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        122份小麥品種(系)抗葉銹病基因Lr 26、Lr 34、Lr 38分子標(biāo)記檢測(cè)

        2016-01-15 06:28:15隋建樞王化陸辛智海陳天青何慶才
        種子 2016年5期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        隋建樞, 王化陸, 辛智海, 王 偉, 陳天青, 何慶才

        (1.貴州省旱糧研究所, 貴陽(yáng)550006; 2.貴州大學(xué)生命科學(xué)院, 貴陽(yáng)550025;3.貴州省植保研究所, 貴陽(yáng)550006)

        小麥葉銹?。↙eaf rust)是由小麥葉銹菌(Puccinia tirticina)引起的真菌病害,在我國(guó)各地均有發(fā)生,以西南及長(zhǎng)江流域的部分地區(qū)如貴州、江西等地發(fā)生較重,嚴(yán)重時(shí)可造成5%~15%甚至更大的產(chǎn)量損失[1]。近年來,華北、西北及東北各地小麥葉銹病也日趨嚴(yán)重。由于育種家的忽視,使得小麥抗葉銹病品種很少,因此部分地區(qū)的葉銹病有加重趨勢(shì)[2]。貴州氣候溫暖濕潤(rùn),常年相對(duì)濕度在70%以上,并且隨著田間栽培環(huán)境的改變、全球性氣候變暖,使得小麥葉銹病呈逐年增加的趨勢(shì),成為影響小麥穩(wěn)產(chǎn)、高產(chǎn)的主要病害之一。選育和利用抗病品種是控制小麥葉銹病最經(jīng)濟(jì)、有效、且對(duì)環(huán)境安全的重要措施。

        截止2010年,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)近100個(gè)抗葉銹病基因,其中72個(gè)被正式命名,67個(gè)被定位,39個(gè)抗病基因被標(biāo)記[3]。而我國(guó)小麥主要抗葉銹病基因有:Lr 1、Lr 3、Lr 3 bg、Lr 10、Lr 13、Lr 14 a、Lr 16、Lr 23、Lr 26、Lr 34和Lr 35,其次還有Lr 9、Lr 11、Lr 12、Lr1 9、Lr2 4和Lr3 8等[4]。通過抗葉 銹 性 表 現(xiàn) 與 分子標(biāo)記型的比較發(fā)現(xiàn),用分子標(biāo)記對(duì)小麥基因組DNA所含抗葉銹基因的鑒定準(zhǔn)確率很高,準(zhǔn)確快速,是輔助選擇與準(zhǔn)確鑒定抗病基因的有效方法。魏新燕等[5]用與抗葉銹基因Lr35連鎖的STS和SCAR 2個(gè)標(biāo)記在F1、F2代植株中標(biāo)記進(jìn)行了分析,檢測(cè)出8個(gè)小麥品種含有Lr 35基因。

        本研究利用Lr 26、Lr 34和Lr 38 3種抗葉銹病的特異性分子標(biāo)記,對(duì)122份小麥品種(系)的進(jìn)行分子標(biāo)記鑒定,以明確這些品種(系)的抗葉銹性,從而填補(bǔ)一些抗葉銹病品種(系)信息的空白,為西南地區(qū)小麥品種合理的推廣種植提供科學(xué)依據(jù),同時(shí)為貴州小麥抗葉銹育種提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        供試的122份小麥材料均為貴州省旱糧研究所多年收集的育種材料(表2),其中包括本單位自育材料以及通過與全國(guó)各育種單位交流學(xué)習(xí)所得材料。

        1.2 引物合成

        根據(jù)已報(bào)道的標(biāo)記序列[6-8](表1),由上海生工生物工程有限公司合成。

        1.3 DNA的提取

        待所有植株長(zhǎng)到5葉左右時(shí),用2%CTAB(十六烷基三乙基溴化銨)提取液提取基因組DNA,具體步驟參照徐如宏等[9]方法,并經(jīng)過改進(jìn)。取約0.2g葉片,放入2.0mL的Eppendorf管中經(jīng)過液氮冷凍后,用研磨棒快速研磨至細(xì)粉末,再加入1 000μL左右65℃預(yù) 熱 提 取 緩 沖 液 (CTAB 2%,Tris-HCl 100 mmol/L,NaCl 1.4mol/L,EDTA 20mmol/L,PVP 1%,β-巰基乙醇1%,pH=8.0),充分混勻,65℃水浴40min,其間輕輕顛倒2~3次;取出冷卻至室溫,加等體積氯仿-異戊醇(24∶1)輕輕顛倒混勻10min,10 000 r/min離心10min;取出上清液加2倍體積的預(yù)冷(-20℃)無水乙醇沉淀DNA,其DNA用70%乙醇洗2~3次,干燥,用50μL去離子水溶解后保存在-20℃冰箱中備用。用NanoDrop 2 000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度,用滅菌ddH2O將終濃度調(diào)至50ng/μL,置于4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 PCR擴(kuò)增檢測(cè)

        反應(yīng)體系10μL,其中含有1×buffer(10mmol/L Tris-HCl,50μmol/L KCl),2.0mmol/L MgCl2,0.2 mmol/L dNTP,上下游引物各0.2μmol/L,50ng模板DNA,0.5UDNA Taq聚合酶。PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性5min;94℃變性50s,54~65℃(退火溫度因引物而異)退火50s,72℃延伸1min,36個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,4℃保存。PCR產(chǎn)物用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳銀染檢測(cè)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 Lr 26STS標(biāo)記的特異性檢測(cè)

        用引物IB-267對(duì)供試小麥材料進(jìn)行PCR檢測(cè),結(jié)果見圖1、表2。擴(kuò)增結(jié)果表明,122個(gè)小麥材料中有33個(gè)品種(系):黔麥17(L 2)、矮豐66(L 14)、連麥2號(hào) (L 1 5)、駐0 2 6 3-5 4 1(L 2 4)、興 育9 8 2(L 3 0)、4TH.STEMRRSN 6095(L 35)、西農(nóng)538(L 45)、新麥06008(L 47)、貴紫1號(hào)(L 53)、安2011-2(L 54)、衡5229(L 57)、RWG10Q0159(L 59)、徐麥9169(L 61)、鄭麥0943(L 64)、云麥49(L 77)、徐農(nóng)0189(L 81)、中梁31(L 83)、中梁30(L 84)、滇麥1號(hào)(L 89)、鄭麥07 H 508(L 96)、洛麥34(L 98)、周麥26(L 99)、周麥27(L 100)、周麥28(L 101)、周麥30(L 102)、周麥32(L 103)、石 H 083-366(L 106)、石 B 11-4098-2(L 107)、濟(jì)麥31(L 108)、石矮2號(hào)(L 113)、中麥69(L 116)、中麥12(L 117)、中麥4044(L 118),可擴(kuò)增出1條210bp的Lr26特異性DNA條帶,與報(bào)道片段大小相同,而其它材料中未檢測(cè)到該條帶,初步判斷,這32個(gè)小麥品種(系)中含有Lr 26基因。

        表1 用于抗葉銹基因鑒定的分子標(biāo)記

        圖1 部分供試小麥材料Lr 26標(biāo)記擴(kuò)增結(jié)果

        表2 供試122個(gè)小麥品種(系)的抗葉銹病分子檢測(cè)結(jié)果

        續(xù)表1

        圖2 部分供試小麥材料Lr 34STS標(biāo)記擴(kuò)增結(jié)果

        圖3 部分供試小麥材料Lr 38SCAR標(biāo)記擴(kuò)增結(jié)果

        2.2 Lr 34STS標(biāo)記的特異性檢測(cè)

        用引物csLV 34對(duì)供試小麥材料進(jìn)行PCR檢測(cè),結(jié)果見圖2、表2。在122份供試材料中能擴(kuò)增出150 bp特異性條帶的只有3個(gè):矮豐66(L 14),興育982(L 30),Q 0159(L 59),因此,可以初步斷定這3個(gè)品種(系)中含有Lr 34基因。

        2.3 Lr 38SCAR標(biāo)記的特異性檢測(cè)

        用引物Y 38SCAR 982對(duì)供試小麥材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果見圖3、表2。如圖3所示,擴(kuò)增得到一條片段大小約為982bp的特異性條帶,與報(bào)道片段大小相符。檢測(cè)到該特異性條帶的品種(系)有:黔麥17(L 2)、貴農(nóng) 21(L 8)、矮豐 66(L 14)、連麥 2 號(hào)(L 15)、駐0263-541(L 24)、興育982(L 30)、4TH.STEMRRSN 6095(L 35)、石06-6136(L 39)、西農(nóng)538(L 45)、新麥06008(L 47)、貴紫1號(hào)(L 53)、安2011-2(L 54)、衡 5229(L 57)、Q 0159(L 59)、徐 麥 9169(L 61)、鄭麥0943(L 64)、蘭天 26(L 69)、云麥 49(L 77)、徐農(nóng)0189(L 81)、中梁 31(L 83)、中梁 30(L 84)、滇麥1號(hào)(L 89)、綿12Z63(L 91)、鄭麥07H 508(L 96)、洛麥34(L 98)、周麥26(L 99)、周麥27(L 100)、周麥28(L 101)、周麥30(L 102)、周麥32(L 103)、石 H 083-366(L 106)、石 B 11-4098-2(L 107)、濟(jì)麥31(L 108)、石矮2號(hào)(L 113)、中作硬桿(L 114)、中 H 4058(L 115)、中麥69(L 116),共37個(gè)品種可能含有Lr 38基因。

        3 討論與結(jié)論

        本研究初步明確了122個(gè)小麥品種(系)中,3種抗葉銹病基因情況,供試的122份小麥材料中,檢測(cè)到含有抗葉銹病基因的品種(系)有37個(gè),其中含有Lr 26的有33個(gè),含有Lr 34的有3個(gè),含有Lr 38的有37個(gè);同時(shí)含有Lr 26和Lr 38的有30個(gè),同時(shí)含有Lr 26、Lr 34和Lr 38的有3個(gè)。

        含有Lr 26的1B/1R品種在20世紀(jì)60年代末至70年代初作為育種材料引進(jìn),是垂直抗病性基因,到20世紀(jì)80年代具有該血緣的品種逐漸成為我國(guó)小麥的主體品種[10],但是隨后新致病小種的出現(xiàn)使得其含有的抗葉銹基因Lr 26失效,導(dǎo)致其后代品種抗性水品下降甚至喪失。該抗性基因單獨(dú)存在時(shí)已經(jīng)基本失效,但與其它基因組合運(yùn)用,仍具有一定的抗病價(jià)值。Lr 34是目前我國(guó)小麥中最重要的抗葉銹病基因之一[4],是一個(gè)典型的慢銹基因,有研究表明,Lr 34在我國(guó)農(nóng)家品種中出現(xiàn)的頻率很高[11],而在本研究的供試小麥材料中檢測(cè)到該基因的頻率很低,說明該抗病基因沒有被很好的運(yùn)用。Lr 34單獨(dú)應(yīng)用時(shí)仍有一定程度發(fā)病[12],但與其它抗病基因同時(shí)運(yùn)用時(shí),可明顯提高其它抗病基因的有效性。Lr 38是一個(gè)抗性很強(qiáng)的抗葉銹基因,具有全生育期抗病性,目前我國(guó)對(duì)其有毒力的致病類型很少,具有較高的利用價(jià)值。

        利用分子標(biāo)記可以快速檢測(cè)出供試材料中所含的抗葉銹病基因類型,在小麥抗病育種方面,可利用分子輔助選擇的優(yōu)勢(shì),克服常規(guī)雜交育種抗病基因的單一化,聚合多個(gè)抗葉銹基因,從而大大提高小麥品種抗病的廣譜性和持久性。

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