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        高效氯氰菊酯降解菌RH7的鑒定及其降解條件的優(yōu)化

        2016-03-01 13:02:55劉清斌楊小龍
        貴州農業(yè)科學 2016年5期
        關鍵詞:氯氰菊酯回歸方程

        劉清斌, 劉 奎, 王 軍, 李 覓, 楊小龍

        (1.四川理工學院 生物工程學院, 四川 自貢 643000; 2.四川國光農化股份有限公司, 四川 簡陽 641400)

        高效氯氰菊酯降解菌RH7的鑒定及其降解條件的優(yōu)化

        劉清斌1, 劉 奎1, 王 軍2, 李 覓1, 楊小龍1

        (1.四川理工學院 生物工程學院, 四川 自貢 643000; 2.四川國光農化股份有限公司, 四川 簡陽 641400)

        為探明高效氯氰菊酯降解菌RH7的種屬地位及其對高效氯氰菊酯的降解率,通過分子生物學方法對菌株RH7進行鑒定,并采用響應曲面法對其降解條件進行優(yōu)化。結果表明:菌株RH7屬于銅綠假單胞菌屬(Pseudomonassp.),將其命名為Pseudomonassp.RH7。通過響應面模型分析,得最優(yōu)降解條件為高效氯氰菊酯濃度111.7 mg/L、溫度32.05℃、pH 6.88。在此條件下,菌株RH7在5 d內對高效氯氰菊酯降解率為79.46%,與所建立模型的預測值(80.83%)接近。

        銅綠假單胞菌屬; 高效氯氰菊酯; 降解條件

        2015年4月20日提請全國人大常委會審議的食品安全法修訂草案三審稿提出“國家鼓勵和支持使用高效低毒低殘留農藥,推動替代劇毒、高毒農藥產品的研發(fā)和應用,加快淘汰劇毒、高毒農藥。劇毒、高毒農藥不得用于蔬菜、瓜果、茶葉和中草藥材”。

        高效氯氰菊酯作為低毒的擬除蟲菊酯類農藥具有對環(huán)境相對穩(wěn)定、降解速度慢的特點[1],隨著擬除蟲菊酯農藥廣泛、大量的應用和使用時間的延長,造成菊酯類農藥在農產品中蓄積或殘留[2-3]。作為一種廣譜殺蟲劑,菊酯類農藥可應用于多種果樹、糧棉油、蔬菜和林木等多種蟲害的防治[4-5],與人們的生活息息相關。已有研究表明,擬除蟲菊酯類農藥對某些有益昆蟲(家蠶、蜜蜂和赤眼蜂等)的毒性很高[6],對人體也有較大毒害,如神經毒性、急性毒性、生殖和發(fā)育毒性等[7]。因此,消除和降低擬除蟲菊酯類農藥殘留的污染物,提高食品和環(huán)境安全已成為人類亟待解決的問題。

        微生物降解是消除環(huán)境中擬除蟲菊酯類農藥污染的有效途徑之一。有關高效氯氰菊酯的降解菌主要在假單胞菌屬(Pseudomonassp.)、芽孢桿菌屬(Bacillussp.)和腸桿菌屬(Enterobacter)等微生物種類中被發(fā)現(xiàn)。為豐富高效氯氰菊酯降解菌資源,筆者從土壤中篩選到的菌株RH7,采用分子生物學方法對其進行鑒定,并利用響應面法對其降解條件進行優(yōu)化,以提高其對高效氯氰菊酯的降解率,為進一步利用該菌對高效氯氰菊酯農藥污染的治理奠定基礎。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        高效氯氰菊酯原藥(純度>95%,成都艾克達化學試劑有限公司),色譜純乙腈(東莞市喬科化學有限公司),rTaq酶、dNTPmixture;10×Pcrbuffer(freeMg2+)、MgCl2(25 mmol/L)、引物16F27/16R1492,均購于TaKaRa公司。

        D3024臺式高速微量(冷凍型)離心機(大龍創(chuàng)新試驗儀器北京有限公司),BD-30生物顯微鏡(深圳市博視達光學儀器有限公司),GZ-250-HSH恒溫恒濕培養(yǎng)箱(韶關市廣智科技設備有限公司)。

        1.2 降解率測定

        以接菌一定濃度高效氯氰菊酯培養(yǎng)液為試驗樣,以未接菌同濃度高效氯氰菊酯培養(yǎng)液為空白樣,采用HPLC法測其殘留量。

        降解率=[(a0-a)/a0]×100%

        式中:a0為空白樣中高效氯氰菊酯的殘留濃度,a為試驗樣中高效氯氰菊酯的殘留濃度。

        1.3 降解菌的16SrDNA鑒定

        1.3.1 細菌總DNA的提取

        1) 將篩選得到的菌株活化后接種到LB固體培養(yǎng)基上,28℃恒溫培養(yǎng)24 h后,挑取少量菌體到滅菌的1.5 mL EP管中。

        2) 加入500 μL CTAB緩沖液和50 μL蝸牛酶(100 mg/μL),37℃,225 r/min震蕩2 h。

        3) 加入10%SDS 100 μL,接著在65℃水浴15 min和-80℃冷凍20 min,反復凍融3次之后,加等體積氯仿、酚、異戊醇(25∶24∶1,v/v/v)震蕩1 min,靜置10 min,10 000 r/min離心10 min。

        4) 取上清液450 μL到新的EP中,加入0.6倍體積預冷的異丙醇,常溫靜置1 h后,20℃,10 000 r/min離心20 min。

        5) 棄上清液,加入1 mL 70%乙醇,靜置10 min后,10 000 r/min離心15 min,棄乙醇溶液(重復洗滌2次),在超凈工作臺吹干至無醇味,加入50 μL無菌雙蒸水,65℃水浴1 h。

        6) 瓊脂糖電泳檢測有無DNA。

        1.3.2 16SrDNA測序及系統(tǒng)發(fā)育樹的建立 將總DNA進行PCR擴增,擴增引物1(27F):AGAGTTTGATCCTGGCTCAG;引物2(1492R):GGTTACCTTGTTACGACTT。PCR反應體系(50 μL體系):模板DNA 2 μL,10×PCR緩沖液5 μL,MgCl2(25 μmol/L)4 μL,引物(10 μmol/L)各0.5 μL,dNTP(2.5 μmol/L)4 μL,Taq DNA聚合酶0.5 μL(5 U/μL),加ddH2O至50 μL。

        PCR反應條件為94℃預變性5 min;94℃變性1 min,55℃復性1 min,72℃延伸1.5 min,35個循環(huán);最后72℃溫育10 min。PCR產物經1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,進行序列測定(經上海杰李生物有限公司進行測序)。

        1.4 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建

        將測得的基因序列去除掉雜峰的部分后拼接,在Ezbiocloud上進行序列比對,篩選相似度較高(>95%)的16SrDNA序列,采用Neighbor-Joining(NJ)法構建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過自舉分析進行置信度檢測,自舉系數(shù)為1 000。使用ClustalX軟件進行序列比對,將DNA序列在NCBI上進行BLAST比對,構建系統(tǒng)發(fā)育樹,并將序列提交到GenBank申請得到注冊號。MEGA5.05繪制發(fā)育樹。

        1.5 菌株降解條件優(yōu)化

        綜合前期單因素試驗結果,選取高效氯氰菊酯濃度(A)、溫度(B)、pH(C)為自變量,用Design Expert V 8.0.6軟件進行響應面試驗設計,選擇3因素3水平的Box-Benhnken設計,試驗因素水平設計見表1。其他培養(yǎng)條件:搖床轉速150 r/min、接種量5%(v/v)、培養(yǎng)時間5 d、普通培養(yǎng)基。

        表1 菌株RH7降解高效氯氰菊酯的響應面試驗 因素與水平

        Table 1 Factors and levels for response surface of strain RH7 to degrading Beta-cypermethrin

        因素Factors編碼Number水平 Levels-101濃度/(mg/L)ConcentrationA50100150溫度/℃TemperatureB253035pHC678

        1.6 回歸方程的建立

        利用Design Expert V 8.0.6對響應面試驗的結果進行分析,得到各個因素與高效氯氰菊酯降解率的回歸方程。

        1.7 高效氯氰菊酯降解率的測定

        1) 樣品前處理。降解試驗定時取樣,加入等體積的三氯甲烷,旋渦混合器上充分振蕩抽提2 min,低溫離心去除菌體,取下層有機相檢測農藥殘留濃度。

        2) 色譜條件。色譜柱Sepax GP-C18柱,流動相為乙腈∶水=75∶25(v/v),流速1 mL/min,檢測波長278 nm,進樣量10 μL。根據標準曲線方程y=19.889x-151.06(R2=0.999 2)計算高效氯氰菊酯的降解率。

        2 結果與分析

        2.1 菌株RH7的16SrDNA系統(tǒng)發(fā)育分析

        2.1.1 16SrDNA擴增結果 由圖1可知,菌株RH7總DNA的擴增產物長度在1 500 bp左右,電泳條帶明亮,陰性對照無條帶,說明擴增效果較好,結果可信。

        2.1.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建 RH7基因序列與BLAS比較,在QenBank中申請得到注冊號為KT715742。從圖2可知,菌株RH7與銅綠假單胞菌〔Pseudomonas aeruginosa JCM 5962(T)〕處于同一聚類分支上,分支置信度為100%,且BLAST比對結果表明,RH7與銅綠假單胞菌〔PseudomonasaeruginosaJCM 5962(T)〕的DNA序列相似度為99%,聚類分析與比對結果一致,因此可以確定該菌株屬于銅綠假單胞菌屬,將其命名為Pseudomonassp.RH7。

        注:A為陰性對照,B為RH7擴增產物。

        Fig.1 The electrophoresis of amplification products of strain RH7

        圖2 菌株RH7的系統(tǒng)發(fā)育樹

        2.2 菌株RH7降解高效氯氰菊酯的條件優(yōu)化

        2.2.1 高效氯氰菊酯降解率的回歸方程建立及顯著性檢驗 通過對菌株RH7降解高效氯氰菊酯響應面試驗結果(表2)分析,得到3個因素與高效氯氰菊酯降解率的回歸方程:

        降解率=78.63+2.74A+8.86B-1.09C+0.36AB-1.99AC+0.22BC-6.62A2-10.88B2-6.06C2

        表2 菌株RH7降解高效氯氰菊酯的響應面設計 試驗及結果

        Table 2 Response design and results of strain RH7 to degrading Beta-cypermethrin

        處理TreatmentABC降解率/%Degradationrate110165.59201170.47300079.134-1-1050.6550-1-153.36600079.42700078.96800077.799-10164.621011072.341110-171.2612-11065.6013-10-162.351401-172.67151-1055.94160-1150.281700077.84

        注:共有17個試驗,其中12個為析因試驗,5個為中心試驗,以估計誤差。

        Note:There are 17 tests including 12 factorial tests and five center tests.

        2.2.2 菌株RH7降解高效氯氰菊酯的條件優(yōu)化及驗證 采用Box-Behnken軟件對確立的回歸方程模型進行參數(shù)優(yōu)化分析,得出菌株RH7降解高效氯氰菊酯的最佳條件為高效氯氰菊酯濃度111.7 mg/L、溫度32.05℃、pH 6.88。在此條件下,實際測得高效氯氰菊酯降解率為79.46%,回歸模型預測降解率為80.83%,與預測值比較接近,說明回歸方程可真實地反應各因素對響應值的影響。

        3 結論

        從土壤樣品中分離到一株高效氯氰菊酯降解菌RH7,采用分子生物學方法對其進行鑒定,最終確定為銅綠假單胞菌屬(Pseudomonassp.)。依據響應面設計建立模型優(yōu)化后高效氯氰菊酯的降解條件為高效氯氰菊酯初始濃度111.7 mg/L、溫度32.05℃、pH為6.88,搖床轉速150 r/min、接種量5%(v/v)、培養(yǎng)時間5 d,其預測值為80.83%。在此條件下,實際測得高效氯氰菊酯降解率為79.46%,與預測值相比其相對誤差范圍在±2%,說明該數(shù)學模型能較好預測各因素與降解率的關系。

        [1] 丁海濤,李順鵬,沈 標,等.擬蟲菊酯類農藥殘留降解菌的篩選及其生理特性研究[J].土壤學報,2003,40(1):123-129.

        [2] Emmanouil C,Euphemia P.Occurrence of pesticides in rain of the Axios River Basin,Greece[J].Environmental Science and Technology,1999,33(14):2363-2368.

        [3] Zhang Z Y,Liu X J,Yu X Y,et al.Pesticide residues in the spring cabbage(BrassicaoleraceaL.var.capitata) grown in open field[J]. Food control,2007,18(6):723-730.

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        [5] 代雪芳,毛 佳,宋 爽,等.高效氯氰菊酯在苜蓿和土壤中的殘留及消解動態(tài)[J].西南農業(yè)學報,2014,27(2):658-663.

        [6] 周 勤,周金錢,吳海平,等.降解殘留有機農藥的微生物資源研究進展[J].農藥學學報,2003(5):42-46.

        [7] Chen S H,Luo J J,Hu M Y,et al.Degradation characteristics and kinetics of beta-cypermethrin byStreptomycessp.HP-S-01[J]. Microbiology China,2011,38(8):1207-1215.

        (責任編輯: 孫小嵐)

        Identification of Beta-cypermethrin Degrading Strain RH7 and Its Optimization of Degradation Conditions

        LIU Qingbin1, LIU Kui1, WANG Jun2, LI Mi1, YANG Xiaolong1

        (1.CollegeofBioengineering,SichuanUniversityofScienceandEngineering,Zigong,Sichuan643000; 2.SichaunGuoguangAgrochemicalLimitedCompany,Jianyang,Sichuan641400,China)

        Strain RH7 was identified by the molecular biological method and the degradation conditions were optimized by the response surface method to discuss species status of Beta-cypermethrin degrading strain RH7 and its degradation rate of Beta-cypermethrin. Results: Strain RH7 is identified asPseudomonassp. The optimum conditions for degrading Beta-cypermethrin include 111.7 mg/L Beta-cypermethrin, 32.05℃ and pH 6.88. The degradation rate of strain RH7 to Beta-cypermethrin reaches 79.46% within 5 d under the optimum conditions, which is close to the predicted value (80.83%) calculated by the established model.

        Pseudomonas; Beta-cypermethrin; degradation condition

        2015-11-10; 2016-05-07修回

        劉清斌(1962-),男,教授,從事食品安全研究。E-mail: 570877656@qq.com

        1001-3601(2016)05-0201-0056-03

        S481+.8

        A

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