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        常見氨基酸結(jié)構(gòu)的記憶方法

        2016-04-10 07:30:00徐立峰
        生物學(xué)教學(xué) 2016年2期
        關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)

        徐立峰

        (山東協(xié)和學(xué)院醫(yī)學(xué)院 濟(jì)南 250000)

        氨基酸代謝是生物化學(xué)中的重點(diǎn)內(nèi)容,而掌握20種常見氨基酸的結(jié)構(gòu)則是學(xué)習(xí)氨基酸代謝的基礎(chǔ)。為快速掌握常見氨基酸的結(jié)構(gòu),總結(jié)出如下多種記憶方法。

        1 學(xué)名記憶法

        氨基酸的學(xué)名包含氨基酸分子結(jié)構(gòu)的部分信息。因而根據(jù)羧酸的命名規(guī)則,寫出氨基酸的學(xué)名,有助于記憶氨基酸的結(jié)構(gòu)。例如,甘氨酸的學(xué)名是氨基乙酸;賴氨酸的學(xué)名是2,6-二氨基己酸。

        2 俗名助記法

        α-氨基酸常用其俗名,可根據(jù)其俗名所蘊(yùn)含的信息來(lái)幫助記憶一些氨基酸的結(jié)構(gòu)。例如,丙氨酸表明是含有3個(gè)碳原子的氨基酸;甲硫氨酸含有甲基和硫原子;苯丙氨酸可看做由苯和丙氨酸組成;天冬酰胺、谷氨酰胺則分別是由天冬氨酸、谷氨酸酰胺化而來(lái),都含有酰胺基;異亮氨酸則是亮氨酸的同分異構(gòu)體;半胱氨酸則是胱氨酸的一半。

        3 結(jié)構(gòu)分析法

        在掌握氨基酸結(jié)構(gòu)通式的基礎(chǔ)上,分析R基團(tuán)的結(jié)構(gòu)。甘氨酸的R基團(tuán)是1個(gè)氫原子;丙氨酸的R基團(tuán)是甲基;纈氨酸的R基團(tuán)是異丙基;絲氨酸的R基團(tuán)是羥甲基或甲醇;蘇氨酸的R基團(tuán)是乙醇;天冬氨酸的R基團(tuán)是乙酸;谷氨酸的R基團(tuán)是丙酸;賴氨酸的R基團(tuán)是丁胺;精氨酸的R基團(tuán)由3個(gè)亞甲基和1個(gè)胍基組成。

        4 衍生法

        多數(shù)氨基酸的結(jié)構(gòu)可看作是由丙氨酸衍生而來(lái)。例如,給丙氨酸的甲基加上1個(gè)羥基是絲氨酸;加上1個(gè)巰基是半胱氨酸;加上2個(gè)甲基是纈氨酸;加上1個(gè)異丙基是亮氨酸;加上1個(gè)羧基是天冬氨酸;加上1個(gè)乙酸是谷氨酸;加上1個(gè)丙胺是賴氨酸;加上1個(gè)苯環(huán)是苯丙氨酸;加上1個(gè)苯酚是酪氨酸;加上1個(gè)吲哚是色氨酸;加上1個(gè)咪唑是組氨酸。

        5 代謝助記法

        根據(jù)氨基酸在體內(nèi)合成與分解的過(guò)程來(lái)幫助記憶。例如,苯丙氨酸在羥化酶的催化下,在苯環(huán)上與丙氨酸相對(duì)的碳原子上加1個(gè)氧原子,轉(zhuǎn)變?yōu)槔野彼?,再進(jìn)一步分解;大多數(shù)植物和微生物的半胱氨酸是由絲氨酸的羥基被巰基取代而成[1],也可看做是把絲氨酸的羥基氧被同族元素硫替代而成;甘氨酸是絲氨酸在轉(zhuǎn)羥甲基酶的作用下,把羥甲基中的碳原子轉(zhuǎn)移給四氫葉酸而生成;精氨酸除去胍基后剩余部分來(lái)自谷氨酸,所以精氨酸除去胍基后剩余部分的碳骨架與谷氨酸的相同。

        6 特點(diǎn)助記法

        根據(jù)氨基酸的特點(diǎn)來(lái)幫助記憶其結(jié)構(gòu)。例如,甘氨酸是最簡(jiǎn)單的氨基酸,它的R基團(tuán)僅是1個(gè)氫原子,因而甘氨酸也無(wú)旋光異構(gòu)現(xiàn)象;脯氨酸是α-亞氨基酸,與α-碳原子相連的是亞氨基,而且脯氨酸屬于雜環(huán)氨基酸,分子中具有1個(gè)雜環(huán);天冬氨酸、谷氨酸則是酸性氨基酸,它們的R基團(tuán)中具有顯酸性的羧基;賴氨酸、精氨酸、組氨酸則是堿性氨基酸,它們的R基團(tuán)中具有顯堿性的基團(tuán),如氨基、咪唑基、胍基。

        7 分類記憶法

        把結(jié)構(gòu)上具有共同特點(diǎn)的氨基酸歸到一類,有助于記憶氨基酸的結(jié)構(gòu)。例如,絲氨酸、蘇氨酸都含有羥基,是羥基氨基酸;苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸都具有苯環(huán),是芳香族氨基酸;半胱氨酸、甲硫氨酸都含有硫原子,是含硫氨基酸;組氨酸、脯氨酸都具有雜環(huán),是雜環(huán)氨基酸;纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸的R基團(tuán)具有支鏈,是支鏈氨基酸,支鏈氨基酸都是必需氨基酸。

        8 功能助記法

        通過(guò)了解氨基酸及其衍生物的功能來(lái)加深對(duì)氨基酸的印象。例如,甘氨酸參與嘌呤堿基、谷胱甘肽、肌酸、卟啉以及結(jié)合型膽汁酸的合成,在膠原蛋白(動(dòng)物體內(nèi)最豐富的蛋白質(zhì))中的含量很高,由于甘氨酸的R基團(tuán)僅是1個(gè)氫原子,因而對(duì)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)β-轉(zhuǎn)角的形成起著至關(guān)重要的作用;半胱氨酸參與蛋白質(zhì)中二硫鍵的形成,對(duì)維持蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)起著重要作用,半胱氨酸經(jīng)氧化脫羧產(chǎn)生的?;撬釁⑴c結(jié)合型膽汁酸的合成;甲硫氨酸是合成蛋白質(zhì)的起始氨基酸,也是甲基供體,是植物激素乙烯合成的唯一前體[2];苯丙氨酸的代謝出現(xiàn)異常,會(huì)導(dǎo)致苯丙酮尿癥;酪氨酸可轉(zhuǎn)變?yōu)閮翰璺影贰⒓谞钕偌に?、黑色素,若缺乏?huì)導(dǎo)致白化??;色氨酸在植物體內(nèi)能轉(zhuǎn)化為植物生長(zhǎng)素吲哚乙酸,色氨酸經(jīng)羥基化和脫羧作用形成的5-羥色胺是腦組織中的抑制性神經(jīng)遞質(zhì);精氨酸是尿素形成的中間產(chǎn)物,其末端的脒基參與形成尿素,也能形成NO信號(hào)分子;天冬氨酸參與嘧啶堿基的形成;谷氨酸是葉酸、谷胱甘肽的組成成分,其鈉鹽則是味精的有效成分,其脫羧基產(chǎn)生的γ-氨基丁酸是重要的中樞神經(jīng)系統(tǒng)抑制性神經(jīng)遞質(zhì);谷氨酰胺是被發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)氨基酸,它是運(yùn)輸氨的主要形式,也參與堿基的合成。

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