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        重組大腸埃希菌外膜蛋白OmpT 的載體構(gòu)建和 表達(dá)條件優(yōu)化及多克隆抗體制備

        2015-07-15 03:46:08劉祥俱雄陳春琳
        關(guān)鍵詞:埃希菌大腸克隆

        劉祥,俱雄,陳春琳

        (陜西理工學(xué)院生物科學(xué)與工程學(xué)院,陜西 漢中 723001)

        大腸埃希菌(Escherichia coli)廣泛存在于自然環(huán)境中,按其致病機(jī)理可分為產(chǎn)腸毒素性、腸道侵襲性、腸道致病性、腸集聚黏附性和腸出血性5種[1],可引起人畜共患病[2],包括腹瀉[3]、腦膜炎[4]、尿道感染[5]、食物中毒[6]等;由其導(dǎo)致的奶牛乳房炎發(fā)病率呈逐年上升趨勢(shì),給奶制品生產(chǎn)及品質(zhì)帶來重大影響[7–8]。大腸埃希菌外膜蛋白酶 T(outer membrane protease T, OmpT)位于細(xì)菌外膜,是大腸埃希菌的主要毒力相關(guān)因子之一[9],可提高細(xì)菌抵抗宿主免疫系統(tǒng)的能力[10–11],也是細(xì)菌進(jìn)入中樞神經(jīng)的黏附因子[4],并介導(dǎo)細(xì)菌在尿路上皮細(xì)胞的定植[12]。此外,OmpT具有很高的免疫原性,能有效提高小鼠對(duì)致病性大腸埃希菌的免疫抵抗能力[13],所以,OmpT有望成為候選的蛋白亞單位疫苗。本研究中利用分子克隆方法獲得大腸埃希菌OmpT蛋白表達(dá)菌株;純化OmpT蛋白,免疫小鼠,制備小鼠OmpT抗血清;通過正交試驗(yàn)確定OmpT適宜的表達(dá)條件與培養(yǎng)條件,旨在為OmpT工業(yè)發(fā)酵與疫苗開發(fā)提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株與質(zhì)粒

        E. coli K12菌株、E. coli DH5a菌株、E. coli BL21菌株和pET–32a質(zhì)粒均由陜西理工學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.1.2 主要試劑

        DNA聚合酶、連接酶及內(nèi)切酶購于大連寶生生物工程公司;質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒均購于上海生物工程有限公司;IPTG購于BBI公司;二抗購于Sigma公司,基因測(cè)序在北京奧科鼎盛生物科技有限公司進(jìn)行。引物由北京奧科鼎盛生物科技有限公司合成。其他試劑均為國產(chǎn),分析純。

        1.2 方法

        1.2.1 重組載體的構(gòu)建

        依據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫公布的E. coli K12的全基因組序列設(shè)計(jì) ompT 基因引物。引物序列為Sense和Anti– sense Primer(5′–gctctcgagttaaaatgtgtactta ag–3′)(下劃線分別表示限制性內(nèi)切酶的位點(diǎn)BamHⅠ和Xho Ⅰ)。PCR反應(yīng)體系(25 μL):PCR緩沖液2.5 μL,10 mmol/L dNTP 2 μL,25 μmol/L引物各1 μL,模板DNA 10 μL,Taq 酶0.2 μL,補(bǔ)水至25 μL。PCR循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性3min,然后進(jìn)行30個(gè)循環(huán)(94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸90 s),最后72℃充分延伸10min,4℃保溫。用PCR產(chǎn)物和pET–32a質(zhì)粒載體進(jìn)行雙酶切,用連接酶連接后轉(zhuǎn)化E. coli DH5a,并對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切和測(cè)序鑒定,最后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E. coli BL21表達(dá)菌株,進(jìn)行OmpT表達(dá)[14]檢測(cè)。

        1.2.2 重組蛋白的表達(dá)檢測(cè)與純化

        選取經(jīng)鑒定后的重組菌接入LB(Amp)液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),以1∶100轉(zhuǎn)接到新鮮LB培養(yǎng)基中,待OD600nm約為0.5時(shí),加入終濃度0.5 mmol/L 的IPTG,37℃誘導(dǎo)5 h,收集菌體,用蛋白電泳檢測(cè)OmpT表達(dá)情況。利用SDS–PAGE電泳方法[15]對(duì)OmpT進(jìn)行蛋白純化。

        1.2.3 小鼠多克隆抗體制備

        將每只昆明鼠免疫OmpT蛋白50μg,第1次采用弗氏完全佐劑,免疫14 d后進(jìn)行第2次免疫,第2次免疫7 d后,進(jìn)行第3次免疫。第3次免疫7 d后于小鼠眼部取血,將血清置于4℃冰箱中過夜析出,離心取上清,–80℃冰箱中保存?zhèn)溆肹15]。

        1.2.4 蛋白抗體的效價(jià)與特異性檢測(cè)

        用ELISA法檢測(cè)抗血清效價(jià),主要步驟為:將OmpT蛋白溶解至0.05μg/μL,在對(duì)應(yīng)的96孔板中加入100 μL抗原,37℃孵育3 h;倒空液體,清洗3次,加入300 μL封閉液,37℃孵育2 h,加100 μL不同稀釋度小鼠抗血清(每種稀釋度均有3個(gè)重復(fù)),37℃孵育30min;充分洗滌后加入100 μL二抗(1∶3 000稀釋),37℃孵育30min;充分洗滌后,每孔加入50 μL底物A與50 μL底物B的混合液,37℃避光顯色10min,迅速加入終止液,酶標(biāo)儀[16]450 nm讀數(shù)。

        采用Western blotting方法檢測(cè)OmpT小鼠抗血清特異性[17],主要步驟為:將大腸埃希菌過夜培養(yǎng),收集菌體,SDS–PAGE蛋白電泳,轉(zhuǎn)NC膜,加入不同稀釋度的小鼠抗血清(對(duì)照加入陰性抗血清),洗滌后,加入二抗(1∶3 000稀釋)孵育,洗滌后DAB顯色。

        1.2.5 OmpT 蛋白氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

        利用NCBI數(shù)據(jù)庫中已公布的細(xì)菌OmpT氨基酸序列,通過 MEGA5.02 軟件進(jìn)行聚類分析,并采用Neighbour–Joining 方法[14]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。

        1.2.6 重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化

        選用L9(34)正交試驗(yàn)確定蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的適宜條件。正交試驗(yàn)分為培養(yǎng)條件與蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件兩部分[18],試驗(yàn)的因子與水平見表1和表2。

        表1 表達(dá)菌株培養(yǎng)條件正交試驗(yàn)的因子與水平 Table 1 Factors and levels of orthogonal experiment for cultural condition of strain expression

        表2 蛋白誘導(dǎo)條件正交試驗(yàn)的因子與水平 Table 2 Factors and levels of orthogonal experiment for protein induced condition

        OmpT表達(dá)菌株培養(yǎng)條件優(yōu)化的正交試驗(yàn):將重組菌株置于LB(Amp)液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),以1∶100(體積)轉(zhuǎn)接入新鮮培養(yǎng)基,按照正交試驗(yàn)?zāi)P鸵笈囵B(yǎng),并記錄所得菌液的OD600nm。

        OmpT表達(dá)菌株誘導(dǎo)條件優(yōu)化的正交試驗(yàn):根據(jù)表達(dá)菌適宜培養(yǎng)條件試驗(yàn)結(jié)果,依照正交試驗(yàn)?zāi)P鸵蟮牟煌瑮l件培養(yǎng)至合適OD600nm,加入不同終濃度的IPTG誘導(dǎo)相應(yīng)時(shí)間。分別吸取1mL菌液離心,將沉淀加入200 μL的2×SDS 上樣緩沖液中,沸水煮樣,并上樣10 μL 進(jìn)行SDS–PAGE電泳。使用Phoretix 1D軟件對(duì)獲得的蛋白電泳條帶進(jìn)行光密度分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 重組載體的構(gòu)建結(jié)果

        圖1 大腸埃希菌ompT基因的PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果 Fig.1 PCR amplification electrophoresis of E. Tgene

        從大腸埃希菌基因組中PCR擴(kuò)增到約1 000 bp的片段,片段大小與預(yù)期大小一致(圖1)。將由PCR 擴(kuò)增得到的目的基因與pET–32a質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,通過連接酶連接轉(zhuǎn)化DH5a菌株,提取重組質(zhì)粒,雙酶切,獲得約1 000 bp的片段,片段大小與預(yù)測(cè)大小一致(圖2)?;驕y(cè)序結(jié)果表明,構(gòu)建的ompT基因的序列與NCBI公布的序列相同,證明重組質(zhì)??寺〕晒Α?/p>

        圖2 重組質(zhì)粒的雙酶切結(jié)果 Fig.2 Results of recombinant plasmid digested by restriction enzyme

        2.2 重組蛋白的表達(dá)與純化結(jié)果

        為檢測(cè)重組蛋白的表達(dá)情況,將重組菌株經(jīng)IPTG誘導(dǎo),蛋白電泳獲得相對(duì)分子質(zhì)量約56 000的蛋白條帶,其中包含約35 000的OmpT蛋白和20 400 的融合蛋白標(biāo)簽,其大小與預(yù)期大小一致;采用SDS–PAGE蛋白電泳切膠純化獲得的OmpT蛋白如圖3所示。

        圖3 OmpT蛋白的表達(dá)與純化電泳圖譜 Fig. 3 Expression and purification electrophoresis of OmpT protein

        2.3 小鼠抗血清效價(jià)與特異性檢測(cè)結(jié)果

        對(duì)獲得的小鼠OmpT抗血清采用ELISA法檢測(cè),發(fā)現(xiàn)其抗體效價(jià)可以達(dá)到1∶1 600(圖4)。Western blotting方法的分析結(jié)果表明,不同稀釋度OmpT抗血清出現(xiàn)明顯條帶,而對(duì)照無對(duì)應(yīng)條帶(圖5),表明OmpT抗血清可與OmpT蛋白特異性結(jié)合,OmpT蛋白小鼠多克隆抗體被成功制備。

        圖4 OmpT 多克隆抗體效價(jià)的測(cè)定結(jié)果 Fig.4 Polyclonal antibody titer of the OmpT

        圖5 OmpT 多克隆抗體特異性的Western blotting 檢測(cè)結(jié)果 Fig.5 Specificity of OmpT polyclonal antibody identification using Western blotting

        2.4 OmpT 蛋白氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化分析

        由圖6可見,不同種大腸埃希菌有聚在一起的趨勢(shì),間接說明OmpT蛋白在不同種大腸埃希菌間具有同源性,可能存在交叉的免疫保護(hù)作用。

        圖6 OmpT 氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹 Fig.6 Phylogenetic tree from OmpT amino acid sequences

        2.5 重組菌株的誘導(dǎo)表達(dá)

        2.5.1 菌株最適培養(yǎng)條件的正交試驗(yàn)結(jié)果

        由正交試驗(yàn)結(jié)果(表3)的極差值(表4)可以看出,各因子對(duì)表達(dá)菌株生長的影響從大到小依次為培養(yǎng)基裝液量、葡萄糖濃度、轉(zhuǎn)速。由極差分析獲得的表達(dá)菌培養(yǎng)的最優(yōu)組合為a1b3c1(葡萄糖濃度為0,轉(zhuǎn)速為230 r/min,培養(yǎng)基裝液量為50mL)。表5方差分析結(jié)果顯示,葡萄糖濃度、轉(zhuǎn)速及裝液量對(duì)表達(dá)菌株培養(yǎng)的影響達(dá)到顯著水平。

        表3 表達(dá)菌株的培養(yǎng)結(jié)果 Table 3 Results of the cultural experiment for strain expression

        表4 表達(dá)菌株培養(yǎng)條件的極差分析結(jié)果 Table 4 Range results of cultural condition for strain expression

        表5 表達(dá)菌株不同培養(yǎng)條件下OD600 nm 的方差分析結(jié)果 Table 5 Variance analysis of cultural condition for strain expression

        2.5.2 OmpT 蛋白適宜誘導(dǎo)表達(dá)條件的正交試驗(yàn)結(jié)果

        將正交試驗(yàn)獲得的表達(dá)菌株進(jìn)行SDS–PAGE電泳(圖7),用Phoretix 1D軟件分析電泳條帶圖譜,獲得蛋白條帶的光密度值如表6所示。由表7中的極差分析結(jié)果可知,各因子對(duì)OmpT蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的影響從大到小依次為誘導(dǎo)溫度、IPTG誘導(dǎo)時(shí)菌體OD600nm、IPTG誘導(dǎo)終濃度、誘導(dǎo)時(shí)間。由極差分析獲得最適宜OmpT蛋白表達(dá)的組合為e3f2g2h2(加IPTG誘導(dǎo)菌液的OD600nm為1.0,IPTG終濃度為0.3 mmol/L,誘導(dǎo)時(shí)間為8 h,誘導(dǎo)溫度為32℃)。表8中的方差分析結(jié)果顯示,加IPTG菌液濃度、IPTG誘導(dǎo)濃度及誘導(dǎo)溫度3個(gè)因子對(duì)OmpT蛋白表達(dá)的影響達(dá)到顯著水平。

        圖7 正交試驗(yàn)獲得的OmpT 表達(dá)菌株SDS–PAGE 電泳圖譜 Fig.7 SDS–PAGE electrophoresis of OmpT strain expression from orthogonal experiment

        s表6 OmpT 蛋白表達(dá)各試驗(yàn)的光密度值 Table 6 Value of optical density from different expression experiments of OmpT protein

        表7 OmpT 蛋白表達(dá)各試驗(yàn)光密度值的極差分析結(jié)果 Table 7 Range analysis on the value of optical density from different expression experiments of OmpT protein

        表8 OmpT 蛋白表達(dá)各因子光密度值的方差分析結(jié)果 Table 8 Variance analysis on the value of optical density from different expression experiments of OmpT protein

        3 結(jié)論與討論

        大腸埃希菌是導(dǎo)致奶牛乳房炎疾病的主要細(xì)菌之一,給奶制品業(yè)帶來的損失巨大[7–8]。OmpT蛋白是大腸埃希菌主要的外膜蛋白之一,具有顯著的免疫保護(hù)作用[13],有望制備成奶牛乳房炎疾病的候選蛋白疫苗。本研究中構(gòu)建大腸埃希菌OmpT表達(dá)菌株,獲得純化的OmpT蛋白,免疫小鼠制備了特異性較好的OmpT多克隆抗體,為OmpT功能研究奠定基礎(chǔ)。此外,本研究發(fā)現(xiàn)OmpT氨基酸序列在不同種類大腸埃希菌間具有同源性,可能為不同種類的大腸埃希菌感染提供交叉免疫保護(hù)作用。

        本試驗(yàn)結(jié)果表明:未誘導(dǎo)時(shí),菌體適宜培養(yǎng)條件為葡萄糖濃度0 %,轉(zhuǎn)速230 r/min,裝液量50mL。有研究發(fā)現(xiàn)充足的氧氣以及合適的轉(zhuǎn)速有利于菌體的生長[19]。這與本實(shí)驗(yàn)證實(shí)提高培養(yǎng)基轉(zhuǎn)速,減少裝液量,可增加細(xì)菌對(duì)氧氣、營養(yǎng)的充分吸收結(jié)果一致。在菌株IPTG誘導(dǎo)后,適宜OmpT蛋白誘導(dǎo)條件為:誘導(dǎo)時(shí)IPTG菌液OD600nm為1.0,IPTG終濃度0.3 mmol/L,誘導(dǎo)時(shí)間8 h,誘導(dǎo)溫度32℃。IPTG是β–半乳糖苷酶的活性誘導(dǎo)物質(zhì),高濃度的IPTG具有一定的細(xì)胞毒性,抑制蛋白的表達(dá)[20–21]。本試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)低濃度IPTG(0.3 mmol/L)有利于蛋白的表達(dá)。

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