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        應(yīng)用熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感病毒

        2015-12-01 10:21:19葉惠儀丁妙霞黃江志黃炳熾黃育浩張險(xiǎn)朋
        畜牧獸醫(yī)科技信息 2015年8期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)方法

        葉惠儀,丁妙霞,黃江志,黃炳熾,黃育浩,張險(xiǎn)朋

        (1.廣東省東莞市橫瀝鎮(zhèn)農(nóng)業(yè)技術(shù)服務(wù)中心,廣東 東莞 523460;2東莞市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,廣東 東莞 523086)

        應(yīng)用熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感病毒

        葉惠儀1,丁妙霞1,黃江志1,黃炳熾2,黃育浩2,張險(xiǎn)朋2

        (1.廣東省東莞市橫瀝鎮(zhèn)農(nóng)業(yè)技術(shù)服務(wù)中心,廣東 東莞 523460;2東莞市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,廣東 東莞 523086)

        為了驗(yàn)證熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感病毒的可行性,應(yīng)用建立的熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感抗原、H9亞型禽流感抗原、H5亞型禽流感抗原、新城疫抗原評(píng)估檢測(cè)方法的特異性,檢測(cè)不同稀釋度的H7N9亞型禽流感抗原,并用建立的方法檢測(cè)采自三鳥(niǎo)批發(fā)市場(chǎng)100份泄殖腔、喉拭子。結(jié)果是建立的熒光RT-PCR方法,H7體系能檢測(cè)出1:10-10抗原稀釋度,N9體系能檢測(cè)1:10-9抗原稀釋度,對(duì)H9亞型禽流感抗原、H5亞型禽流感抗原、新城疫抗原無(wú)交叉反應(yīng);檢出100份泄殖腔、喉拭子結(jié)果均為陰性。結(jié)果表明,熒光RT-PCR方法H7N9亞型禽流感病毒具有快速、靈敏、特異的特點(diǎn),適合對(duì)禽類(lèi)的大規(guī)模監(jiān)測(cè)。

        H7N9亞型禽流感;熒光RT-PCR;禽類(lèi);檢測(cè)

        禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)屬于正粘病毒科A型流感病毒屬,病毒基因組由8個(gè)單股負(fù)鏈RNA組成,編碼10種蛋白,根據(jù)糖蛋白HA和NA的血清學(xué)反應(yīng)情況進(jìn)一步分為若干亞型。目前,已從水禽中分離到了16種HA與9種NA亞型的A型流感病毒。家禽感染AIV后,表現(xiàn)為高致病力,中度致病力,低致病力和無(wú)致病力。禽流感病毒H5N1、H5N2、H9N2、H7N7、H10N7以及H10N8等均有感染人的報(bào)道。2013年3年31日首先在中國(guó)上海和安徽發(fā)現(xiàn)了3例人感染H7N9禽流感病例,根據(jù)全國(guó)法定傳染病疫情報(bào)告,截至2015年6月30日,全國(guó)累計(jì)人感染H7N9禽流感病例達(dá)到537例,死亡227例。H7N9亞型禽流感雖然在家禽中表現(xiàn)為低致病性,但是嚴(yán)重威脅到公共衛(wèi)生的安全,對(duì)于防控該病,實(shí)施監(jiān)測(cè)和早期的診斷顯得尤為重要。近幾年來(lái),熒光PCR技術(shù)得到了很大的發(fā)展,已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動(dòng)物疫病監(jiān)測(cè)和診斷,為了驗(yàn)證應(yīng)用熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感病毒可行,對(duì)該方法的特異性、敏感性、重復(fù)性并采取了臨床樣品進(jìn)行了試驗(yàn),現(xiàn)報(bào)告如下。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 試劑和儀器H7N9亞型禽流感病毒熒光RT-PCR試劑盒購(gòu)自中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司,批號(hào)為:2015002;H5亞型禽流感抗原(Re-6株)、H9亞型禽流感抗原:購(gòu)自哈爾濱維科生物技術(shù)開(kāi)發(fā)公司,批號(hào)分別為:2013004,2013002;新城疫抗原購(gòu)自哈爾濱動(dòng)物生物制品國(guó)家工程研究中心有限公司,批號(hào):20150116;病毒RNA提取試劑盒(離心柱法)購(gòu)自中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司,批號(hào):20140724。

        1.1.2 儀器與設(shè)備ABI 7500熒光PCR儀,購(gòu)自美國(guó)ABI公司。

        1.1.3 樣品來(lái)源雞泄殖腔、后拭子共100只采自東莞市常平鎮(zhèn)三鳥(niǎo)批發(fā)市場(chǎng)。

        1.2 方法

        1.2.1 核酸提取方法在1.5mL的無(wú)菌離心管內(nèi)加入50μL蛋白酶K;取200μL樣品加入離心管中;加入200μL已含Carrier RNA的裂解液,漩渦振蕩15s充分混勻,瞬時(shí)離心,72℃,10min;加入250μL乙醇,漩渦振蕩15s;將混合液全部吸至離心柱,室溫下12000g離心1min,將離心柱裝至新的收集管;將500μL的抑制物去除液加入離心柱,室溫下12000g離心1min,將離心柱裝至新的收集管;將500μL的去離子液加入離心柱,室溫下12000g離心1min,將離心柱裝至新的收集管;將離心柱收集管室溫下14000g離心3min除去參與乙醇;將離心柱取出,放置于新的1.5mL,打開(kāi)離心柱蓋子,72℃放置2min;在離心柱膜的正上方加入72℃預(yù)熱的洗脫液50μL,靜止1min,14000g離心1min,核酸-20℃保存。

        1.2.2 熒光RT-PCR方法分別配置H7和N9反應(yīng)體系,每管加入反應(yīng)液A 17μL,反應(yīng)液B 3μL。探針檢測(cè)模式設(shè)置為:ReporterDye1:FAM,QuencherDye:NONE,Passive Reference:NONE。反應(yīng)條件設(shè)置為:50℃15min,1個(gè)循環(huán);95℃15min,1個(gè)循環(huán);94℃15s,58℃45s(收集熒光),45個(gè)循環(huán)。陰性質(zhì)控?zé)o擴(kuò)增曲線Undet,陽(yáng)性質(zhì)控有擴(kuò)增曲線,Ct值小于等于32結(jié)果成立。結(jié)果判定:如果H7及N9反應(yīng)體系FAM檢測(cè)通道均無(wú)擴(kuò)增曲線或Ct值大于42判為H7N9亞型禽流感病毒陰性;如果H7及N9反應(yīng)體系FAM檢測(cè)通道均有擴(kuò)增曲線,且Ct值小于等于42判為H7N9亞型禽流感病毒陽(yáng)性;如果僅H7或N9反應(yīng)體系僅其中的擴(kuò)增曲線滿足判為陽(yáng)性,則只能判定H7亞型或N9亞型禽流感病毒陽(yáng)性。

        2 結(jié)果

        2.1 H7 N9 亞型禽流感抗原檢測(cè)結(jié)果以10-2~10-11各稀釋度H7N9禽流感抗原為模板,用離心柱法提取方法提取核酸,然后用同一試劑盒方法同時(shí)上機(jī)檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果為H7能檢測(cè)出1:10-10抗原稀釋度,N9能檢測(cè)1:10-9抗原稀釋度,詳細(xì)結(jié)果見(jiàn)表1。

        表1 不同稀釋度H7N9亞型禽流感熒光RT-PCR檢測(cè)結(jié)果

        2.2 特異性試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)果分別用H7N9亞型禽流感抗原、H9亞型禽流感抗原、H5亞型禽流感抗原、新城疫抗原強(qiáng)1:1000稀釋?zhuān)秒x心柱法提取方法提取核酸,用同一試劑盒方法同時(shí)上機(jī)檢測(cè),結(jié)果為陽(yáng)性質(zhì)控、臨界陽(yáng)性質(zhì)控和陰性質(zhì)控成立,H7N9亞型禽流感抗原H7反應(yīng)體系CT值為19.01,N9反應(yīng)體系CT值為20.22,H9亞型禽流感抗原、H5亞型禽流感抗原、新城疫抗原的H7和N9體系檢測(cè)結(jié)果均為陰性。

        2.3 重復(fù)性試驗(yàn)用離心柱法3次平行提取病毒RNA為模板,同時(shí)用同種試劑進(jìn)行檢測(cè),對(duì)其重復(fù)性進(jìn)行分析,變異系數(shù)(CV)為1.13%,重復(fù)性良好。

        2.4 臨床樣品檢測(cè)結(jié)果檢測(cè)100份雞泄殖腔、喉拭子結(jié)果均為陰性。

        3 討論

        H7N9亞型禽流感病毒是一種新型重組的A型流感病毒,2013年2月在中國(guó)華東地區(qū)首發(fā)并呈高度散發(fā)狀態(tài),雖然對(duì)家禽無(wú)癥狀或低致病性,但對(duì)公共衛(wèi)生構(gòu)成了嚴(yán)重的威脅。由于此病對(duì)家禽無(wú)癥狀或低致病性,所以應(yīng)用快速的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法,對(duì)該病進(jìn)行監(jiān)測(cè)顯得尤為重要。熒光PCR技術(shù)作為一種快速、準(zhǔn)確、特異方法已廣泛用于動(dòng)物疫病監(jiān)測(cè)和發(fā)生動(dòng)物疫情時(shí)的早期診斷該方法操作簡(jiǎn)便,從核酸提取到出結(jié)果僅需3h,熒光PCR不僅實(shí)現(xiàn)了常規(guī)PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規(guī)PCR相比,熒光PCR技術(shù)由于多使用了一條可與模板互補(bǔ)配對(duì)的熒光探針,提高了特異性,并且由自動(dòng)化儀器收集熒光信號(hào),避免了肉眼判斷的主觀性,又可進(jìn)一步提高靈敏度;熒光PCR技術(shù)全封閉反應(yīng),無(wú)須PCR后處理,避免污染,保證了結(jié)果的可靠性和重復(fù)性。根據(jù)試驗(yàn)結(jié)果,應(yīng)用建立的熒光RT-PCR方法檢測(cè)H7N9亞型禽流感抗原,H7體系可以檢測(cè)到1:10-10抗原稀釋度,N9體系能檢測(cè)到1:10-9抗原稀釋度,且對(duì)H9亞型禽流感抗原、H5亞型禽流感抗原、新城疫抗原無(wú)交叉反應(yīng),重復(fù)性試驗(yàn)變異系數(shù)為1.13%,證明該方法敏感度比較高,特異性好,重復(fù)性好,適合大規(guī)模的動(dòng)物疫病監(jiān)測(cè)。

        [1]Y.M.Saif,等.禽病學(xué)[M].第11版.北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社,2005:147-166.

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        10.3969/J.ISSN.1671-6027.2015.08.027

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