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        16S rRNA基因在肺炎支原體鑒定中的應(yīng)用

        2015-09-03 10:41:54程忠雨周亮湯海霞
        關(guān)鍵詞:支原體靈敏度基因組

        程忠雨 周亮 湯海霞

        ·臨床研究·

        16S rRNA基因在肺炎支原體鑒定中的應(yīng)用

        程忠雨 周亮 湯海霞

        目的 我們通過(guò)比較利用16S rRNA基因和血清學(xué)檢驗(yàn)方法在診斷肺炎支原體感染中的效果差異,期待找到一種快速有效的方法來(lái)鑒定支原體肺炎,并建立一套完善的支原體肺炎臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)。方法 將我院呼吸科收治的140例患者分成兩組,16S rRNA基因組70例,用16S rRNA基因進(jìn)行檢驗(yàn);血清學(xué)檢驗(yàn)組70例,用血清學(xué)檢驗(yàn)方法進(jìn)行檢驗(yàn)。通過(guò)比較檢驗(yàn)結(jié)果的假陽(yáng)性率、靈敏度和檢驗(yàn)平均耗時(shí)判定診斷方法在診斷肺炎支原體感染中效果的差異。結(jié)果 血清學(xué)檢驗(yàn)組靈敏度為65%,假陽(yáng)性率為36%,檢驗(yàn)平均耗時(shí)為3 h;16S rRNA基因檢驗(yàn)組靈敏度為85%,假陽(yáng)性率為21%,檢測(cè)平均耗時(shí)為0.5 h。計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn)的處理方式,以P<0.05認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論 16S rRNA基因檢驗(yàn)作為一種新型的診斷技術(shù),在診斷肺炎支原體感染中相比傳統(tǒng)的血清學(xué)檢驗(yàn)方法具有明顯的優(yōu)勢(shì),無(wú)論在靈敏度、檢驗(yàn)結(jié)果的假陽(yáng)性率和檢驗(yàn)耗時(shí)上都優(yōu)勢(shì)明顯,可考慮作為一種常用的支原體肺炎臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)之一。

        肺炎支原體;16S rRNA;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng);血清學(xué)檢驗(yàn)方法;肺炎

        肺炎支原體(M.Pneumonia)作為一種無(wú)細(xì)胞壁的寄生微生物,能夠引起很多哺乳動(dòng)物呼吸系統(tǒng)嚴(yán)重病變,同時(shí)也是引發(fā)人類肺炎的常見(jiàn)病原微生物之一[1],比如上呼吸道感染、間質(zhì)性肺炎等。臨床上由肺炎支原體引發(fā)的疾病病癥通常不明顯,經(jīng)過(guò)2~3周的潛伏期后,才會(huì)引發(fā)相應(yīng)的癥狀,例如口干、發(fā)熱、咳嗽以及不明原因的頭痛和肌肉酸痛等。由肺炎支原體引發(fā)的呼吸系統(tǒng)疾病與普通流行性感冒所表現(xiàn)的癥狀具有相似點(diǎn),因此不易做出相應(yīng)的臨床鑒別診斷。由于較難診斷為肺炎支原體感染,常常錯(cuò)過(guò)最佳的治療時(shí)期,導(dǎo)致并發(fā)癥的產(chǎn)生,最終給患者的身心造成嚴(yán)重的損害。常用的肺炎支原體檢測(cè)方法主要有血清學(xué)法,包括酶聯(lián)免疫吸附法、凝集素試驗(yàn)法和明膠顆粒凝集法等,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,診斷方法逐漸多元化,出現(xiàn)了PCR診斷法、核酸診斷試驗(yàn)法等。

        16S rRNA基因是原核微生物的標(biāo)志性基因,具有高度保守性,常用來(lái)作為標(biāo)志性基因用于原核微生物的鑒別和分類。不同生物的16S rRNA基因具有不同的保守區(qū)和可變區(qū),通過(guò)該區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物即可擴(kuò)增出特異的目的片段,從而判定原核微生物的種屬特性;另外我們也可以利用原核微生物的16S rRNA基因通用引物對(duì)其基因組進(jìn)行擴(kuò)增,將擴(kuò)增出來(lái)的目的片段進(jìn)行測(cè)序,根據(jù)測(cè)序結(jié)果判定該微生物的種屬特性[2]。因此我們期待找到一種快速有效的方法來(lái)鑒定支原體肺炎,并具有快速的檢測(cè)速度和較高的檢測(cè)靈敏度,從而為建立一套完善的支原體肺炎臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 病例選擇 選取2013年至今我院呼吸科收治的140例患者,其中男78例,女62例,平均分成兩組。16S rRNA基因組70例,其中男40例,女30例;血清學(xué)檢驗(yàn)組70例,其中男38例,女32例。16S rRNA基因組和血清學(xué)檢驗(yàn)組均有口干、發(fā)熱、咳嗽以及不明原因的頭痛和肌肉酸痛等癥狀。16S rRNA基因組70例,用16S rRNA基因進(jìn)行檢驗(yàn);血清學(xué)檢驗(yàn)組70例,用血清學(xué)檢查方法進(jìn)行檢驗(yàn)。兩組患者的年齡組成均大于3歲,并且性別和年齡分布均勻。

        1.2 診斷方法

        1.2.1 16S rRNA基因檢驗(yàn)法 患者住院后,我們?cè)诘?天清晨從患者深部呼吸道分泌物取樣檢測(cè)。首先我們將患者頭部后仰,采用鼻咽拭子采樣法進(jìn)行采樣,將樣品稀釋處理后,利用原核生物16S rRNA通用引物對(duì)其基因組進(jìn)行擴(kuò)增,將擴(kuò)增的目的片段測(cè)序后序列在國(guó)家生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì)。與肺炎支原體16S rRNA基因序列一致并伴有上述臨床癥狀的我們認(rèn)為是肺炎支原體感染[3]。

        1.2.2 血清學(xué)檢驗(yàn)方法 機(jī)體感染肺炎支原體后,體內(nèi)會(huì)發(fā)生免疫反應(yīng),血液中不但出現(xiàn)相應(yīng)的抗體還會(huì)產(chǎn)生凝集素,凝集素與相應(yīng)抗原(O型紅細(xì)胞)在一定的條件下反應(yīng)產(chǎn)生IgM型抗體。我們通過(guò)酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(MP-IgM>1∶80)結(jié)合上述臨床癥狀的判定為肺炎支原體感染。

        1.3 統(tǒng)計(jì)方法 計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn)的處理方式,如果P值小于0.05,則認(rèn)為兩種檢驗(yàn)(16S rRNA基因檢驗(yàn)法和血清學(xué)檢驗(yàn)方法)差異明顯,計(jì)數(shù)資料以百分比表示。

        2 研究結(jié)果

        通過(guò)比較檢驗(yàn)結(jié)果的假陽(yáng)性率、靈敏度和檢驗(yàn)平均耗時(shí)判定診斷方法在診斷肺炎支原體感染中效果的差異。結(jié)果顯示,血清學(xué)檢驗(yàn)組靈敏度為65%,假陽(yáng)性率為36%,檢驗(yàn)平均耗時(shí)為3 h;16S rRNA基因檢驗(yàn)組靈敏度為85%,假陽(yáng)性率為21%,檢驗(yàn)平均耗時(shí)為0.5 h(表1)。

        表1 兩種方法檢測(cè)肺炎支原體結(jié)果

        從上表中可以看出16S rRNA基因作為一種新型的診斷技術(shù),在診斷肺炎支原體感染中相比傳統(tǒng)的血清學(xué)檢驗(yàn)方法具有明顯的優(yōu)勢(shì),無(wú)論在靈敏度、檢驗(yàn)結(jié)果的假陽(yáng)性率和檢驗(yàn)耗時(shí)上都優(yōu)勢(shì)明顯,比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,可考慮作為一種臨床上常用的支原體肺炎診斷標(biāo)準(zhǔn)之一[4]。

        3 討論

        由肺炎支原體誘發(fā)的肺炎在臨床患者中占有比較大的比例,但是由于其臨床癥狀不典型,往往被誤認(rèn)為其他原因所引起的肺炎,錯(cuò)過(guò)最佳的診療時(shí)間。近年來(lái)隨著人們對(duì)肺炎支原體流行病學(xué)特征認(rèn)識(shí)的加深,隨著分子生物學(xué)研究技術(shù)的發(fā)展,人們對(duì)肺炎支原體的檢測(cè)逐漸有了新的手段和方法。傳統(tǒng)的檢測(cè)肺炎支原體的方法主要以血清學(xué)手段為主[5],但是該方法靈敏度低、耗時(shí)長(zhǎng),很難滿足快速診斷的臨床需求,因此開(kāi)發(fā)一種高效、快速、準(zhǔn)確有效的肺炎支原體檢測(cè)方法變得十分迫切。本研究通過(guò)對(duì)臨床病例的分組研究,證明了16S rRNA基因作為一種新型的診斷技術(shù)相比傳統(tǒng)的血清學(xué)檢驗(yàn)方法具有明顯的優(yōu)勢(shì),具有一定的開(kāi)發(fā)價(jià)值。

        [1]王責(zé)年,馬進(jìn)強(qiáng),蘇艾云.肺炎支原體感染的實(shí)驗(yàn)室診斷進(jìn)展[J].診斷學(xué)理論與實(shí)踐,2009,8(4):458-460.

        [2]郭紅波,季偉,王美娟.蘇州地區(qū)兒童肺炎支原體感染的流行病學(xué)分析[J].江蘇醫(yī)藥,2010,36(2):160-162.

        [3]陳倩,施圣云,胡正,等.南京地區(qū)急性呼吸道感染兒童支原體、衣原體和常見(jiàn)呼吸道報(bào)道病毒病原學(xué)分析[J].中國(guó)當(dāng)代兒科雜志,2010,12(6):450-454.

        [4]葉湘,張真,王群興,等.女性泌尿生殖道感染支原體屬的分布及耐藥性分析[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2012,22(3):652-653.

        [5]王勇,祝曉瑩,袁紅瑛.泌尿生殖道支原體感染及耐藥性研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2009(6):702-704.

        2014-12-01)

        1005-619X(2015)04-0369-02

        10.13517/j.cnki.ccm.2015.04.012

        264309 山東省榮成市第二人民醫(yī)院呼吸科

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