孔彪,沈冬麗,芮濤,張國(guó)輝
(江蘇大學(xué)附屬人民醫(yī)院心內(nèi)科,江蘇鎮(zhèn)江212002)
MicroRNA-195與Smad7靶向關(guān)系的研究
孔彪,沈冬麗,芮濤,張國(guó)輝
(江蘇大學(xué)附屬人民醫(yī)院心內(nèi)科,江蘇鎮(zhèn)江212002)
目的:構(gòu)建含有Smad7基因3′-UTR區(qū)的熒光素酶報(bào)告基因載體,利用雙熒光素酶報(bào)告基因驗(yàn)證MicroRNA195與其潛在靶基因Smad7的靶向關(guān)系。方法:PCR擴(kuò)增出Smad7基因3′-UTR區(qū)片段,以此構(gòu)建含3′-UTR的熒光素酶報(bào)告基因載體(wild type,WT);將miRNA-195與熒光素酶報(bào)告重組子共轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞中,雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)檢測(cè)熒光素酶活性;構(gòu)建含Smad7基因3′-UTR突變體(mutant,Mut)的熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒,檢測(cè)熒光素酶活性變化。結(jié)果:測(cè)序結(jié)果表明,含有Smad7基因3′-UTR區(qū)的熒光素酶報(bào)告基因載體構(gòu)建正確;熒光素酶活性實(shí)驗(yàn)表明,與對(duì)照組相比,miRNA-195可使含Smad7基因3′-UTR區(qū)的熒光素酶報(bào)告重組子的熒光素酶活性降低40%左右;而定點(diǎn)突變Smad7基因3′-UTR的熒光素酶報(bào)告重組子熒光活性未有明顯變化。結(jié)論:成功構(gòu)建了Smad7基因3′-UTR區(qū)的熒光素酶報(bào)告基因載體,而miRNA-195可以直接作用于Smad7基因3′-UTR區(qū),抑制其熒光素酶活性。
MicroRNA195;Smad7基因;熒光素酶報(bào)告基因;3′-UTR
微小RNA(miRNA)是一種小的內(nèi)源性非編碼RNA分子,大約由18~24個(gè)核苷酸組成。它可與靶基因mRNA的3′端非編碼區(qū)(3′-UTR)結(jié)合,通過(guò)翻譯水平的抑制或斷裂靶標(biāo)mRNAs而調(diào)節(jié)基因的表達(dá)[1]。miRNA影響其目標(biāo)蛋白的生物學(xué)功能,對(duì)細(xì)胞增殖與分化進(jìn)行調(diào)節(jié),并可加速細(xì)胞凋亡,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)疾病病理生理進(jìn)程的調(diào)控。國(guó)內(nèi)外大量基礎(chǔ)和臨床研究已證實(shí),多種miRNA在心血管疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中扮演重要角色[2-3]。van Rooij等[4]研究發(fā)現(xiàn),心臟特異性的miRNA-195在哺乳動(dòng)物的肥大心肌中表達(dá)上調(diào)。目前尚未確定miRNA-195作用的靶基因,其介導(dǎo)心臟病變的機(jī)制也不明確。利用Target scan 5.1預(yù)測(cè)軟件,我們發(fā)現(xiàn)Smad7是miRNA-195的潛在靶基因之一,本研究旨在利用熒光素酶實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證二者間的靶向關(guān)系,為進(jìn)一步研究心肌病心肌細(xì)胞肥大病理生理改變的機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
1.1 材料
胚腎細(xì)胞HEK293T細(xì)胞株、大腸埃希菌TOP10菌株由本實(shí)驗(yàn)室保存,miRNA mimics購(gòu)買于上海吉碼公司,轉(zhuǎn)染試劑Fugene HD(Roche公司),經(jīng)改造的雙熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒(pLUC載體)購(gòu)自華安平康公司,引物由Invitrogen公司合成。PCR試劑盒(TaKaRa公司),質(zhì)粒提取試劑盒(OMEGA公司),XhoⅠ、NotⅠ、T4DNA連接酶(Fermentas公司),雙熒光報(bào)告系統(tǒng)(Promega公司),細(xì)胞裂解液(Promega公司)。
1.2 方法
1.2.1 構(gòu)建野生型和突變型Smad7熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒 Smad7基因3′-UTR序列從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得,設(shè)計(jì)成對(duì)PCR擴(kuò)增引物。Smad7上游引物:5′-GTGGGGAGAAGAGGACAGGAC-3,下游引物:5′-GTGGTACCCACTTTCGCACA-3′。以基因組DNA作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),獲得3′-UTR基因片段。經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離PCR產(chǎn)物。將經(jīng)NotⅠ和XhoⅠ酶切純化后的具有相同酶切位點(diǎn)的pLUC與3′-UTR PCR片段相連接,22℃連接2 h后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞TOP10,取適量轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布于LB平板上,37℃培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)16 h,觀察菌落生長(zhǎng)情況。將經(jīng)菌落PCR和質(zhì)粒PCR鑒定正確的克隆菌液送測(cè)序,驗(yàn)證重組克隆插入片段的序列信息,含有目的序列的正確質(zhì)粒命名為(Luc-Smad7-WT)。定點(diǎn)突變?cè)揝mad7 3′-UTR中的核心序列(UGCUGCU),構(gòu)建含Smad7 3′-UTR突變體的熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒(Luc-Smad7-Mut)。
1.2.2 miRNA-195與Luc-Smad7-WT/Luc-Smad7-Mut共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞 胰酶消化HEK293T細(xì)胞,計(jì)數(shù),每1/96孔種2×104(100μL)細(xì)胞,將處理好的細(xì)胞均勻加于各孔中,置于37℃,5%CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)約24 h。每孔添加的試劑量:0.2μg Luc-Smad7-WT/Luc-Smad7-Mut,0.3μL Fugene HD,0.45μgmiRNA mimics,miRNA NC作為對(duì)照,一組實(shí)驗(yàn)3個(gè)復(fù)孔。30μL Opti-MEM培養(yǎng)基稀釋質(zhì)粒,最后加入0.9μL Fugene HD,混勻后室溫靜置15 min。將混合物取10μL均勻滴加于每孔細(xì)胞中,每3個(gè)孔為一實(shí)驗(yàn)組,置于37℃,5%CO2培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)。
1.2.3 熒光素酶活性檢測(cè) 轉(zhuǎn)染完成48 h后,采用Luciferase Reporter Assay System進(jìn)行檢測(cè)。吸除轉(zhuǎn)染各孔內(nèi)的培養(yǎng)基,于各孔中加入80μL稀釋后的1×細(xì)胞裂解液,置于脫色搖床上振蕩1 h,收集各孔的細(xì)胞裂解液,12 000 r/min,離心1 min沉淀雜質(zhì)。取上述細(xì)胞裂解液于不透明96孔板各孔中,按照說(shuō)明書依次加入螢火蟲熒光素酶及海腎熒光素酶底物,通過(guò)Tecan Infinite F200/M200型多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2.1 miRNA-195與Smad7基因3′-UTR區(qū)互補(bǔ)結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)
從Target scan 5.1預(yù)測(cè)軟件獲取miRNA-195與Smad7基因3′-UTR區(qū)互補(bǔ)結(jié)合位點(diǎn),并以此構(gòu)建miRNA-195種子區(qū)突變體(種子區(qū)突變?yōu)橄嗷セパa(bǔ)的堿基),見(jiàn)圖1。
圖1 m iRNA195與Smad7靶位點(diǎn)配對(duì)示意圖
2.2 Smad7基因3′-UTR區(qū)的PCR擴(kuò)增
以基因組DNA作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),獲得Smad7基因3′-UTR基因片段384 bp,DNA凝膠電泳結(jié)果顯示與預(yù)計(jì)大小相符(圖2)。
圖2 Smad7基因3′-UTR區(qū)的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3 熒光素酶報(bào)告基因載體的構(gòu)建
上述3′-UTR PCR片段純化后經(jīng)NotⅠ和XhoⅠ雙酶切處理,克隆到具有相同酶切位點(diǎn)的pLUC載體中,將經(jīng)PCR鑒定為陽(yáng)性的重組質(zhì)粒進(jìn)行進(jìn)一步酶切鑒定,結(jié)果顯示重組質(zhì)粒含有與Smad7基因3′-UTR基因片段大小相符合的插入片段(384 bp,圖3)。重組克隆插入片段經(jīng)測(cè)序鑒定證實(shí)為Smad7基因3′-UTR區(qū)(圖略)。
圖3 熒光素酶報(bào)告基因載體的構(gòu)建
2.4 miRNA-195對(duì)Smad7基因3′-UTR區(qū)的調(diào)控
結(jié)果表明,rno-miR-195與含Smad7基因3′-UTR片段的雙熒光素酶報(bào)告基因共轉(zhuǎn)染驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)相對(duì)于負(fù)對(duì)照(mimics NC與含Smad7基因3′-UTR片段的雙熒光素酶報(bào)告基因共轉(zhuǎn)染)有極顯著性差異(t=13.291,P=0.006),同時(shí)熒光比值為負(fù)對(duì)照的56.30%。說(shuō)明rno-miR-195對(duì)Smad7 3′-UTR的基因表達(dá)水平有顯著抑制作用(圖4)。
rno-miR-195與含Smad7基因3′-UTR突變體片段的雙熒光素酶報(bào)告基因共轉(zhuǎn)染驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)相對(duì)于負(fù)對(duì)照(mimics NC與含Smad7基因3′-UTR突變體片段的雙熒光素酶報(bào)告基因共轉(zhuǎn)染)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=0.626,P=0.595),同時(shí)熒光比值為負(fù)對(duì)照的103.02%。說(shuō)明rno-miR-195對(duì)Smad7基因3′-UTR突變體的基因表達(dá)水平無(wú)抑制作用(圖4)。
圖4 m iRNA-195對(duì)Smad7基因3′-UTR的表達(dá)調(diào)控
糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)是糖尿病患者的主要心臟并發(fā)癥之一,以心肌肥大和心肌纖維化為主要特征性病理改變,是導(dǎo)致糖尿病患者心血管系統(tǒng)疾病的高發(fā)生率和高病死率的重要原因,其發(fā)病機(jī)制、診斷治療已成為基礎(chǔ)和臨床研究的熱點(diǎn)。近年來(lái),對(duì)心臟相關(guān)的miRNAs及多種病理?xiàng)l件下miRNAs差異性表達(dá)的研究,揭示了它在心血管疾病中重要的調(diào)節(jié)作用。miRNA-195參與了多種病因引起的心肌肥大的病理生理過(guò)程[3]。刁雪紅等[5]研究發(fā)現(xiàn),miRNA-195在糖尿病小鼠模型的心肌組織中的表達(dá)明顯上調(diào)。而本課題組前期工作中同樣發(fā)現(xiàn)在高糖培養(yǎng)的心肌細(xì)胞中,miRNA-195表達(dá)也上調(diào),因此推測(cè)miRNA-195在高糖引起的心肌細(xì)胞肥大中發(fā)揮重要作用,但其靶基因及其在糖尿病心肌病發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中的作用機(jī)制尚不清楚。
我們利用生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)miRNA-195潛在靶基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miRNA-195種子序列可與Smad7的3′-UTR片段上的一段堿基序列完全配對(duì)。Smad7可通過(guò)阻斷TGF-β1受體與受體調(diào)節(jié)型Smad s或共同調(diào)節(jié)型Smads的結(jié)合抑制TGF-β1信號(hào)通路的傳導(dǎo),從而阻斷TGF-β1的生物學(xué)效應(yīng)[6]。研究發(fā)現(xiàn),糖尿病大鼠心肌組織中Smad7表達(dá)減少,且其變化與糖尿病心臟病變相關(guān),提示Smad信號(hào)系統(tǒng)失衡可能與糖尿病心肌病發(fā)生發(fā)展存在密切關(guān)聯(lián)。同時(shí)發(fā)現(xiàn)TGF-β1介導(dǎo)的心肌重構(gòu)可被Smad7阻斷,說(shuō)明以Smad7為代表的抑制型Smad s可發(fā)揮保護(hù)作用[7]。
熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)作為一種重要的miRNA靶位點(diǎn)鑒定方法,常被用來(lái)驗(yàn)證miRNA是否直接作用于其潛在靶基因的3′-UTR[8]。為了驗(yàn)證Smad7是否直接受miRNA-195的調(diào)控,我們將含有大鼠miRNA-195種子序列的Smad7的3′-UTR片段克隆到報(bào)告基因載體中,得到Luc-Smad7-WT報(bào)告載體,并且構(gòu)建了含有突變序列的載體Luc-Smad7-Mut。然后將構(gòu)建成功的重組質(zhì)粒和miRNA-195瞬時(shí)共轉(zhuǎn)染293T工具細(xì)胞,利用雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)檢測(cè)Luciferase熒光值。若能觀察到含有Smad7基因3′-UTR片段的外源性質(zhì)粒載體與miRNA-195寡核苷酸在工具細(xì)胞中相互作用,可認(rèn)為該作用機(jī)制具有普遍性[9]。結(jié)果顯示,在293T細(xì)胞中,野生型Smad7 3′-UTR+miRNA-195報(bào)告基因載體的熒光素酶活性較對(duì)照組顯著降低,而種子區(qū)突變體則無(wú)顯著差異。后期,課題組在高糖培養(yǎng)的心肌細(xì)胞中通過(guò)轉(zhuǎn)染miRNA-195抑制劑,發(fā)現(xiàn)miRNA-195表達(dá)下調(diào)的同時(shí),Smad7蛋白表達(dá)水平增加,推測(cè)miRNA-195通過(guò)TGF-β1/Smad通路參與糖尿病心肌病時(shí)的心肌肥大。上述結(jié)果充分證明Smad7確實(shí)為miRNA-195的靶基因。
綜上所述,miRNA-195可通過(guò)靶向抗心肌重構(gòu)基因Smad7,調(diào)控其表達(dá)水平,參與糖尿病心肌病心肌細(xì)胞肥大的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程。本研究進(jìn)一步完善了糖尿病心肌病的發(fā)病機(jī)制。在未來(lái)的臨床研究中,miRNA-195或許可作為糖尿病心肌病新的治療靶點(diǎn)。
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Investigating the relationship between M icroRNA-195 and Smad7
KONG Biao,SHEN Dong-li,RUITao,ZHANGGuo-hui
(Department of Cardiology,the Affiliated People′s Hospital of Jiangsu University,Zhenjiang Jiangsu 212002,China)
Objective:The luciferase reporter vector containing 3′-UTR of Smad7 was constructed.Dual luciferase reporter gene system was applied to determine the association between miRNA-195 and its target gene Smad7.M ethods:The 3′-UTR of Smad7 fragment amplified by PCR was cloned into luciferase vector.MiRNA-195 and the luciferase reporters containing 3′-UTR(Smad7-3′UTR-WT)or mutant 3′-UTR(Smad7-3′UTR-Mut)of Smad7 were co-transfected into HEK293T cells and dual luciferase reporter gene system was applied to test luciferase activity.Results:DNA sequencing showed that the sequences of the cloned regions were correct.The luciferase activity of Smad7-3′UTR-WT plasmid treated with miRNA-195 was decreased to about 40%compared with control.Themutant3′-UTR were no longer repressed bymiRNA-195.Conclusion:The Smad7 3′-UTR luciferase reporter vector has been constructed successfully.MiRNA-195 can repress the luciferase activity of the reporter gene and had direct effect on Smad7 3′-UTR.
MicroRNA195;Smad7;luciferase reporter gene;3′-UTR
R393
A
1671-7783(2015)04-0286-04
10.13312/j.issn.1671-7783.150049
孔彪(1986—),男,碩士研究生;張國(guó)輝(通訊作者),博士,主任醫(yī)師,碩士生導(dǎo)師,E-mail:13338812776@189.cn
2015-03-19 [編輯]何承志