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        洛伐他汀?;D移酶在畢赤酵母中的高效表達

        2015-11-29 08:32:02袁國強李鶴王翠韓衛(wèi)強任麗梅
        生物技術通訊 2015年6期
        關鍵詞:發(fā)酵罐辛伐他汀酵母菌

        袁國強,李鶴,王翠,韓衛(wèi)強,任麗梅

        石藥集團中諾藥業(yè)(石家莊)有限公司 酶工程研究所,河北 石家莊 050041

        辛伐他汀是目前國內(nèi)外最暢銷的降脂藥之一,可用于控制血液中膽固醇含量及預防心血管疾病,其藥理作用是作為競爭性抑制劑,抑制膽固醇合成的限速酶——3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶的活性,從而降低膽固醇的生物合成[1]。在傳統(tǒng)生產(chǎn)工藝中,主要利用化學方法以洛伐他汀為原料合成得到辛伐他汀[2-4],但近年來逐步轉向能耗低、毒性低的酶法生產(chǎn)。專利WO2005/040107[5]報告了使用酯酶作為酯化劑合成辛伐他汀,但是由于區(qū)域選擇性酯化的要求使得必須進行其他醇基的保護,導致總產(chǎn)量的降低。因此,找到能夠選擇性?;强闪炙岬奶匦钢苿?,對于有效合成辛伐他汀將起到至關重要的作用。

        土曲霉的洛伐他汀生物合成基因簇編碼的一個相對分子質(zhì)量約46 000 的蛋白即洛伐他汀?;D移酶(lovastatinacy transferase,LovD),可將酰基硫酯的?;鶊F區(qū)域選擇性酰基化莫那可林酸C8羥基,為生物合成辛伐他汀提供有效的酶制劑[6]。后來將LovD基因構建到大腸桿菌中,其工程菌應用到從莫那可林酸到辛伐他汀的合成過程中[7]。后續(xù)高雪研究了以大腸桿菌為宿主的LovD 的86、12、190、275、26、161 等位點的定點突變,其突變體有效改進了LovD的活性、溫度穩(wěn)定性及可溶性[8]。

        本實驗室從LovD的原始序列出發(fā),根據(jù)三維構像推測影響酶活的關鍵性位點,進行定點突變,獲得比原始序列酶活高出數(shù)倍的突變大腸桿菌菌株,但大腸桿菌工程菌容易受環(huán)境影響。目前LovD 的研究主要在大腸桿菌里進行表達發(fā)酵,國內(nèi)外尚無將此基因在畢赤酵母中表達的研究報道。巴斯德畢赤酵母表達系統(tǒng)作為一種真核表達系統(tǒng),具有培養(yǎng)條件簡單、易于操作、適應性強、便于高密度發(fā)酵培養(yǎng)和工業(yè)化生產(chǎn)等優(yōu)點[9]。已有多種蛋白在巴斯德畢赤酵母系統(tǒng)中得以高效表達[10-11]。我們從經(jīng)過多次突變優(yōu)化的LovD基因出發(fā),將其分別構建到胞外表達載體pPIC9K 和胞內(nèi)表達載體pAO815 中,篩選出合適的表達載體,實現(xiàn)了基因在宿主菌中的功能性表達,獲得了高效表達的基因工程菌,并初步進行了5L自動發(fā)酵罐放大試驗,以期為LovD的大規(guī)模生產(chǎn)奠定技術基礎。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        巴斯德畢赤酵母GS115,質(zhì)粒pPIC9K、pAO815購自Invitrogen 公司;含有突變的LovD基因的質(zhì)粒pET-21d-LovD為本實驗室構建并保存[12]。

        酵母提取物和蛋白胨購自OXOID公司;其他化學試劑均購自上海國藥集團化學試劑有限公司;rTaqDNA 酶、Probest高保真聚合酶、dNTP 混合物、T4DNA 連接酶均購自TaKaRa 公司;限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、NotⅠ、SalⅠ均購自NEB 公司;溶壁酶(lyticase)購自Sigma 公司;質(zhì)粒小提試劑盒和瓊脂糖回收試劑盒購自北京天根有限公司;引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成;LB、YPD、BMGY、MD 等培養(yǎng)基配方參考《分子克隆實驗指南》(第3版)[13]。

        ZS01-0057 電泳儀、Gene PulserⅡ電穿孔儀(Bio-RAD公司);瓊脂糖電泳儀(北京六一儀器廠);5L 攪拌式發(fā)酵罐(上海保興生物設備工程有限公司);LT低溫連接儀(珠海黑馬醫(yī)學儀器有限公司)。

        1.2 LovD基因的畢赤酵母重組質(zhì)粒構建

        根據(jù)突變的LovD基因序列及畢赤酵母載體的多克隆位點分別設計2 組引物,即引物L1(5'-CCT GAATTCATGGGTTCTAACATTGACGCAG-3',下 劃線堿基為EcoRⅠ識別位點)、L2(5'-CCTGCGGCCG CTTAGCCCTGTTGGTATTGTGCA-3',下劃線堿基為NotⅠ識別位點)、L3(5'-CCTGAATTCATGGGTTCT AACATTGACGCAG-3',下劃線堿基為EcoRⅠ識別位點)、L4(5'-CCTGAATTCTTAGCCCTGTTGGTAT TGTGCA-3',下劃線堿基為EcoRⅠ識別位點),以pET-21d-LovD(本實驗構建保存)為模板,擴增LovD基因,用回收試劑盒回收該PCR產(chǎn)物片段,將回收的PCR 產(chǎn)物與表達質(zhì)粒pPIC9K 和pAO815 分別用NotⅠ/EcoRⅠ雙酶切和EcoRⅠ單酶切,用T4DNA 連接酶將表達載體與酶切產(chǎn)物連接,轉化感受態(tài)大腸桿菌TOP10,然后在含氨芐西林(50 μg/mL)的LB平板培養(yǎng)基上篩選陽性克隆,利用相應引物進行菌落PCR 及酶切重組質(zhì)粒驗證,將正確的菌株送上海英駿生物技術公司測序,測序結果正確,即得到重組表達載體pPIC9K-LovD和pAO815-LovD。

        1.3 LovD的畢赤酵母轉化及鑒定

        將畢赤酵母GS115單菌落挑入YPD培養(yǎng)基中活化后,按0.5%的接種量接入50 mL YPD 培養(yǎng)基中培養(yǎng)至對數(shù)期,離心獲得的菌體用20 mL 無菌水洗2 次,再用20 mL 無菌1 mol/L 山梨醇洗1 次,加入1 mL山梨醇重懸菌體獲得GS115感受態(tài)細胞。

        將大腸桿菌TOP10(pPIC9K-LovD)和TOP10(pAO815-LovD)置于LB液體培養(yǎng)基中,37℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)過夜,提取重組質(zhì)粒,用SalⅠ內(nèi)切酶線性化重組質(zhì)粒。

        將線性化pPIC9K-LovD和pAO815-LovD的重組質(zhì)粒加入80 μL GS115 感受態(tài)細胞中冰浴5 min,1500 V 電擊5 ms 轉化,加入800 μL 山梨醇將細胞洗至EP 管中,28℃溫育2 h,離心,涂MD 平板培養(yǎng)至長出菌落后,劃線分離出單菌落。

        將單菌落挑入無菌水中,加入適量溶壁酶,37℃溫育1 h消化細胞壁,取部分消化產(chǎn)物為模板、片段引物為鑒定引物進行PCR,檢測陽性克隆。

        1.4 重組畢赤酵母菌的搖瓶誘導表達

        分別挑選8株陽性重組菌接入2 mL YPD 液體培養(yǎng)基活化2 d,以1%的接種量轉接30 mL BMGY(pH8.0)液體培養(yǎng)基中,200 r/min、28℃過夜培養(yǎng),每隔24 h補加1%甲醇進行誘導,共誘導72 h,收集菌液,用于酶活測定。

        1.5 酵母表達的LovD粗酶液的制備

        1.5.1 pPIC9k-LovD胞外表達重組菌粗酶液制備取2 mL 發(fā)酵菌液,12 000 r/min 離心10 min,收集上清用于酶活測定。

        1.5.2 pAO815-LovD胞內(nèi)表達重組菌粗酶液的制備 取2 mL 發(fā)酵菌液,離心收集菌體,用1 mL 0.05 mol/L 磷酸鈉緩沖液(pH8.5)重懸,加入適量酸洗玻璃珠振蕩破碎20 min,離心上清作為粗酶液。

        1.6 LovD酶活測定

        反應體系參考文獻[5,8]并改進??偡磻w積為5 mL,內(nèi)含4 mg/mL 莫那可林酸、0.008% DMB-SMMP 及2 mL 菌液所得上清,以pH8.5 的400 mmol/L 三乙醇胺緩沖溶液補足。在25℃、磁力攪拌條件下反應30 min,然后取100 μL,加入900 μL磷酸二氫鉀-乙腈溶液,進行高效液相色譜(HPLC)檢測。

        色譜柱為菲羅門公司的C18 柱(4.6 mm×33 mm,3 μm),流動相為0.1%醋酸水溶液∶乙腈(40∶60),等度洗脫,流速1.0 mL/min,檢測波長238 nm,柱溫25℃,進樣量10 μL。以辛伐他汀銨鹽(97.6%)為標準品,以單點校正方法計算反應后辛伐他汀的含量。酶活定義:在25℃、pH8.5 條件下,每分鐘催化生成1 μmol辛伐他汀所需酶量為1個單位(U)。

        1.7 重組畢赤酵母菌的發(fā)酵罐放大實驗及酶功效實驗

        以篩選到的高酶活胞外表達重組子為出發(fā)菌株,接種到150 mL YPD液體培養(yǎng)基中,28℃過夜培養(yǎng),制成種子液,以5%的接種量接入3 L BMGY 液體培養(yǎng)基(5L發(fā)酵罐)中,發(fā)酵過程中流加28%氨水控制pH值,以甘油為碳源。菌體生長階段溫度設定為28℃,pH 設定為5.0,待培養(yǎng)18 h 后甘油耗盡(溶氧陡然上升)后繼續(xù)補加約50%的甘油。誘導產(chǎn)酶階段溫度設定為25℃,pH設定為7.0,當溶氧再一次上升時,流加甲醇至發(fā)酵液中進行誘導,在發(fā)酵過程中適時調(diào)節(jié)甲醇流速使溶氧保持在20%以上,發(fā)酵過程中每隔12 h取樣測定?;D移酶活性。

        收集發(fā)酵罐菌體,12 000 r/min離心10 min,收集上清,用10k 膜超濾濃縮,將濃縮后的上清凍干,制成凍干粉,用于辛伐他汀酸合成實驗。

        將莫那可林酸溶于pH8.5的400 mmol/L三乙醇胺緩沖溶液中,終濃度為60 mg/mL,待其完全溶解后加入凍干粉,使酶濃度達到7 mg/mL,攪拌10 min后加入一定量的活性炭,攪拌5 min,加入側鏈DMB-S-MMP,其終濃度為0.044%,反應總體積為100 mL 左右,HPLC 檢測辛伐他汀的生成。反應結束,計算莫那可林酸轉化率:(初始投入反應時莫那可林酸的含量-莫那可林酸的剩余含量)/初始投入反應時莫那可林酸的含量。

        2 結果

        2.1 LovD基因的PCR擴增

        根據(jù)LovD基因序列及畢赤酵母載體的多克隆位點分別設計了2 組引物進行PCR 擴增,PCR 產(chǎn)物經(jīng)8 g/L 瓊脂糖凝膠電泳,結果如圖1,擴增到1200 bp左右的條帶,其大小與預測結果一致。

        2.2 重組表達質(zhì)粒pPIC9K-LovD 和pAO815-LovD的鑒定

        將重組質(zhì)粒pPIC9K-LovD用限制性內(nèi)切酶NotⅠ/EcoRⅠ雙酶切,將pAO815-LovD用EcoRⅠ單酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,前者可見含1200 bp 左右的基因條帶和約9900 bp 的載體條帶(圖2A),后者可見含1200 bp 左右的基因條帶和約7700 bp 的載體條帶(圖2B),說明目的基因已成功插入載體。測序結果證明插入位點正確且無突變。

        2.3 重組畢赤酵母菌的搖瓶表達及活性測定

        分別挑選8 株陽性重組酵母菌,在BMGY 培養(yǎng)基中進行搖瓶發(fā)酵,誘導72 h后測定其合成的辛伐他汀的活性。結果顯示,胞外表達菌和胞內(nèi)表達菌各重組子之間的酶活力無明顯差異,將各重組子的酶活取平均值如圖3 所示,胞外重組酵母菌的酶活是胞內(nèi)重組酵母菌的近3 倍,其合成的辛伐他汀的酶活可達52 U/L,說明畢赤酵母的胞外表達系統(tǒng)更適合LovD。

        圖1 LovD的PCR結果

        圖2 pPIC9K-LovD(A)和pAO815-LovD(B)的酶切鑒定

        圖3 胞外重組酵母菌GS115/pPIC9K-LovD和胞內(nèi)重組酵母菌GS115/pAO815-LovD的酶活

        2.4 胞外表達重組酵母菌株發(fā)酵罐放大實驗

        以篩選到的高酶活胞外表達重組子為出發(fā)菌株,接種到150 mL YPD液體培養(yǎng)基中,28℃過夜培養(yǎng),制成種子液,然后以5%的接種量接入3 L 的BMGY(pH8.0)液體培養(yǎng)基(5L發(fā)酵罐)中,誘導96 h時,發(fā)酵液中酶活達到了最大值,為609.3 U/L,隨著誘導時間的延長,酶活力趨于穩(wěn)定(圖4),因此確定96 h為搖瓶發(fā)酵最佳誘導時間。

        2.5 LovD的功效實驗

        圖4 5L發(fā)酵罐中生產(chǎn)LovD的酶活力過程變化曲線

        重組酵母菌株菌液經(jīng)收集、濃縮、制成凍干粉,用于辛伐他汀合成,經(jīng)過45 h反應后,結果如圖5所示。反應結束時,莫那可林酸的轉化率可達96%,酵母表達的LovD 可很好地催化莫那可林酸生成辛伐他汀,反應物中的雜質(zhì)較少。

        3 討論

        圖5 HPLC檢測LovD催化莫那可林酸合成辛伐他汀

        國內(nèi)外學者已對LovD 的原核異源表達進行了一些研究[7],其出發(fā)基因序列均為土曲霉來源的?;D移酶氨基酸序列。在此基礎上,進行了突變等研究。2007 年,Xie 等[14]通過構建的大腸桿菌BL21(DE3)/pAW31表達菌株,進行了全細胞催化莫納克林酸生成辛伐他汀的實驗探索,底物濃度為5 g/L時轉化率達99%,產(chǎn)品濃度可達98%。但其僅為小試實驗,并無后期放大化實驗結果。2010 年,華東理工大學的朱麗平在該研究基礎上,從多個方面對發(fā)酵培養(yǎng)基和發(fā)酵條件進行優(yōu)化,提高大腸桿菌BL21菌株中的?;D移酶LovD 的表達,最終酶活僅為250 U/L,辛伐他汀合成轉化率為90%[15]。本研究中LovD基因來源于實驗室進化保存,區(qū)別于上述學者的突變位點。本研究中底物濃度為60 g/L 時,轉化率達到了96%以上,具備工業(yè)化應用指標。研究發(fā)現(xiàn),大腸桿菌內(nèi)存在可降解側鏈DMB-S-MMP 的未知酶,因此產(chǎn)物中含有側鏈的分解產(chǎn)物DMB-SMPA,不利于后續(xù)分離。本研究所構建的畢赤酵母胞外工程菌株,由于其自身蛋白分泌較少,雜蛋白較少,用于催化辛伐他汀合成實驗不會造成對側鏈的降解,因此產(chǎn)物的雜質(zhì)較少,利用后續(xù)純化,且產(chǎn)物收率高,可克服大腸桿菌發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)中存在自身蛋白表達多、后處理較為復雜,特別是在氣候條件、溫度濕度等方面也較為敏感,易被噬菌體感染等問題。在后續(xù)的工業(yè)化生產(chǎn)中,煙臺只楚藥業(yè)已利用本公司開發(fā)的相關酶進行了辛伐他汀工業(yè)化生產(chǎn)驗證,其產(chǎn)品純度達到了99%以上[16]。因此,本研究所構建的畢赤酵母工程菌,為LovD的表達提供了一條新途徑,為生物法合成辛伐他汀工業(yè)化生產(chǎn)奠定了基礎。

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