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        桑粉虱快速分子檢測技術(shù)

        2016-05-03 14:43:10柴建萍倪婧江秀均羅雁婕謝道燕
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年3期
        關(guān)鍵詞:基因

        柴建萍+倪婧+江秀均+羅雁婕+謝道燕+白興榮

        摘要: 桑粉虱[Pealius mori (Takahashi)]是我國植桑區(qū)重要的桑樹害蟲,在云南植桑區(qū)引起危害。針對桑粉虱蟲體小,與其他種類粉虱形態(tài)相似導(dǎo)致識別困難的問題,基于線粒體COⅠ分子標(biāo)記進(jìn)行桑園及周邊不同寄主植物粉虱種群鑒定的工作,比較與桑粉虱親緣關(guān)系較近的6種粉虱COⅠ基因序列,設(shè)計桑粉虱種特異性引物sfs5-1/sfs5-2,擴增300 bp片段,建立桑粉虱快速分子檢測技術(shù)。該引物只對桑粉虱COⅠ基因具有擴增能力,而對煙粉虱、溫室白粉虱無擴增效果,且對桑粉虱單頭成蟲、卵粒、幼蟲具有較好擴增能力,表現(xiàn)出桑粉虱種的特異性。該引物靈敏性高,對桑粉虱DNA模板最低檢測值為0.15 ng/μL。該檢測技術(shù)簡便、高效,可用于桑粉虱鑒定、苗木調(diào)運過程害蟲檢測、種群遷移擴散監(jiān)測及防控機制研究等多個領(lǐng)域。

        關(guān)鍵詞: 桑粉虱;COⅠ基因;特異性引物;分子檢測

        中圖分類號:S433.39 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號:1002-1302(2016)03-0145-03

        桑粉虱[Pealius mori(Takahashi)]屬同翅目粉虱科害蟲,是對我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)存在較大威脅的6種重要粉虱類害蟲之一[1]。桑粉虱以幼蟲、成蟲刺吸桑葉汁液發(fā)生危害,其分泌物導(dǎo)致桑園煤污病流行,造成桑葉品質(zhì)及產(chǎn)量下降。近年來,國內(nèi)植桑區(qū)域呈現(xiàn)“東桑西移”格局,桑粉虱在云南植桑區(qū)暴發(fā)危害并呈擴大趨勢。由于各地對桑粉虱種類識別不清楚,缺乏靶標(biāo)害蟲發(fā)生規(guī)律、危害習(xí)性、藥劑防效等背景知識,導(dǎo)致防治效果低下、防控難度增大。

        粉虱類害蟲的形體微小,種內(nèi)變異普遍,僅憑粉虱成蟲的外觀識別易造成種類鑒定混亂[2]。粉虱分類鑒定依據(jù)蛹?xì)ぬ卣鞫浅上x特征[3],蛹?xì)ば螤詈皖伾?,背面特征,邊緣的齒和剛毛,背剛毛和刺毛,胸部和腹部氣管褶、孔、冠、裂等特征是粉虱分類的重要依據(jù)[4]。桑粉虱蛹體長0.70~0.80 mm,呈黃褐色,橢圓形;成蟲體長0.70~0.80 mm,體淡黃色,被有白粉[5],外形與其他種類粉虱極為相似。非專業(yè)研究人員很難直觀地將桑粉虱與其他種類粉虱區(qū)別開。應(yīng)用DNA序列的分子標(biāo)記技術(shù)可找出不同生物類群間的遺傳差異,彌補傳統(tǒng)形態(tài)分類方法的不足,能較快進(jìn)行物種鑒定[6]。其中線粒體COⅠ基因被廣泛應(yīng)用于昆蟲系統(tǒng)發(fā)育及近緣種鑒定,在煙粉虱隱種鑒定、遺傳分化研究中發(fā)揮重要作用。但在昆蟲種類鑒定時,線粒體COⅠ基因需經(jīng)PCR擴增、檢測、測序、比對等諸多環(huán)節(jié),操作過程耗時、費用高,特別在進(jìn)行大量樣本鑒定時較為繁瑣。

        本研究基于線粒體COⅠ分子標(biāo)記對桑園及周邊不同寄主植物粉虱種群鑒定的結(jié)果,即桑樹上只有桑粉虱1種粉虱類害蟲危害,而桑園周邊蔬菜及經(jīng)濟(jì)作物以煙粉虱B型、溫室白粉虱發(fā)生危害[7]。比較桑粉虱、煙粉虱、溫室白粉虱、螺旋粉虱、番荔枝褶粉虱、番石榴黑棒粉虱、伯粉虱等7種粉虱COⅠ基因序列,根據(jù)桑粉虱COⅠ基因的種間特異性設(shè)計引物,通過PCR擴增、電泳檢測,建立桑粉虱快速分子檢測技術(shù),以期為植桑區(qū)桑粉虱害蟲識別、危害監(jiān)測及種群發(fā)生機制研究提供技術(shù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 試驗蟲源

        桑粉虱采自云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶桑蜜蜂研究所桑園(2014年6月),蟲態(tài)為成蟲、卵、幼蟲。煙粉虱樣本采自桑園周邊寄主植物薄荷(2012年5月),蟲態(tài)為成蟲。溫室粉虱采自大棚內(nèi)寄主植物黃瓜(2012年5月),蟲態(tài)為成蟲。煙粉虱及溫室粉虱經(jīng)過線粒體mt COⅠ分子標(biāo)記鑒定為煙粉虱B型及溫室白粉虱[7]。

        1.2 試驗儀器與試劑

        XW-80A渦旋儀(上海精科實業(yè)有限公司);Sorva ll Biofuge Stratos臺式高速冷凍離心機(ThermoFish);S1000 PCR擴增儀(BIO-RAD);PowerPac Universal電泳系統(tǒng)(BIO-RAD);GelDoc TM+XR紫外凝膠成像系統(tǒng)(BIO-RAD)。

        DNA提取液:含50 mmol/L Tris-HCl (pH 值8.0)、20 mmol/L NaCl、1 mmol/L EDTA、1% SDS;Tris-EDTA緩沖液:含10 mmol/L Tris-HCl(pH值 8.0)、1 mmol/L EDTA(pH 值8.0);蛋白酶K(Merck)、Easy Taq DNA Polymerase、2.5 mmol/L dNTPs,購自Trans(北京)公司;引物由Invitrogen(上海)公司合成;其他無機試劑為國產(chǎn)分析純。

        1.3 供試粉虱DNA提取

        粉虱DNA提取方法參照柴建萍等方法[7],分別提取5頭桑粉虱、煙粉虱、溫室白粉虱基因組DNA。收集桑粉虱5個粒卵及5頭2齡幼蟲,進(jìn)行桑粉虱卵、幼蟲基因提取。

        1.4 桑粉虱特異性引物設(shè)計

        根據(jù)柴建萍等報道的桑粉虱(登錄號:KP168713)測序結(jié)果[7],以及NCBI數(shù)據(jù)庫中公開的煙粉虱(Bemisia tabaci)(登錄號:KF059959)、溫室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)(登錄號:HM185763)、螺旋粉虱(Aleurodicus dispersus)(登錄號:KC822648)、番荔枝褶粉虱(Aleurotrachelus anonae) (登錄號:HM150624)、番石榴黑棒粉虱(Aleuroclava guyavae)(登錄號:JQ340179)、伯粉虱待定種(Metabemisia sp.)(登錄號:JQ340198)7種粉虱COⅠ堿基序列,應(yīng)用CLUSTAL X 2.1、MEGA5軟件進(jìn)行序列對比分析;用Primer Premer 5.0軟件設(shè)計桑粉虱特異性引物并進(jìn)行評價。

        1.5 引物特異性驗證

        分別以鑒定為桑粉虱、煙粉虱B型、溫室白粉虱的各5頭成蟲的DNA為模板,用設(shè)計引物sfs5-1/sfs5-2進(jìn)行PCR擴增驗證引物特異性。PCR擴增體系為25 μL,其中含 2.5 μL 10×buffer,1.9 μL 2.5 μmol/L dNTPs,20 μmol/L上、下游引物各0.5 μL,0.2 μL 5 U/L Taq DNA聚合酶,1.8 μL 100 μg/mL DNA模板,加ddH2O補足。反應(yīng)程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ 20 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 45 s,共35個循環(huán);72 ℃ 10 min。取5 μ L 擴增產(chǎn)物,加1 μL載樣緩沖液于1%瓊脂糖凝膠中,在100 V電壓下電泳15 min后,用紫外凝膠成像系統(tǒng)檢測電泳結(jié)果。

        1.6 引物靈敏性檢測

        以桑粉虱5頭幼蟲、5粒卵提取的基因組DNA為模版,用引物sfs5-1/sfs5-2進(jìn)行PCR擴增檢測有效性;檢測桑粉虱DNA模板濃度,并將模板濃度按1、10、102、103、104倍數(shù)稀釋成系列濃度梯度,用引物sfs5-1/sfs5-2進(jìn)行PCR擴增檢測其靈敏性。PCR體系及反應(yīng)條件同“1.5”節(jié)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 引物的選擇

        通過桑粉虱與NCBI數(shù)據(jù)庫公開的共7種粉虱COⅠ基因序列對比分析,設(shè)計桑粉虱特異性引物sfs5-1/sfs5-2,上游引物sfs5-1為5′-GTGGATTTGGGAACTGACTA-3′,下游引物sfs5-2為5′-GTGACATTCCTAAGGTTCGT-3′,預(yù)計擴增產(chǎn)物為300 bp。

        2.2 引物特異性驗證結(jié)果

        選擇引物sfs5-1/sfs5-2對桑粉虱及桑園周邊煙粉虱B型、溫室白粉虱基因組DNA進(jìn)行PCR擴增,電泳檢測結(jié)果表明,桑粉虱基因組DNA均可擴增出約300 bp目的條帶,而煙粉虱及溫室白粉虱基因組DNA未見目的條帶(圖1)。3種粉虱各重復(fù)5頭成蟲基因組擴增得到的結(jié)果一致,說明引物sfs5-1/sfs5-2在3種粉虱中具有桑粉虱種的特異性。

        2.3 引物靈敏性檢測

        引物sfs5-1/sfs5-2對桑粉虱幼蟲及卵基因組均可擴增出約300 bp目的條帶,說明設(shè)計的引物對桑粉虱卵、幼蟲、成蟲各蟲態(tài)具有良好擴增能力(圖2)。桑粉虱DNA模板按1、10、102、103、104倍數(shù)稀釋后分別得到1.5 ng/μL、0.15 ng/μL、15 pg/μL、1.5 pg/μL、0.15 pg/μL系列梯度濃度,經(jīng)過引物sfs5-1/sfs5-2 的PCR擴增、靈敏度檢測,表明該引物對模板濃度的最低檢測值為 0.15 ng/μL,引物靈敏性較高(圖3)。

        3 結(jié)論與討論

        對于形態(tài)特征不穩(wěn)定或多變異性的昆蟲,特別是近緣種的區(qū)別和疑難種的鑒定,PCR擴增分子標(biāo)記技術(shù)可解決傳統(tǒng)形態(tài)分類難以解決的難題且不受蟲態(tài)影響[6,8]。其中線粒體COⅠ基因已廣泛用于近緣種間系統(tǒng)進(jìn)化研究,并已應(yīng)用于粉虱、蚜蟲等多種昆蟲新物種鑒定[9-11]。基于線粒體COⅠ

        基因序列分析基礎(chǔ)上發(fā)展起來的種特異性鑒定技術(shù),在擴增未知DNA模板時可根據(jù)目標(biāo)片段的有無將目標(biāo)種類與其他種類鑒別開,由于該技術(shù)操作簡便,在粉蚧、實蠅、小蠹蟲、線蟲等害蟲的快速鑒定中被廣泛應(yīng)用[12-15]。針對較多隱種分化的煙粉虱,通過對多個隱種mtCOⅠ序列限制性內(nèi)切酶位點分析,篩選特定的內(nèi)切酶,利用mtCOⅠPCR-RFLP技術(shù)成功鑒定了國內(nèi)9個煙粉虱隱種[16]。應(yīng)用隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)技術(shù)篩選出溫室白粉虱特異性片段,由此片段設(shè)計特定序列擴增(sequence characterized amplified regions,SCAR)特異引物可將溫室白粉虱與其他種粉虱區(qū)別開,提高了溫室白粉虱檢測效率[17]。對于入侵性螺旋粉虱、雙鉤巢粉虱,采用其mtCOⅠ基因種的特異性序列,設(shè)計各自特異性引物,通過PCR擴增、檢測,成功將靶標(biāo)粉虱與其他種粉虱區(qū)別開,為口岸檢疫、害蟲檢測及監(jiān)測提供了快速分子鑒定技術(shù)[18-19]。

        云南蒙自桑園及周邊不同寄主植物粉虱種群鑒定表明,桑樹上僅有桑粉虱1種粉虱害蟲危害;遺傳距離及系統(tǒng)發(fā)育聚類分析得出,不同于煙粉虱、溫室白粉虱等多種粉虱,桑粉虱作為獨立分枝存在[7]。東桑西移,伴隨云南省桑園面積擴大,桑粉虱在該省的危害日趨嚴(yán)重。建立科學(xué)、簡便、高效的桑粉虱檢測技術(shù),對粉虱危害季節(jié)的桑粉虱鑒定、種苗調(diào)運過程害蟲檢測、種群遷移擴散監(jiān)測及防控機制研究等有重要的科學(xué)意義。

        本研究根據(jù)與桑粉虱親緣關(guān)系較近的6種粉虱mt COⅠ堿基序列,設(shè)計桑粉虱特異性引物sfs5-1/sfs5-2,并建立桑粉虱快速分子檢測技術(shù)。該引物可將桑粉虱與桑園周邊多發(fā)性的煙粉虱、溫室白粉虱區(qū)別開,并且對桑粉虱單頭成蟲、卵粒、幼蟲均具擴增能力,產(chǎn)生目的片段約為300 bp。引物靈敏度高,桑粉虱基因組DNA模板最低檢測值為0.15 ng/μL,可用于痕量或可疑蟲態(tài)的桑粉虱檢測。煙粉虱、溫室白粉虱是世界性害蟲。螺旋粉虱是1種入侵性害蟲,我國臺灣有64科144種植物受害,海南省有47科120種植物受害[20]。番荔枝褶粉虱、番石榴黑棒粉虱、伯粉虱在國內(nèi)尚未見報道。本試驗檢測樣本種類有限,僅涉及桑粉虱及廣泛分布危害的煙粉虱、溫室白粉虱,桑粉虱種特異檢測還需更多地域、更多種類粉虱樣本進(jìn)行驗證。

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