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        COPD患者外周骨骼肌萎縮中的功能性蛋白組學(xué)的研究

        2015-04-29 00:00:00楊玉段麗芳
        醫(yī)學(xué)信息 2015年51期

        摘要:目的 對(duì)正常老年人、COPD患者無外周骨骼肌萎縮、COPD患者合并外周骨骼肌萎縮的蛋白電泳圖譜進(jìn)行配對(duì)分析比較,尋找差異蛋白質(zhì)點(diǎn)。方法 應(yīng)用質(zhì)譜鑒定技術(shù),對(duì)差異蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行鑒定。結(jié)論 經(jīng)相關(guān)文獻(xiàn)檢索,分析所鑒定的蛋白質(zhì)在COPD患者外周骨骼肌萎縮的關(guān)系,為今后新的治療靶點(diǎn)的研究奠定基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞:慢性阻塞性肺疾病;骨骼肌萎縮;蛋白質(zhì)

        近年來,慢性阻塞性肺疾?。╟hronic obstructive pulmonary disease,COPD)的發(fā)病率和病死率正逐年增加,不是一種單純的肺部疾病,而是可以累及引起全身炎癥、心血管系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、骨骼肌萎縮、骨質(zhì)疏松等具有廣泛的肺外損傷的全身疾病,尤其是不明原因的骨骼肌萎縮和體重減輕及功能障礙[1]。分析與肌肉萎縮相關(guān)的關(guān)鍵蛋白質(zhì)及其功能可能對(duì)治療具有重要的臨床指導(dǎo)意義。

        1 資料與方法

        1.1蛋白質(zhì)取材 30例老年人,年齡均在70~90歲,無COPD組(正常組)10例,COPD患者無外周骨骼肌萎縮組(無萎縮組)10例,COPD患者存在外周骨骼肌萎縮組(萎縮組)10例,分別取髕骨上15cm股四頭肌的外側(cè)肌;所有肌肉樣品,在切取后立刻用冰的PBS沖洗,去掉組織中殘留的血液等,剪成碎片置于1.5ml Eppenderf管中,并儲(chǔ)存于-80℃。

        1.2方法

        1.2.1蛋白質(zhì)的制備:將收集完的樣品,用電子天平稱取等重量樣品(50mg)用預(yù)冷的0.01 mol·L-1PBS:(磷酸鹽緩沖液)洗滌3次,預(yù)冷的蒸餾水洗滌1次,出去渣滓,在液氮中制動(dòng)研磨至粉末狀,加適量裂解液充分混勻,在4℃冰浴靜置15min,冰浴超聲、離心,后取上清,用bradford法測其標(biāo)本的濃度,分別取樣本量1000μg均于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2雙向凝膠電泳、染色劑脫色:第一向等點(diǎn)聚焦:從冰箱中取出IPG(17mm PH3-10)預(yù)制膠條分成三組,經(jīng)過與溶脹緩沖液充分混合、稀釋、過濾、蒸發(fā)制成膠條立即進(jìn)行平衡、第二向SDS-PAGE電泳。第二向SDS-PAGE電泳:拿出膠條放在平衡緩沖液Ⅰ中水平緩慢搖動(dòng)平衡,再轉(zhuǎn)移至平衡緩沖液Ⅱ中水平緩慢搖動(dòng)平衡等一系列處理后凝膠,進(jìn)行染色、脫色。

        1.2.3蛋白圖象采集與分析:染色、脫色完成后的雙向電泳凝膠,用凝膠圖像掃描儀透射掃描獲得圖像,發(fā)送圖象至ImageMaster的軟件分析程序進(jìn)行下一步凝膠圖象的分析。蛋白質(zhì)斑點(diǎn)檢測,調(diào)整峰值、邊緣以及利用子模式中的增刪、分割等找出代表同一蛋白質(zhì)的點(diǎn),以比較不同凝膠中的蛋白表達(dá)情況。

        1.2.4膠內(nèi)酶切和質(zhì)譜分析:選擇雙向凝膠電泳匹配后找到的差異非常顯著的蛋白點(diǎn)自動(dòng)匹配,將電泳后凝膠中差異非常顯著的蛋白點(diǎn)切出,反復(fù)清洗,脫色后的膠塊在真空離心干燥機(jī)內(nèi)干燥,使膠塊完全脫水體積縮小成近似球狀,離心干燥。所有的PMF質(zhì)譜圖MALDI-TOF-MS分析,通過PMF鑒定蛋白質(zhì)可以根據(jù)分子量、等電點(diǎn)、肽段匹配數(shù)、尋找匹配的相關(guān)蛋白質(zhì)。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 應(yīng)用SPSS11.5統(tǒng)計(jì)軟件包方差分析及顯著性t 檢驗(yàn)。進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,數(shù)據(jù)均用(x±s)表示,P值<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1蛋白質(zhì)的濃度測定結(jié)果 經(jīng)過Bradford法測得樣本蛋白質(zhì)的濃度為,正常組8.31μg/μl,非萎縮組:10.61μg/μl,萎縮組9.54μg/μl。

        2.2雙向凝膠電泳圖 見圖1。

        2.3差異表達(dá)蛋白 根據(jù)蛋白點(diǎn)的面積、灰度值及光密度值等參數(shù),用ImageMaster2D Platinum Software軟件對(duì)正常組、萎縮組、非萎縮組蛋白圖譜進(jìn)行分析比較,發(fā)現(xiàn)COPD患者蛋白圖譜中有17個(gè)蛋白斑點(diǎn)表達(dá)量與正常組有顯著差異(差異為Vol%值上調(diào)或下調(diào)2倍以上),用胰蛋白酶消化后,進(jìn)行MALDI-TOF-MS檢測,得到肽質(zhì)量指紋譜。徑Mascot查詢SWISSPROT數(shù)據(jù)庫,結(jié)合2-DE凝膠上蛋白點(diǎn)的分子量和等電點(diǎn),得分超過66分(P<0.05)將被認(rèn)為是可靠鑒定的結(jié)果,其中有10個(gè)超過66分,推測功能性蛋白可能為烯醇酶-1,碳酸脫水酶(碳酸脫水酶Ⅲ),肌鈣蛋白T和幾種血紅蛋白。

        3 討論

        通過蛋白組學(xué)的方法比較正常組、非萎縮組、萎縮組的蛋白表達(dá)量的差異,本實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)幾個(gè)功能性蛋白表達(dá)量在三組中有著明顯的差異。以下將逐一詳細(xì)討論。

        3.1烯醇酶-1(ENO1) 烯醇酶-1,是一種存在于肌肉等組織里的酶,在碳水化合物的新陳代謝中起著重要作用。在糖類的發(fā)酵、酵解中,此能量通過丙酮酸激酶的作用用于ATP的生成;還能與細(xì)胞骨架蛋白和多聚核苷酸結(jié)合[1-2],是纖溶酶原、層粘連蛋白的受體等[3],ENO1作為纖維蛋白溶酶原受體、纖維蛋白溶酶原結(jié)合蛋白,將纖維蛋白溶酶原結(jié)合于細(xì)胞周圍并促其活化,活化的纖維蛋白溶酶原發(fā)揮其蛋白水解酶的作用,激活纖溶酶其表達(dá)增加將使成肌細(xì)胞表面纖溶酶的產(chǎn)生增加。在本研實(shí)驗(yàn)究中,我們發(fā)現(xiàn)無論是非萎縮組還是萎縮組表達(dá)量都是上調(diào)的;推測可能在患者在長期慢性缺氧時(shí),出現(xiàn)有氧呼吸的ATP能量生成不足,使得烯醇酶-1表達(dá)量增加來促進(jìn)ATP生成,這是與COPD患者氧通氣不足引起的無氧呼吸糖酵解是相吻合的;當(dāng)缺氧進(jìn)一步加重時(shí),可能出現(xiàn)烯醇酶啟動(dòng)纖溶酶系統(tǒng)開始分解骨骼肌肌纖維,來滿足能量的不足,進(jìn)而引起骨骼肌纖維的減少,即發(fā)生骨骼肌的萎縮;國內(nèi)外并未見有關(guān)于COPD患者骨骼肌蛋白酶在調(diào)節(jié)骨骼肌萎縮上報(bào)道,可能還存在其他途徑能使該蛋白酶在表達(dá)量上的變化,其具體途徑仍需要進(jìn)一步的研究,分析該蛋白酶在調(diào)節(jié)骨骼肌蛋白分解及代謝上的分子機(jī)制。

        3.2碳酸脫水酶Ⅲ(CAⅢ) 碳酸脫水酶Ⅲ是碳酸苷酶的一種,它們都具有共同的主要功能:①在血液及其他組織中維持酸堿平衡;②幫助體內(nèi)組織排除二氧化碳;③確保以CO2和HCO3-為催化底物的酶保持適度的底物濃度,參與體內(nèi)酸堿平衡調(diào)節(jié)及離子交換等過程起重要的作用;碳酸酐酶是紅細(xì)胞的主要蛋白質(zhì)成分之一,在紅細(xì)胞中的地位僅次于血紅蛋白;本實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析發(fā)現(xiàn),存在有兩種形式碳酸脫水酶同工酶,根據(jù)肽段的匹配更接近與碳酸酐酶Ⅲ(CAⅢ)的結(jié)構(gòu),CAⅢ肽鏈均由259個(gè)氨基酸組成;就目前的了解,CAⅢ除上述功能外,可能存在的生理作用主要有3點(diǎn):①由于CAⅢ具有水化酶的功能,因此可以促進(jìn)將I型肌纖維代謝過程中產(chǎn)生的CO2運(yùn)送出細(xì)胞;②由于CAⅢ具有磷酸酶活性,它可能參與細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo);③由于肝臟,脂肪細(xì)胞和骨骼肌的功能均與能量代謝有關(guān)。研究還發(fā)現(xiàn),在重癥肌無力患者的骨骼肌上測得CAⅢ蛋白的表達(dá)水平明顯減少[4]。對(duì)于重癥肌無力骨骼肌中CAⅢ蛋白缺乏的認(rèn)識(shí),其可能與骨骼肌的易疲勞和收縮無力有關(guān)[5]。本研究結(jié)果分析,CAⅢ均在非萎縮組及萎縮組都明顯的升高,當(dāng)在copd患者中,推測原因有兩種,①由于CO2的儲(chǔ)留引起碳酸的升高,故體內(nèi)的PH降低,機(jī)體為調(diào)解體內(nèi)的酸堿平衡,促進(jìn)CAⅢ的生成來維持機(jī)體的酸堿平衡,促進(jìn)CO2排除細(xì)胞外而維持體內(nèi)酸堿平衡;②由于患者的運(yùn)動(dòng)耐力減弱、骨骼肌收縮力減弱,機(jī)體為增加肌肉收縮力而對(duì)CAⅢ增加的調(diào)節(jié),來抵抗肌力的下降;這一點(diǎn)與上述理論是相吻合的,另外CAⅢ還具有磷酸酶的活性,磷酸酶是細(xì)胞信號(hào)傳到的一種重要的酶,故CAⅢ是否在信號(hào)傳導(dǎo)上存在對(duì)骨骼肌的調(diào)節(jié)?是否還參與copd患者外周骨骼肌蛋白的分解等的作用分子機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。

        3.3肌鈣蛋白T(TnT) 肌鈣蛋白位于肌纖維之中,是橫紋肌收縮的重要調(diào)節(jié)蛋白,是調(diào)節(jié)Ca2+的可逆作為肌肉收縮離合開關(guān)。肌鈣蛋白T(TnT)是肌鈣蛋白其中1個(gè)亞基,在骨骼肌收縮和舒張過程中起重要調(diào)節(jié)作用,與原肌球蛋白結(jié)合,是肌肉的主要調(diào)節(jié)蛋白;本實(shí)驗(yàn)研究慢肌中的肌鈣蛋白T同工型在非萎縮組和萎縮組均有明顯的升高,但在后期發(fā)生骨骼肌萎縮時(shí),肌鈣蛋白T有所下降,但還高于正常組,根據(jù)以上的理論與實(shí)驗(yàn)結(jié)果綜合分析認(rèn)為在copd初期未發(fā)展到骨骼肌萎縮時(shí),骨骼肌收縮與舒張較正常下降,機(jī)體為抵抗骨骼肌功能的減弱,增加肌鈣蛋白T同工型來結(jié)合鈣離子增加粗肌絲與細(xì)肌絲的運(yùn)動(dòng),增加骨骼肌的運(yùn)動(dòng)耐力,維持正常運(yùn)動(dòng)。推測copd患者缺氧逐漸加重、病情逐漸發(fā)展,合成ATP進(jìn)一步的減少,甚至發(fā)展到合成ATP不足,引起骨骼肌蛋白的分解來彌補(bǔ)供能的不足,即骨骼肌纖維的減少,發(fā)生萎縮,故肌鈣蛋白T較前有所下降;但在研究肌鈣蛋白T在骨骼肌上的很少,是否也存在骨骼肌的壞死、降解等機(jī)制仍不清楚,其分子機(jī)制還待進(jìn)一步的研究。

        總之,目前工作證明了使用蛋白質(zhì)組學(xué)分析骨骼肌萎縮相關(guān)蛋白質(zhì)的可行性和有效性。本研究方法及結(jié)果將給人的骨骼肌肌肉萎縮原因帶來的可能理解,并能對(duì)臨床診斷或者藥物發(fā)現(xiàn)的潛在目的,篩選一些\"疾病特異蛋白\"提供幫助。

        參考文獻(xiàn):

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