羅旭東,林舉達(dá),鄒曉波,殷靜雯
(廣東醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院精神心理科,廣東 湛江 524001)
·薈萃分析·
miR-137基因rs1625579多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的Meta分析
羅旭東,林舉達(dá),鄒曉波,殷靜雯
(廣東醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院精神心理科,廣東 湛江 524001)
目的 系統(tǒng)評(píng)價(jià)miR-137 rs1625579位點(diǎn)基因多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。方法計(jì)算機(jī)檢索PubMed、Embase、Springer Link、Wiley Online Library、HighWire Press、Google Scholar和CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)以獲取2015年8月之前發(fā)表的關(guān)于miR-137單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)rs1625579基因多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病的病例對(duì)照研究文獻(xiàn),采用Review Manager5.0和Stata12.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果最終納入8篇,miR-137基因rs1625579位點(diǎn)多態(tài)性與精神分裂癥在顯性模型(TT+GT vs GG)、隱性模型(TT vs GT+GG)、加性模型(TT vs GG)和等位基因模型(T vs G)分析中差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。合并OR值分別為1.47、1.21、1.53、1.17;P值分別為0.03、0.001、0.02、0.003。結(jié)論miR-137單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs1625579與精神分裂癥的易感性均具顯著相關(guān),為miR-137多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)聯(lián)性的研究提供了理論參考。
精神分裂癥;miR-137;rs1625579;多態(tài)性;Meta分析
精神分裂癥是神經(jīng)發(fā)育異常引起的復(fù)雜遺傳疾病[1]。微小RNA(microRNA,miRNA)通過(guò)多條信號(hào)通路調(diào)控多個(gè)基因表達(dá)對(duì)神經(jīng)發(fā)育起關(guān)鍵作用[2]。微小RNA-137(microRNA-137,miR-137)是在大腦中高豐度表達(dá)的miRNA,它對(duì)胚胎神經(jīng)干細(xì)胞決定、神經(jīng)細(xì)胞增殖與分化、突觸成熟等方面都具有重要作用,它的失調(diào)會(huì)引起神經(jīng)系統(tǒng)基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的改變而誘發(fā)精神相關(guān)疾病,它已被確立為精神分裂癥易感基因[3]。全基因組關(guān)聯(lián)性掃描研究發(fā)現(xiàn)位于miR-137宿主基因上的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs1625579,與精神分裂癥具有高相關(guān)性[4]。但是在不同人群中進(jìn)行的病例對(duì)照研究卻得出不一致的結(jié)果[5-9],因此,本研究采用Meta分析的方法系統(tǒng)評(píng)價(jià)miR-137 rs1625579位點(diǎn)基因多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。
1.1 檢索策略 從PubMed(http://www.ncbi.nlm. nih.gov/pubmed),Embase(http://www.elsevier.com/solutions/embase-biomedical-research),Springer Link(http: //link.springer.com/),Wiley Online Library(http://onlinelibrary.wiley.com/),HighWire Press(http://highwire. stanford.edu),Google Scholar(http://scholar.google. com)和 China NationalKnowledge Infrastructure (CNKI:http://www.cnki.net)數(shù)據(jù)庫(kù)以獲取2015年8月之前發(fā)表的關(guān)于miR-137多態(tài)性與精神分裂癥易感性關(guān)系的所有病例對(duì)照研究,使用檢索關(guān)鍵詞及主題詞包括:schizophrenia;miR-137;microRNA-137;rs1625579。
1.2 納入標(biāo)準(zhǔn) (1)語(yǔ)種為英語(yǔ)或中文;(2)病例組符合診斷標(biāo)準(zhǔn)(DSM-Ⅳ或者ICD-10)的精神分裂癥患者,對(duì)照組為健康人群;(3)病例組和對(duì)照組有明確的rs1625579基因型頻率分布數(shù)據(jù),可以計(jì)算比值比(Odds ratio,OR)和95%可信區(qū)間(Confidence inter-val,CI);(4)篩除數(shù)據(jù)不完整的文獻(xiàn)。
1.3 資料提取 對(duì)納入研究的文獻(xiàn)資料提取第一作者姓名、發(fā)表日期、研究對(duì)象種族來(lái)源、病例組和對(duì)照組的總?cè)藬?shù)、哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)檢驗(yàn)結(jié)果、基因分型方法、基因型及等位基因頻率分布數(shù)據(jù)。文獻(xiàn)檢索、資料提取時(shí)由兩位研究者分別進(jìn)行,共同商議、匯總。無(wú)法達(dá)成一致,交由第3位研究者裁定。納入文獻(xiàn)采用NOS量表(Newcastle-Ottawa Scale)進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià)。
1.4 資料合并及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用OR作為檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量和95%CI作為衡量miR-137多態(tài)性rs1625579與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間關(guān)聯(lián)程度的效應(yīng)指標(biāo)。合并OR值時(shí)采用下述4種模型進(jìn)行計(jì)算:顯性模型(TT+GT vs GG)、隱性模型(TT vs GT+GG)、加性模型(TT vs GG)、等位基因模型(T vs G)。采用基于χ2檢驗(yàn)的校正Q檢驗(yàn)來(lái)衡量各研究間效應(yīng)量分布有無(wú)顯著異質(zhì)性,檢驗(yàn)水準(zhǔn)設(shè)為0.05,采用I2值評(píng)價(jià)各研究間變異占總變異的百分比,I2值在0~1之間,I2=0時(shí)各研究間無(wú)異質(zhì)性,I2值趨近于0時(shí)各研究間異質(zhì)性可歸因于偶然因素,低于25%認(rèn)為是輕度異質(zhì)性,25%~50%為中度異質(zhì)性,大于50%則認(rèn)為各研究間有高度異質(zhì)性。若P>0.05或I2<50%,各研究間效應(yīng)量分布異質(zhì)性顯著,采用固定效應(yīng)模型(Mantel-Haenszel)進(jìn)行合并,反之,則采用隨機(jī)效應(yīng)模型(DerSimonian-Laird)進(jìn)行合并運(yùn)算。采用Z檢驗(yàn)評(píng)價(jià)合并OR值有無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,檢驗(yàn)水準(zhǔn)設(shè)為0.05。根據(jù)Egger′s回歸檢驗(yàn)、Begg′s級(jí)聯(lián)檢驗(yàn)判斷納入文獻(xiàn)是否存在顯著發(fā)表偏倚。偏倚檢驗(yàn)P<0.01則認(rèn)為存在顯著發(fā)表偏倚。所有P值均為雙側(cè)檢驗(yàn),除異質(zhì)性評(píng)估及發(fā)表偏倚外,檢驗(yàn)水準(zhǔn)均設(shè)為P<0.05時(shí)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。統(tǒng)計(jì)分析采用STATA 10.0(Stata Corporation,College Station,TX,USA)和Review Manager 5.0(Coehrane Collaboration,Software Update,Oxford,United Kingdom)軟件完成。
2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 共檢出相關(guān)文獻(xiàn)28篇,閱讀題目、摘要和全文,根據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)以及結(jié)合文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)結(jié)果最終對(duì)文獻(xiàn)做如下處理:剔除綜述1篇,非基因多態(tài)研究10篇,非精神分裂癥相關(guān)研究3篇,未報(bào)告rs1625579多態(tài)位點(diǎn)文獻(xiàn)1篇,未進(jìn)行基因型及等位基因分析3篇,非病例對(duì)照研究1篇,無(wú)完整基因型數(shù)據(jù)1篇,最終納入8篇文獻(xiàn)進(jìn)行Meta分析(圖1)。
2.2 納入文獻(xiàn)概要 依據(jù)納入、排除標(biāo)準(zhǔn)和NOS量表(Newcastle-Ottawa Scale)評(píng)價(jià)結(jié)果,最終納入8篇病例對(duì)照研究文獻(xiàn),其中病例組包括3 802例精神分裂癥患者,對(duì)照組包括3 461名健康對(duì)照,納入文獻(xiàn)中的樣本均符合H-W遺傳平衡定律,見(jiàn)表1。
圖1 文獻(xiàn)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)流程
表1 納入miR-137基因多態(tài)性與精神分裂癥病例對(duì)照研究基本信息
2.3 Meta分析結(jié)果 miR-137基因rs1625579位點(diǎn)多態(tài)性與精神分裂癥顯著相關(guān)性,見(jiàn)圖2。顯性模型(TT+GT vs GG)分析中,突變率異質(zhì)性檢驗(yàn)P=0.83 (P>0.05),I2=0%,各個(gè)文獻(xiàn)間不存在異質(zhì)性,故選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)合并,OR合并值為1.47,95%CI為(1.03 ,2.11),P=0.03。結(jié)果表明TT+GT基因型與GG基因型比較,rs1625579基因型多態(tài)性與精神分裂癥顯著相關(guān)(P<0.05)。隱性模型(TT vs GT+GG)分析中,突變率異質(zhì)性檢驗(yàn)P=0.84(P>0.05),I2=0%,各個(gè)文獻(xiàn)間不存在異質(zhì)性,故選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)合并,OR合并值為1.21,95%CI為(1.08,1.35),P= 0.001。結(jié)果表明TT基因型與GT+GG基因型比較,rs1625579基因型多態(tài)性與精神分裂癥顯著相關(guān)(P<0.05)。加性模型(TT vs GG)分析中,突變率異質(zhì)性檢驗(yàn)P=0.82(P>0.05),I2=0%,各個(gè)文獻(xiàn)間不存在異質(zhì)性,故選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)合并,OR合并值為1.53,95%CI為(1.06,2.19),P=0.02。結(jié)果表明TT基因型與GG基因型比較rs1625579基因型多態(tài)性與精神分裂癥顯著相關(guān)(P<0.05)。等位基因模型(T vs G)分析中,突變率異質(zhì)性檢驗(yàn)P=0.37(P>0.05),I2=7%,各個(gè)文獻(xiàn)間異質(zhì)性可歸因于偶然因素,故選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)合并,OR合并值為1.17,95%CI為(1.06,1.30),P=0.003。結(jié)果表明TT+GT基因型與GG基因型比較,rs1625579基因型多態(tài)性與精神分裂癥顯著相關(guān)(P<0.05)。
2.4 發(fā)表偏倚分析 顯性模型(TT+GT vs GG)中,Begg′s檢測(cè)Z=0.00,P=1.00;Egger′s檢測(cè)t=0.17,P= 0.869。隱性模型(TT vs GT+GG)中,Begg’s檢測(cè)Z= 0.37,P=0.711;Egger′s檢測(cè)t=0.66,P=0.531。加性模型(TT vs GG)中,Begg′s檢測(cè)Z=0.12,P=1.00;Egger′s檢測(cè)t=0.25,P=0.811。等位基因模型(T vs G)分析中,Begg′s檢測(cè)Z=0.62,P=0.536;Egger′s檢測(cè)t=0.50,P=0.636。研究結(jié)果表明:本研究納入的文獻(xiàn)不存在發(fā)表偏倚。
圖2 miR-137基因多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的Meta分析森林圖
近年來(lái),miR-137對(duì)神經(jīng)細(xì)胞增殖和分化及對(duì)精神分裂癥的相關(guān)基因的調(diào)控可能使其成為精神分裂癥發(fā)病的易感基因[3]。在尸檢中發(fā)現(xiàn)miR-137在前額葉皮質(zhì)的表達(dá)在患者和對(duì)照組之間沒(méi)有顯著差異,但是在40名正常人群中,TT風(fēng)險(xiǎn)基因型的被試前額葉皮質(zhì)miR-137表達(dá)量顯著高于G等位基因攜帶者,精神分裂癥患者中則差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[13]。該研究首次提出了miR-137的表達(dá)量在正常人和精神分裂癥患者中都存在差異性的變化,特別是單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)rs1625579的不同基因型miR-137表達(dá)量的差異,因此,提示rs1625579可能參與調(diào)控miR-137的表達(dá),而與精神分裂癥的易感性相關(guān)。
rs1625579位于miR-137基因下游的8 kb區(qū)域,是迄今發(fā)現(xiàn)與精神分裂癥關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)位點(diǎn)(P=1.6×10-11)[4]。但是,隨后在英國(guó)[8,14]、澳大利亞[5]、美國(guó)、加拿大[10]等高加索人群的相關(guān)研究中,miR-137與精神分裂癥病例對(duì)照研究得出了陰性的結(jié)果,在中國(guó)人群中rs1625579與精神分裂癥相關(guān)性的研究結(jié)果不一致[3,6,11]。差異的結(jié)果使miR-137在精神分裂癥中易感性的研究遇到了一定的困難。造成差異性結(jié)果的原因可能為:首先,由于精神分裂癥是一個(gè)高度異質(zhì)性的疾病,目前尚無(wú)客觀的實(shí)驗(yàn)室檢查作為診斷依據(jù),造成不同研究的入組病例異質(zhì)性增高;其次,受到樣本量的影響,即使是對(duì)于同一多態(tài)位點(diǎn)在相同人群中的研究也得出不同甚至相反的結(jié)果;再次,由于在不同種族人群中等位基因頻率、單體型頻率不同。造成病例對(duì)照研究常出現(xiàn)矛盾性的結(jié)果。以rs1625579多態(tài)位點(diǎn)為例,筆者的檢索結(jié)果顯示rs1625579三種基因型頻率分布在亞洲人群、歐洲人群和非洲人群之間存在顯著的差異;同屬亞洲人群的日本和中國(guó)人群也具有差異性:中國(guó)人群的TT基因型的頻率最低,而非洲人群的TT基因型的頻率最高。我們查閱了miR-137 rs1625579多態(tài)性與精神分裂癥發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的病例對(duì)照研究進(jìn)行Meta分析,最終納入符合要求的8篇研究,合計(jì)患者3 802例,健康對(duì)照者3 461例。Meta分析的結(jié)果提示在顯性模型、隱性模型、加性模型和等位基因模型中miR-137單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs1625579與精神分裂癥的易感性均具顯著相關(guān)(分別為P=0.03,P=0.001,P=0.02,P=0.003)。進(jìn)一步證實(shí)了miR-137基因多態(tài)與精神分裂癥的相關(guān)性。
雖然Meta定量合成多個(gè)研究的結(jié)果,能夠提高檢驗(yàn)效能。但是仍存在一些可能影響結(jié)果的局限性:在研究中存在語(yǔ)言偏倚,檢索語(yǔ)種限定為中文和英文,排除了其他的語(yǔ)種,可能造成結(jié)果的偏倚。
綜上所述,miR-137單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)rs1625579與精神分裂癥的易感性均具顯著相關(guān)。我們的研究結(jié)果為miR-137多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)聯(lián)性的研究提供理論參考。但是rs1625579基因多態(tài)如何影響miR-137的表達(dá)進(jìn)而調(diào)控其下游通路影響精神分裂癥的機(jī)制目前尚不清楚。rs1625579多態(tài)到底是發(fā)揮功能性作用,或者僅僅是與功能性多態(tài)位點(diǎn)相連鎖的遺傳標(biāo)記,這都需要進(jìn)一步研究證實(shí)。
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Correlation between single nucleotide polymorphism rs1625579 in miR-137 gene and schizophrenia:a meta-analysis.
LUO Xu-dong,LIN Ju-da,ZOU Xiao-bo,YIN Jing-wen.Department of Psychiatry,the Affiliated Hospital of Guangdong Medical College,Zhanjiang 524001,Guangdong,CHINA
ObjectiveTo assay the association between the single nucleotide polymorphism(rs1625579)in miR-137 gene and schizophrenia.MethodsStudies about the effects of rs1625579 in miR-137 gene on the sensitivity in patients with schizophrenia until Aug.2015 were searched from PubMed,Embase,Springer Link,Wiley Online Library,HighWire Press,Google Scholar,and China National Knowledge Infrastructure(CNKI).Meta-analysis was performed by using Review Manager5.0 and Stata12.0.ResultsA total of 8 studies were included.A significant association between rs1625579 and schizophrenia was found using dominant[TT+GT vs GG,P=0.03,odds ratio(OR)=1.47],recessive(TT vs GT+GG,P=0.001,OR=1.21),additive(TT vs GG,P=0.02,OR=1.53),and allele(T vs G,P=0.003,OR= 1.17)models.ConclusionThe results of our study provide convincing evidence that rs1625579 is significantly associated with schizophrenia.
Schizophrenia;miR-137;rs1625579;Polymorphism;Meta-analysis
R749.3
A
1003—6350(2016)04—0656—04
10.3969/j.issn.1003-6350.2016.04.051
2015-10-22)
廣東省湛江市科技攻關(guān)計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):2013B01258)
通迅作者:殷靜雯。E-mail:amysays@live.com