唐 蕊,張雪輝,殷世群,萬慧潔
(1.邢臺(tái)學(xué)院化學(xué)工程與生物技術(shù)學(xué)院 河北邢臺(tái) 054001; 2.邢臺(tái)市林業(yè)局 河北邢臺(tái) 054000)
黃瓜枯萎病是由半知菌亞門尖孢鐮孢菌黃瓜?;蚚Fusarium oxysporum(Schl.)f.sp.cucumerinumOwen.]引起的一種嚴(yán)重的土傳病害,在黃瓜露地和保護(hù)地栽培中均有發(fā)生,是影響黃瓜生產(chǎn)最主要的病害之一。病菌從幼根或傷口侵入,危害維管束,阻礙水分運(yùn)輸,使植株迅速萎蔫且病勢(shì)發(fā)展迅速,很難控制。發(fā)病率一般為10%~30%,嚴(yán)重時(shí)可達(dá)80%~90%[1-2]。近年來,該病的發(fā)生程度日趨嚴(yán)重,嚴(yán)重影響黃瓜的產(chǎn)量,導(dǎo)致經(jīng)濟(jì)效益降低,造成巨大損失。目前生產(chǎn)上針對(duì)黃瓜枯萎病的防治除了選用抗病品種、結(jié)合輪作倒茬或嫁接等栽培管理等農(nóng)業(yè)措施外,配合處理種子與土壤及發(fā)病初期施藥等化學(xué)防治方法進(jìn)行綜合防治。化學(xué)藥劑主要有青枯立克、惡霉靈、甲霜惡霉靈等,雖然各種藥劑交替使用能有效緩解病菌抗藥性的產(chǎn)生,但長(zhǎng)期使用導(dǎo)致許多菌株出現(xiàn)抗藥性,防治效果減弱;另一方面,化學(xué)藥劑的大量使用,也造成藥品殘留等食品安全問題。隨著人們經(jīng)濟(jì)能力的提高、環(huán)保意識(shí)的加強(qiáng),對(duì)食品質(zhì)量提出了更高的要求,加之現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的發(fā)展和《食品安全法》的實(shí)施,農(nóng)產(chǎn)品的安全生產(chǎn)顯得尤為重要。利用拮抗菌防治枯萎病屬于生物防治,對(duì)人畜無害、不污染環(huán)境、果實(shí)安全性高,成為專家學(xué)者研究的熱點(diǎn)。近年來主要研究的生防菌類群有真菌類的木霉、叢枝菌根,細(xì)菌類的芽孢桿菌、假單胞桿菌和放線菌類的鏈霉菌屬[3-4]。本研究在對(duì)黃瓜枯萎病拮抗菌篩選的基礎(chǔ)上,通過培養(yǎng)特征觀察、顯微觀察、革蘭氏染色、16S rDNA序列分析等對(duì)拮抗效果較好的拮抗菌HM-7進(jìn)行鑒定,為生防制劑的研發(fā)奠定理論基礎(chǔ)。
1.1.1 供試菌株 拮抗菌HM-7(邢臺(tái)學(xué)院微生物實(shí)驗(yàn)室從黃瓜種植園土樣中分離獲得,對(duì)黃瓜枯萎病拮抗效果顯著的菌株)。
1.1.2 培養(yǎng)基及試劑 牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉膏 3g,蛋白胨 10g,NaCl 5g,瓊脂 17g,水 1 000 mL。牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基:牛肉膏3g,蛋白胨10g,NaCl 5g,水 1 000 mL。馬鈴薯培養(yǎng)基(PDA):馬鈴薯 200g,葡萄糖 20g,瓊脂 17g,水 1 000 mL。高氏 I號(hào)培養(yǎng)基:可溶性淀粉 20g,KNO31g,NaC1 0.5g,K2HPO4·3H2O 0.5g,MgSO40.5g,F(xiàn)eSO40.01g,瓊脂 17g,水 1 000 mL,pH 7.2~7.4。SK8255 基因組抽提試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.2.1 拮抗菌HM-7菌株菌落特征觀察 采用平板劃線分離法。將活化的生防菌HM-7分別接種至牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基、PDA培養(yǎng)基、高氏I號(hào)培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng),觀察不同時(shí)間其在不同培養(yǎng)基中的菌落特征。
1.2.2 顯微觀察和革蘭氏染色 選取生長(zhǎng)24h的生防菌HM-7進(jìn)行顯微觀察,并進(jìn)行革蘭氏染色,在油鏡下觀察結(jié)果[5]。
1.2.3 拮抗菌HM-7基因組DNA的提取 將拮抗菌HM-7的單菌落接種到牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基中,在37℃中,200 r·min-1下震蕩培養(yǎng)過夜。取1 mL菌體培養(yǎng)液于EP管中,8 000 r·min-1離心1min,棄上清液。加入 20mg·mL-1的溶菌酶 180 μL,置于37℃水浴鍋中保溫1h,期間每10min混勻一次。加入蛋白酶K 20 μL,混勻后置于56℃水浴鍋中保溫30min,過程中每10min搖勻一次。加入20mg·mL-1的 RNA 酶 20 μL,室溫放置 3min。加入Buffer BD 200 μL,放置于70℃水浴鍋中水浴10min。加入200 μL無水乙醇,充分混勻,放置2min。12 000 r·min-1離心 1min,棄去液體。加入含異丙醇的 PW Buffer 500 μL,10 000 r·min-1離心30 s,棄上清液。加入含無水乙醇的Wash Solution,10 000 r·min-1離心 30 s,棄去液體,再離心 2min,棄去殘留液體,置于室溫晾干。加入100 μL的CE Buffer 12 000 r·min-1離心 2min,保存 DNA 溶液。過夜后,采用1.0%瓊脂糖凝膠80 V電泳檢測(cè)DNA,采集電泳圖像[6-8]。
1.2.4 16S rDNA序列的PCR擴(kuò)增 將提取的生防菌HM-7基因組DNA進(jìn)行16S rDNA的PCR擴(kuò)增[6-8]。 PCR 擴(kuò)增的 引物 27F:5’GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG 3’;1492R:5’CGGCTACCTTGTTACGACTT 3’。PCR擴(kuò)增體系:HM-7基因組DNA(100 ng·μL-1)1 μL,正向引物(4 nmol·mL-1)0.5 μL,反向引物(4 nmol·mL-1)0.5 μL,dNTP(10 mmol·mL-1)0.5 μL,10 倍Taq酶緩沖液 2.5 μL,Taq酶(2 U·μL-1)0.2 μL 加水至 25 μL。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)轭A(yù)變性94℃5min,變性94℃30 s,退火55℃35 s,延伸 72℃ 1min,35個(gè)循環(huán),延伸 8min,擴(kuò)增完成。采用1.0%瓊脂糖凝膠80 V電泳檢測(cè)DNA,采集電泳圖像。
1.2.5 PCR產(chǎn)物收集 將電泳結(jié)果PCR產(chǎn)物依據(jù)購自上海生工的回收盒標(biāo)示的使用說明進(jìn)行回收。
1.2.6 PCR序列測(cè)序分析 回收后的PCR產(chǎn)物寄送到生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。將拮抗菌HM-7的16S rDNA測(cè)序結(jié)果在Blast(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)在線分析比對(duì),利用MEGA 5.0中的Neighbor-Joining方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹來鑒定HM-7分類地位,進(jìn)化性分支模式的穩(wěn)定性用MEGA 5.0中的Bootstrap分析。
牛肉膏培養(yǎng)基上生長(zhǎng)初期,菌落呈米白色,邊緣光滑,有突起,水潤(rùn)透明,不產(chǎn)色素。生長(zhǎng)后期菌株呈乳白色,邊緣呈小波浪狀,有明顯的突起,褶皺,不產(chǎn)色素,菌株挑起時(shí)有拉絲,呈黏稠狀(圖1)。PDA培養(yǎng)基上生長(zhǎng)初期與牛肉膏上相似,后期邊緣光滑,突起不明顯,菌落外緣有透明圈(圖2)。高氏Ⅰ號(hào)培養(yǎng)基上僅有很少量菌落生長(zhǎng)。
圖1 牛肉膏培養(yǎng)基菌落
圖2 PDA培養(yǎng)基菌落
顯微鏡下油鏡觀察,生防菌HM-7菌株為短桿狀,具有運(yùn)動(dòng)性,革蘭氏染色呈陽性(圖3)。
圖3 革蘭氏染色油鏡觀察
生防菌HM-7基因組DNA提取瓊脂糖凝膠電泳鑒定,采集圖像(圖4),參照分子量標(biāo)準(zhǔn)可知,HM-7的DNA大小在2 500 bp以上;16S rDNA基因的PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳鑒定,采集圖像(圖5),參照分子量標(biāo)準(zhǔn)條可知16S rDNA片段的長(zhǎng)度在1 500 bp左右。16S rDNA測(cè)序結(jié)果在NCBI上比對(duì),生防菌HM-7與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloquefaciens)、枯草芽孢桿菌(B.subtilissubsp)、萎縮芽孢桿菌(B.subtilissubsp)相似度均達(dá)99%,與地衣芽孢桿菌(B.licheniformis)相似度達(dá)98%。利用MEGA軟件構(gòu)建出系統(tǒng)發(fā)育樹(圖6),HM-7與解淀粉芽孢桿菌處于同一分支,親緣關(guān)系更近。結(jié)合細(xì)菌生長(zhǎng)形態(tài)觀察初步鑒定HM-7為解淀粉芽孢桿菌。
圖4 基因組DNA電泳圖
圖5 PCR產(chǎn)物電泳圖
圖6 拮抗菌HM-7系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
通過對(duì)培養(yǎng)特征觀察、顯微觀察、革蘭氏染色、16S rDNA序列分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,初步鑒定拮抗菌HM-7為解淀粉芽孢桿菌。
由于微生物殺菌劑對(duì)環(huán)境污染小、果實(shí)安全性高,其發(fā)展趨勢(shì)與人類生態(tài)環(huán)境、食品安全和生物多樣性具有良好的相容性,加之現(xiàn)代微生物工業(yè)化生產(chǎn)技術(shù)的日趨完善,研發(fā)可替代化學(xué)殺菌劑的微生物殺菌劑是植物病害生物防治研究的重要方面。芽孢桿菌種群龐大,繁殖能力強(qiáng),耐熱、耐酸堿,理化性質(zhì)穩(wěn)定,抑菌譜廣泛,是研究較為廣泛和深入的微生物類群之一,也是應(yīng)用于植物病害生物防治的生防菌的主要來源之一。我國(guó)已研發(fā)成功并投入生產(chǎn)的生防芽孢桿菌商品制劑有百抗、麥豐寧、紋曲寧、伊天得、根腐消等[9-11]。本研究中的拮抗菌HM-7被初步鑒定為解淀粉芽孢桿菌,而解淀粉芽孢桿菌是目前作為生防芽孢桿菌中的主要菌種之一,故其有望開發(fā)為生物制劑應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。但拮抗菌HM-7的抑菌譜、拮抗物質(zhì)穩(wěn)定性、產(chǎn)生條件、分離提取以及拮抗機(jī)制等方面均有待進(jìn)一步試驗(yàn)探索。
隨著生物技術(shù)的發(fā)展,利用分子生物學(xué)技術(shù)導(dǎo)入拮抗基因研發(fā)工程菌株,或是采用誘變育種、原生質(zhì)體融合育種等技術(shù)進(jìn)一步獲得拮抗效果更加卓越的菌株,將成為生防制劑研發(fā)的新方向。