàn)橹扑幤髽I(yè)研發(fā)提供基因數(shù)據(jù)服務(wù),并在2015年3月宣布準(zhǔn)備在未來(lái)幾年向制藥業(yè)發(fā)展,將多年積累的基因數(shù)據(jù)進(jìn)行自主藥品開(kāi)發(fā)。實(shí)際上,目前看來(lái),基因測(cè)序技術(shù)除了在臨床診斷、產(chǎn)前診斷上應(yīng)用之外,較為成熟的應(yīng)用前景就是靶向治療。

        一位相關(guān)從業(yè)者評(píng)論說(shuō),“23andMe是一種更為高級(jí)的商業(yè)模式。而且背靠谷歌的龐大資源。而中國(guó)國(guó)內(nèi)的芯片篩查,是以較低級(jí)的商業(yè)模式,更弱的技術(shù)實(shí)力,和高無(wú)數(shù)倍的產(chǎn)品定價(jià),在做和23andMe一模一樣的事。這個(gè)項(xiàng)目扔到美國(guó),一定活不下去。但在國(guó)內(nèi)做,還是很有可能賺大錢(qián)的,因?yàn)?3andMe不好進(jìn)來(lái)?!?/p>

        事實(shí)上,在中國(guó),國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局(CFDA)也對(duì)臨床領(lǐng)域的基因測(cè)序技術(shù)有著嚴(yán)格的把關(guān)。2014年2月9日,CFDA與國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)叫停了基因檢測(cè)的臨床應(yīng)用。

        2014年12月,國(guó)家衛(wèi)計(jì)委先后發(fā)布了《關(guān)于開(kāi)展高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)工作的通知》和《關(guān)于產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)開(kāi)展高通量基因測(cè)序產(chǎn)前篩查與診斷臨床應(yīng)用試點(diǎn)工作的通知》。這意味著高通量基因測(cè)序技術(shù)在基因檢測(cè)領(lǐng)域的臨床應(yīng)用獲得國(guó)家認(rèn)可。但在健康領(lǐng)域,行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)仍是空白。

        一位從業(yè)者舉了一個(gè)例子:“安吉莉娜·朱莉在Myriad公司花幾千美元做乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)檢測(cè),報(bào)告中提出,她患乳癌的概率為87%;摘除乳腺后終身患病風(fēng)險(xiǎn)降至5%。這個(gè)預(yù)測(cè)的底氣是怎么來(lái)的呢?Myriad每年收到的關(guān)于BRCA的基因樣品多達(dá)15萬(wàn)件,巨量的樣本,巨量的基因型信息。而現(xiàn)在一個(gè)國(guó)內(nèi)公司,打出‘安吉莉娜·朱莉同款的旗號(hào),搞一個(gè)幾百塊錢(qián)的檢測(cè),測(cè)幾個(gè)位點(diǎn)就得。效果肯定不一樣吧!但是你向消費(fèi)者傳達(dá)了一個(gè)什么信息呢?這東西就值幾百塊。這對(duì)整個(gè)行業(yè)就很不好。”

        但郝向穩(wěn)對(duì)基因檢測(cè)的消費(fèi)市場(chǎng)仍舊持樂(lè)觀態(tài)度。他說(shuō):“一些基于銷(xiāo)售出發(fā),把基因檢測(cè)吹得很萬(wàn)能的公司,確實(shí)是對(duì)基因檢測(cè)的一種傷害。但是,中國(guó)也要啟動(dòng)自己的精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃,這個(gè)市場(chǎng)還是會(huì)越來(lái)越大的。畢竟,如果根據(jù)國(guó)外研究結(jié)果來(lái)給國(guó)內(nèi)的人做分析,因?yàn)橛腥朔N上的差異,準(zhǔn)確性也要打折扣,所以,建立我們自己的基因庫(kù)也是很重要的?!?/p>

        (姜宇婷薦自《中國(guó)新聞周刊》)

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