據科學網2016年6月23日報道，中科院昆明動物所張亞平課題組利用二代測序技術對滇南小耳豬進行了全基因組測序，拓展了對家豬馴化過程中毛色變異調控機制的認識，并對滇南小耳豬的選育具有指導意義。相關研究成果發(fā)表于《科學報告》。

家豬毛色表型常作為易察覺的外型特征，在品種選育中起重要作用。六白(四蹄、頭和尾尖白色)是家豬常見的毛色類型。之前有研究揭示歐洲家豬出現的六白毛色與MC1R基因的插入突變緊密相關，但對有著不同馴化起源的中國家豬來說，這一表型的形成機制至今并不清楚。在滇南小耳豬中，六白毛色比例較高，并且大量個體出現了不完全六白的特征，給該家豬品種的選育帶來了困難。

課題組對17頭具有六白毛色表型和14頭全黑表型的滇南小耳豬進行了全基因組測序，利用比較基因組學分析手段并結合大規(guī)模群體基因分型驗證，從分子層面揭示了調控滇南小耳豬六白毛色的遺傳機制。結果顯示，滇南小耳豬的六白毛色并非由MC1R基因突變導致，而是受到多個基因共同調控的復雜性狀；CNTLN、PINK1和EDNRB三個基因的變異共同解釋了滇南小耳豬群體中約20%的毛色表型變異；在六白個體中，EDNRB基因上游一段跨物種保守的CEBPB識別motif發(fā)生突變，可能導致了基因表達的改變。