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        南極海泥來源抗腫瘤真菌的篩選與鑒定

        2015-12-28 05:42:24
        化學(xué)與生物工程 2015年6期

        (中國藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇南京210009)

        海洋微生物由于資源豐富,在解決用藥需求問題的同時具有不破壞生態(tài)環(huán)境等優(yōu)點,其生物活性物質(zhì)的研究已成為國內(nèi)外研究的熱點[1]。特別是海洋真菌因其代謝途徑復(fù)雜、代謝產(chǎn)物種類繁多而日益受到研究者的重視[2],是開發(fā)抗腫瘤及其它藥物的重要資源。海洋真菌次級代謝產(chǎn)物因新穎的骨架結(jié)構(gòu)而具有生物活性的多樣性[3],其抗氧化性、抗菌、抗酪氨酸酶、細(xì)胞毒活性或抗腫瘤、醌還原酶誘導(dǎo)和抗瘧原蟲活性也被廣泛研究[4]。目前,已從海洋環(huán)境中分離得到多種具有較強細(xì)胞毒活性和抗腫瘤活性的天然產(chǎn)物,僅2006~2012年間,就從海洋真菌中分離得到了690個天然產(chǎn)物[4],其中大多數(shù)化合物屬于聚酮類,其次為生物堿、萜類以及肽類。這些海洋真菌多屬于青霉屬和曲霉屬,還有不常見的頂頭胞屬、裸胞殼菌屬、附球菌屬等。雖然從海洋真菌中分離的抗癌先導(dǎo)化合物進(jìn)入人體臨床試驗的數(shù)量大幅增加[5],但這些先導(dǎo)化合物由于結(jié)構(gòu)復(fù)雜、合成難度較大,難以滿足臨床需求[6]。

        作者在此對61株分離自南極海泥的海洋真菌進(jìn)行抗腫瘤活性篩選,以期發(fā)現(xiàn)具有潛在應(yīng)用前景的抗腫瘤活性菌株,并為活性物質(zhì)的分離奠定基礎(chǔ)。

        1 實驗

        1.1 材料、試劑與儀器

        海泥樣品取自南極深海,保存于中國藥科大學(xué)微生物制藥實驗室。

        MTT(噻唑藍(lán)),Sigma公司;1640培養(yǎng)基、胎牛血清,Giboco公司;二甲基亞砜、乙酸乙酯,分析純,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;真菌基因組DNA 提取試劑盒,上海生工生物工程有限公司;Taq酶,上海生物工程公司;PCR 引物由上海生物工程公司合成。

        SHZ-D(Ⅲ)型循環(huán)水式真空泵、HH-S型水浴鍋,鞏義予華儀器有限責(zé)任公司;BS1245型分析天平,北京賽多利斯儀器系統(tǒng)有限責(zé)任公司;DHG-9140A 型電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱,上海恒科有限公司;CO2培養(yǎng)箱,Excella公司;酶標(biāo)儀,BIO-TEK 公司;旋轉(zhuǎn)真空蒸發(fā)儀,上海亞榮生化儀器廠;SW-CJ-2FD 型超凈工作臺,上海博訊實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;凝膠成像系統(tǒng),Bio-Rad公司。

        1.2 培養(yǎng)基

        分離培養(yǎng)基:馬鈴薯培養(yǎng)基(取200g馬鈴薯,煮沸30min,5~8層紗布過濾,濾液補足至1 000mL)中加入葡萄糖1.6%、瓊脂2%、海鹽1.6%,混合后加入200mg氯霉素。

        發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖3%,可溶性淀粉2%,酵母粉1%,KH2PO42%,海鹽2%,MgSO4·7H2O 0.6%。

        細(xì)胞培養(yǎng)基:1640培養(yǎng)基中加入10%的胎牛血清和1%的雙抗。

        1.3 腫瘤細(xì)胞株

        人肝癌HepG-2細(xì)胞;人胃癌7901細(xì)胞;人結(jié)腸癌116細(xì)胞。

        1.4 方法

        1.4.1 菌株的分離

        采用平板稀釋法,取海泥樣品1g,加無菌水10 mL,激烈振蕩制備混懸液,逐步稀釋制成10-1~10-7梯度溶液,分別涂布于分離平板上,28 ℃倒置培養(yǎng)。觀察菌落的形態(tài),挑取形態(tài)大小差異較大的菌落,純化后4 ℃冰箱保存。

        1.4.2 乙酸乙酯萃取物的制備

        將純化后的菌體由斜面接種至發(fā)酵培養(yǎng)基中,于28 ℃、200r·min-1培養(yǎng)7d,發(fā)酵液去除菌絲體,用等體積乙酸乙酯萃取3次,上層有機相于45℃減壓濃縮至干,用二甲基亞砜溶解配制成100μg·mL-1的粗品并用0.22μm 微孔濾膜過濾供活性測試。

        1.4.3 抗腫瘤活性菌株的篩選

        采用MTT 法[7]測試乙酸乙酯萃取物的體外抗腫瘤活性。取對數(shù)生長期的細(xì)胞,用細(xì)胞消化液消化并收集細(xì)胞,吹打混勻,記數(shù),配制成5×104個·mL-1的細(xì)胞懸液。按每孔180μL 接種于96孔板,并設(shè)置陰性對照和空白對照。于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h后加入20μL稀釋的乙酸乙酯萃取物,每個濃度設(shè)置5 個復(fù)孔,繼續(xù)培養(yǎng)20h。每孔加入20μL MTT,反應(yīng)4h后取出,吸去上清液,加入150μL 二甲基亞砜溶液,用酶標(biāo)儀測定590nm 處吸光度,按下式計算抑制率。

        1.4.4 活性菌株的鑒定

        取適量發(fā)酵液,離心,去上清液,將菌絲體在液氮中充分研磨后轉(zhuǎn)入2 mL EP 管中,用真菌基因組DNA 提取試劑盒提取DNA 后,采用真菌通用引物ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)擴增提取的rDNA ITS基因。PCR 反應(yīng)體系為50μL:模板DNA 5μL、引物ITS1和引物ITS4各1μL、dNTP mixture(2.5mmol·L-1)4μL、10×PCR buffer 5μL、Taq酶5μL;ddH2O 33.5μL。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性3min;95℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸40s,33個循環(huán);72 ℃延伸3min。

        PCR 擴增產(chǎn)物的檢測:取5μL 擴增產(chǎn)物加1μL 6×上樣緩沖溶液,于含溴化乙啶的1% 瓊脂糖凝膠上100V 電泳30min,在紫外燈下觀察純化結(jié)果。對純化后產(chǎn)物測序,并與GenBank中已知序列進(jìn)行比對,以鑒定抗腫瘤活性菌株的歸屬。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 抗腫瘤活性菌株的初篩

        采用MTT 法對分離得到的61株海洋真菌進(jìn)行活性初篩。分別測定100 μg·mL-1海洋真菌對HepG-2細(xì)胞、7901細(xì)胞及116細(xì)胞的抑制率,結(jié)果見表1。

        由表1可知:有27株菌對HepG-2細(xì)胞抑制率大于60%,占總供試菌株的44.26%;有22株菌對7901細(xì)胞具有抑制作用,占總供試菌株的36.07%;有22株菌對116 細(xì)胞抑制率大于50%,占總供試菌株的36.07%。

        2.2 抗腫瘤活性菌株的復(fù)篩

        為進(jìn)一步驗證活性菌株的抗腫瘤活性,采用倍比稀釋法將初篩中具有較高抗腫瘤活性的9株菌株濃度(μg·mL-1)分別稀釋為50、25、12.5、6.25,通過MTT 法測定其在不同濃度下對HepG-2細(xì)胞的抑制率,并計算IC50值,結(jié)果見表2。

        由表2可知,菌株S33、S45發(fā)酵液的濃度稀釋到6.25μg·mL-1時,抗腫瘤活性仍然很高。于是,又將其濃度(μg·mL-1)稀釋至10、5、2.5、1.25、0.625,結(jié)果發(fā)現(xiàn)菌株S33和S45仍具有很高的抗腫瘤活性,其IC50值分別為3.53μg·mL-1和1.25μg·mL-1。

        2.3 抗腫瘤活性菌株的鑒定

        對具有較高抗腫瘤活性的菌株S3、S26、S33、S45、S48、S50、S58進(jìn)行測序,并與GenBank中已知序列進(jìn)行比對,結(jié)果見表3。

        由表3 可知,菌株S3 屬黑附球菌屬,菌株S26、S50屬曲霉屬,菌株S33、S45屬青霉屬,菌株S48屬藍(lán)狀菌屬,菌株S58屬交鏈孢真菌屬。

        3 結(jié)論

        從南極海泥樣品中分離得到61株海洋真菌,先采用MTT 法對其發(fā)酵液的乙酸乙酯萃取物進(jìn)行體外抗腫瘤活性篩選,然后對活性較高的菌株進(jìn)行鑒定,并進(jìn)一步測定乙酸乙酯萃取物對HepG-2細(xì)胞的IC50值。結(jié)果表明:對HepG-2細(xì)胞抑制率大于60%的有29株菌,占總供試菌株的47.54%;對7901 細(xì)胞具有抑制作用的有22 株菌,占總供試菌株的36.07%;對116細(xì)胞抑制率大于50%的有22株菌,占總供試菌株的36.07%;菌株S45的抗腫瘤活性最強,對HepG-2細(xì)胞的IC50值為1.25μg·mL-1,經(jīng)鑒定為青霉屬真菌。

        表1 抗腫瘤活性菌株對HepG-2細(xì)胞、7901細(xì)胞及116細(xì)胞的抑制率/%Tab.1 Inhibition rate of antitumor active strains against cell HepG-2,cell 7901and cell 116/%

        表2 抗腫瘤活性菌株對HepG-2細(xì)胞的抑制率及IC50值Tab.2 Inhibition rate and IC50value of antitumor active strains against cell HepG-2

        表3 抗腫瘤活性菌株的鑒定Tab.3 Identification of antitumor active strains

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