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        近紅外光譜檢測結(jié)合BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)用于藥物分類及MATLAB實現(xiàn)

        2016-04-10 08:02:02賈蕓芳閔昌敏琚成朱博王鵬
        國際生物醫(yī)學工程雜志 2016年4期
        關(guān)鍵詞:藥品分類分析

        賈蕓芳 閔昌敏 琚成 朱博 王鵬

        300350天津,南開大學電子信息與光學工程學院(賈蕓芳、琚成、朱博);300191天津市醫(yī)療器械技術(shù)審評中心(閔昌敏);300384天津市蘭力科化學電子高技術(shù)有限公司(王鵬)

        近紅外光譜檢測結(jié)合BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)用于藥物分類及MATLAB實現(xiàn)

        賈蕓芳 閔昌敏 琚成 朱博 王鵬

        300350天津,南開大學電子信息與光學工程學院(賈蕓芳、琚成、朱博);300191天津市醫(yī)療器械技術(shù)審評中心(閔昌敏);300384天津市蘭力科化學電子高技術(shù)有限公司(王鵬)

        目的 為實現(xiàn)快速、無損的藥物分類以及提高藥物分類準確率。方法 采用主成分分析和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相結(jié)合(PCA-ANN)的模式識別,建立了藥物分類模型并使用MATLAB語言開發(fā)了藥物分類軟件。采用近紅外光譜檢測技術(shù),對5種藥物、共120個批號的樣本,在激發(fā)波長為1 350~1 800 nm、間隔為0.5 nm處收集近紅外光檢測數(shù)據(jù)。結(jié)果 本研究模型在摻入干擾藥物種類數(shù)小于5種時,網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練均方差(MSE)為5.91e-03,預(yù)測誤差率(β)為2.469%。結(jié)論 利用近紅外光譜檢測技術(shù)結(jié)合PCA-ANN的方法可有效進行藥物分類且可提高分類的準確率。

        近紅外光譜; 誤差反向傳播; 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò); 主成分分析; MATLAB

        Fund program:Funding of Tianjin Science and Technology Commissioner(15JCTPJC63900)

        0 引言

        近紅外光譜(near infra-red spectrum,NIRS)分析技術(shù)是20世紀50年代發(fā)展起來的一種無創(chuàng)檢測技術(shù),已在農(nóng)產(chǎn)品成分的快速、定量檢測方面得到了廣泛應(yīng)用[1-4]。近紅外光(near infrared,NIR)是指波長在780~2 526 nm之間、介于可見光區(qū)(VIS)和中紅外光區(qū)(MIR)之間的電磁波。NIR波段的光子能量剛好滿足了有機分子中含氫基團(如O—H、C—H、N—H等)基頻躍遷、倍頻躍遷、合頻躍遷的能量需求;同時,有機物中含氫基團的種類、數(shù)量及不同含氫基團之間的組合方式等多項因素,直接影響NIR在有機物中的吸收峰,使得不同物質(zhì)具有其獨特的NIR圖譜信息,因此NIRS又被稱為有機物的“指紋圖譜”[5-6]。隨著商品化NIRS檢測設(shè)備的普及,NIRS檢測技術(shù)所具有的快速、安全、無損等優(yōu)勢使其在生物醫(yī)藥、農(nóng)產(chǎn)品、石油、化工、煙草等多個領(lǐng)域得以廣泛使用。

        NIRS檢測與現(xiàn)代數(shù)據(jù)分析處理算法相結(jié)合,是當前NIRS分析領(lǐng)域的研究重點[7-10]。本研究將誤差反向傳播(back propagation,BP)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(artificial neural network,ANN)算法[11]與主成分分析(principal components analysis,PCA)方法相結(jié)合,建立了用于藥物分類的ANN識別模型;并采用MATLAB語言開發(fā)了用于藥物分類的軟件;最后,以5種藥物的900個NIRS數(shù)據(jù)為例,對該程序的分類效果進行評估。實驗顯示,本研究的藥物分類模型及MATLAB程序具有較好的實際應(yīng)用價值,具有很好的用戶交互性,用戶可根據(jù)需要自由選擇建模數(shù)據(jù)、設(shè)置網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)、主成分書等識別參數(shù),為NIRS檢測技術(shù)與ANN、PCA數(shù)據(jù)處理方法的有機結(jié)合提供了平臺。此技術(shù)不僅可用于藥物分類,在水果、蔬菜、糧油等產(chǎn)品等級評估方面也具有潛在應(yīng)用價值。

        1 材料與方法

        1.1 主要材料與儀器

        本實驗使用了5種藥品,其規(guī)格、劑量及生產(chǎn)廠家如表1所示。實驗過程中,采用無損檢測方法,未對藥物進行任何預(yù)處理,為便于模式識別,采用了編號的方法對5種藥品進行編號,其中每種藥品又分別選擇了不同的批號數(shù),如1號藥品選擇18個批號、2號藥品選擇12個批號等,共120個樣本數(shù)量。

        使用AXSUN近紅外分析儀(美國AXSUN公司)采集藥品的NIRS數(shù)據(jù)。選擇光源波長的掃描范圍為1 350~1 800 nm,光譜分辨率為0.5 nm;使用積分球漫反射式的NIR檢測方式,每次光譜測試時,在波長范圍內(nèi)掃描16次,每個樣本測量6次,每個樣本的NIRS數(shù)據(jù)中任取3組用于建模,另外3組用于評估,時間間隔為0.5 min;實驗環(huán)境為室溫約25℃,相對濕度為40%。

        1.2 方法

        1.2.1 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法

        人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)包括輸入層、隱含層、輸出層。ANN的基本單元是神經(jīng)元,每個神經(jīng)元表示一種特定的信號傳遞函數(shù)。圖1為ANN結(jié)構(gòu)示意圖。圖中:xi表示輸入信號,wij表示第j個神經(jīng)元所收到的第i個xi的權(quán)值,權(quán)值w越大說明xi的影響越大;Bj為閾值,f為激勵函數(shù),yi為輸出信號。神經(jīng)元對所有輸入的加權(quán)求和進行判斷,即形成該神經(jīng)元的輸出信號yj,判斷依據(jù)表示為

        式中:Bj表示第j個神經(jīng)元的閾值。

        圖1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)示意圖

        ANN中,輸入信號xi(i=1,2,3......,N)的數(shù)量N一般等于樣本的特征點個數(shù),特征點個數(shù)的多少決定了樣本輸入形式的復(fù)雜程度,特征點個數(shù)增加將導(dǎo)致網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜度提高,運算量也隨之增大。本研究中,特征點指的是藥品光譜圖像中吸收峰的位置及其強度,輸出信號(yj)指的是產(chǎn)生藥品的分類結(jié)果。

        ANN具有自學習能力,主要表現(xiàn)在其權(quán)值可以根據(jù)誤差(E)及學習速率(dj)自動調(diào)整,其中輸出誤差E定義為

        權(quán)值調(diào)整策略表示為

        式中:t為運算的次數(shù)。式(3)表明第t+1次運算所需權(quán)值是在上一次(第t次)計算權(quán)值的基礎(chǔ)上,根據(jù)輸出誤差和學習速率進行調(diào)整的結(jié)果。

        表1 5種藥品相關(guān)信息

        本研究在進行藥物數(shù)據(jù)處理時,可通過改變主成分數(shù)目,隱含層神經(jīng)元數(shù)(藥物的編號方式)來尋求最優(yōu)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)??赏ㄟ^使用訓(xùn)練的時間來評價網(wǎng)絡(luò)的效率,訓(xùn)練集的網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練的均方差(MSE)用以評價網(wǎng)絡(luò)的誤差,同時使用預(yù)測集的誤差率(β)評價預(yù)測結(jié)果。MSE計算方法為

        式中:M為神經(jīng)元節(jié)點數(shù)。

        β的計算公式為

        式中:a為預(yù)測錯誤的樣本個數(shù),b為預(yù)測集總數(shù)。

        1.2.2 主成分分析法

        主成分分析(PCA)法是利用降維的思想,把多個指標轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個綜合指標的多元統(tǒng)計分析方法。對于本研究的NIRS數(shù)據(jù),光源波長的掃描范圍為1 350~1 800 nm,光譜分辨率為0.5 nm,每個光譜數(shù)據(jù)有900個數(shù)據(jù)點。若直接以這900個數(shù)據(jù)點作為xi,則N=900,這將導(dǎo)致運算速度極慢甚至癱瘓。

        筆者采用標準歸一化和PCA相結(jié)合的方法,在不丟失主要光譜信息的前提下選擇為數(shù)較少的新變量來代替原來較多的變量,解決了由于譜帶的重疊而無法分析的困難。在PCA處理后的NIRS數(shù)據(jù)將被抽提出N個主成分作為ANN的網(wǎng)絡(luò)輸入。

        1.2.3 MATLAB程序設(shè)計

        MATLAB程序流程如圖2所示,主要包括3個主要部分:訓(xùn)練集樣本設(shè)置、ANN模型參數(shù)設(shè)置和預(yù)測集樣本設(shè)置。首先,訓(xùn)練集樣本數(shù)據(jù)為儀器自動生成的SPC文件,程序通過調(diào)用MATLAB函數(shù)uigetfile('*.spc','select spcfile','MultiSelect','on')完成數(shù)據(jù)輸入,并繪制原始光譜圖;第2步,對原始數(shù)據(jù)標準進行歸一化處理,歸一化后的數(shù)據(jù)再進行PCA處理,根據(jù)分析結(jié)果中信息利用率選擇ANN分析所需主成分個數(shù);第3步,根據(jù)激勵函數(shù)、閾值等ANN模型的參數(shù)設(shè)置,建立ANN模型;最后,輸入預(yù)測樣本數(shù)據(jù),調(diào)用已生成的ANN模型,生成輸出結(jié)果。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 原始光譜數(shù)據(jù)

        本實驗中共獲得120個樣本的NIRS數(shù)據(jù),并將6次掃描結(jié)果的平均值作為結(jié)果存儲在SPC格式文件中;采用Origin軟件繪制5種藥品的原始光譜并進行歸一化處理(圖3)。由此可見,每種藥品均有各自的NIRS光譜特征,證明藥物分類算法可通過PCA和ANN相結(jié)合,提取被測樣本光譜數(shù)據(jù)特征峰信息以實現(xiàn)對藥物種類的識別。

        圖2 MATLAB程序設(shè)計流程圖

        2.2 主成分分析結(jié)果

        主成分分析(PCA)用于壓縮原始NIRS數(shù)據(jù),從龐大的NIRS數(shù)據(jù)中提取關(guān)鍵特征信息,以降低ANN分析的計算量,同時又不損失有用信息。本研究對5種藥品的預(yù)測集樣本NIRS數(shù)據(jù)的主成分分析結(jié)果如圖4所示,其中圖4A為以5種藥物NIRS代表為例經(jīng)PCA分析后各波長處的分數(shù),其峰值處對應(yīng)主成分所對應(yīng)的波段;圖4B為PCA后數(shù)據(jù)的信息利用率,可見隨著主成分數(shù)自1至10的增加,PCA信息的利用率也隨之逐漸增加,并在大于4時趨于飽和。PCA的信息率可保存98%以上的有用信息,因此后續(xù)實驗中選擇了4個主成分作為ANN的輸入。

        2.3 ANN神經(jīng)元數(shù)的影響

        ANN神經(jīng)元數(shù)應(yīng)大于輸入的主成分數(shù),當選擇前4個主成分時,神經(jīng)元數(shù)量對ANN網(wǎng)絡(luò)誤差與訓(xùn)練時間影響的數(shù)據(jù)結(jié)果如表1所示,結(jié)果曲線如圖5所示。在其他的測試情形的對比中,可發(fā)現(xiàn)隱含層神經(jīng)元為9個時,其網(wǎng)絡(luò)的均方差和訓(xùn)練時間較長,不適合作為最終的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu);當隱含層神經(jīng)元數(shù)大于10個時,均方差趨于平緩,穩(wěn)定在較低的數(shù)值;當隱含層神經(jīng)元數(shù)大于12個時,網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練時間明顯增加,不利于提高程序的效率?;谝陨戏治?,筆者選用10個隱含層神經(jīng)元,在保證均方誤差較小的同時,訓(xùn)練時間也不會過長。

        2.4 PCA-ANN藥物分類結(jié)果

        當主成分數(shù)N=4、神經(jīng)元數(shù)M=10時,筆者對5種藥品原始NIRS數(shù)據(jù)進行了分類識別,識別誤差(MSE)和訓(xùn)練集誤差率(β)如表2所示。其中,當藥品種類數(shù)大于5時,表示預(yù)測集數(shù)據(jù)中摻入了干擾藥物。干擾藥物是指訓(xùn)練集中沒有的藥物,每種干擾藥物的訓(xùn)練集和預(yù)測集樣本數(shù)分別為25個和11個。

        表1 神經(jīng)元數(shù)不同時對MSE和訓(xùn)練時間的影響

        表2 藥物識別結(jié)果

        根據(jù)預(yù)測數(shù)據(jù)繪制預(yù)測結(jié)果曲線如圖6所示,可見當藥品種類數(shù)小于11,即摻入干擾藥物種類數(shù)小于6種時,β小于3%,證明網(wǎng)絡(luò)的質(zhì)量較好(MSE較低),預(yù)測準確率也較高(β較?。?。由此可見,PCA與ANN結(jié)合是一種較好用于藥物NIRS分類的識別方法,具有較好的容錯率。說明只需提供足夠訓(xùn)練集樣本數(shù),即能對藥物進行正確分類。

        3 結(jié)論

        近紅外光譜(NIRS)是有機物的指紋圖譜,人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)算法具有自學習及自適應(yīng)能力,其容錯能力高,且信息可并行處理,具有較高效率,很好地克服了人工分析的缺點。本研究將兩者相結(jié)合,通過對藥物進行NIRS分析,建立了基于主成分分析(PCA)和ANN的藥物分類模型。對5種藥品不同批號120個樣本的NIRS數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明,當未摻入干擾藥物時,采用該模型的識別率可達到100%;同時,干擾實驗也顯示,當干擾藥物種類數(shù)小于6時,該模型具有較小的預(yù)測誤差率(β<3%)。因此,筆者認為以藥物NIRS數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),結(jié)合ANN算法與PCA和標準化歸一化預(yù)處理,可有效進行藥物的分類識別。

        利益沖突 無

        (圖3~6見插頁4-12)

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        Application and MATLAB realization of drugs'classification based on the combination of NIRS detectionand BP ANN algorithm

        Jia Yunfang,Min Changmin,Ju Cheng,Zhu Bo,Wang Peng

        College of Electronic Information and Optical Engineering,Nankai University,Tianjin 300350,China(Jia YF,Ju C, Zhu B);Tianjin Medical Device Technical Evaluation Center,Tianjin 300191,China(Min CM);Lanlike Chemical Electronic High Technology Co.Ltd.,Tianjin 300384,China(Wang P)

        Jia Yunfang,Email:jiayf@nankai.edu.cn

        Objective To realize rapid and non-destructive drug classification and improve the accuracy of drug classification.Methods A model for drug classification based on the combination of principal components analysis and artificial neural network(PCA-ANN)method was introduced.The software for drugs classification was then developed with the utility of MATLAB language.The near infra-red spectrum(NIRS)detection technique was executed on five kinds of drugs(a total of 120 batch samples)and the detection data was collected within the range of 1 350-1 800 nm of excitation wavelength and 0.5 nm of wavelength interval.Results The network training mean square error(MSE)was 5.91e-03,and the prediction error(β)was 2.469%when the number of the interfering drugs number was less than 5.Conclusions The classification of drugs by NIRS combined with PCA-ANN is feasible and the classification accuracy can be increased.

        Near infra-red spectrum; Error back propagation; Artificial neural network; Principal components analysis;MATLAB

        賈蕓芳,Email:jiayf@nankai.edu.cn

        10.3760/cma.j.issn.1673-4181.2016.04.007

        天津市科技特派員項目(15JCTPJC63900)

        2016-05-06)

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