亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        番茄褪綠病毒RT-PCR檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)化及河南分離物的鑒定

        2016-09-14 01:19:45孫曉輝高利利劉靈芝劉永光竺曉平
        植物保護(hù) 2016年4期
        關(guān)鍵詞:河南番茄引物

        馮 佳, 孫曉輝, 高利利, 劉靈芝, 喬 寧, 劉永光, 竺曉平*

        (1. 山東省蔬菜病蟲(chóng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院, 泰安 271018;2. 濰坊科技學(xué)院蔬菜花卉研究所, 濰坊 262700)

        ?

        番茄褪綠病毒RT-PCR檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)化及河南分離物的鑒定

        馮佳1,孫曉輝1,高利利1,劉靈芝1,喬寧2,劉永光2,竺曉平1*

        (1. 山東省蔬菜病蟲(chóng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院, 泰安271018;2. 濰坊科技學(xué)院蔬菜花卉研究所, 濰坊262700)

        為獲得高效、靈敏和穩(wěn)定的番茄褪綠病毒(Tomatochlorosisvirus, ToCV)RT-PCR檢測(cè)體系,選取文獻(xiàn)報(bào)道的和重新設(shè)計(jì)的共9套ToCV的RT-PCR引物,經(jīng)過(guò)一系列測(cè)試和比較,篩選出了靈敏度、特異性均較高的引物組合,并對(duì)反應(yīng)條件、參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,確定了最優(yōu)反應(yīng)條件。應(yīng)用優(yōu)化的ToCV RT-PCR檢測(cè)體系對(duì)從河南設(shè)施蔬菜生產(chǎn)區(qū)采集的疑似感病番茄樣品進(jìn)行檢測(cè),擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序后經(jīng)BLAST比對(duì)發(fā)現(xiàn),河南分離物的CP和HSP70基因序列與GenBank上注冊(cè)的ToCV典型分離物序列的相似性均達(dá)94%以上,通過(guò)對(duì)ToCV病毒粒子的電鏡觀察而進(jìn)一步確定ToCV已在河南侵染設(shè)施番茄。

        番茄褪綠病毒;RT-PCR;多重PCR;序列分析

        番茄褪綠病毒(Tomatochlorosisvirus, ToCV)隸屬長(zhǎng)線形病毒科(Closteroviridae)毛形病毒屬(Crinivirus),能通過(guò)2屬4種粉虱進(jìn)行傳播,但不能通過(guò)摩擦接種傳毒[1]。自1998年美國(guó)首次發(fā)現(xiàn)ToCV后,其他多個(gè)國(guó)家陸續(xù)報(bào)道了該病毒的發(fā)生[2-7];國(guó)內(nèi)ToCV最早在臺(tái)灣被發(fā)現(xiàn)[8],2012年后北京、山東、河北、天津等地區(qū)均有該病毒危害的報(bào)道[9-12]。2013年至2014年該病毒病害在山東等地大面積流行,造成番茄嚴(yán)重減產(chǎn)[13]。植株感染ToCV后首先表現(xiàn)為下部葉片葉脈間褪綠黃化,后逐漸向上部葉片蔓延,隨著病情加重,葉脈變成深綠色,感病葉片變厚、變脆,且易折,植株長(zhǎng)勢(shì)變?nèi)?果實(shí)變小且提前轉(zhuǎn)色。

        高效、靈敏的ToCV檢測(cè)技術(shù)對(duì)病害的早期預(yù)警及發(fā)病規(guī)律的了解至關(guān)重要。目前國(guó)際上主要采用RT-PCR技術(shù)檢測(cè)番茄褪綠病毒[14-17],血清學(xué)方法應(yīng)用得較少[18]。ToCV的分子鑒定通常需要同時(shí)檢測(cè)其外殼蛋白(coat protein, CP)基因和熱激蛋白(heat shock protein 70 family homologue, HSP70)基因。已報(bào)道的檢測(cè)ToCV的引物各不相同,針對(duì)的靶標(biāo)序列也各有側(cè)重,有的僅針對(duì)CP基因或HSP70基因的部分片段,有的針對(duì)其全長(zhǎng),反應(yīng)條件也差別不一。鑒于此,本研究對(duì)已報(bào)道的ToCV分子檢測(cè)技術(shù)體系進(jìn)行了系統(tǒng)測(cè)試、比較和重新設(shè)計(jì)、優(yōu)化、篩選,建立了快速、穩(wěn)定、高效的ToCV RT-PCR檢測(cè)技術(shù),并應(yīng)用該技術(shù)對(duì)河南地區(qū)設(shè)施番茄病樣進(jìn)行了檢測(cè),確定了ToCV在河南省的發(fā)生情況。

        1 材料和方法

        1.1材料

        1.1.1樣品采集

        2014年7月至8月在河南省設(shè)施番茄產(chǎn)區(qū)共采集疑似感染番茄褪綠病毒的病樣46份,其中中牟縣10份,滑縣8份,內(nèi)黃縣10份,北莊縣5份,馬村區(qū)9份,武陟縣4份。以本實(shí)驗(yàn)室從河北、天津采集并測(cè)序鑒定的感病葉片和山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所提供的山東淄博感病葉片為陽(yáng)性對(duì)照;以健康番茄植株葉片作為陰性對(duì)照。所有待測(cè)樣品和陽(yáng)性樣品均保存于-20℃冰箱,用于RNA提取等后續(xù)試驗(yàn)。

        1.1.2菌株、載體及試劑

        大腸桿菌(Escherichiacoli)DH5α由山東省蔬菜病蟲(chóng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供;克隆載體pMD18-T、RNase Inhibitor、RTase M-MLV(RNase H-)、T4 DNA連接酶購(gòu)自TaKaRa公司;快捷型瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒Ⅱ(離心柱型)購(gòu)自北京百泰克生物技術(shù)有限公司;EasyTaqDNA聚合酶、dNTPs、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)Trans2K Plus購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;其他生化試劑及普通化學(xué)試劑均為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純。

        1.2方法

        1.2.1疑似病樣總RNA的提取及cDNA合成

        稱(chēng)取疑似感病植物葉片0.1 g,加液氮研磨成粉末,采用TRIzol法提取葉片總RNA,用于后續(xù)cDNA的合成。反轉(zhuǎn)錄步驟參照文獻(xiàn)[15]進(jìn)行。

        1.2.2引物設(shè)計(jì)與合成

        本研究所用引物共9套,其中5套來(lái)自已發(fā)表文獻(xiàn)[19-22];利用Premier 5重新設(shè)計(jì)了針對(duì)HSP70和CP基因的引物4套(表1)。9套引物中針對(duì)CP基因4套、熱激蛋白HSP70 基因5套,引物由鉑尚生物技術(shù)(上海)有限公司合成。

        表1 本研究所用引物信息

        1.2.3RT-PCR檢測(cè)體系的優(yōu)化

        采用RT-PCR對(duì)表1中的引物進(jìn)行對(duì)比和篩選優(yōu)化,在優(yōu)化時(shí),針對(duì)影響PCR擴(kuò)增的模板濃度、引物濃度和退火溫度進(jìn)行檢測(cè)和調(diào)整[22-25]。以山東淄博ToCV陽(yáng)性樣品RNA (1 μg)為模板合成cDNA。分別應(yīng)用ToCV特異性引物(表1)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物初始濃度均設(shè)為10 pmol/μL。cDNA的初始濃度為1 600 ng/μL,分別稀釋至25、50、75、100、125、150、180倍,通過(guò)比較擴(kuò)增效果,選擇靈敏度高的引物組合,分別設(shè)置其濃度為7、5、4、3、2和1 pmol/μL進(jìn)行靈敏度測(cè)試;同時(shí)對(duì)退火溫度進(jìn)行優(yōu)化,分別在30、33.8、37.4、42.2、48.4、52、59.5、64.2和68 ℃下進(jìn)行擴(kuò)增。最后對(duì)結(jié)果進(jìn)行比較,選定最優(yōu)引物組合、最佳引物濃度和退火溫度。應(yīng)用優(yōu)化的擴(kuò)增體系對(duì)河南設(shè)施番茄產(chǎn)區(qū)的番茄樣品進(jìn)行RT-PCR檢測(cè)。

        1.2.4雙重PCR體系設(shè)計(jì)

        ToCV的鑒定需要同時(shí)檢測(cè)CP和HSP70基因,采用雙重PCR擴(kuò)增可以提高效率。分別用To-CP-F/R和To-HSP-F/R的下游引物對(duì)山東淄博陽(yáng)性對(duì)照樣品葉片總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,然后同時(shí)擴(kuò)增CP基因和HSP70基因,試驗(yàn)方法參考文獻(xiàn)進(jìn)行[26-30]。擴(kuò)增體系:10× PCR buffer 2.5 μL,2.5 mmol/L dNTPs 1.0 μL,To-CP-F/R和To-HSP-F/R各1.0 μL,cDNA 1.0 μL,TaqDNA 聚合酶 0.5 μL,ddH2O 補(bǔ)足 25 μL。擴(kuò)增條件為:94℃ 3 min;94℃ 30 s,52℃ 30 s,72℃ 2 min,循環(huán)25次;72℃ 10 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物通過(guò)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)并拍照記錄結(jié)果。

        1.2.5PCR產(chǎn)物回收及測(cè)序

        參照凝膠回收試劑盒說(shuō)明書(shū)對(duì)檢測(cè)結(jié)果呈陽(yáng)性的樣品進(jìn)行回收和純化,將純化的PCR產(chǎn)物連接到pMD18-T載體上并轉(zhuǎn)化DH5α。陽(yáng)性克隆經(jīng)驗(yàn)證后,將菌液送上海鉑尚生物科技有限公司測(cè)序。

        1.2.6序列分析

        利用NCBI中的BLAST程序比較病毒樣品的CP和HSP70基因序列。從GenBank中下載已注冊(cè)的ToCV序列,用DNAStar中的MegAlign對(duì)選定的序列進(jìn)行相似性比對(duì),再利用MEGA 4.0構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

        1.2.7ToCV病毒粒子的提純和電鏡觀察

        取300 g感病番茄葉片置于-20℃冰箱過(guò)夜(盡量去除粗大葉柄),參照Fribourg等[31]提取馬鈴薯Y病毒的方法并略加改進(jìn)提取ToCV病毒粒子,最后回溶病毒沉淀時(shí),適當(dāng)減少0.01 mol/L磷酸鹽緩沖液的用量并增加回溶時(shí)間,以增加溶液中病毒粒子的濃度。

        利用磷鎢酸負(fù)染色技術(shù)對(duì)提純的ToCV病毒粒子進(jìn)行染色觀察[32-34],選用3%的磷鎢酸染色液,將樣品滴加在Formvar膜的銅網(wǎng)上,室溫晾干后進(jìn)行電鏡觀察。

        2 結(jié)果與分析

        2.1PCR擴(kuò)增條件優(yōu)化

        RT-PCR檢測(cè)體系的優(yōu)化結(jié)果表明,當(dāng)cDNA模板稀釋至8.89 ng/μL時(shí),引物To-HSP-F/R和To-CP-F/R依然可以擴(kuò)增出可見(jiàn)的目的條帶,而其他ToCV特異性引物均未檢測(cè)出目的條帶(圖1)。選擇引物To-CP-F/R,對(duì)其濃度和退火溫度進(jìn)行進(jìn)一步調(diào)整優(yōu)化。結(jié)果表明,退火溫度在30~68℃時(shí)均有條帶出現(xiàn)(圖2a),但退火溫度過(guò)高或過(guò)低均會(huì)對(duì)特異性擴(kuò)增造成影響,最適退火溫度在37~64℃;引物濃度在1~10 pmol/μL時(shí),均能檢測(cè)到特異性條帶(圖2b),但引物濃度過(guò)低同樣會(huì)影響特異性擴(kuò)增,引物濃度在4~10 pmol/μL時(shí),擴(kuò)增效率最好。

        2.2雙重PCR擴(kuò)增體系鑒定及在河南番茄褪綠病毒檢測(cè)中的應(yīng)用

        以To-CP-F/R和To-HSP-F/R建立的雙重PCR檢測(cè)體系能同時(shí)檢測(cè)到ToCV的CP和HSP基因(圖3a),達(dá)到了預(yù)期的效果。

        以從河南省設(shè)施番茄種植區(qū)采集的46份番茄葉片總RNA為模板,利用引物To-CP-F/R和To-HSP-F/R進(jìn)行雙重RT-PCR擴(kuò)增。從檢測(cè)結(jié)果(表2)可以看出,僅河南中牟縣和滑縣樣品中擴(kuò)增得到了970 bp和1 864 bp特異性條帶(圖3b),測(cè)序結(jié)果表明,河南中牟縣ToCV分離物(HNZZZM1)、滑縣地區(qū)ToCV分離物(HNAYHX)的CP基因全長(zhǎng)為774個(gè)核苷酸,GenBank登錄號(hào)分別為KP264984和KP264983;HSP70基因全長(zhǎng)為1 665個(gè)核苷酸,GenBank登錄號(hào)分別為KP264987和KP264986。

        圖1 不同ToCV引物靈敏度對(duì)比結(jié)果Fig.1 Sensitivity of different ToCV primers

        圖2 To-CP-F/R的最適退火溫度和濃度篩選Fig.2 Screening annealing temperature and primer concentrations of To-CP-F/R for RT-PCR

        采集時(shí)間/年-月-日Collectiondate采集地點(diǎn)Collectionsite樣品癥狀Symptoms陽(yáng)性樣品數(shù)/總樣品數(shù)Positive/totalsamples2014-07-28河南中牟縣ZhongmouCounty,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing2/102014-07-29河南滑縣HuaCounty,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing1/82014-07-31河南內(nèi)黃縣NeihuangCounty,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing0/102014-08-01河南北莊縣BeizhuangCounty,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing0/52014-08-02河南馬村區(qū)MacunDistrict,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing0/92014-08-02河南武陟縣WuzhiCounty,Henan葉片黃化,植株矮小Leafchlorosis,plantdwarfing0/4

        圖3 ToCV的雙重PCR體系及河南感病番茄的檢測(cè)Fig.3 ToCV duplex PCR system and detection results of diseased samples from Henan

        2.3引物穩(wěn)定性比較

        選取保存于-20℃冰箱的山東淄博、河南中牟、河北衡水和天津武清ToCV番茄陽(yáng)性樣品對(duì)優(yōu)化得到的兩對(duì)ToCV特異性引物To-CP-F/R和To-HSP-F/R進(jìn)行穩(wěn)定性比較。結(jié)果發(fā)現(xiàn)To-CP-F/R相對(duì)穩(wěn)定,而To-HSP-F/R在擴(kuò)增不同地區(qū)ToCV陽(yáng)性樣品時(shí)穩(wěn)定性存在差異 (圖4)。

        圖4 引物To-HSP-F/R和To-CP-F/R對(duì)不同地區(qū)陽(yáng)性樣品的擴(kuò)增結(jié)果Fig.4 Amplification products of positive samples from different regions using To-HSP-F/R and To-CP-F/R

        選取山東淄博陽(yáng)性樣品測(cè)定HSP70基因分段擴(kuò)增引物HSP-1-F/R、HSP-2-F/R的穩(wěn)定性,結(jié)果表明HSP-2-F/R的擴(kuò)增效率優(yōu)于HSP-1-F/R(圖5a)。進(jìn)一步選取河北衡水、天津武清、河南中牟和山東淄博ToCV陽(yáng)性番茄樣品測(cè)定To-HSP-F/R和HSP-2-F/R的穩(wěn)定性,結(jié)果表明,引物To-HSP-F/R的穩(wěn)定性低于HSP-2-F/R(圖5b)。

        2.4序列分析

        采用DNAStar中的MegAlign軟件分析本試驗(yàn)獲得的河南中牟縣ToCV分離物(HNZZZM1)和滑縣ToCV分離物(HNAYHX)的CP基因(GenBank登錄號(hào)KP264984和KP264983)和HSP70基因(GenBank登錄號(hào)KP264987和KP264986)的核苷酸序列。結(jié)果顯示,中牟縣和滑縣ToCV分離物的CP基因同源性為99.6%,HSP70基因同源性為99.16%。由于兩地分離物同源性較高,因此以河南滑縣分離物(HNAYHX)為代表與GenBank中注冊(cè)的各地區(qū)典型ToCV分離物的核苷酸序列進(jìn)行一致性比較。結(jié)果表明,河南滑縣ToCV分離物(HNAYHX)的CP和HSP70基因序列與GenBank中代表性的ToCV分離物相似性均在94%以上(表3)。為進(jìn)一步分析其進(jìn)化關(guān)系及分類(lèi)地位,選取國(guó)內(nèi)外不同地區(qū)代表性的番茄褪綠病毒分離物,分別針對(duì)CP和HSP70基因序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖6a~b),結(jié)果表明ToCV河南分離物(HNZZZM1、HNAYHX)與中國(guó)北京(ToCV-BJ)、南京(Nanjing)、山東(SDSG)和日本(Tochigi)分離物親緣關(guān)系處于同一個(gè)大分支上,其中與日本分離物的親緣關(guān)系最近。

        圖5 不同引物擴(kuò)增HSP70基因結(jié)果Fig.5 Amplification results of HSP70 gene using different primers

        分離物名稱(chēng)Isolatename分離地點(diǎn)Location登錄號(hào)Accessionno.一致性/% IdentityCP序列HSP70序列Tochigi日本JapanAB513443100-Tochigi日本JapanAB513442-99.7AT80/99-IC西班牙SpainKJ74025798.098.8AT80/99西班牙SpainDQ13614697.998.8SDSG中國(guó)ChinaKC70951099.799.8SDTAMZ中國(guó)ChinaKC812627-99.7SDLC中國(guó)ChinaKC812626-99.7SDLC中國(guó)ChinaKC81262299.7-BJ中國(guó)ChinaKC31137599.7-ToCV-BJ中國(guó)ChinaKC88799999.899.6Nanjing中國(guó)ChinaKJ81504599.799.5Florida美國(guó)USAAY90344899.599.5Fr法國(guó)FranceEU62535098.3-ToC-Br2巴西BrazilJQ95260199.099.4Gr-535希臘GreeceEU28474499.199.3IS以色列IsraelDQ23467398.9-HP韓國(guó)KoreaKP11453799.8-Amelia美國(guó)USAHQ87984094.6-TICV-CA4美國(guó)USAFJ54230630.964.4

        2.5ToCV病毒粒子觀察

        用磷鎢酸負(fù)染法對(duì)安陽(yáng)番茄樣品中提取的ToCV病毒粒子染色并進(jìn)行電鏡觀察(圖7),電鏡結(jié)果可以清晰地顯示長(zhǎng)度為800 nm左右的線條形病毒粒子聚集在一起。

        3 討論與結(jié)論

        ToCV的鑒定需要同時(shí)對(duì)CP和HSP70兩個(gè)基因進(jìn)行測(cè)定,目前文獻(xiàn)中針對(duì)ToCV的檢測(cè)方法主要以RT-PCR為主,已報(bào)道的文獻(xiàn)中檢測(cè)CP基因的引物有ToCV-F/R[21]和CP-F/R[19];檢測(cè)HSP70基因的引物有ToC-5/6[20]、HSP-1-F/R和HSP-2-F/R[19],其中引物CP-F/R、HSP-1-F/R、HSP-2-F/R和ToC-5/6引用次數(shù)較多[5-9,15-17]。ToCV-F/R和CP-F/R均可擴(kuò)增全長(zhǎng)CP基因,引物ToC-5/6擴(kuò)增HSP70基因的部分序列,HSP-1-F/R和HSP-2-F/R是通過(guò)擴(kuò)增HSP70基因的上、下兩部分序列,通過(guò)重疊區(qū)拼接得到全長(zhǎng)HSP70基因序列,但HSP-2-F/R的擴(kuò)增效率高于HSP-1-F/R。本研究重新設(shè)計(jì)合成了檢測(cè)CP和HSP70全長(zhǎng)基因的引物To-CP-F/R和To-HSP-F/R,并與已有的引物進(jìn)行對(duì)比分析。結(jié)果表明,本研究設(shè)計(jì)的引物To-CP-F/R的靈敏度和穩(wěn)定性均較好,而To-HSP-F/R的穩(wěn)定性較已發(fā)表的分段擴(kuò)增引物HSP-2-F/R[19]稍差,但該引物可直接一步擴(kuò)增得到HSP70基因全序列,省去分段擴(kuò)增和序列拼接等步驟,達(dá)到高效、省時(shí)的擴(kuò)增效果。本研究對(duì)ToCV常規(guī)PCR檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,對(duì)引物的退火溫度和濃度進(jìn)行了調(diào)整,同時(shí)設(shè)計(jì)并測(cè)試了雙重PCR體系。優(yōu)化后的RT-PCR檢測(cè)體系對(duì)ToCV病毒的檢出率相對(duì)較高,避免了因引物靈敏度低而出現(xiàn)假陰性現(xiàn)象,同時(shí)得到了相對(duì)穩(wěn)定的RT-PCR擴(kuò)增條件,減少擴(kuò)增過(guò)程中出現(xiàn)的引物濃度和退火溫度對(duì)PCR結(jié)果的影響;設(shè)計(jì)的雙重PCR體系可以同時(shí)擴(kuò)增ToCV的CP和HSP70基因,能有效縮短試驗(yàn)時(shí)間。用優(yōu)化的RT-PCR檢測(cè)技術(shù)對(duì)河南番茄種植區(qū)的疑似感病番茄樣品進(jìn)行檢測(cè),確定河南番茄已受到ToCV的侵染,同時(shí)通過(guò)提純病毒和電鏡觀察,進(jìn)一步確定了結(jié)果。

        圖6 番茄褪綠病毒CP和HSP70基因進(jìn)化樹(shù)Fig.6 Phylogenetic relationships based on sequences of the ToCV CP and HSP70 genes

        圖7 ToCV病毒粒子電鏡圖片F(xiàn)ig.7 ToCV virus particles electron microscopy image

        番茄褪綠病毒是番茄生產(chǎn)上近幾年新發(fā)生的病毒,該病毒可通過(guò)煙粉虱傳播,發(fā)展蔓延迅速,其引起的癥狀與生理性的營(yíng)養(yǎng)缺素癥非常相似,給診斷帶來(lái)一定的難度,造成病情延誤,番茄產(chǎn)量下降,給種植戶(hù)帶來(lái)巨大的損失。開(kāi)發(fā)和優(yōu)化高效、準(zhǔn)確的分子檢測(cè)方法,在植株發(fā)病的早期檢測(cè)并及時(shí)預(yù)警,有利于控制該病害的發(fā)生和流行。

        [1]Wintermantel W M, Wisler G C. Vector specificity, host range, and genetic diversity ofTomatochlorosisvirus[J]. Plant Disease, 2006, 90 (6): 814-819.

        [2]Wisler G C, Li R H, Liu H Y, et al.Tomatochlorosisvirus: A new whitefly-transmitted, phloem-limited, bipartite closterovirus of tomato [J]. Phytopathology, 1998, 88(5): 402-409.

        [3]Accotto G P, Vaira A M, Vecchiati M, et al. First report ofTomatochlorosisvirusin Italy[J]. Plant Disease, 2001, 85(11): 1208.

        [4]Dalmon A, Bouyer S, Cailly M, et al. First report ofTomatochlorosisvirusandTomatoinfectiouschlorosisvirusin tomato crops in France [J]. Plant Disease, 2005, 89(11): 1243.

        [5]Barbosa J C, Teixeira A P M, Moreira A G, et al. First report ofTomatochlorosisvirusinfecting tomato crops in Brazil [J]. Plant Disease, 2008, 92(12): 1709.

        [7]Papayiannis L C, Ioannou N, Dovas C I, et al. First report ofTomatochlorosisviruson tomato crops in Cyprus [J]. Plant Pathology, 2006, 55(4): 567.

        [8]Tsai W S, Shih S L, Green S K, et al. First report of the occurrence ofTomatochlorosisvirusandTomatoinfectionschlorosisvirusin Taiwan [J]. Plant Disease, 2004, 88(3): 311.

        [9]Zhao R N, Wang R, Wang N, et al. First report ofTomatochlorosisvirusin China [J]. Plant Disease, 2013, 97(8): 1123.

        [10]趙黎明, 李剛, 劉永光, 等. 番茄褪綠病毒與番茄黃化曲葉病毒復(fù)合侵染的分子鑒定[J]. 中國(guó)蔬菜, 2014(12): 15-20.

        [11]周濤, 楊普云, 趙汝娜, 等. 警惕番茄褪綠病毒在我國(guó)的傳播和危害[J]. 植物保護(hù), 2014, 40(5): 196-199.

        [12]高利利, 孫國(guó)珍, 王勇, 等. 天津地區(qū)番茄褪綠病毒的分子檢測(cè)和鑒定[J]. 華北農(nóng)學(xué)報(bào), 2015, 30(3): 211-215.

        [13]劉永光, 魏家鵬, 喬寧, 等. 番茄褪綠病毒在山東暴發(fā)及其防治[J]. 中國(guó)蔬菜, 2014(5): 67-69.

        [14]Zhao Liming, Li Gang, Gao Ying, et al. Molecular detection and complete genome sequences ofTomatochlorosisvirusisolates from infectious outbreaks in China [J]. Journal of Phytopathology, 2014, 162(10): 627-634.

        [15]趙黎明, 李剛, 劉永杰, 等. 侵染番茄的番茄褪綠病毒山東泰安分離物的分子鑒定和序列分析[J]. 植物保護(hù), 2014, 40(5): 34-39.

        [16]趙汝娜, 王蓉, 師迎春, 等. 侵染甜椒的番茄褪綠病毒的分子鑒定[J]. 植物保護(hù), 2014, 40(1): 128-130.

        [17]李潔, 李慧, 丁天波, 等. 膠東半島地區(qū)番茄褪綠病毒的快速檢測(cè)與鑒定[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué), 2015, 47(2): 86-89.

        [18]Jacquemond M, Verdin E, Dalmon A, et al. Serological and molecular detection ofTomatochlorosisvirusandTomatoinfectionschlorosisvirusin tomato [J]. Plant Pathology, 2009, 58(2): 210-220.

        [19]Hirota T, Natsuaki T, Murai T, et al. Yellowing disease of tomato caused byTomatochlorosisvirusnewly recognized in Japan [J]. Journal of General Plant Pathology, 2010, 76(2): 168-171.

        [20]Dovas C I, Katis N I, Avgelis A D.Multiplex detection of criniviruses associated with epidemics of a yellowing disease of tomato in Greece [J]. Plant Disease, 2002, 86(12): 1345-1349.

        [21]孫國(guó)珍, 高利利, 陸文利, 等. 河北省設(shè)施番茄褪綠病毒分子檢測(cè)和鑒定研究[J]. 北方園藝, 2015(9): 95-98.

        [22]周丹, 謝曉娜, 陳明輝, 等. 甘蔗宿根矮化病PCR檢測(cè)技術(shù)優(yōu)化分析[J]. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào), 2012, 43(5): 616-620.

        [23]尚明照, 何寧, 殷冬梅, 等. 花生基因組SRAP-PCR體系的優(yōu)化[J]. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào), 2007, 23(5): 99-103.

        [24]陳靜, 胡曉輝, 苗華榮, 等. 花生SRAP-PCR技術(shù)體系的優(yōu)化[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué), 2008(5): 24-26.

        [25]賈晉, 張魯剛. 蘿卜DDRT-PCR技術(shù)體系的優(yōu)化[J]. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版), 2008, 36(4): 128-134.

        [26]Dai Jin, Cheng Julong, Huang Tian, et al. A multiple reverse transcription PCR assay for simultaneous detection of five tobacco viruses in tobacco plants[J]. Journal of Virological Methods, 2012,183(1): 57-62.

        [27]Lefeuvre P, Hoareau M,Delatt H, et al. A multiplex PCR method discriminating between the TYLCV and TYLCV-Mld clades ofTomatoyellowleafcurlvirus[J]. Journal of Virological Methods,2007, 144: 165-168.

        [28]陳明潔, 劉勇, 涂知明, 等. 多重PCR法快速鑒定轉(zhuǎn)基因小麥植株及后代[J]. 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版), 2004, 32(9): 105-107.

        [29]陳浩東,劉方,王為, 等.棉花多重PCR技術(shù)及其對(duì)雜交棉純度鑒定的初步研究[J].棉花學(xué)報(bào),2011,23(1):22-27.

        [30]張顯勇,蔡文偉, 楊本鵬,等.甘蔗花葉病和宿根矮化病多重PCR檢測(cè)方法的建立[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué), 2008, 41(12): 4321-4327.

        [31]Fribourg C E, Nakashima J. Characterization of a new potyvirus from potato [J]. Phytopathology, 1984, 74(11): 1363-1369.

        [32]韋石泉, 徐慧民. 應(yīng)用負(fù)染色技術(shù)電鏡觀察快速檢測(cè)植物病毒粒子的研究[J]. 微生物學(xué)雜志, 1985, 5(4): 7-10.

        [33]洪健,陳集雙, 周雪平, 等. 植物病毒的電鏡診斷[J]. 電子顯微學(xué)報(bào), 1999, 18(3): 274-289.

        [34]張文麗, 張玉芬, 張秀軍. 應(yīng)用電鏡負(fù)染色技術(shù)檢測(cè)嗜水氣單胞菌[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2009, 37(27): 12910-12911.

        (責(zé)任編輯:楊明麗)

        Technique optimization of RT-PCR for detecting Tomato chlorosisvirusand molecular identification of isolates in Henan Province

        Feng Jia1,Sun Xiaohui1,Gao Lili1,Liu Lingzhi1,Qiao Ning2,Liu Yongguang2,Zhu Xiaoping1

        (1. Shandong Provincial Key Laboratory for Biology of Greenhouse Vegetable Diseases and Insect Pests,College of Plant Protection,Shandong Agricultural University,Tai’an271018,China; 2. Institute of Vegetables and Flowers, Weifang University of Science & Technology, Weifang262700, China)

        To obtain stable, sensitive and specific RT-PCR detection system forTomatochlorosisvirus(ToCV), 9 primer pairs redesigned or selected from those published research papers were compared for their productivity, sensitivity and specificity in the RT-PCR detection system, a series of tests were conducted and the primer pairs that most sensitive and specific among them were selected and confirmed, and the RT-PCR reaction conditions were optimized, The optimized RT-PCR detection system was used to detect the ToCV-suspected tomato samples from greenhouse vegetable-growing area in Henan Province. Sequence analysis revealed that theCPandHSP70 homologue gene of Henan isolates shared 97% nucleotide sequence identity with that of ToCV isolates registered in the NCBI, indicating the tomato plants were infected by ToCV in Henan. This results were also confirmed by electron microscopy observation of the virus particles extracted from the samples.

        Tomatochlorosisvirus;RT-PCR;multiplex PCR;sequence analysis

        2015-09-10

        2015-11-23

        公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專(zhuān)項(xiàng)(201303028);山東省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(2014GNC111008);山東省自然科學(xué)基金(ZR2012CM032)

        E-mail:zhuxp@sdau.edu.cn

        S 436.412.11

        A

        10.3969/j.issn.0529-1542.2016.04.020

        猜你喜歡
        河南番茄引物
        DNA引物合成起始的分子基礎(chǔ)
        高中生物學(xué)PCR技術(shù)中“引物”相關(guān)問(wèn)題歸類(lèi)分析
        番茄炒蛋
        秋茬番茄“疑難雜癥”如何挽救
        SSR-based hybrid identification, genetic analyses and fingerprint development of hybridization progenies from sympodial bamboo (Bambusoideae, Poaceae)
        番茄果實(shí)“起棱”怎么辦
        出彩河南
        青年歌聲(2019年7期)2019-07-26 08:34:58
        河南:過(guò)大年,逛廟會(huì)
        金橋(2018年3期)2018-12-06 09:05:34
        河南:走進(jìn)就業(yè)的春天
        放歌河南
        日韩欧美亚洲综合久久影院d3| 美利坚日韩av手机在线| 亚洲av无码码潮喷在线观看| 内射无码专区久久亚洲 | 国产精品av在线| 亚洲xxxx做受欧美| 欧美日韩a级a| 少妇高潮精品正在线播放| 国产精品偷窥熟女精品视频| 国产高潮刺激叫喊视频| 亚洲AV毛片无码成人区httP| av天堂手机一区在线| 黄片视频免费在线播放观看| 久久久久亚洲av片无码下载蜜桃| 亚洲国产精品线路久久| 亚洲国产一区二区三区视频在线| 亚州无吗一区二区三区| 精品少妇人妻久久免费| 亚洲av人片在线观看| 亚洲熟妇久久精品| 色一情一乱一伦一区二区三欧美| 亚洲AV乱码毛片在线播放| 亚洲中文中文字幕乱码| 乱色欧美激惰| 精品爆乳一区二区三区无码av| 91日本在线精品高清观看| 精品麻豆一区二区三区乱码| 精品国产一区二区三区2021| 亚洲av无码第一区二区三区| 久热re在线视频精品免费| 日本特殊按摩在线观看| 欧美丰满少妇xxxx性| 人妻被黑人粗大的猛烈进出| 亚洲女同同性少妇熟女| 亚洲第一幕一区二区三区在线观看| 97夜夜澡人人双人人人喊| 国产 中文 制服丝袜 另类| 少妇人妻字幕一区二区| 国产无遮挡aaa片爽爽| 久久久久久久女国产乱让韩| 国产高清一区在线观看|