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        甲基化調(diào)節(jié)miR-200b的表達及其對胃癌MGC-803細胞增殖侵襲能力的影響

        2015-08-24 08:41:50郭蓉寧向紅姜葵張慶瑜
        天津醫(yī)藥 2015年4期
        關鍵詞:細胞系甲基化試劑盒

        郭蓉,寧向紅,姜葵,張慶瑜

        甲基化調(diào)節(jié)miR-200b的表達及其對胃癌MGC-803細胞增殖侵襲能力的影響

        郭蓉,寧向紅,姜葵,張慶瑜△

        目的 體外研究基因miR-200b發(fā)生甲基化的不同程度及其表達量的差異對胃癌細胞MGC-803增殖、侵襲、凋亡及對上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的影響。方法 以正常胃黏膜上皮細胞GES-1、胃癌細胞MGC-803為研究對象,提取細胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄后進行實時熒光定量PCR檢測2種細胞系中miR-200b的表達量;亞硫酸氫鈉修飾PCR(BSP)法檢測miR-200b啟動子區(qū)甲基化水平。用不同濃度5-氮雜胞苷(5′-Aza-CdR)藥物處理MGC-803細胞72 h后,同法檢測miR-200b的表達量及啟動子區(qū)甲基化水平變化。根據(jù)上述實驗結(jié)果選擇合適的藥物作用濃度和時間即(10 μmol/L,72 h)作為處理組。通過Transwell侵襲實驗觀測細胞侵襲能力;流式細胞技術檢測細胞周期及凋亡的分布情況;Western-blot檢測上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關指標E-cadherin、N-cadherin、ZEB1、Slug、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)9等的表達水平。結(jié)果 miR-200b在GES-1中表達量較MGC-803高(P=0.022)。啟動子區(qū)甲基化水平則與之相反(P=0.034)。藥物不同濃度作用后的MGC-803細胞系miR-200b表達量有隨濃度升高而升高的趨勢,作用濃度為10 μmol/L時miR-200b啟動子區(qū)甲基化水平較對照組低(P=0.043)。與對照組相比,處理組細胞晚期凋亡數(shù)增多;G0/G1期細胞數(shù)顯著增多,S期顯著減少;穿過Transwell小室細胞數(shù)顯著減少;Western-blot實驗表明E-cad?herin表達量升高,N-cadherin、ZEB1、Slug、MMP9表達量降低。結(jié)論 miR-200b啟動子區(qū)甲基化程度的不同可以影響其表達量,而miR-200b表達量的異常又與胃癌MGC-803細胞增殖、侵襲能力密切相關。

        胃腫瘤;腺癌;細胞凋亡;細胞增殖;DNA甲基化;微RNA-200b

        表觀遺傳學修飾包括DNA甲基化及組織蛋白乙?;?,它們在腫瘤形成和發(fā)展過程中有很重要的作用,尤其是DNA甲基化[1]。DNA甲基化是在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG 2個核苷酸的胞嘧啶被選擇性地添加甲基形成5-甲基胞嘧啶后對腫瘤進行調(diào)節(jié)的。研究已證實,基因啟動子區(qū)發(fā)生異常甲基化后可對腫瘤的發(fā)生、發(fā)展產(chǎn)生一定的影響,如P21基因啟動子區(qū)高度甲基化后導致表達量降低,同時增加了乳腺癌的發(fā)病率[2];miR-200b和甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑共同作用可以在不同程度上阻止間質(zhì)表型肝細胞癌發(fā)生肺轉(zhuǎn)移[3]。Micro-RNAs是由19~22個核苷酸組成的非編碼RNA,主要結(jié)合在目標mRNA的3′非翻譯區(qū)(3′-UTR),通過轉(zhuǎn)錄后水平對基因表達進行調(diào)節(jié)[4]。Mi-RNAs的表達模式具有高度保守性、時序性和組織特異性,在不同組織、不同發(fā)育階段中表達水平有顯著差異,是調(diào)控其他功能基因表達的重要分子[5]。本實驗旨在研究miR-200b基因啟動子區(qū)異常甲基化的程度與基因表達量的關系,及基因甲基化作用對胃癌MGC-803細胞增殖、侵襲能力的影響。

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料 GES-1細胞購自北京腫瘤細胞庫,MGC-803細胞購自中國科學院上海生科院細胞資源中心。甲基化作用抑制劑5-氮雜胞苷(5′-Aza-CdR)購自美國Sigma公司,TRIZOL試劑購自美國Ambion公司,dNTP mixture、反轉(zhuǎn)錄酶(MMLV)、RNase抑制劑購自大連TaKaRa公司,熒光定量miRNAPCR試劑盒、逆轉(zhuǎn)錄引物及RT-PCR引物購自上海吉瑪公司。NI-細胞基因組DNA提取試劑盒,處理、純化回收DNA的EpiTect Bisulfite kit,No.59104試劑盒購自QIA?GEN公司,pMD?18-T Vector Cloning Kit購自大連TaKaRa公司。細胞凋亡檢測采用南京凱基公司Annexin V-FITC細胞凋亡檢測試劑盒,Matrigel購自美國BD公司,E-cadherin、N-cadherin、ZEB1、Slug、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)9單克隆抗體均購自美國Cellsignal公司,相應二抗均購自中杉金橋公司。

        1.2 方法

        1.2.1 細胞培養(yǎng)與分組處理 GES-1、MGC-803細胞接種于含10%胎牛血清(56℃水浴滅活40min)DMEM高糖培養(yǎng)基中,在37℃含有5%CO2的濕潤空氣恒溫密閉式培養(yǎng)箱中培養(yǎng),實驗時細胞處于對數(shù)生長期。第一部分:驗證miR-200b 在GES-1、MGC-803細胞中的表達量差異。第二部分:用不同濃度5′-Aza-CdR(2.5、5、7.5、10 μmol/L)作用胃癌MGC-803細胞72 h后,檢測miR-200b表達量差異,并選擇miR-200b升高較明顯所對應藥物濃度作為處理組進行下一步實驗,對照組為相同條件下空白對照。第三部分:驗證miR-200b表達量差異在調(diào)節(jié)增殖、侵襲、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化中的作用。

        1.2.2 RNA提取及實時熒光定量PCR法檢測miR-200b表達量變化 TRIZOL法提取生長狀態(tài)良好的GES-1和處理前后的MGC-803細胞總RNA,依照試劑盒說明書配置逆轉(zhuǎn)錄反應體系,所用引物為特異miR-200b逆轉(zhuǎn)錄引物以及內(nèi)參U6逆轉(zhuǎn)錄引物,得到cDNA,逆轉(zhuǎn)錄條件:95℃5 min,37℃1 h。以逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物cDNA為模板進行PCR反應,檢測miR-200b表達量變化。PCR反應條件:預變性95℃ 5min,95℃ 30s,62℃ 30s,共40個循環(huán),得出各組Ct值,所得結(jié)果按照2-ΔΔCt法進行計算。

        1.2.3 亞硫酸氫鈉修飾測序PCR(BSP)法檢測miR-200b基因啟動子區(qū)甲基化水平變化 用NI-細胞基因組DNA提取試劑盒提取GES-1、MGC-803細胞系基因組DNA,瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA完整性。使用QIAGEN(EpiTect Bisulfite kit,No.59104)試劑盒處理、純化回收DNA并作為模板,設計并驗證合成引物4對進行PCR,從中優(yōu)選1對引物,其特異性引物序列:上游5′-GTATTTAGAGGAAGATGAGATG-3′,下游5′-AACCTAACTTATTAATTAACCTAC-3′,產(chǎn)物372 bp。擴增條件為95℃ 5min,95℃ 40s、54℃ 40s、72℃ 50s,共40個循環(huán),72℃ 10min,產(chǎn)物回收后使用TaKaRa(pMD?18-T Vector Cloning Kit)連結(jié)、轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,搖菌后涂板(加Amp的LB固體培養(yǎng)基),做菌落PCR檢測,挑取陽性菌放入加有Amp的LB液體培養(yǎng)基搖菌,過夜后測序。使用BiQAnalyzer軟件對測序結(jié)果進行CpG島甲基化水平分析。

        1.2.4 細胞凋亡測定 選擇生長在直徑為60 mm培養(yǎng)皿中MGC-803細胞系處理組和對照組,棄去培養(yǎng)基,PBS清洗2次,用不含EDTA的胰酶消化收集于EP管中,1 000 r/min離心5 min后棄去上清,PBS洗滌2~3次后收集細胞(1~5)×105個/mL,按說明書加入凱基凋亡試劑盒中試劑,室溫避光反應5~15 min,立即于real-tec流式細胞儀中于488 nm激發(fā)波長下檢測細胞凋亡情況。

        1.2.5 細胞周期測定 選擇生長在6孔板中的MGC-803細胞系處理組和對照組,常規(guī)消化離心細胞,收集于EP管中,之后于EP管中加入約500 μL預冷的75%乙醇溶液,于4℃冰箱固定過夜,離心后棄去乙醇,PBS洗滌2次,加入300 μL PI溶液。避光染色20 min后,1 000 r/min離心5 min,棄去染料,PBS洗滌后于流式細胞儀488 nm波長下檢測各組細胞周期分布情況。

        1.2.6 Transwell侵襲實驗檢測細胞侵襲能力 在8 μm小孔聚碳酸酯濾膜的培養(yǎng)小室上鋪用預冷無血清DMEM培養(yǎng)基稀釋的Matrigel機制膠(Matrigel∶DMEM=1∶2)30 μL,37℃培養(yǎng)箱內(nèi)孵育待其凝固,接種150 μL無血清培養(yǎng)基稀釋MGC-803細胞約50 000個,下室加入500 μL含10%胎牛血清DMEM培養(yǎng)液,每組設3個復孔。37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)48 h后,取出Transwell小室,棄去上室液體,用棉簽輕輕擦掉上層未遷移細胞,蘇木精染色5 min,PBS洗滌。DP-70熒光相差倒置顯微鏡(×100)采集圖像,隨機讀取3個視野,計算穿過膜的細胞數(shù)并取平均值。

        1.2.7 Western-blot檢測細胞蛋白表達水平 分別收集對照組及處理組MGC-803細胞,用細胞裂解液RIPA裂解提取細胞總蛋白。SDS-PAGE凝膠電泳分離,恒壓80 V電轉(zhuǎn)移至PVDF印跡膜。膜封閉液封閉1 h后,加入一抗E-cad?herin、N-cadherin、ZEB1、Slug、MMP9、GAPDH(1∶1 000稀釋)4℃孵育過夜。次日室溫復溫30 min后PBST洗膜,用辣根過氧化物酶標記的二抗(1∶1 000稀釋)室溫孵育1 h,凝膠成像系統(tǒng)采集成像。GAPDH蛋白作為內(nèi)參。以目標蛋白條帶灰度值/同一樣本內(nèi)參條帶灰度值計算目標蛋白相對表達量。以上實驗重復3次。

        1.3 統(tǒng)計學方法 使用SPSS 11.0軟件進行分析,計量資料采用均數(shù)±標準差(±s)表示,多組之間差異比較使用單因素方差分析,多重比較采用LSD-t檢驗;2組間比較采用成組t檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 GES-1和MGC-803細胞miR-200b的表達水平 GES-1細胞中miR-200b表達高于MGC-803細胞(3.84±0.43 vs 1.98±0.29,t=6.709,P=0.022)。

        2.2 不同濃度處理對MGC-803中miR-200b表達水平的影響 不同濃度(0、2.5、5.0、7.5、10 μmol/L)5′-Aza-CdR處理MGC-803細胞72 h后miR-200b表達量分別為1.00±0.00、2.35±0.39、2.28±0.26、3.36±0.01、5.98±0.63,差異有統(tǒng)計學意義(F=9.283,P<0.01),以10 μmol/L升高較為顯著。

        2.3 GES-1和MGC-803細胞miR-200b啟動子區(qū)甲基化差異 MGC-803中miR-200b啟動子區(qū)發(fā)生甲基化程度較GES-1顯著升高([93.80±6.00)%vs (78.10±7.60)%,t=5.636,P=0.034]。

        2.4 MGC-803處理組和對照組中miR-200b啟動子區(qū)甲基化差異 10 μmol/L 5′-Aza-CdR處理組細胞甲基化程度較對照組降低([87.50±11.30)%vs (93.80±6.00)%,t=4.642,P=0.043]。GES-1和MGC-803對照組及處理組的miR-200b啟動子區(qū)甲基化位點圖,見圖1。

        Fig.1 Methylation profiles around the transcriptional start site of miR-200b in GES-1 and MGC-803圖1 GES-1和MGC-803對照組及處理組的miR-200b啟動子區(qū)甲基化位點圖

        2.5 去甲基化處理后MGC-803細胞凋亡水平變化結(jié)果 MGC-803處理組較對照組晚期細胞凋亡率增加([5.25±0.32)%vs(3.52±0.18)%,t=9.636,P= 0.011],見圖2。

        Fig.2 Ratio of apoptotic cells in 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells圖2 處理組和對照組MGC-803細胞系凋亡率

        2.6 去甲基化處理后 MGC-803細胞周期變化 MGC-803處理組較對照組q細胞大多被阻滯在G0/G1期,而G2/M期、S期的細胞數(shù)明顯減少(均P<0.01),見圖3、表1。

        Fig.3 Cell cycle profiles of MGC-803 after 5′-Aza-CdR treatment圖3 5′-Aza-CdR處理后的MGC-803細胞周期圖

        Tab.1 The percentages of various cell phages in 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells表1 處理組和對照組MGC-803細胞在不同細胞周期的比例 (n=3,%,±s)

        Tab.1 The percentages of various cell phages in 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells表1 處理組和對照組MGC-803細胞在不同細胞周期的比例 (n=3,%,±s)

        **P<0.01

        組別對照組處理組t G0/G1期56.44±1.64 67.63±1.89 19.580**G2/M期9.32±0.15 12.91±0.21 4.532**S期34.24±0.88 19.46±0.45 7.357**

        2.7 去甲基化處理后MGC-803細胞系侵襲能力變化 與對照組相比,處理組穿過小室的細胞數(shù)顯著減少,且每個視野的細胞數(shù)均少于對照組([11.03± 0.93)個 vs(18.82±1.36)個,t=6.722,P=0.021],見圖4。

        2.8 MGC-803細胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關蛋白表達變化 處理組MGC-803細胞中E-cadherin蛋白相對表達水平較對照組明顯升高(P<0.01),而N-cad?herin、ZEB1、Slug、MMP9較對照組明顯降低(P<0.01),見圖5、表2。

        Fig.4 The invasiveness of MGC-803 after 5′-Aza-CdR treatment圖4 5′-Aza-CdR處理MGC-803細胞后侵襲能力的變化(×100)

        Fig.5 The protein expression levels of E-cadherin,N-cadherin,ZEB1,Slug,MMP9 in 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells圖5 MGC-803處理組及對照組中E-cadherin、N-cadherin、ZEB1、Slug、MMP9蛋白表達水平

        Tab.2 Comparison of protein expression levels of E-cadherin,N-cadherin,ZEB1,Slug,MMP9 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells表2 MGC-803處理組及對照組中E-cadherin、N-cadherin、ZEB1、Slug、MMP9蛋白表達水平比較(n=3,±s)

        Tab.2 Comparison of protein expression levels of E-cadherin,N-cadherin,ZEB1,Slug,MMP9 5′-Aza-CdR treated and control MGC-803 cells表2 MGC-803處理組及對照組中E-cadherin、N-cadherin、ZEB1、Slug、MMP9蛋白表達水平比較(n=3,±s)

        **P<0.01

        組別對照組處理組t E-cadherin 0.22±0.03 1.81±0.04 11.452**N-cadherin 1.93±0.02 0.86±0.01 5.365**ZEB1 1.58±0.01 0.64±0.05 6.941**Slug 1.62±0.06 0.29±0.07 8.758**MMP9 1.58±0.02 0.16±0.03 9.280**

        3 討論

        3.1 基因異常甲基化的作用 異常DNA甲基化和組織蛋白乙酰化是表觀遺傳學修飾中最主要的兩部分,在基因致癌與抑癌研究中有重要作用[6]。其能在不改變DNA序列的前提下,改變生物的遺傳表象[7]。當基因發(fā)生異常甲基化時,常導致轉(zhuǎn)錄沉默,使重要基因如抑癌基因、DNA修復基因等喪失功能,從而導致正常細胞的生長分化調(diào)控失常以及DNA損傷不能被及時修復,這與多種腫瘤形成密切相關[8]。MiR-200b是長度僅有19~22 nt的核苷酸片段。本次研究證實miR-200b上游啟動子區(qū)有CpG島聚集區(qū)并且這些區(qū)域有甲基化現(xiàn)象存在,啟動子區(qū)發(fā)生甲基化后,影響基因正常轉(zhuǎn)錄和翻譯過程,導致其表達量降低;同時也可以在不同程度上增強腫瘤細胞MGC-803的侵襲性和增殖性。

        3.2 5′-Aza-CdR的去甲基化作用 5′-Aza-CdR 是DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMT)的抑制劑,它可以和DNMT發(fā)生共價結(jié)合導致酶活性降低,進而影響甲基化發(fā)生率,并使由于甲基化原因?qū)е鲁聊幕蛑匦卤磉_。本研究證實5′-Aza-CdR可以部分逆轉(zhuǎn)miR-200b啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài),從而使由于異常甲基化作用導致的低表達狀態(tài)發(fā)生上調(diào),進而降低胃癌MGC-803細胞的惡性侵襲與增殖性。

        3.3 EMT的發(fā)生受miR-200b表達量的影響 EMT被認為是轉(zhuǎn)移性腫瘤形成的最早的步驟[9],同時也是組織重新塑造的關鍵因素。EMT的特點是:代表上皮標志的指標(如E-cadherin)消失,而代表間充質(zhì)標志的指標(如N-cadherin、ZEB1、Slug)上調(diào)[10]。研究表明,miR-200a的抑癌作用主要是通過抑制正常EMT,其具體機制是通過作用于其靶點ZEB1/ZEB2,降低對E-cadherin的抑制作用,促進E-cadherin高表達[11]。本研究證實,受不同程度甲基化影響的miR-200b表達量也可以影響EMT相關蛋白的表達。

        本研究表明,miR-200b啟動子區(qū)高度甲基化狀態(tài)是導致其低表達的主要原因,而在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑的作用下,可使低表達量的miR-200b發(fā)生上調(diào)。對于在胃癌細胞MGC-803中充當抑癌基因的miR-200b來說,其甲基化狀態(tài)的不同會直接影響其表達量,進而間接影響其抑癌作用,導致MGC-803的惡性增殖和侵襲性發(fā)生改變,并影響EMT相關蛋白的表達。因此,基因異常甲基化的相關研究在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、預防及治療方面具有重要意義。

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        (2014-11-12收稿 2015-01-21修回)

        (本文編輯 李鵬)

        Methylation of miR-200b and its effects on proliferation,invasion of gastric cancer cell line MGC-803

        GUO Rong,NING Xianghong,JIANG Kui,ZHANG Qingyu△
        Department of Gastroenterology,Tianjin Medical University General Hospital,Tianjin 300052,China
        △Corresponding Author E-mail:zhangqy@tijmu.edu.cn

        Objective To investigate the effect of expression level and methylation level of miR-200b on proliferation,invasion and apoptosis of gastric cancer cell line MGC-803 in vitro.Methods Normal human gastric epithelium cell line GES-1,and gastric cancer cell line MGC-803 cells were cultured and harvested to extract total RNA.Then miR-200b ex?pression level was examined via q-PCR;Methylation in promoter of miR-200b was revealed by Bisulphite PCR.MGC-803 cells were treated with different concentrations of 5′-Aza-CdR to test its effect on miR-200b expression and methylation of its promotor.The effect of its treatment at 10 μmol/L for 72 h on invasion,proliferation and apoptosis of both cell lines were detected by Transwell assay,F(xiàn)low cytometry and apoptosis assay respectively.The gene related to EMT(epithelial-mesen?chymal transition)such as E-cadherin,N-cadherin,ZEB1,Slug were checked by Western blot.Results The expression of miR-200b in GES-1 is higher than that in MGC-803(P=0.022).The methylation level in promoter region of miR-200b in GES-1 is lower than that in MGC-803(P=0.034).After treated with 5′-Aza-CdR,the expression of miR-200b in MGC-803 cell was up-regulated in a timely dependent manner.On the contrary,the methylation in promoter of mirR-200b were down-regulated when 5′-Aza-CdR were added at 10 μmol/L(P=0.043).What's more,5′-Aza-CdR administration increas?es cell apoptosis especially in aged cells and delays cell cycle at G0/G1which in turn decrease ratio of cells in S phages.5′-Aza-CdR treatment also decreased invasiveness and induced expression of E-cadherin,as well as down regulated the ex?pressions of N-cadhrin,ZEB1,Slug and MMP9 in MGC-803 cells.Conclusion Expression of miR-200b could be affected by methylation of promoter of miR-200b and in turn regulate proliferation and invasion of gastric cells in vitro.

        stomach neoplasms;adenocarcinoma;cell apoptosis;cell proliferation;DNA methylation;microRNA-200b

        R735.2,R349.6

        A

        10.11958/j.issn.0253-9896.2015.04.002

        國家自然科學基金資助項目(81172356);天津市自然科學基金重點項目(10JCZDJC18500)

        天津醫(yī)科大學總醫(yī)院消化內(nèi)科(郵編300052)

        郭蓉(1987),女,碩士在讀,主要從事胃癌發(fā)病機制研究

        △E-mail:zhangqy@tijmu.edu.cn

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