陳軼翔/編譯
“進化論”的再思考
陳軼翔/編譯
可塑性:蝴蝶在干燥(圖左)和濕潤的季節(jié)(圖右)分別出現(xiàn)不同的顏色
●關于進化論,什么過程應當被看作是最基本的,或是否需要重新思考進化論。在這一問題上,研究者們看法不一。來自英國圣安德魯斯大學的凱文·萊蘭(Kevin Laland)及同事認為,進化論沒有一個廣泛適用的理論框架,忽視了一些關鍵過程,亟需重新考慮。而美國杜克大學的格雷戈里·A·雷(Gregory A.Wray)等人則認為,進化論能夠適應通過不懈合成產(chǎn)生的證據(jù),無需反思。
在不知道基因存在的情況下,查爾斯·達爾文(Charles Darwin)構(gòu)想出了物競天擇的進化理論,而現(xiàn)在主流進化理論幾乎完全聚焦于改變基因頻率的基因遺傳和過程上。然而,層出不窮的新數(shù)據(jù)使得前者的理論難以站得住腳——一種全新的進化論觀點開始成形,其中生物體生長發(fā)育的過程被認為是進化的原因。
英國圣安德魯斯大學的凱文·萊蘭說,六年前,他們中的一些人首次討論了與上述相關的研究進展。自那時起,萊蘭作為跨學科研究團隊的一位成員致力于創(chuàng)建一個更廣泛的框架,即“延伸進化合成”(EES)理論,并不斷充實其架構(gòu),提出假設和做出預測。本質(zhì)上,該理論主張進化的重要驅(qū)動力不能僅僅歸應于基因,必須將其編織到進化論的整個架構(gòu)中。
萊蘭相信,EES將會對進化如何工作進行新的闡釋。因為生物體是在發(fā)育過程中構(gòu)建形成的,而不是簡單地由基因編碼發(fā)育的。生物不會為了去適應已有的環(huán)境而進化,但會與環(huán)境共同建構(gòu)和共同進化,這一過程也會改變生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)。
而且,支持改變進化論概念的生物學家數(shù)量在迅速增長,包括基因組學、表觀遺傳學、生態(tài)學和社會科學,尤其是發(fā)育生物學。然而,僅僅提到EES這一概念,通常會引發(fā)進化生物學家的不滿,繼而陷入一場激烈的爭論、相互指責,乃至失實的陳述。或許進化生物學家擔心,其他學科涌入進化生物學領域會降低對他們的認可度。
在這里,我們希望闡明EES的邏輯關系,以此使這場辯論有所降溫,同時鼓勵大家對改變進化的根本原因公開進行討論。
進化論的核心形成于上世紀三四十年代,它結(jié)合了自然選擇、遺傳學和其他領域的理論,闡釋進化是如何發(fā)生的。這種“現(xiàn)代綜合論”允許進化過程被描述為隨時間推移的種群變化中的基因變異頻率,例如兔子抵抗黏液瘤病毒的基因的擴展。
在之后的數(shù)十年中,進化生物學合并了與現(xiàn)代綜合論相一致的發(fā)展。其中之一是強調(diào)進化中的隨機事件“中性理論”。但標準進化理論(SET)很大程度上保持著與經(jīng)典現(xiàn)代綜合論相同的假設,繼續(xù)引導著人們?nèi)绾嗡伎歼M化論。
SET講述的故事很簡單:基因隨機突變出現(xiàn)了新的變異類型;遺傳是通過DNA產(chǎn)生;自然選擇是適應的唯一原因。從這個觀點看,生物發(fā)育的復雜性,即隨著生物體的生長成熟而發(fā)生的變化是次要的,甚至可以說是無關緊要的。
萊蘭說,這種以基因為中心的觀點未能覆蓋整個進化過程。其缺失的環(huán)節(jié)包括生理發(fā)育如何影響變異產(chǎn)生(發(fā)育偏差);環(huán)境怎樣直接決定生物體的特性(可塑性);生物體如何修飾環(huán)境(生態(tài)位構(gòu)建),以及生物體又是如何傳輸比跨世代更多的基因(額外基因遺傳)。
對于SET而言,這些現(xiàn)象僅僅是進化的結(jié)果。但對于EES來說,這些現(xiàn)象則是進化的原因。
對于生物體適應原因和新特性的出現(xiàn),有價值的見解來自于進化發(fā)育生物學領域。例如一些實驗結(jié)果很難與SET吻合,很多變異并非隨機發(fā)生,在1 000多種蜈蚣當中,有一種蜈蚣因體節(jié)發(fā)育機制會產(chǎn)生部分奇數(shù)帶腿體節(jié)。
對此,有研究人員表示,發(fā)育偏差這個概念有助于解釋生物體是如何適應環(huán)境和物種多樣化的。例如,與那些在坦噶尼喀湖的麗魚科魚相比,馬拉維湖的麗魚科魚從物種上更接近生存于該湖的其他麗魚科魚,但兩個湖中的麗魚科魚體型相似:一些有著厚實的嘴唇,一些有著突出的額頭,還有一些有著短小強健的下頜。
圖中所示的兩條麗魚科魚,左側(cè)來自于坦噶尼喀湖,右側(cè)則來自于馬拉維湖,在進化過程中,兩者逐步形成了類似的體型
對于上述現(xiàn)象,SET解釋為趨同進化:類似的環(huán)境條件對隨機遺傳變異選擇產(chǎn)生的等效結(jié)果。一個更簡潔的假說是,是發(fā)育偏差和自然選擇共同作用的結(jié)果。自然并非自由地選擇生物體發(fā)育的各種可能,而是沿著發(fā)育過程所設置的特定路線進行。
這種現(xiàn)象被稱為可塑性。例如,隨著土壤水分和化學過程的變化,葉子的形狀也可能隨之改變。SET認為這種可塑性是調(diào)整,甚至干擾。EES則認為這是生物體在適應性進化過程中似乎可能邁出的第一步。這里的關鍵是,可塑性使得生物體不僅能夠應對新的環(huán)境條件,而且可以生成適應新條件的特性。當環(huán)境條件發(fā)生變化時,如果自然選擇保留那些能夠有效做出回應的基因變異,那么在某一特性首次出現(xiàn)之后,基因變異的累積使得該特性穩(wěn)定下來時,也就有了生物體的適應,有時會在幾代之后出現(xiàn)。
本質(zhì)上,SET將環(huán)境作為一個引發(fā)或改變自然選擇的背景條件,而不是進化過程的一部分。例如白蟻如何適應自己建造的洞穴,生物體又是如何適應火山爆發(fā)的,兩者并無區(qū)分。而萊蘭團隊則認為,火山爆發(fā)是特殊事件,不受生物體行為支配。相比之下,白蟻是以一種可重復、定向的方式在構(gòu)建并規(guī)范自己的家園,是過去的自然選擇形成的,并促使未來的選擇。類似地,哺乳動物、鳥類和昆蟲建造和改善自己的巢窩,是對筑巢的不斷進化所做的適應性反應。
上述見解來自于不同的領域,但整合在一起卻有驚人的一致性。它們表明,遺傳變異并非隨機的;遺傳的不只是基因,有多種途徑可以達到生物體和環(huán)境之間的和諧。重要的是,它們展現(xiàn)了生物體發(fā)育直接導致了適應和物種形成及其方式,以及進化改變的速度和模式。
SET一直以來的對于上述現(xiàn)象的界定方式,嚴重降低了其重要性。例如,發(fā)育偏差通常喜歡將一些“限制條件”強加于選擇能獲得什么上。相比之下,EES將發(fā)育過程視為一個創(chuàng)造性因素,可以解釋生物為何擁有某些特性的原因。
生理學、生態(tài)學和人類學領域的研究者都在證明SET框架所設定的限制性假設所存在的問題,他們沒有意識到其實還有很多人也在做著同樣的工作。萊蘭認為,科學中的多元化視角有利于替代性假說的發(fā)展,EES已形成一個可靠的理論框架,鼓勵大家探索有意義的工作,從而使進化生物學發(fā)生概念性的改變。
1881年10月,達爾文在辭世前6個月出版了最后一本書《腐植土的產(chǎn)生與蚯蚓的作用》。他之所以研究這些低等動物是因為它們證實了一種有趣的反饋過程:當改變自己的行為時,蚯蚓能適應一種環(huán)境。
達爾文通過與園藝大師對話和簡單實驗了解了蚯蚓的相關知識。通過多年觀察與實驗累積的數(shù)據(jù),并結(jié)合了農(nóng)業(yè)、地質(zhì)、胚胎學和行為學的不同理論,他提煉出關于進化過程的深刻見解。自此,進化論思想從那時到現(xiàn)在都遵循著達爾文對證據(jù)以及合成其他領域信息的重視。
美國杜克大學的格雷戈里·A·雷等表示,進化論思想歷史上一次極具意義的轉(zhuǎn)變發(fā)生在上世紀20年代,當時少數(shù)統(tǒng)計學家和遺傳學家為這一轉(zhuǎn)變奠定了基礎。1936年至1947年,他們的研究成果形成了現(xiàn)代綜合論,將達爾文的自然選擇與遺傳學、較小范圍的古生物學和分類學結(jié)合起來。最重要的是,它為量化精確理解適應和物種形成奠定了理論基礎。
此后幾十年間,進化生物學家不斷改進、修正和擴充現(xiàn)代綜合論的框架。例如,當分子生物學家將DNA確定為遺傳和特性改變的物質(zhì)基礎后,他們認為這一成果使進化論得到了實質(zhì)的擴展延伸?!白运健盌NA的發(fā)現(xiàn)使我們更多地在基因而非特性層面去研究自然選擇,代表了進化理論的另一擴展方面。
然而,卻有一些進化生物學家認為關于遺傳的概念方面的進化論已經(jīng)僵化了。更具體地說,他們主張四個現(xiàn)象是重要的進化過程:表型可塑性,生態(tài)位構(gòu)建,包容繼承和發(fā)育偏差。對此,哈佛大學的霍皮·E·胡克斯特拉(Hopi E.Hoekstra)在認同的同時,表示會用自己的方法研究它們。“我們不認為這些過程應該得到如此特別的關注,并被賦予一個諸如EES的名字?!?/p>
事實上,萊蘭及其同事強調(diào)的進化現(xiàn)象已經(jīng)與進化生物學融為了一體。所有這些概念都可以追溯到達爾文本人,例如他分析了蚯蚓在適應土壤的同時所發(fā)生的反饋現(xiàn)象?!艾F(xiàn)在,我們將其稱為生態(tài)位構(gòu)建,但新名字無法改變進化生物學家一個多世紀以來對生物體和環(huán)境的研究事實?!卑紫?、海貍和園丁鳥的極好適應性長期以來是進化研究的主要部分。
另一個過程,即表型可塑性吸引了進化生物學家廣泛的關注。有關環(huán)境影響特征變化有無數(shù)證明的案例,例如當食物來源發(fā)生變化時,麗魚科魚類口部形狀也會發(fā)生變化;擬葉蟲出生在干燥的季節(jié)是棕色的,若在濕潤的季節(jié)則是綠色的。過去十年間的進步,揭示出響應不同環(huán)境條件的基因表達有著令人驚訝的可塑性,為人們理解其物質(zhì)基礎敞開了大門。例如,M·J·韋斯特·埃伯哈德(M·J·West-Eberhard)在其著作中,討論了很多可塑性的問題,包括適應中可塑性是如何先于基因變化的。
雷表示,萊蘭及其同事強調(diào)的現(xiàn)象在進化生物學中沒有被忽視過。然而,和所有的理論一樣,他們需要在嚴謹理論、實證結(jié)果和批判性討論中證明自己的價值。他同時指出,萊蘭等感興趣的現(xiàn)象僅僅是有利于進化生物學發(fā)展的諸多現(xiàn)象中的四個。
事實上,大多數(shù)進化生物學家都有自己的一份清單,上面羅列著希望得到更多關注的話題。有人認為是異位顯性,即遺傳變異體之間的復雜交互,有人則主張研究“隱藏基因變異”(該基因突變只影響特定基因或環(huán)境條件特性),還有人認為應該研究物種的滅絕,或?qū)夂蜃兓倪m應,或行為的進化。這樣的例子不勝枚舉。
而萊蘭及其同事認為,SET是靜態(tài)和統(tǒng)一的。在他們看來,現(xiàn)在的進化生物學家不愿意考慮挑戰(zhàn)性觀點。雷說,當前的進化理論絕非停留在過去,而是充滿了活力。如今,進化生物學家從基因組學、醫(yī)學、生態(tài)學、人工智能和機器人技術領域汲取靈感。相信,達爾文如果在世的話,他也會贊同的。
最后,雷等認為,若淡化“基因中心論”觀點,也就意味著不再重視進化論最具預測性、廣泛的可適用性和已經(jīng)過實證驗證的成分。盡管適應是需要基因改變,但非遺傳過程有時也會對生物體進化方式產(chǎn)生影響。例如,萊蘭及同事的表型可塑性的觀點是正確的,即如果生物體對環(huán)境反應出現(xiàn)了遺傳變異,可塑性使得進化更容易發(fā)生,這方面已有大量的文檔記錄,無需對此特別關注。
目前還不太清楚的是,生物體在適應過程中可塑性能否產(chǎn)生遺傳變異?半個多世紀前,發(fā)育生物學家康拉德·沃丁頓(Conrad Waddington)描述了一個他稱為遺傳同化的過程,即新的基因突變有時可使可塑性狀轉(zhuǎn)化并發(fā)育,甚至在沒有特定的環(huán)境條件下進行。然而,實驗室外很少有此類案例被記錄下來。這種情況究竟是缺乏關注,還是本質(zhì)上很少見,對此還需進一步的研究。
至于萊蘭及同事強調(diào)的自然選擇、遺傳漂移、基因突變、基因重組四種現(xiàn)象是產(chǎn)生改變進化基本過程的附屬物,盡管都不是關鍵的,但它們可以在某種情況下改變進化過程?;诖耍鼈円捕贾档醚芯?。對于真正有趣的現(xiàn)象,例如表型可塑性、基因外遺傳、生態(tài)位構(gòu)建和發(fā)育偏差(還有很多)想要引起更多關注的話,則就是設法收集證據(jù)并證明其重要性。
達爾文曾聲稱蚯蚓“在世界歷史中發(fā)揮的作用比很多人預想的要大得多”。在做出結(jié)論之前,他花了40多年收集數(shù)據(jù)。即使這樣,他在出版著作時,唯一擔心的就是證據(jù)不足,唯恐誤導世人。
[資料來源:Nature][責任編輯:則鳴]