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        馬炯的雙面人生

        2016-09-03 05:53:43武光磊
        科學(xué)中國(guó)人 2016年16期
        關(guān)鍵詞:細(xì)胞核復(fù)合物顯微鏡

        本刊記者 武光磊

        馬炯的雙面人生

        本刊記者 武光磊

        吾生也有涯。而知也無(wú)涯。學(xué)海漫漫,很多人窮其一生都難在一個(gè)領(lǐng)域里有所建樹(shù),終碌碌無(wú)為,草莽而終。而復(fù)旦大學(xué)信息與工程學(xué)院光科學(xué)與工程系的青年研究員馬炯用他一半技術(shù)、一半生物的雙向科研成就,為我們展示了一個(gè)科研工作者如何在兩個(gè)領(lǐng)域都有所成就。

        初見(jiàn)馬炯,并沒(méi)有想象中那么嚴(yán)肅。他坦誠(chéng)、開(kāi)朗、愛(ài)笑,直言不諱,又分寸有佳。他聊星座,說(shuō)自己能在兩個(gè)領(lǐng)域里吃香大概是“托了這個(gè)雙子座的?!?;還笑言自己是追星族,并拿出與諾獎(jiǎng)得主的照片和記者一同分享。而談及他的科研工作,馬炯并沒(méi)有太多地說(shuō)起科研工作的辛苦,而是更多地分享他的步步歷程。

        一半是技術(shù),一半是生物

        馬炯1999年進(jìn)入復(fù)旦大學(xué)物理系,2008年取得物理系光學(xué)專(zhuān)業(yè)博士學(xué)位。博士階段開(kāi)始,馬炯就致力于發(fā)展光學(xué)技術(shù)與生物課題相結(jié)合的研究工作。期間他曾作為訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者前往南非羅德斯大學(xué)化學(xué)系和挪威奧斯陸大學(xué)生理系進(jìn)行學(xué)術(shù)交流。

        在南非期間,他確認(rèn)水溶性CdTe量子點(diǎn)的光催滅機(jī)理,首次測(cè)定其單態(tài)氧產(chǎn)量,并開(kāi)創(chuàng)出一種應(yīng)用于其實(shí)現(xiàn)光動(dòng)力治療癌癥的方法。2008年赴美從事博士后工作后,他一直致力于發(fā)展新型的單分子超分辨熒光顯微鏡,用于細(xì)胞核孔復(fù)合物的研究工作。在美國(guó),馬炯與Yang教授共同開(kāi)發(fā)了SPEED顯微技術(shù),并在10nm空間精度和400μs時(shí)間精度下,研究了各類(lèi)分子穿越細(xì)胞核孔的選擇機(jī)制。他首次觀(guān)測(cè)到細(xì)胞核孔內(nèi)非折疊蛋白的三維結(jié)構(gòu),并首次獲得生物小分子穿越細(xì)胞核孔三維路徑,確定了其間的選擇性機(jī)制,并于2010年及2012年在Proceedings of the National Academy of Sciences上發(fā)表了兩篇高質(zhì)量論文。

        馬炯還與Walter教授合作,開(kāi)發(fā)應(yīng)用于超分辨顯微鏡的mRNA熒光標(biāo)記系統(tǒng),結(jié)合單分子顯微追蹤技術(shù),完成了mRNA穿越核孔的選擇機(jī)制的初步研究,確認(rèn)了mRNA核孔輸出三維路徑,糾正了一維路徑數(shù)據(jù)所造成的認(rèn)知誤解,并發(fā)表在Nature Communication上。

        而談到技術(shù)和生物研究,馬炯說(shuō)他從來(lái)沒(méi)有糾結(jié)兩者之間的取舍,而是始終游走在兩者的平衡之中。曾經(jīng)在南非和挪威做訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者的時(shí)候,他感到技術(shù)上偏重太多時(shí),就在前去美國(guó)的時(shí)候有意識(shí)地加重了生物研究的選擇。技術(shù)是他的“技”,而生物就是他的“巧”。有技方成巧,通過(guò)超分辨率光學(xué)顯微鏡的技術(shù)不斷提高,他在細(xì)胞核孔復(fù)合物領(lǐng)域的研究也不斷加深;以巧推動(dòng)技,通過(guò)細(xì)胞核孔復(fù)合物實(shí)驗(yàn)研究的需求,他又不斷革新超分辨光學(xué)顯微鏡的技術(shù)。雙子的多面性,他展現(xiàn)在了科研領(lǐng)域中,并且大獲成功。

        2015年6月,馬炯?xì)w國(guó)。他坦言,歸國(guó)的一部分原因是因?yàn)楣枢l(xiāng)的父母,另一部分則是國(guó)家現(xiàn)在對(duì)于青年學(xué)者的重視,能夠讓他在最有精力的時(shí)刻投入到科研中去?!澳軌?yàn)閲?guó)家做一點(diǎn)事情,國(guó)家也重視我做的事情,這當(dāng)然是再好不過(guò)了?!瘪R炯笑言。

        超分辨光學(xué)顯微鏡下看世界

        顯微鏡的發(fā)展?jié)M足了人們對(duì)觀(guān)察微觀(guān)世界的需求,讓人們可以看得越來(lái)越“小”。但由于衍射極限的存在,幾十年來(lái)光學(xué)顯微鏡的分辨率停滯在了200nm左右。2014年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)?lì)C發(fā)給了美國(guó)及德國(guó)三位科學(xué)家Eric Betzig、Stefan W.Hell和William E.Moerner,獲獎(jiǎng)理由是“研制出超分辨率熒光顯微鏡”。幾位獲獎(jiǎng)?wù)咔擅钤O(shè)計(jì)了避開(kāi)衍射極限的方法,其研究突破性地將光學(xué)顯微鏡帶入了納米維度。在納米顯微鏡下,科學(xué)家實(shí)現(xiàn)了活體細(xì)胞中單個(gè)分子通路的可視化,能夠觀(guān)察到分子是如何在大腦神經(jīng)細(xì)胞之間生成神經(jīng)突觸;可以追蹤帕金森病、阿爾茲海默癥和亨廷頓癥患者體內(nèi)相關(guān)蛋白的累積情況;還能跟蹤受精卵在分裂形成胚胎時(shí)蛋白質(zhì)的變化過(guò)程。現(xiàn)在已經(jīng)進(jìn)入了“光學(xué)顯微鏡2.0”的時(shí)代,超分辨熒光顯微鏡推動(dòng)著新一輪生物醫(yī)學(xué)的飛速發(fā)展。

        現(xiàn)今,已具有多種不同超分辨成像技術(shù)實(shí)際應(yīng)用于生物系統(tǒng)的范例,也已出現(xiàn)了商業(yè)化的超分辨顯微鏡系統(tǒng),但仍然沒(méi)有達(dá)到完美狀態(tài)。在許多生物研究中,各類(lèi)超分辨系統(tǒng)有著各自的局限性,如對(duì)于特殊熒光標(biāo)記的發(fā)光特性依賴(lài),或是高空間精度測(cè)量制約了探測(cè)時(shí)間進(jìn)一步縮短。因此,研究和發(fā)展合適新的原理和方法,研制出適合專(zhuān)項(xiàng)生物課題研究的顯微鏡將是今后發(fā)展的一大方向。

        談起二維到三維的超分辨退卷積計(jì)算開(kāi)發(fā)的時(shí)候,馬炯說(shuō)起了一個(gè)有意思的故事:他做出這個(gè)開(kāi)發(fā)之后,花了整整一個(gè)星期的時(shí)間說(shuō)服他的老師來(lái)相信他的成果,因?yàn)樗睦蠋煾緹o(wú)法想象有人可以做出從二維分布中獲取系統(tǒng)的三維分布的開(kāi)發(fā)。而當(dāng)他的老師認(rèn)可了他的成果,他和他的老師又開(kāi)始一起說(shuō)服領(lǐng)域里的其他研究者一起應(yīng)用這項(xiàng)成果的相關(guān)研究人員。“這告訴我們,固化思維的可怕??萍家M(jìn)步,科研人員要?jiǎng)?chuàng)新研究,首先就要從打破自己的固有傳統(tǒng)認(rèn)知開(kāi)始。”馬炯嚴(yán)肅地說(shuō)。

        歸國(guó)后的馬炯將開(kāi)始著手建立顯微鏡第二平臺(tái)熒光返還探測(cè)技術(shù),實(shí)現(xiàn)兼具超高的時(shí)間和空間分辨率的三維分子熒光追蹤系統(tǒng)。他將把研究中所獲得的信息將與跟蹤RNA輸出細(xì)胞核孔的研究互相印證,通過(guò)分析RNA在細(xì)胞核孔各位置的高時(shí)空精度動(dòng)態(tài)過(guò)程,進(jìn)一步研究細(xì)胞核孔蛋白調(diào)控基因的機(jī)理。此外,研究中所發(fā)展的原理和方法還將能夠被廣泛用于毫秒量級(jí)甚至更快的纖毛內(nèi)分子運(yùn)輸、細(xì)胞間分子交換及跨膜通道開(kāi)關(guān)等生物問(wèn)題的研究。

        在研究中,馬炯將采用創(chuàng)新技術(shù),促使實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)同時(shí)具有很高的時(shí)間和三維空間分辨率,在不影響平面二維光學(xué)分辨精度的前提下,不通過(guò)擬合點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù),而在亞毫秒級(jí)時(shí)間分辨量級(jí)和10nm三維空間分辨量級(jí),實(shí)現(xiàn)對(duì)三維單分子熒光信息的實(shí)時(shí)探測(cè)和分析,滿(mǎn)足高速動(dòng)態(tài)生物學(xué)研究的特點(diǎn)和條件。在新型光學(xué)系統(tǒng)中,他還將利用凹面鏡返還光程無(wú)色差的光學(xué)原理,創(chuàng)新設(shè)計(jì)凹面鏡熒光返還光路系統(tǒng),能夠?qū)方向信息轉(zhuǎn)換成x-y水平方向的信息,從而獲取單分子z方向的位置信息。

        馬炯及其合作者在2016年美國(guó)生物物理學(xué)會(huì)年會(huì)

        與超分辨顯微鏡PALM技術(shù)發(fā)明人、2014年諾貝爾獲獎(jiǎng)?wù)逧ric Betzig教授在一起。

        細(xì)胞核孔復(fù)合物探尋

        在細(xì)胞核孔復(fù)合物的研究中,馬炯將利用SPEED顯微鏡技術(shù),完成各類(lèi)FG屏障與各類(lèi)主要的傳輸分子間反應(yīng)區(qū)域的三維分布測(cè)量。細(xì)胞核孔復(fù)合物是真核細(xì)胞中連接細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核之間的選擇性雙向通道,控制著絕大部分細(xì)胞核所需的蛋白輸入,以及核內(nèi)基因物質(zhì)的輸出??梢哉f(shuō),核孔是細(xì)胞內(nèi)基因調(diào)控中非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。核孔的缺陷會(huì)導(dǎo)致核孔相關(guān)的白血病及阿爾茲海默癥等疾病。其本身更是各類(lèi)病毒侵入細(xì)胞的重要關(guān)口之一,各類(lèi)病毒會(huì)通過(guò)不同的方式通過(guò)核孔,最終侵入細(xì)胞的基因表達(dá)系統(tǒng)導(dǎo)致疾病發(fā)生。核孔的結(jié)構(gòu)與功能的研究將為各類(lèi)基因調(diào)控機(jī)制的研究提供一環(huán)重要的依據(jù),對(duì)核孔蛋白缺失相關(guān)的白血病、阿爾茲海默癥的致病機(jī)制,以及各種類(lèi)病毒的侵入機(jī)制等核孔相關(guān)病理機(jī)制或基因治療提供關(guān)鍵信息。

        一個(gè)NPC是由30種多不同的核孔蛋白構(gòu)成,長(zhǎng)約200nm、直徑為120nm、中心內(nèi)徑為50nm的大分子復(fù)合物。其中有三分之一的核孔蛋白富含苯丙氨酸-甘氨酸(FG)氨基酸片段,且在自然狀態(tài)下呈現(xiàn)出非固定形態(tài),我們稱(chēng)之為FG-Nups。這些FG-Nups組成了具有選擇性機(jī)制的FG屏障。FG屏障選擇性地調(diào)控基因相關(guān)物質(zhì)按照被動(dòng)運(yùn)輸或者主動(dòng)介入運(yùn)輸?shù)姆绞竭M(jìn)出細(xì)胞核:只有小于60kDa的分子才能通過(guò)被動(dòng)運(yùn)輸?shù)姆绞?,自由擴(kuò)散通過(guò)NPC;另一種方式是主動(dòng)運(yùn)輸,如含有入核信號(hào)或者核孔輸出信號(hào)的蛋白或復(fù)合物分子,在核孔運(yùn)輸?shù)鞍讕椭?,形成?fù)合物,通過(guò)TRs 與FG片段相互作用,從而通過(guò)FG屏障。TRs與需要傳輸?shù)牡鞍仔纬傻膹?fù)合物的結(jié)合與解離,通過(guò)細(xì)胞核內(nèi)外的RanGDP和RanGTP的濃度梯度來(lái)調(diào)節(jié)。通過(guò)電子顯微鏡可以觀(guān)察到細(xì)胞核孔結(jié)構(gòu)蛋白,但卻無(wú)法獲得這些高度自由的非折疊蛋白的結(jié)構(gòu),所以至今在生理狀態(tài)下FG屏障及其相關(guān)的核孔物質(zhì)傳輸?shù)臋C(jī)理仍不清楚。

        馬炯將利用SPEED顯微鏡技術(shù),完成各類(lèi)FG屏障與各類(lèi)主要的傳輸分子間反應(yīng)區(qū)域的三維分布測(cè)量。他將確認(rèn)活細(xì)胞內(nèi)FG-Nup相互反應(yīng)的存在及相應(yīng)的水凝膠分布。綜合各反應(yīng)分布,完成接近完善的FG屏障的完整分布。他還將利用基因敲除,獲取缺失核孔蛋白的分布,理解其對(duì)白血病的致病機(jī)理及對(duì)腺相關(guān)病毒(AAV)基因療法的調(diào)控機(jī)制。從傳輸?shù)鞍组g的競(jìng)爭(zhēng)情況,了解細(xì)胞核孔在大通量物質(zhì)運(yùn)輸下對(duì)應(yīng)的優(yōu)先選擇機(jī)制。

        達(dá)成這項(xiàng)研究的基礎(chǔ),是SPEED顯微技術(shù)能在超短的時(shí)間內(nèi)獲得高精度的空間位置信息,調(diào)控光學(xué)設(shè)置的穩(wěn)定和準(zhǔn)確,以及對(duì)各不同分子不同擴(kuò)散速率下,在確保單分子熒光定位精度的同時(shí),優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件獲取最多的數(shù)據(jù)量,是實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵。擁有豐富的超分辨光學(xué)經(jīng)驗(yàn),這讓馬炯能夠滿(mǎn)足數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性及穩(wěn)定地產(chǎn)出量。據(jù)此,他將創(chuàng)新領(lǐng)先技術(shù),努力實(shí)現(xiàn)分子競(jìng)爭(zhēng)通過(guò)核孔的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)創(chuàng)新。

        細(xì)胞核孔復(fù)合物示意圖。作者A.Goryaynov

        馬炯老師和他的課題組

        未來(lái)故事

        回國(guó)后的馬炯選擇了他的母校復(fù)旦大學(xué)作為科研工作的新起點(diǎn)。這里熟悉的環(huán)境讓他很快就進(jìn)入到了工作當(dāng)中并規(guī)劃新的征程。

        首先,馬炯將繼續(xù)提升SPEED顯微技術(shù)的性能及推廣其應(yīng)用范圍。所有的對(duì)稱(chēng)體系研究中,馬炯的SPEED顯微技術(shù)都可以推廣應(yīng)用。而在快速跟蹤領(lǐng)域中,這項(xiàng)技術(shù)也具有明顯優(yōu)勢(shì)。其次,他將繼續(xù)完善超快速的實(shí)時(shí)單分子三維追蹤。再次,馬炯將提高靜態(tài)單分子熒光定位下的超分辨圖像精度。現(xiàn)在的主流超分辨顯微鏡是用了一種光開(kāi)關(guān)蛋白來(lái)實(shí)現(xiàn),這將會(huì)造成單位時(shí)間內(nèi)的信號(hào)光的損失。馬炯換了其他方式,利用分子運(yùn)動(dòng)進(jìn)特定區(qū)域時(shí)將這個(gè)分子可能發(fā)出的所有熒光進(jìn)行收集,從而提高靜態(tài)單分子熒光定位下的超分辨圖像精度。

        此外,馬炯還將利用單分子熒光圖像獲取除未知外的其他信息。他認(rèn)為這部分是相當(dāng)有意思的內(nèi)容。利用這些單分子圖像可以看到,隨著探測(cè)時(shí)間的加長(zhǎng),隨著分子運(yùn)動(dòng)速度越來(lái)越快,這個(gè)分子的單分子影像所占區(qū)域會(huì)越來(lái)越大,馬炯可以通過(guò)這些分子的大小探測(cè)到運(yùn)動(dòng)速率的快慢,確定這個(gè)區(qū)域的黏滯性有多大,從而找到這個(gè)分子所在納米位置的環(huán)境信息。

        最后擴(kuò)展到生物學(xué)的研究領(lǐng)域,比如基因治療方面?,F(xiàn)在病毒如何進(jìn)入到細(xì)胞、感染到細(xì)胞并最終復(fù)制出來(lái)的完整機(jī)制還有很多未知之處。如果徹底研究清楚,就能標(biāo)記這個(gè)病毒,知道它什么時(shí)候進(jìn)入到什么位置,如何從細(xì)胞吞噬體逃出,并且穿過(guò)細(xì)胞核孔到達(dá)細(xì)胞核,把基因嵌入其中。馬炯將通過(guò)光學(xué)手段解析所有步驟,為治療絕癥提供重要依據(jù)。

        采訪(fǎng)中,馬炯并沒(méi)有過(guò)多涉及家庭,卻在言語(yǔ)中流露出對(duì)父母、對(duì)妻子的柔情。而科研事業(yè)于他,更是一種信仰與幸福,讓他收獲前所未有的樂(lè)趣。作為2015年歸國(guó)的青年研究員,馬炯在國(guó)內(nèi)的事業(yè)剛剛起步,也必將乘風(fēng)破浪,揚(yáng)帆遠(yuǎn)航。

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