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        小麥及其近緣物種中類燕麥儲藏蛋白Avenin瞝ike基因的克隆綜述

        2015-05-30 10:48:04孫楊柳
        安徽農(nóng)業(yè)科學 2015年8期

        摘要 介紹了小麥的品質(zhì)及品質(zhì)的形成、小麥的儲藏蛋白及儲藏蛋白的分類。綜述了近年來關于類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因發(fā)現(xiàn)、Avenin-like基因的胚乳特異性表達的時空表達模式以及Avenin-like基因的啟動子的作用元件和時空表達特異性研究。

        關鍵詞:Avenin-like基因;胚乳特異性表達;啟動子

        中圖分類號:S188 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611(2015)08-040-03

        小麥的品質(zhì)主要包含營養(yǎng)品質(zhì)和加工品質(zhì)[1]。其中小麥的營養(yǎng)品質(zhì)主要是指所含的營養(yǎng)物質(zhì)對生物體營養(yǎng)需要的適合性和滿足程度,包括營養(yǎng)成分含量的多少和各種營養(yǎng)成分是否全面和均衡。小麥的加工品質(zhì)是指小麥籽粒對制粉以及制作不同食品的適應性和滿足程度,主要包括一次加工品質(zhì)即磨粉品質(zhì)和二次加工品質(zhì)即食品加工品質(zhì)。磨粉品質(zhì)是指籽粒在輾磨為面粉的過程中,品質(zhì)對磨粉工藝的滿足程度,主要包括籽粒容重、灰分、硬度、出粉率、面粉白度等。小麥的食品加工品質(zhì)包括烘烤和蒸煮后的質(zhì)量,烘烤品質(zhì)主要指出粉率、灰分、粉色、細度、沉降值、α-淀粉酶活性等指標,蒸煮品質(zhì)主要指吸水率、攪拌特性、面筋延伸性和抗延性[2]。物質(zhì)組成決定加工品質(zhì),小麥加工品質(zhì)很大程度上取決于面團流變學特性,與小麥儲藏蛋白的組分關聯(lián)密切[3-8]。

        面粉加水之后經(jīng)過攪拌后形成面團,其大致的分子機理為:谷蛋白亞基通過分子間二硫鍵交聯(lián),然后形成纖維狀大分子聚合體,從宏觀上表現(xiàn)為彈性的形成。醇溶蛋白在分子內(nèi)在二硫鍵、氫鍵等的共同作用下形成球狀結(jié)構(gòu),通過非共價鍵穿插在谷蛋白網(wǎng)絡構(gòu)架中,在宏觀上表現(xiàn)為面團具有延展性[9]。面團的彈性和黏性用面團的流變學特性來描述。

        1924年,Osborne[10]根據(jù)種子中貯藏蛋白的溶解條件,將貯藏蛋白分為兩大類。其中第一大類為面筋蛋白,主要含有麥谷蛋白和麥醇溶蛋白。麥谷蛋白約占45%,可以溶于稀酸或稀堿,由17~20條多肽鏈構(gòu)成,呈纖維狀,水合時無黏性,彈性好,決定面團彈性。麥醇溶蛋白約占40%,醇溶性,由一條多肽鏈構(gòu)成,僅有分子內(nèi)二硫鍵和較緊密的三維結(jié)構(gòu),呈球形,多由非極性氨基酸組成,富含谷氨酰胺和脯氨酸,故水合時黏性好,參與面團延展性[11]。第二大類主要為非面筋蛋白,主要包括清蛋白和球蛋白。清蛋白可溶于水或低濃度鹽溶液,約占蛋白總量的2.5%;球蛋白可溶于稀釋的鹽溶液中但不能溶于水,約占蛋白總量的5%。

        1 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因及蛋白的發(fā)現(xiàn)

        1.1 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因的發(fā)現(xiàn) 2001年,Anderson等[12]將小麥授粉后的種子與種子胚乳特異性EST進行雜交,其cDNA文庫是小麥授粉后5~30 d的種子cDNA文庫,發(fā)現(xiàn)了一類新的小麥胚乳特異性表達基因,然后BLAST對比分析,證明該小麥胚乳特異性表達的基因與燕麥Avenin儲藏蛋白基因相似度最高。

        2004年,Li等[13]分別以小麥的胚、胚乳以及未授粉子房的RNA反轉(zhuǎn)錄的DNA為探針,與小麥授粉后12 d的種子cDNA文庫進行差異雜交,結(jié)果證明4個基因類似于燕麥Avenin蛋白編碼基因,并研究了這類小麥Avenin-like蛋白編碼基因在各個組織中的表達模式,進一步證明了該類基因只在胚乳中特異性表達。

        2005年,Vensel等[14]通過質(zhì)譜技術以及雙向電泳技術,將小麥開花后10~36 d的胚乳中分離出的蛋白質(zhì)經(jīng)序列比較分析后發(fā)現(xiàn)了5個類似于燕麥的蛋白質(zhì),通過研究證明該類蛋白質(zhì)是小麥新型種子儲藏蛋白。

        2005年,Drea等[15]應用高通量原位雜交技術,檢測小麥胚乳發(fā)育早期基因表達模式,將檢測到種子發(fā)育期間有多個Avenin-like蛋白編碼基因在胚乳中特異性表達,這些表達產(chǎn)物被證明類似于小麥儲藏蛋白。

        2005年Dupont等[16]從小麥種子胚乳中分離得到一個新型蛋白質(zhì),然后通過試驗表明小麥胚乳中這類蛋白與燕麥Avenin蛋白相似度很高。

        1.2 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like蛋白的研究 2006年,Kan等[17]利用構(gòu)建的小麥和山羊草開花后14 d的種子cDNA文庫與小麥胚乳特異性表達的EST芯片雜交,結(jié)果顯示為陽性克隆,將陽性克隆的基因序列和推導的蛋白質(zhì)序列經(jīng)BLAST比較分析后,因這種基因與小麥儲藏蛋白基因Avenin同源性較高,故將這種基因命名為Avenin-like基因,將其相應的蛋白命名為Avenin-like蛋白。

        依據(jù)Avenin-like蛋白的結(jié)構(gòu)差異,可以分為Avenin-like type a和Avenin-like type b 2種蛋白,分別含有約148和265個氨基酸殘基,分子量分別約為16 kDa和30 kDa[17]。已分離的小麥Avenin-like type a基因Avenin-like type b基因長度分別為450和855 bp。

        2008年,陳鵬等[18-19]利用小麥及其近緣物種各種山羊草為研究材料,克隆得到了23個ALP type-b同源基因,然后利用半定量PCR技術及Western-blot雜交分析驗證,結(jié)果表明,該基因在胚乳中特異性表達。并證明這些Avenin-like蛋白存在典型的“半胱氨酸-半胱氨酸”,即“Cys-Cys”結(jié)構(gòu)域。陳鵬等[20-21]利用實時熒光定量即RT-PCR技術證明Avenin-like基因的時空表達模式,Avenin-like基因在根、莖、葉、花等其他組織中均無表達,但在胚乳中特異性表達。

        2 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因的啟動子研究

        2.1 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因啟動子的克隆和元件分析 基于類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因在胚乳中特異性表達的特性,2012年,宋斐等[22]對ALP type-B基因啟動子的克隆及其功能進行了研究。

        采用實時熒光定量PCR即RT-PCR分析發(fā)現(xiàn),ALP type-B基因在小麥胚乳中表達,但在根、莖、葉和花等其他組織中均無表達,表明ALP type-B基因的表達具有胚乳特異性。運用反向PCR技術,從小麥鄂恩1號中克隆得到ALP type-B基因的上游1.664 bp啟動子序列。應用PLACE和plantCARE等數(shù)據(jù)庫分析了該1.664 bp啟動子元件,發(fā)現(xiàn)該啟動子除具備啟動子的基本元件TATA-box、CAAT-box外,還含有胚乳特異性表達的元件,如GCN4元件、TGTAAAG元件、Skn-motif元件、AACA元件等[23](圖1)。

        基于對啟動子順式作用元件序列的生物信息學分析,為了進一步分析鑒定上述啟動子元件的作用,以載體pBI121為基本框架,構(gòu)建了包括ALP type-B基因上游1,664 bp序列及4個分別含有不同序列長度的5′端缺失啟動子序列999、785、550和290 bp在內(nèi)的5個雙元表達載體,并以其長度為基礎分別命名為載體pALP-17、pALP-10、pALP-8、pALP-6和pALP-3,表達載體的報告基因均是GUS基因(圖2)。

        2.2 類燕麥儲藏蛋白Avenin-like基因啟動子的特異性表達分析 將上述5個pALP-17、pALP-10、pALP-8、pALP-6和pALP-3雙元表達載體轉(zhuǎn)化于煙草中,獲得了轉(zhuǎn)基因植株,其中轉(zhuǎn)化pALP-3、pALP-8和pALP-10表達載體的轉(zhuǎn)基因煙草陽性植株各5株,轉(zhuǎn)化pALP-6表達載體的轉(zhuǎn)基因煙草陽性植株4株,轉(zhuǎn)化pALP-17表達載體的轉(zhuǎn)基因煙草陽性植株19株。

        對獲得的T0代陽性轉(zhuǎn)基因煙草植株進行GUS組織化學檢測,進行定性研究,其原理是報告基因GUS(β-葡聚糖苷酶)可將X-Gluc水解成藍色物質(zhì),因此具有GUS活性的部位或位點呈現(xiàn)藍色或藍色斑點,可用肉眼或顯微鏡觀察到。證實ALP type-B基因啟動子可驅(qū)動報告基因在煙草胚乳中表達,但在煙草其他組織如根、莖、葉和花中并未檢測到報告基因GUS基因的表達。然后對轉(zhuǎn)基因煙草進行GUS熒光定量分析,其中轉(zhuǎn)化有pALP-3的種子GUS活性達到273.06 nmol/(mg蛋白·hr),這個值是陰性對照種子[14.25 nmol/(mg蛋白·hr)]的近20倍,說明prolamin-box元件可以保持啟動子驅(qū)動報告基因在胚乳中本底水平的表達;同時研究證明隨著啟動子序列長度的增加,至-785 bp啟動子驅(qū)動報告基因達到最高GUS活性即447.86 nmol/(mg蛋白·hr),推測ESP-like元件與RY motif元件可能共同作用構(gòu)成一個強胚乳特異性上調(diào)元件;而后則逐漸降低直至173.68 nmol/(mg蛋白·hr),由此推測在-785 bp啟動子上游和下游,分別有較強的下調(diào)和上調(diào)順式作用元件,而G-box并未發(fā)揮其遠端上調(diào)作用[22]。

        3 需要進一步研究的工作

        對各顯著啟動子元件進行缺失突變分析和點突變分析,并對含有潛在的顯著上調(diào)、下調(diào)順式作用元件的區(qū)段進行更加精細地截取并進行轉(zhuǎn)基因研究。

        以轉(zhuǎn)基因小麥為材料,通過凝膠組織分析鑒定具有顯著上調(diào)、下調(diào)作用順式作用元件的特異結(jié)合蛋白,以期找到新的反式作用因子,為深入研究小麥胚乳特異性表達調(diào)控機制提供新方向。

        通過基因槍法將pALP-17載體轉(zhuǎn)入小麥,進一步明確該小麥ALP type-B基因啟動子在禾本科植物中的表達特性,為該啟動子在基因工程中的應用奠定基礎。

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