施星臣 耿哲 施鑫鶴
骨肉瘤Saos-2細(xì)胞Set7/9基因沉默及基因治療靶點(diǎn)構(gòu)建
施星臣耿哲施鑫鶴
目的:構(gòu)建沉默的人Set7/9的真核表達(dá)載體,篩選其穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的骨肉瘤Saos-2細(xì)胞株,評(píng)價(jià)干擾效果以及對(duì)骨肉瘤相關(guān)基因表達(dá)和細(xì)胞增殖的影響,為臨床骨肉瘤基因治療提供新靶點(diǎn)。方法:依據(jù)靶向序列,構(gòu)建人Set7/9基因的shRNA和對(duì)照載體,穩(wěn)定轉(zhuǎn)染骨肉瘤細(xì)胞Saos-2。應(yīng)用Real-time PCR以及Western-blot方法檢測(cè)其基因和蛋白質(zhì)水平,確定該基因的沉默情況。結(jié)果:構(gòu)建載體Set7/9-shRNA,Real-time PCR和Western-blot結(jié)果顯示,沉默后Set7/9基因和蛋白表達(dá)明顯被抑制,而與其相關(guān)的Sirt1、Suv39h1蛋白表達(dá)水平提高,細(xì)胞增殖率增加。結(jié)論:沉默Set7/9基因后,上調(diào)與其相關(guān)的Sirt1和Suv39h1蛋白表達(dá)水平,Set7/ 9基因在骨肉瘤Saos-2細(xì)胞系中可能調(diào)控其的表達(dá)。此外,細(xì)胞增殖效率增加表明Set7/9具有抑制骨肉瘤Saos-2細(xì)胞增殖的作用。
Set7/9;Saos-2細(xì)胞;Western-blot
【Abstract】Objective:To silencehuman gene Set7/9 and screen outstable transfection cell line in Saos-2,and investigate the impact ofknockdown ofSet7/9 and influence to theexpression of the related genes.Supplynew target forclinical testand therapy.M ethods:The target oligowasdesigned by thesoftand synthesized,shRNA interferencevectorand the controlvectorwere constructed and transfected into Saos-2 cells.Then Real-time PCR and western-blotwere performed for detection of knockdown of Set7/9.Results:The shRNA interference vector wasconstructed and transfected into Saos-2 cellssuccessfully,comparedwith thenegative controlgroup,theexpression ofSet7/9wasdramatically down-regulated.Meanwhile,expression of related protein Sirt1 up regulated.Conclusion:Down regulation the expression of Set7/9 can upregulate Sirt1and Suv39h1,imply thatSet7/9may regulate theirexpression in Saos-2,and suppress theproliferation.
【Keywords】Set7/9;Saos-2 cells;Western-blot
骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)又稱為成骨肉瘤,是從間質(zhì)細(xì)胞系發(fā)展而來(lái)的一種最常見(jiàn)的原發(fā)性骨惡性腫瘤,在兒童和年輕成人中具有高侵襲性和遠(yuǎn)端高發(fā)轉(zhuǎn)移性[1]。小兒骨惡性腫瘤治療包括新輔助化療和手術(shù)技術(shù),治療方法雖有巨大進(jìn)步,但仍有大量的復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移的病例[2,3]。骨肉瘤的治愈率約為25%,治愈水平幾乎停滯在20年前[4,5]。因此,迫切需要研究其發(fā)病機(jī)制,為藥物研究提供新的靶點(diǎn),從而為臨床給出新的治療方案。
表觀遺傳學(xué)方面的研究逐漸成為熱點(diǎn),其在腫瘤發(fā)生和發(fā)展中的作用也不斷被揭示,其中越來(lái)越多的報(bào)道探討了SET結(jié)構(gòu)域在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的作用[6,7]。SET結(jié)構(gòu)域是蛋白賴氨酸甲基化轉(zhuǎn)移酶(protein ysine methyltransferases,PLMTs或PKMTs)家族成員[8,9]。有報(bào)道Set7/9可介導(dǎo)Suv39h1甲基化,致使基因組不穩(wěn)定[10],對(duì)Sirtuin 1(Sirt1)去乙酰化起作用[11],而Suv39h1與腫瘤發(fā)病有關(guān)。對(duì)于Set7/9在骨肉瘤細(xì)胞中如何影響Suv39h1以及Sirt1基因和蛋白水平表達(dá),是否可以調(diào)控其細(xì)胞活性,仍有待研究。
研究報(bào)道指出Set7/9、Suv39h1、Sirt1等基因之間存在一定相互作用,而這些作用與一些疾病的發(fā)生有關(guān)。這三個(gè)基因在骨肉瘤細(xì)胞中的作用,特別是起關(guān)鍵調(diào)控作用的Set7/9基因鮮有報(bào)道。本研究以人骨肉瘤Saos-2細(xì)胞株為研究對(duì)象,構(gòu)建了Set7/9-shRNA質(zhì)粒,沉默骨肉瘤細(xì)胞株中Set7/9基因,以探討其在骨肉瘤細(xì)胞系Saos-2中所發(fā)揮的作用。為臨床治療提供依據(jù)和預(yù)后判斷標(biāo)準(zhǔn);并在基礎(chǔ)研究方面為骨肉瘤細(xì)胞活性及細(xì)胞周期等方面的研究提供靶向生物治療的理論支持。
1.1實(shí)驗(yàn)材料及試劑和設(shè)備E.coli.Top10感受態(tài)細(xì)胞、骨肉瘤細(xì)胞株Saos-2均由本實(shí)驗(yàn)室保存,DNA內(nèi)切酶、DNA連接酶、DNAmarker、瓊脂糖等均購(gòu)自加拿大BBI公司;抽提質(zhì)粒的試劑盒購(gòu)買于上海生工生物工程有限公司;LipofectamineTM2000轉(zhuǎn)染試劑購(gòu)自Invitrogen公司;DMEM、胎牛血清FBS、雙抗(青鏈霉素)均購(gòu)自GIBCO公司;Polybrene購(gòu)自Sigma公司;PBS購(gòu)自AMEROSCO公司;SIRT1多克隆抗體SIRT1(sc-15404),SUV39H1單克隆抗體SUV39H1(sc-377112)SET7/9的單克隆抗體SET7/9(sc-56774),購(gòu)自SANTA CRUZ公司;熒光顯微鏡生產(chǎn)商為Motic公司,MX3000P實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀購(gòu)買于Stratagene公司。
1.2構(gòu)建SETD7-shRNA載體質(zhì)粒及其鑒定應(yīng)用在
線軟件http://genomics.jp/sidirect/,合并通過(guò)文獻(xiàn)查閱列出SET7/9基因干擾序列為GGGCACCTGGACGATGACGGA,TTCTCCGAACGTGTCACGT為陰性對(duì)照。為避免終止信號(hào)產(chǎn)生,loop結(jié)構(gòu)為TTCAAGAGA。兩端酶切位點(diǎn)EcoRI與BamHI。按照如下程序在PCR儀上退火:95℃5min;85℃5min;75℃5min;70℃5min;4℃保存。退火后得濃度為10μM的shRNA模板。酶切載體,電泳后回收。隨后,連接反應(yīng),挑選陽(yáng)性克隆,提取質(zhì)粒,測(cè)序。
1.3慢病毒載體的包裝及侵染細(xì)胞將慢病毒包裝系統(tǒng)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293FT細(xì)胞,48h收集上清并濃縮;72h再收集濃縮。滴度1×108TU/m l,重組后病毒侵染Saos-2細(xì)胞,puromycin篩選獲得穩(wěn)篩株細(xì)胞。
1.4SET7/9表達(dá)效果檢測(cè)puromycin選擇后,擴(kuò)增穩(wěn)篩株,收樣,提取總RNA,熒光定量PCR檢測(cè),SET7/9基因的(目的)F primer:CACAGATGGGAGACTGATCTTCAAG,R primer:TTACTTCTCCTACAAGGCT TCCTCC,PCR條件為:95℃,2分鐘預(yù)變性;95℃,30秒;63℃,40秒;40個(gè)循環(huán);western-blot檢測(cè)干擾后SET7/9蛋白表達(dá)情況。
1.5Saos-2細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)本實(shí)驗(yàn)采用CCK8試劑檢測(cè)Saos-2細(xì)胞增殖。制備細(xì)胞懸液:細(xì)胞計(jì)數(shù);接種到96孔板中,3個(gè)重復(fù);37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),加入10μl CCK8;培養(yǎng)3小時(shí),可以繼續(xù)培養(yǎng),以確認(rèn)最佳條件;測(cè)定450nm吸光度。
圖1 挑取Set7/9菌落測(cè)序鑒定
2.1Set7/9-shRNA載體質(zhì)粒的鑒定和測(cè)序結(jié)果空載體pGLV3/H1/GFP/puro連接插入子,之后轉(zhuǎn)化菌株Top10,挑取菌落并抽提質(zhì)粒。用EcoRI進(jìn)行單酶切,電泳進(jìn)行初步判斷,并且將符合8000bp的酶切條帶所對(duì)應(yīng)的克隆挑取2個(gè),進(jìn)行測(cè)序證明SET7/9shRNA載體構(gòu)建成功。見(jiàn)圖1。2.2 SET7/9基因沉默情況穩(wěn)篩株細(xì)胞擴(kuò)增,72h收樣,Western-blot、Realtime PCR檢測(cè)。從蛋白和基因水平上對(duì)Saos-2細(xì)胞中SET7/9基因的沉默情況進(jìn)行分析,Western-blot檢測(cè)顯示,其蛋白表達(dá)也顯著下調(diào),同樣該基因表達(dá)水平明顯被抑制(P<0.05)。β-actin為內(nèi)參,檢驗(yàn)轉(zhuǎn)染72h SET7/9基因以及蛋白表達(dá)水平。見(jiàn)圖2。
圖2 SET7/9蛋白與基因的沉默效果
2.3SET7/9基因沉默可以上調(diào)SIRT1表達(dá)同時(shí)在實(shí)驗(yàn)組中,用Western-blot對(duì)SIRT1及SUV39H1的蛋白表達(dá)進(jìn)行檢測(cè),SIRT1蛋白表達(dá)水平顯著增加,SUV39H1蛋白的表達(dá)也有上調(diào),但變化不顯著,見(jiàn)圖3。
圖3 SET7/9沉默后SIRT1與SUV39H 1蛋白表達(dá)變化
2.4SET7/9基因影響Saos-2細(xì)胞增殖對(duì)SET7/9基因進(jìn)行沉默實(shí)驗(yàn)后,相對(duì)于野生型和陰性對(duì)照組Saos-2細(xì)胞的增殖率顯著提高,從轉(zhuǎn)染后72h開(kāi)始出現(xiàn)差異,到達(dá)120h時(shí)沉默組與野生型組差異最顯著,在96h時(shí),沉默組與陰性對(duì)照組差異最明顯,見(jiàn)圖4。
圖4 SET7/9基因沉默后骨肉瘤細(xì)胞增殖率提高
骨肉瘤是從間質(zhì)細(xì)胞系發(fā)展而來(lái),是一種最常見(jiàn)的原發(fā)性骨惡性腫瘤,其中小兒骨惡性腫瘤中最為常見(jiàn)。目前對(duì)于骨肉瘤成因,特別是重要作用機(jī)制和相關(guān)因子的研究鮮有報(bào)道,因此,從分子生物學(xué)角度入手,深入探討其發(fā)病機(jī)制,有助于提高骨肉瘤治療的針對(duì)性,提高患者生存率。
對(duì)具有修飾功能的蛋白進(jìn)行研究有助于揭示其抑癌等作用的機(jī)制,Set7/9基因具有對(duì)多個(gè)與腫瘤相關(guān)基因的調(diào)控作用,對(duì)其作用機(jī)制的研究可以為骨肉瘤的發(fā)病機(jī)制提供參考依據(jù)。國(guó)內(nèi)研究人員發(fā)現(xiàn)Set7/9可以調(diào)控Sirt1,而Sirt1可以抑制p53乙?;瑢?dǎo)致p53乙?;皆龈撸?2];p53作為抑癌基因已有較多報(bào)道,在胃癌等疾病中其發(fā)生突變是早期事件[13-15]。在異染色質(zhì)形成及基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中,Set7/9可以影響Suv39h1蛋白的甲基化水平[10],研究指出,Suv39h1對(duì)于組蛋白H3K9的甲基化具有較大作用,H3K9甲基化與胃癌等在內(nèi)的一些腫瘤發(fā)生有關(guān)。因此,結(jié)合Set7/9已有的功能報(bào)道,本文對(duì)其在骨肉瘤細(xì)胞中的功能進(jìn)行研究。選擇一種有效的和長(zhǎng)期的沉默Set7/9的方法是必需的。脂質(zhì)體介導(dǎo)shRNA進(jìn)入細(xì)胞通常轉(zhuǎn)染效率低,而慢病毒包裝,轉(zhuǎn)染細(xì)胞獲得穩(wěn)定株在越來(lái)越多的研究中得到應(yīng)用[16]。通過(guò)改造HIV-1形成的逆轉(zhuǎn)錄病毒[17],shRNA可以進(jìn)行長(zhǎng)期基因沉默研究的方法[18-20],能夠?qū)⒛康幕蛘系饺旧w上,得到穩(wěn)定的細(xì)胞株。
本研究成功構(gòu)建了Set7/9-shRNA質(zhì)粒,初步探索了與其相關(guān)蛋白的表達(dá)變化情況及在骨肉瘤細(xì)胞系Saos-2中該基因的功能。研究發(fā)現(xiàn),在骨肉瘤細(xì)胞系Saos-2中沉默Set7/9基因后,與其相關(guān)作用的Sirt1蛋白表達(dá)水平顯著提高,Suv39h1蛋白表達(dá)也有所升高。這表明在Set7/9沉默后,Sirt1,Suv39h1所具有的去乙?;图谆饔迷谠鰪?qiáng),使得細(xì)胞更傾向于增殖和分裂。在細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)也進(jìn)一步證實(shí)了在Saos-2中沉默Set7/9基因后,細(xì)胞增殖率明顯高于野生型和陰性對(duì)照組,由此可以看出Set7/9基因?qū)τ诠侨饬鯯aos-2細(xì)胞的增殖具有一定的調(diào)控作用。
本研究通過(guò)沉默Set7/9基因,觀察了與其相關(guān)因子的表達(dá)變化和甲基化作用,發(fā)現(xiàn)這些因子水平的變化可能對(duì)細(xì)胞周期和活性產(chǎn)生影響,對(duì)于骨肉瘤中這些因子的相互作用,有待更深入的研究,以充實(shí)骨肉瘤的形成及轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,為進(jìn)一步開(kāi)展靶向藥物研究和臨床檢測(cè)治療提供依據(jù)。
[1]Carola AS,Arndt,Peter S,et al.Common Musculoskeletal Tumors of Childhood and Adolescence[J].Mayo Clin Proc,2012,87(5):475-487.
[2]BacciG1,F(xiàn)errariS,LonghiA,etal.Patternof relapse in patientswithosteosarcomaof the extremities treated with neoadjuvantchemotherapy[J]. Eur JCancer,2001,37(1):32-38.
[3]Kempf-Bielack B,Bielack SS,JürgensH,et al.Osteosarcoma relapse after combined modality therapy:an analysis of unselected patients in the Cooperative Osteosarcoma Study Group(COSS)[J].Journal of ClinicalOncology,2005,23(3):559-568.
[4]Gorlick R,Anderson P,Andrulis I,etal.Biology of childhood osteogenic sarcoma and potential targets for therapeutic development:meeting summary[J].Clin Cancer Res,2003,9(15):5442-5453.
[5]Allison,DC,Carney SC,Ahlmann ER,et al.A meta-analysis of osteosarcoma outcomes in themodernmedical era[J].Sarcoma,2012,2012(4):704872.
[6]Kurash JK,LeiH,Shen Q,etal.Methylation ofp53 by Set7/9mediates p53 acetylation and activity in vivo[J].Molecular cell,2008,29(3):392-400.
[7]Esteve PO,Chin HG,Benner J,et al.Regulation of DNMT1 stability through SET7-mediated lysinemethylation inmammalian cells[J].Proc Natl Acad SciUSA,2009,106(13):5076-5081.
[8]Guo HB,Guo H.Mechanism of histonemethylation catalyzed by protein lysinemethytransferase SET7/9 and origin ofproductspecificity[J]. Proc Natl Acad SciUSA,2007,104(21):8797-802.
[9]Qian C,Zhou MM.SET domain protein lysinemethyltransferases:structure,specificityand catalysis[J].CellMolLifeSci,2006,63(23):2755-63.
[10]Donglai Wang,Jingyi Zhou,Xiangyu Liu,et al.Methylation of SUV39H1 by SET7/9 results in heterochromatin relaxation and genome instability[J].Proc NatlAcad SciUSA,2013,110(14):5516-5521.
[11]Liu X,Wang D,Zhao Y,et al.Methyltransferase Set7/9 regulates p53 activity by interacting with Sirtuin 1(SIRT1)[J].Proc Natl Acad Sci USA,2011,108(5):1925-1930.
[12]Huang J,Perez-Burgos L,Placek B J,et al.Repression of p53 activity by Smyd2mediatedmethylation[J].Nature,2006,444(7119):629-632.
[13]朱薇,史平,李曉明.凋亡誘導(dǎo)因子和突變型p53在胃癌前病變組織及胃癌組織中的表達(dá)及其相關(guān)性研究[J].蘭州大學(xué)學(xué)報(bào):醫(yī)學(xué)版,2015,41(2):41-45.
[14]Scoumanne A,Chen X.Proteinmethylation:anewmechanism ofp53 tumorsuppressor regulation[J].HistolHistopathol,2008,23(9):1143-1149.
[15]Niu ZS,Li BK,Wang M,M Wang.Expression of p53 and C-myc genes and its clinical relevance in the hepatocellular carcinomatous and pericarcinomatous tissues[J].World Journal of Gastroenterology,2002,8(5): 822-826.
[16]Ghosh SS,Gopinath P,Ramesh A.Adenoviral vectors:a promising tool for gene therapy[J].Applied Biochemistry and Biotechnology,2006,133(1):9-29.
[17]Lois C,Hong E J,Pease S,etal.Germ line transmission and tissue specific expression of transgenes delivered by lentiviral vectors[J].Science,2002,295(5556):868-872.
[18]姜海艷,王玉梅,關(guān)偉軍.乳腺癌多藥耐藥機(jī)制及RNAi技術(shù)的應(yīng)用[J].中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué),2009,13(4):561.
[19]Yu JY,DeRuiter SL,Turner DL.RNA interference by expression of short-interfering RNAs and hairpin RNAs in mammalian cells[J].ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences(USA),2003,7(2):228-236
[20]Liu F,He CW,Zhang YF,et al.RNA interference by expression of shorthairpin RNAs suppresses bcl-xL gene expression in nasopharyngealcarcinomacells[J].ActaPharmacologicaSinica,2005,26(2):228-234.
Establishment and effection of Saos-2 Stable cell linesw ith Saos-2 gene knockdown and new thinking for therapy
ShiXingchen1, Geng Zhe2,ShiXinhe3.1.DepartmentofOrthopaedics,the Second People'sHospital ofLanzhou City,Lanzhou 730046,China;2.SchoolofBasic Medicine,Lanzhou University,Lanzhou 730000,China;3.Department ofCentral Laboratory,Lanzhou University Second Hospital,Lanzhou 730030,China
A
1004-2725(2016)09-0646-04
甘肅省青年科技基金計(jì)劃(項(xiàng)目編號(hào):1506RJYA315)
730046甘肅蘭州,蘭州市第二人民醫(yī)院骨科(施星臣);730000甘肅蘭州,蘭州大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究所(耿哲);730030甘肅蘭州,蘭州大學(xué)第二醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)室(施鑫鶴)
施星臣,E-mail:shixh@lzu.edu.cn