戴黃益,劉明志,呂鎮(zhèn)城
(1.西南林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院云南昆明 650224;2.惠州學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,廣東惠州 516007)
頂空固相微萃取-氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法鑒別產(chǎn)紫杉醇的內(nèi)生菌株J11和誘變菌株J11-8
戴黃益1,2,劉明志2*,呂鎮(zhèn)城2
(1.西南林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院云南昆明 650224;2.惠州學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,廣東惠州 516007)
采用頂空固相微萃取-氣相色譜-質(zhì)譜(HS-SPME-GC-MS)對(duì)產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌J11及其誘變菌株J11-8的揮發(fā)性成分進(jìn)行分析.結(jié)果表明,J11菌株可鑒定19種揮發(fā)性成分,J11-8菌株鑒定可鑒定24種揮發(fā)性成分,兩者揮發(fā)性化學(xué)成分及相對(duì)百分含量具有明顯差異.因此,HS-SPME-GC-MS可用于區(qū)分野生型真菌和突變真菌在代謝組學(xué)上的差異,在真菌的種屬鑒定上具有重要的理論和實(shí)踐價(jià)值.
內(nèi)生真菌;紫杉醇;頂空固相微萃取(HS-SPME);氣相色譜-質(zhì)譜(GC-MS)
目前,隨著研究的深入,在地球上新發(fā)現(xiàn)的真菌的種類比預(yù)想的要多得多,其中,新發(fā)現(xiàn)的內(nèi)生真菌的種類占據(jù)相當(dāng)大的比例.傳統(tǒng)的真菌的分類鑒定方法主要基于形態(tài)學(xué)的觀察和鑒定,形態(tài)學(xué)鑒定的主要依賴于無性孢子和有性孢子,特別是有性孢子及其生殖過程.對(duì)于內(nèi)生真菌來說,在很多情況下,無性孢子和有性孢子的形成需要與植物形成共生關(guān)系,這給鑒定工作造成了困難.目前,基于標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化程度較高的真菌鑒定方法逐步建立,如Biolog微生物自動(dòng)分析系統(tǒng)[1]和BIOFOSUN系統(tǒng)鑒定[2]方法,但是,這兩種真菌鑒定方法操作復(fù)雜,應(yīng)用范圍有限,且需要專用的儀器設(shè)備,因而,難于推廣應(yīng)用.另一方面,基于DNA條形碼的分子生物學(xué)技術(shù)逐漸成熟,如ITS(Internal transcribed spacer)等條形碼技術(shù)成為鑒定真菌的可靠方法[3-5].目前,在GeneBank和EMBL數(shù)據(jù)庫登記的真菌條形碼序列呈現(xiàn)出快速增長,在真菌的鑒定中發(fā)揮了重要作用,成為真菌分子鑒定的主要方法.
隨著現(xiàn)代高精度分析化學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展和完善,在生物學(xué)領(lǐng)域展示了越來越廣的應(yīng)用前景.基于代謝組學(xué)基礎(chǔ)上的對(duì)真菌的蛋白質(zhì),次生代謝產(chǎn)物和揮發(fā)性物質(zhì)的微生物菌種鑒定方法成為可能,如基質(zhì)輔助激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)[6-9],氣相色譜-質(zhì)譜(GC-MS)[10,11].在本研究中,筆者分離獲得一株產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌J11[12,13]并通過誘變育種,獲得產(chǎn)紫杉醇的高產(chǎn)菌株J11-8[14].本文通過頂空固相微萃取-氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分析鑒定了揮發(fā)性成分,結(jié)果表明,兩個(gè)菌株的揮發(fā)性組及相對(duì)含量具有顯著差異,這些結(jié)果可作為識(shí)別兩個(gè)菌株“身份”的“指紋圖譜”.該方法在真菌的菌種鑒定上可能具有應(yīng)用前景.
1.1 材料
產(chǎn)紫杉醇的內(nèi)生真菌J11菌株由本實(shí)驗(yàn)室分離獲得,經(jīng)形態(tài)和分子鑒定為葡萄座腔菌屬真菌[11,12].J11-8菌株為J11菌株的突變株,紫杉醇產(chǎn)量可達(dá)1024.2μg/L[13].
QP-2010-Plus型氣質(zhì)聯(lián)用儀(日本島津公司);手動(dòng)頂空固相微萃取裝置(德國IKA公司);65 μm PDMS/ DVB統(tǒng)領(lǐng)取纖維頭(美國Supelco公司);Rtx-5MS色譜柱(美國安捷倫公司).
1.2 HS-SPME法
J11和J11-8菌株培養(yǎng)于含PDA固體培養(yǎng)基的100 mL頂空瓶中15 d,用于固相微萃取.使用手動(dòng)固相微萃取進(jìn)樣器及萃取頭進(jìn)行吸附.萃取頭在使用前在氣相色譜進(jìn)樣口老化2 h,老化溫度為250℃.將老化的萃取頭插入樣品瓶的頂空部分,室溫下吸附30 min.吸附完成后插入GC樣口進(jìn)行解吸附.
1.3 GC-MS分析條件
升溫程序如下:起始溫度40℃,保留2 min,以4℃/min升溫到220℃,再以15℃/min升溫到250℃,保留2 min.進(jìn)樣口溫度250℃,連接口溫度280℃,解吸附5 min.載氣為高濃度He(99.99%),不分流進(jìn)樣,流速為1 mL/min.質(zhì)譜條件:連接口溫度280℃,電離方式EI,離子源溫度為230℃,四級(jí)桿溫度150℃;電子能量70 eV,Scan模式全程掃描.樣品經(jīng)過氣相色譜進(jìn)樣分離后,形成不同色譜峰.
采用GC-MS計(jì)算機(jī)聯(lián)用儀分析J11菌株和J11-8菌株的化學(xué)組成,經(jīng)NIST/WILEY檢索及面積歸一化計(jì)算,分別確定2個(gè)菌株的揮發(fā)性化學(xué)組分.J11菌株的GC-MS總離子流圖見圖1,揮發(fā)性化學(xué)組分見表1,J11-8菌株的總離子流圖見圖2,揮發(fā)性化學(xué)組分見表2.
圖1 J11菌株的GS-MS分析揮發(fā)性化學(xué)成分的總離子流圖
表1 J11檢測結(jié)果
圖2 J11-8菌株的GC-MS分析揮發(fā)性化學(xué)成分的部離子流圖
表2 J11-8
通過比較表1和表2,發(fā)現(xiàn)在野生型J11菌株的19個(gè)揮發(fā)性化學(xué)組分與其突變株J11-8的24個(gè)揮發(fā)性化學(xué)組分中,僅有3個(gè)組分相同,即二甲基硅烷二醇,檸檬油精和十二甲基環(huán)己硅氧烷,且其相對(duì)含量差異較大.在野生型菌株J11中,主要揮發(fā)性化學(xué)成分除了二甲基硅烷二醇(6.24%),檸檬油精(9.46)和十二甲基環(huán)己硅氧烷(31.26%)外,還包括十四甲基環(huán)庚硅氧烷(20.84%),十六甲基環(huán)辛硅氧烷(12.87%)以及對(duì)-乙?;?鄰-[(三甲基硅烷基)乙炔基]苯酚(9.73%),但在突變菌株中,除了二甲基硅烷二醇(19.71%)含量顯著增加外,檸檬油精(1.33%)和十二甲基環(huán)己硅氧烷(0.60%)的含量顯著降低,但是,乙醇(22.37%)和丙烷(13.78%)顯著升高,此外,碳酸氫銨,氨基甲酸銨,1-碘-3-甲基-2-戊酮,三甲基丁醇等組分也顯著升高.
通過頂空固相微萃取-氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法分析野生型J11菌株和突變菌株J11-8的揮發(fā)性化學(xué)成分,可以看出兩者具有顯著差異,這說明野生型菌株和突變型菌株在代謝途徑上具有明顯不同的特性,可用于區(qū)分野生型和突變型菌株,是菌種或菌株“亞型”的“身份標(biāo)簽”和“指紋圖譜”.另一方面,從實(shí)驗(yàn)結(jié)果來看,由于野生型菌株和突變菌株在代謝組學(xué)上的差異程度顯然超過了DNA序列的差異程度,因而,該方法是否可用于真菌的菌種鑒定一直存在疑問.事實(shí)上,同一個(gè)菌株在不同培養(yǎng)基,不同培養(yǎng)條件以及不同的培養(yǎng)時(shí)間,通過該方法分析獲得的代謝“指紋圖譜”也可能存在顯著差異.因此,目前,在通過與DNA條形碼序列比較,獲得大量詳實(shí)和可靠的數(shù)據(jù),以及在提出一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化方案以前,通過該方法鑒定菌株可能是一個(gè)有爭議的問題.雖然如此,該方法作為鑒別野生型菌株和突變型菌株的“指紋圖譜”還是可靠的.
相對(duì)于同時(shí)蒸餾萃?。⊿DE-GC-MS),HS-SPMEGC-MS操作更簡單.同時(shí),相對(duì)于DNA條形碼ITS所進(jìn)行的菌種鑒定,利用HS-SPME-GC-MS進(jìn)行菌種鑒定,節(jié)省了大量的操作步驟,且操作簡單.如果能夠與ITS等條形碼比較,證明HS-SPME-GC-MS在鑒定菌種具有可靠性,以及建立標(biāo)準(zhǔn)化的方法,利用HS-SPMEGC-MS鑒定菌種為時(shí)不遠(yuǎn),應(yīng)該具有廣闊的應(yīng)用前景.目前,利用MALDI-TOF-MS鑒定真菌有較多研究報(bào)道[15,16],但是,該方法需要提取真菌的全部蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)是否提取完全,以及蛋白質(zhì)提取方法等將影響鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性.從本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果來看,通過HSSPME-GC-MS所獲得的真菌揮發(fā)性化學(xué)組分較少,這將是影響其在基礎(chǔ)研究和應(yīng)用前景方面的主要障礙.因此,通過分析GC-MS分析真菌提取物中的小分子天然化合物有助于鑒別和鑒定真菌.
[1]姚粟,程池,李金霞,等.Biolog微生物自動(dòng)分析系統(tǒng)——絲狀真菌鑒定操作規(guī)程的研究[J].食品與發(fā)酵工業(yè),2006,32(8):63-67.
[2]章強(qiáng)強(qiáng),趙穎,李莉,等.利用BIOFOSUN系統(tǒng)鑒定常見曲霉[J].檢驗(yàn)醫(yī)學(xué),2010,25(7):515-518.
[3]仇萌,鄒先彪.DNA-ITS序列鑒定深部真菌菌種的研究進(jìn)展[J].中國真菌學(xué)雜志,2011,6(2):122-125.
[4]徐羅娜,涂敏,王曉芳.DNA條形碼技術(shù)在真菌上的研究與應(yīng)用[J].湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,53(20):4790-4795.
[5]鄭冰,應(yīng)春妹,汪雅萍,等.rDNA-ITS序列分析對(duì)臨床少見絲狀真菌鑒定作用的評(píng)估[J].檢驗(yàn)醫(yī)學(xué),2011,26(10):648-652.
[6]梁錚,柏彩英,羅婭莎,等.MALDI-TOF-MS技術(shù)快速鑒定臨床酵母樣真菌的應(yīng)用評(píng)價(jià)[J].檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)與臨床,2015,12(18):2658-2663.
[7]徐昕榮,朱斌,馬瑜璐,等.MALDI-TOF-MS鑒定生物脫氮細(xì)菌的方法研究[J].環(huán)境科學(xué)與技術(shù),2010,23(10):148-151.
[8]馮建軍,龍海,劉新嬌,等.MALDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)鑒定植物病原體研究進(jìn)展[J].植物檢疫,2014,28(6):13-18.
[9]黃聲雷,胡必杰,陳蓉,等.兩種MALDI-TOF MS系統(tǒng)快速鑒定血培養(yǎng)中白念珠菌以外酵母樣真菌[J].檢驗(yàn)醫(yī)學(xué),2015,30(2):128-131.
[10]李康樂,包佳源,陸瑞利,等.SDE-GC-MS法分析三種蟲生真菌菌絲中揮發(fā)性成分[J].菌物學(xué)報(bào),2012,31(1):92-101.
[11]張霄霄,汪定成,張惠中.質(zhì)譜在臨床病原真菌檢測及鑒定中的研究進(jìn)展[J].臨床檢驗(yàn)雜志,2015,33(4):294-296.
[12]劉明志.南方紅豆杉產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌的分離[J].熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào),2011,19(4):360-364.
[13]劉明志,段中崗,呂鎮(zhèn)城,等.高產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌J11的鑒定[J].中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào),2014,30(10):1031-1038.
[14]劉明志,呂鎮(zhèn)城,冉夢(mèng)蓮,等.產(chǎn)紫杉醇葡萄座腔菌J11菌株誘變獲得高產(chǎn)菌株[J].藥物生物技術(shù),2015,22(1):45-48.
[15]葉麗艷,郭玲,馬艷寧,等.基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)在快速鑒定真菌中的臨床應(yīng)用研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2015,25(15):3361-3363.
[16]姜長宏,龍軍,華夏.基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀在侵襲性真菌感染病原真菌鑒定中的應(yīng)用[J].實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志,2015,31(17):2902-2904.
【責(zé)任編輯:吳躍新】
Identification of Paclitaxel-producing Wild-type Entophyte fungus J11 and Its Mutant Strain J11-8 by HS-SPME-GC-MS
DAI Huang-yi1,2,LIU Ming-zhi2*,LV Zhen-cheng2
(1.College of Life Science,Southwest Forestry University,Kunming 650224,Yunnan China;2.School of Life Science,Huizhou University,Huizhou 516007,Guangdong China)
The volatile components of paclitaxel-producing wild-type endophyte fungus J11 and its mutant strain J11-8 were analyzed by headspace solid-phase microextraction gas chromatography-mass spectrometry(HS-SPME-GC-MS).Results showed that nineteen compounds in the J11 and twenty-four compounds in J11-8 were identified.The volatile components and their relative percentages in both strains had significant differences.The difference on metabolomics for wild-type fungus and mutant fungus could be distinguished by HS-SPME-GC-MS.The HS-SPME-GC-MS has an important theoretical and practical values on identification for fungus’s species and genus.
endophytic fungus;paclitaxel;headspace-solid-phase microextraction(HS-SPME);gas chromatography-mass spectrometry(GC-MS)
R965.1
A
1671-5934(2016)06-0045-05
2016-10-15
廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013B060400026)
戴黃益(1991-),女,廣東龍川人,碩士研究生,研究方向?yàn)榉肿蛹?xì)胞生物學(xué).
*通訊作者:劉明志,教授,Email:tlmz63@163.com.