馬 猛,王克華 ,曲 亮,竇套存,沈曼曼,郭 軍,盧 建,胡玉萍
(1.江蘇省家禽科學(xué)研究所,江蘇 揚(yáng)州 225003;2.揚(yáng)州翔龍禽業(yè)發(fā)展有限公司,江蘇 揚(yáng)州 225200)
雞的開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量是影響蛋雞育種和生產(chǎn)的重要指標(biāo)。開(kāi)產(chǎn)日齡不僅影響蛋雞開(kāi)產(chǎn)后產(chǎn)蛋率上升的速度及產(chǎn)蛋高峰期的持續(xù)時(shí)間,而且對(duì)整個(gè)產(chǎn)蛋周期中的產(chǎn)蛋量也有一定的影響[1],開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的過(guò)大或者過(guò)小對(duì)蛋雞的蛋質(zhì)量和產(chǎn)蛋量均具有較大的影響[2-8]。有研究表明經(jīng)典的遺傳學(xué)方法只能在總體上對(duì)基因的效應(yīng)和作用方式進(jìn)行估計(jì),但是卻不能區(qū)分不同基因在效應(yīng)上的差別[9]。蓋鈞鎰等[10]、Zhang 等[11]、Wang 等[12]提出的主基因+多基因混合遺傳分析方法不僅能夠鑒別主基因,而且對(duì)多基因也可以進(jìn)行檢測(cè),且能夠估計(jì)出相應(yīng)的遺傳參數(shù)。本研究利用主基因+多基因混合遺傳模型來(lái)對(duì)綠殼蛋雞黑羽純系和白來(lái)航雞資源群體的開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量進(jìn)行分析,對(duì)蛋雞開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的遺傳規(guī)律進(jìn)行探討,確定開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的最適合模型,為蛋雞的育種提供一定的理論指導(dǎo)。
試驗(yàn)以黑羽綠殼蛋雞純系為親本P1,以白來(lái)航雞為親本P2,其中P1共109只,P2共66只,F(xiàn)1(P1♂×P2♀、P2♂×P2♀)代 513 只,F(xiàn)2[(P1♂×P2♀)♂×(P1♂×P2♀)♀、(P2♂×P1♀)♂×(P2♂×P1♀)♀]代1 744只。試驗(yàn)動(dòng)物均飼養(yǎng)于揚(yáng)州翔龍禽業(yè)發(fā)展有限公司,飼養(yǎng)管理?xiàng)l件一致,試驗(yàn)過(guò)程中每只雞均單籠飼養(yǎng)。
試驗(yàn)中記錄每個(gè)世代的每只母雞產(chǎn)下第1枚蛋的時(shí)間,開(kāi)產(chǎn)時(shí)間為雞產(chǎn)下第1枚蛋時(shí)間減去出雛時(shí)間;同時(shí)測(cè)量雞產(chǎn)下第1枚蛋時(shí)的體質(zhì)量,即為開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量。
試驗(yàn)所有數(shù)據(jù)均采用Excel 2003進(jìn)行統(tǒng)計(jì),用SPSS17.0進(jìn)行正反交群體間的t檢驗(yàn),用南京農(nóng)業(yè)大學(xué)研發(fā)的SEA-G4F2軟件包進(jìn)行主基因+多基因混合遺傳模型分析。
數(shù)據(jù)進(jìn)行分析前對(duì)F1和F2代的數(shù)據(jù)進(jìn)行正反交之間的比較,如果正反交之間差異顯著,則需要消除正反交效應(yīng)。
正交效應(yīng)=正交群體平均值-群體平均值(1)
反交效應(yīng)=反交群體平均值-群體平均值 (2)
用于分離分析的數(shù)據(jù)=原數(shù)據(jù)-正反交效應(yīng) (3)
利用P1、P2、F1和F23個(gè)世代進(jìn)行分離分析的遺傳模型共有五大類24個(gè)遺傳模型,其具體對(duì)應(yīng)的解釋見(jiàn)表1。
應(yīng)用蓋鈞鎰等[10]提出的主基因+多基因混合遺傳模型來(lái)進(jìn)行分離分析,通過(guò)極大似然法和IECM算法對(duì)混合分布中的有關(guān)成分分布參數(shù)做出估計(jì),然后對(duì)24個(gè)模型中AIC值(Akaike’s information criterion)進(jìn)行比較,選擇其中AIC值較小的相對(duì)應(yīng)的模型進(jìn)行適合性檢驗(yàn),然后確定出最適模型,根據(jù)最適模型的分析結(jié)果,估計(jì)其相應(yīng)的一階和二階遺傳參數(shù)。具體的最適模型的選擇和遺傳參數(shù)估計(jì)參照文獻(xiàn)[10]。適合性檢驗(yàn)共有5個(gè)統(tǒng)計(jì)量,即均勻性檢驗(yàn)U21、U22和U23,Smirnov檢驗(yàn)nW2和 Kolmigorov檢驗(yàn) Dn。
其中h2mg為主基因遺傳率,h2pg為多基因遺傳率。
表1 各個(gè)遺傳模型對(duì)應(yīng)的解釋Tab.1 Explain of each geneticalmodel
開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的次數(shù)分布見(jiàn)表2和表3,由表2,3知,2個(gè)親本的開(kāi)產(chǎn)日齡均要大于F1和F2代的開(kāi)產(chǎn)日齡,親本P1和P2開(kāi)產(chǎn)日齡的均值差異不顯著(P>0.05),F(xiàn)1和F2的開(kāi)產(chǎn)日齡均值均要小于親本的,說(shuō)明F1和F2代的開(kāi)產(chǎn)日齡具有超親遺傳。F2代的次數(shù)分布主要呈現(xiàn)單峰正態(tài)分布。開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的2個(gè)親本的開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的均值分別為1 102 g和1 320 g,親本P2的開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量明顯大于親本P1的開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量,F(xiàn)1和F2代的開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量分別為1 118 g和1 175 g,介于2個(gè)親本之間。F2的次數(shù)分布主要呈現(xiàn)出單峰偏態(tài)分布。
表2 開(kāi)產(chǎn)日齡的次數(shù)分布Tab.2 Frequency distributions for the age at first egg
表3 開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的次數(shù)分布Tab.3 Frequency distributions for the body weight at first egg
開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的各個(gè)模型及其所對(duì)應(yīng)的AIC值見(jiàn)表4。由表4可知,開(kāi)產(chǎn)日齡的所有模型中模型D、E和E-1的AIC值分別為20 915.84、20 865.8和20 954.48,選擇這3個(gè)模型作為期望模型,進(jìn)一步進(jìn)行適合性檢驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),模型D的適合性檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量有9個(gè)值達(dá)到了顯著水平,模型E有7個(gè)統(tǒng)計(jì)量達(dá)到了顯著性水平,模型E-1有13個(gè)統(tǒng)計(jì)量達(dá)到了顯著性水平,因此,根據(jù)最適模型的選擇標(biāo)準(zhǔn),選擇統(tǒng)計(jì)量顯著性個(gè)數(shù)較少的模型E作為最適模型,且模型E的AIC值最小,因此選擇模型E為開(kāi)產(chǎn)日齡的最適模型,即2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因混合遺傳模型。開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的24個(gè)模型中AIC值較小的模型為B-1、E和E-1,其對(duì)應(yīng)的AIC值分別為34 717.05、34 710.72和34 707.34,因此選擇模型B-1、E和E-1作為期望模型進(jìn)行下一步的適合性檢驗(yàn),檢驗(yàn)結(jié)果為模型B-1的檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量有2個(gè)達(dá)到了顯著性水平,模型E和E-1各有1個(gè)檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量達(dá)到了顯著性水平,但是模型E-1的AIC值最小,因此選擇模型E-1作為開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的最適模型,即2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因混合遺傳模型。開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的最適模型的適合性檢驗(yàn)見(jiàn)表5。
表4 開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量各個(gè)模型所對(duì)應(yīng)的AIC值Tab.4 The Akaike’s information criterion(AIC)values in each model for the age and body weight at first egg
表5 開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量最適模型的適合性檢驗(yàn)Tab.5 Tests for goodness-of-fit of bestmodel for the age and body weight at first egg
由表6可知,在開(kāi)產(chǎn)日齡的一階遺傳參數(shù)的估計(jì)中,2對(duì)主基因的加性效應(yīng)之間和顯性效應(yīng)之間差別很小,分別為6.25和6.25、-6.25和-6.20。AA 的加性效應(yīng)和 BB 的加性效應(yīng)相等,均為6.25,Bb 的顯性效應(yīng)和加顯效應(yīng)也相等,估計(jì)值均為-6.20;二階遺傳參數(shù)的估計(jì)中,總體方差為125.54,主基因的方差為31.46,多基因的方差較小,幾乎為0,主基因的遺傳率25.06%。在開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的一階遺傳參數(shù)中,2對(duì)主基因 AA 和 BB的加性效應(yīng)分別為593.23和585.51,Aa和 Bb的顯性效應(yīng)為-14.91和70.44,加加效應(yīng)和顯顯效應(yīng)分別為12.84和-70.95,加顯效應(yīng)和顯加效應(yīng)分別為-499.85和-581.89,多基因的加性效應(yīng)和顯性效應(yīng)分別為-1 287.39和-64.23。在二階遺傳參數(shù)中,總體的方差為31 787.27,主基因的方差為20 114.99,主基因的遺傳率為63.28%,2個(gè)性狀的主基因遺傳率均遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于多基因的遺傳率,說(shuō)明開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量主要是由主基因控制的。
表6 開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的遺傳參數(shù)估計(jì)Tab.6 Estimates of genetic parameters for the age and body weight at first egg
目前,關(guān)于主基因+多基因的應(yīng)用在植物數(shù)量性狀的遺傳研究上報(bào)道的較多[13-15],且有研究表明用QTL定位檢測(cè)出來(lái)的植物數(shù)量性狀的主基因的數(shù)量與用主基因+多基因混合遺傳模型分析出來(lái)的主基因?qū)?shù)是一樣的[16]。但是目前將該模型應(yīng)用于動(dòng)物數(shù)量性狀遺傳的研究報(bào)道較少,王克華等[17]用仙居雞和隱性白羽雞為素材對(duì)雞12周齡體質(zhì)量進(jìn)行主基因+多基因混合遺傳模型分析,認(rèn)為雞12周齡體質(zhì)量的最適模型為E-6模型。曲亮等[18-19]對(duì)雞的40周齡蛋質(zhì)量、冠長(zhǎng)、冠高和冠厚進(jìn)行主基因+多基因的遺傳模型分析,認(rèn)為40周齡蛋質(zhì)量、冠長(zhǎng)、冠高和冠厚的最適模型均為E模型。
本研究利用主基因+多基因混合遺傳模型對(duì)雞開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量進(jìn)行分析,結(jié)果表明開(kāi)產(chǎn)日齡的最適模型為模型E,即2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因混合遺傳模型,開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的最適模型為E-1,即2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因混合遺傳模型。開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的2對(duì)主基因的加性效應(yīng)均為正值,說(shuō)明開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量越大的個(gè)體對(duì)后代的影響較大。開(kāi)產(chǎn)日齡的2對(duì)主基因的加性效應(yīng)值之和與顯性效應(yīng)值之和相加基本可以抵消,但是開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的2對(duì)主基因和多基因的加性效應(yīng)之和遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于顯性效應(yīng)之和,說(shuō)明開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量主要受加性效應(yīng)的互作影響,其次才是顯性效應(yīng)的互作。開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的主基因遺傳率分別為25.06%和63.28%,這些主基因的發(fā)現(xiàn)以及加性、顯性、上位性等遺傳效應(yīng)的明確,對(duì)理解雞開(kāi)產(chǎn)日齡和開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的遺傳特征,指導(dǎo)雞的育種實(shí)踐具有重要意義。研究表明,雞開(kāi)產(chǎn)日齡的遺傳力為0.15~0.54,開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量遺傳力為0.18~0.56[20-26],與前人的研究結(jié)果相比,本研究的開(kāi)產(chǎn)日齡的遺傳力處于前人研究的范圍內(nèi),開(kāi)產(chǎn)體質(zhì)量的遺傳力要高于前人的研究,其原因可能是不同雞種和不同算法之間的差異造成的。
雖然主基因+多基因混合遺傳模型應(yīng)用很廣泛,但是還是有一定的局限,目前只能夠分析1~3對(duì)主基因的遺傳,而對(duì)于3對(duì)以上的主基因則不能夠進(jìn)行判別,但是其能夠計(jì)算出各個(gè)性狀的一階和二階遺傳參數(shù),這對(duì)數(shù)量性狀的遺傳效應(yīng)研究,與主基因緊密連鎖的分子標(biāo)記的發(fā)掘和分子標(biāo)記輔助選擇都能夠奠定一定的理論基礎(chǔ)。
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