呂美云等
摘要:從江西省宜春市溫湯鎮(zhèn)溫泉水域中篩選出35株產(chǎn)α-淀粉酶嗜熱菌株,選取一株產(chǎn)α-淀粉酶活力較高的嗜熱菌YC-15為出發(fā)菌株,對(duì)其進(jìn)行16S rRNA基因序列分析。結(jié)果表明,YC-15與枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的16S rRNA序列相似性達(dá)98%,結(jié)合其形態(tài)、生理生化特征,進(jìn)一步證明了YC-15在分類上應(yīng)歸屬枯草芽孢桿菌。并對(duì)YC-15產(chǎn)酶條件進(jìn)行了研究,其最佳碳源為2%可溶性淀粉,最佳氮源為0.5%酵母膏+0.5%蛋白胨,最適產(chǎn)酶初始pH為7.0,最適產(chǎn)酶溫度55 ℃,屬中性嗜熱產(chǎn)α-淀粉酶菌。
關(guān)鍵詞:嗜熱菌;α-淀粉酶; 鑒定; 產(chǎn)酶條件
中圖分類號(hào):Q939.124;TS261.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2015)18-4573-05
DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2015.18.046
α-淀粉酶是將淀粉分子內(nèi)部α-1,4糖苷鍵切開(kāi),生成糊精和還原糖,因?yàn)楫a(chǎn)物的末端殘基碳原子構(gòu)型為α構(gòu)型,故稱α-淀粉酶。α-淀粉酶是商品化生產(chǎn)最早、應(yīng)用最早、應(yīng)用范圍最廣和用量最大的工業(yè)酶類之一,它廣泛應(yīng)用于糧食加工、食品工業(yè)、釀造、發(fā)酵、紡織品工業(yè)和醫(yī)藥行業(yè)[1]。α-淀粉酶約占工業(yè)酶市場(chǎng)的30%[2]。在工業(yè)生產(chǎn)中,不同的生產(chǎn)工藝,對(duì)α-淀粉酶要求不同,在造紙工業(yè)與面包焙烤工業(yè)中,需要中溫下熱穩(wěn)定性好的α-淀粉酶,而釀酒時(shí),需要高溫下熱穩(wěn)定性好的α-淀粉酶。因此,隨著α-淀粉酶的應(yīng)用領(lǐng)域不斷擴(kuò)大, 開(kāi)發(fā)篩選具有各種特性的α-淀粉酶成為目前酶制劑研究領(lǐng)域的一個(gè)重要方向。
張繼千等[3]從威海文登海域篩選到一株產(chǎn)中溫淀粉酶的海洋菌W11,初步鑒定為弧菌;權(quán)淑靜等[4]從釀造大曲中篩選到一株產(chǎn)酸性α-淀粉酶菌株,鑒定為黑曲霉;胡建恩等[5]從海底熱液口獲得了一株耐高溫α-淀粉酶,命名為超嗜熱古菌HJ21,耐高溫α-淀粉酶的最適作用溫度為95 ℃。高溫菌,又稱嗜熱菌,是指能在高溫(60 ℃)環(huán)境中生長(zhǎng)和繁殖的極端環(huán)境微生物,主要包括部分細(xì)菌、古菌和真菌,嗜熱菌的耐熱性及其產(chǎn)生的相關(guān)耐熱酶對(duì)很多工業(yè)有相當(dāng)大的潛在價(jià)值,因而備受關(guān)注。江西宜春溫泉有著良好的地?zé)豳Y源,水溫常年保持在68~72 ℃,可為嗜熱菌提供生長(zhǎng)環(huán)境。目前關(guān)于宜春溫泉菌的研究鮮有報(bào)道,本研究選取一株產(chǎn)α-淀粉酶的嗜熱菌菌株YC-15為出發(fā)菌株,對(duì)其進(jìn)行形態(tài)觀察、生理生化試驗(yàn)和16S rRNA 基因序列分析,并優(yōu)化其產(chǎn)酶條件,旨在為豐富產(chǎn)淀粉酶菌種資源和進(jìn)一步挖掘該菌株的應(yīng)用價(jià)值提供參考。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品采集 從江西省宜春市溫湯鎮(zhèn)溫泉古井采樣點(diǎn)1處(溫度68 ℃,pH 6.5~6.7)和宰殺禽類溫泉水池采樣點(diǎn)2處(溫度65 ℃,pH 6.2~6.5)分別采樣。常溫運(yùn)輸, 實(shí)驗(yàn)室4 ℃保存。
1.1.2 培養(yǎng)基 富集培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨基礎(chǔ)培養(yǎng)基;α-淀粉酶選擇培養(yǎng)基[6]:淀粉10 g,NH4H2PO4 5 g,酵母膏1 g,K2HPO4 0.1 g,MgSO4 0.1 g,檸檬酸三鈉 0.5 g, MnSO4 0.1 g,F(xiàn)eSO4 0.1 g,CaCl2 0.2 g,pH 7.2,固體培養(yǎng)基中添加瓊脂22 g;種子培養(yǎng)基[7]:可溶性淀粉2.0%,酵母膏1.0%,蛋白胨0.5%,NaCl 0.5%,pH 7.0;基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基[7]:可溶性淀粉2.0%,蛋白胨0.5%,酵母膏0.5%,NaCl 0.5%,K2HPO4 0.1%,CaCl2·2H2O 0.05%,MgSO4.7H2O 0.05%, FeSO4·7H2O 0.005%,pH 7.0。
1.1.3 主要試劑 博彩生物Taq DNA polymerase、MgCl2、Buffer for Taq DNA polymerase、Fast DL 2000 ladder瓊脂糖(上海藍(lán)季科技發(fā)展有限公司);PCR純化試劑盒[康寧生命科學(xué)(吳江)有限公司]。
1.1.4 主要儀器 DYY-6C型電泳儀(北京市六一儀器廠),ZF-90型暗箱式紫外透射儀(上海顧村電光儀器廠),GZX-9070 MBE型數(shù)顯鼓風(fēng)干燥箱(上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠),TC-XP-G型梯度PCR儀(杭州博日科技有限公司),722型可見(jiàn)光分光光度計(jì)(上海佑科儀器儀表有限公司)。
1.2 方法
1.2.1 菌種篩選 取2處水樣放入88 ℃恒溫水浴鍋中處理15 min,取1 mL處理過(guò)的樣品接種到已滅菌的50 mL牛肉膏蛋白胨基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,55 ℃搖床培養(yǎng)24 h。將培養(yǎng)液稀釋5個(gè)梯度10-1、10-2、10-3、10-4、10-5,分別取每一濃度0.1 mL 涂布于α-淀粉酶選擇培養(yǎng)基上,置于55 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待菌落形成,將其放置4 ℃冰箱5 h,觀察菌落形狀、大小和菌落周圍透明圈。挑取有透明圈菌株,采用常規(guī)的稀釋涂布法進(jìn)行菌株的分離和純化,滴加路戈氏碘液,觀察各菌株產(chǎn)透明圈情況,選取d0/d1(d0為水解圈直徑,d1為菌落直徑)最大的為本試驗(yàn)出發(fā)菌株。
1.2.2 菌株發(fā)酵 將出發(fā)菌株接種于種子液培養(yǎng)基搖瓶12 h,2%接種量接入發(fā)酵培養(yǎng)基中,55 ℃下?lián)u床180 r/min培養(yǎng)24 h。
1.2.3 粗酶液的制備 菌株發(fā)酵完成后,經(jīng)過(guò)8 000 r/min離心10 min,取上清液即為粗酶液。
1.2.4 α-淀粉酶活力測(cè)定 用姜永明等[8]改良法:取5 mL 0.5%的可溶性淀粉溶液,在40 ℃水浴中預(yù)熱10 min,然后加適當(dāng)稀釋的酶液0.5 mL,反應(yīng)5 min后,用5 mL 0.1 mol/L鹽酸終止反應(yīng)。取0.5 mL反應(yīng)液與5 mL稀碘液顯色,在620 nm處測(cè)光密度。以0.5 mL水代替0.5 mL反應(yīng)液為空白,以不加酶液(加檸檬酸緩沖液pH 6.0)為對(duì)照。計(jì)算公式:酶活力=(R0-R)/R0×50×D,其中R0、R分別表示對(duì)照和反應(yīng)液的光密度,D為酶稀釋倍數(shù)。調(diào)整D使(R0-R)/R0在0.2~0.7。酶活力單位定義:在40 ℃,5 min內(nèi)水解1 mg淀粉的酶量為一個(gè)活力單位。
1.2.5 菌種鑒定方法 常規(guī)鑒定參見(jiàn)文獻(xiàn)[9]、[10];分子鑒定參見(jiàn)文獻(xiàn)[11]中的方法進(jìn)行。
1.2.6 產(chǎn)酶條件優(yōu)化 以單因素試驗(yàn)考察碳源、氮源、初始pH、發(fā)酵溫度等條件,按2%的接種量接種,180 r/min水浴培養(yǎng)后,測(cè)定粗酶液酶活力,確定目標(biāo)菌株最佳發(fā)酵碳源、氮源、初始pH、發(fā)酵最佳溫度。
1.2.7 菌種YC-15總DNA的提取與檢測(cè) 取1.5 mL培養(yǎng)液于EP管中,13 000 r/min離心5 min,棄上清液。向沉淀物中加入1 mL get緩沖液,冰上放置3 min,13 000 r/min離心5 min。棄上清液,加入0.6 mL TE緩沖液制成懸濁液。向懸濁液中加入60 μL 1%SDS劇烈振蕩。放入65 ℃水浴30 min溶液變性。加入等體積Tris飽和酚∶氯仿∶異戊醇(25∶24∶1),振蕩10 min離心15 min保留上清液。加入等體積飽和酚再抽提1次,取上清液。向上清液中加入1/10體積3 mol/L NaAc。加入等體積異丙醇,離心10 min棄上清液。用70%乙醇洗滌,留沉淀,加入80 μL TE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA。
1.2.8 16S rDNA PCR擴(kuò)增、序列測(cè)定及分子系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 以提取YC-15菌株總DNA 為模板, 對(duì)16S rDNA基因序列進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。引物序列:27F:(5-ATTCCGGTTGATCCTGC-3)和1541R:(5-AGGAGGTGATCCAGCCGCA-3)。PCR 采用50 μL 反應(yīng)體系,反應(yīng)條件: 94 ℃預(yù)變性4 min ,94 ℃變性1 min ,退火溫度設(shè)置(58、57.4、56.4、54.9、53.1、51.5、50.5、50.0 ℃)8個(gè)梯度40 s ,72 ℃延伸2 min,循環(huán)30次;72 ℃保持10 min。用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR 擴(kuò)增結(jié)果, 并通過(guò)PCR 產(chǎn)物純化試劑盒進(jìn)行純化。PCR 產(chǎn)物由上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)得的ITS序列在GenBank中進(jìn)行BLAST,應(yīng)用MEGA6.0軟件中鄰接法(Neighbour-joining methods,NJ)構(gòu)建聚類分析樹(shù)狀圖,bootstrap檢驗(yàn)值≥50%,1 000次重復(fù)。
2 結(jié)果與分析
2.1 產(chǎn)α-淀粉酶的嗜熱菌株的篩選
將宜春溫泉采集到的水樣富集,以梯度稀釋涂布于α-淀粉酶選擇培養(yǎng)基平板,置于55 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待菌落形成,將其放置4 ℃冰箱5 h,觀察菌落周圍透明圈,初步確定為產(chǎn)α-淀粉酶嗜熱菌株。再將菌株以稀釋平板法進(jìn)一步分離純化。滴加路戈氏碘液,測(cè)定淀粉水解圈大小,選取d0 /d1最大的YC-15作為本試驗(yàn)出發(fā)菌株(表1)。
2.2 產(chǎn)α-淀粉酶菌株YC-15的鑒定
2.2.1 菌株YC-15形態(tài)觀察 YC-15菌落在平板上產(chǎn)生的透明水解圈(圖1)。菌落圓形較大,邊緣較平滑,略有小齒,表面褶皺干燥,乳白色。光學(xué)顯微鏡下可以觀察到菌株為短桿菌,中生芽孢(圖2)。
2.2.2 菌株YC-15生理生化測(cè)定 對(duì)菌株YC-15進(jìn)行了鑒定,結(jié)合形態(tài)學(xué)和生理生化特征(表2),初步鑒定YC-15菌株為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。
2.3 菌株YC-15總DNA和16S rDNA的電泳
產(chǎn)淀粉酶的嗜熱菌株YC-15總基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳圖譜見(jiàn)圖3,提取的16S rDNA-PCR顯示在2 000 bp附近出現(xiàn)了清晰的條帶,測(cè)序結(jié)果表明,PCR擴(kuò)增得到的16S rDNA區(qū)域的目的片段大小為1 454 bp。16S rDNA電泳如圖4所示。
2.4 菌株YC-15 16S rRNA序列分析
基于菌株16S rRNA序列采用鄰接法構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)以確證YC-15菌株的分類歸屬(圖5),菌株與枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的16S rRNA序列相似性達(dá)98%,可以看出YC-15菌株應(yīng)歸為枯草芽孢桿菌。
2.5 菌株YC-15產(chǎn)酶條件的優(yōu)化
2.5.1 YC-15菌株生長(zhǎng)曲線 由圖6中生長(zhǎng)曲線與相應(yīng)時(shí)間產(chǎn)酶曲線可知,4~14 h為YC-15菌株對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,16 h后菌體生長(zhǎng)進(jìn)入穩(wěn)定期;而α-淀粉酶活力在培養(yǎng)12 h后開(kāi)始迅速增加,32 h時(shí)α-淀粉酶酶活力達(dá)到最高,隨后酶活力開(kāi)始降低。
2.5.2 碳源對(duì)菌株YC-15產(chǎn)酶能力的影響 以蛋白胨為氮源,改變基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中碳源的種類,配制液體發(fā)酵培養(yǎng)基。121 ℃滅菌20 min。以250 mL三角瓶裝液50 mL發(fā)酵培養(yǎng)基,按0.5%的接種量接種,55 ℃,180 r/min搖床培養(yǎng)32 h后測(cè)定粗酶液酶活力(圖7)。由圖7可知,以淀粉為碳源時(shí)酶活力最高。
2.5.3 氮源對(duì)菌株YC-15產(chǎn)酶能力的影響 以淀粉為碳源,改變基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中氮源的種類,配制液體發(fā)酵培養(yǎng)基(圖8)。由圖8可知,以0.5%酵母膏+0.5%蛋白胨為氮源產(chǎn)酶能力最強(qiáng)。
2.5.4 培養(yǎng)基初始pH對(duì)菌株YC-15產(chǎn)酶能力的影響 以淀粉為碳源、0.5%酵母膏+0.5%蛋白胨為氮源,改變發(fā)酵培養(yǎng)基的初始pH,55 ℃溫度下180 r/min搖床培養(yǎng)32 h(圖9)。由圖9可知,培養(yǎng)基初始pH為7時(shí)菌株產(chǎn)酶能力最強(qiáng),而在pH 5~9酶活力相對(duì)穩(wěn)定。
2.5.5 培養(yǎng)溫度對(duì)菌株YC-15產(chǎn)酶能力的影響 將已優(yōu)化碳源、氮源、初始pH的發(fā)酵培養(yǎng)基在9個(gè)溫度下180 r/min搖床培養(yǎng)32 h(圖10)。由圖10可知,經(jīng)過(guò)酶活力測(cè)定得知55 ℃培養(yǎng)時(shí)菌株產(chǎn)酶能力最強(qiáng)。在50~60 ℃酶活力較穩(wěn)定,在90 ℃時(shí)的酶活力可達(dá)最大值的50%。
3 結(jié)論
本研究系宜春市溫湯鎮(zhèn)溫泉水域中篩選得到的一株產(chǎn)α-淀粉酶菌株YC-15,通過(guò)對(duì)其16S rRNA 基因序列分析,結(jié)果顯示,YC-15與枯草芽孢桿菌的16S rRNA 序列相似性達(dá)98%,結(jié)合其形態(tài)、生理生化特征,進(jìn)一步證明了YC-15在分類上應(yīng)歸屬枯草芽孢桿菌。并對(duì)YC-15生長(zhǎng)和產(chǎn)酶條件進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,4~14 h 為YC-15菌株對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,最佳碳源2%可溶性淀粉,最佳氮源0.5%酵母膏+0.5%蛋白胨,最適產(chǎn)酶初始pH為7.0,pH 5~9酶活力相對(duì)穩(wěn)定,最適產(chǎn)酶溫度55 ℃,在90 ℃時(shí)的酶活力可達(dá)最大值的50%,由此可見(jiàn),菌株pH適用范圍廣,具有一定的耐熱性,有望進(jìn)一步誘變,增強(qiáng)菌株對(duì)熱穩(wěn)定性和提高產(chǎn)酶能力,實(shí)現(xiàn)高溫發(fā)酵,以應(yīng)用于淀粉加工、酒精、味精、啤酒、有機(jī)酸和飼料等行業(yè)。
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