王東方,曹 慧
(山東省高校生物化學(xué)與分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 濰坊學(xué)院,山東 濰坊 261061)
程序性死亡或細(xì)胞凋亡(programed cell death,PCD)是多細(xì)胞生物體中一些細(xì)胞所采取的一種由自身基因調(diào)控的主動(dòng)死亡方式[1]。近年來隨著動(dòng)物和醫(yī)學(xué)中細(xì)胞凋亡的深入研究,植物的PCD 研究也成為植物學(xué)研究的熱點(diǎn)領(lǐng)域。許多研究表明,在眾多的環(huán)境脅迫例如干旱、高低溫和鹽堿脅迫下半胱氨酸蛋白酶mRNA 會(huì)積累[2-3],在植物發(fā)生PCD 的某些發(fā)育階段過程中半胱氨酸蛋白酶mRNA 也會(huì)增加,這說明半胱氨酸蛋白酶(Caspase)與植物發(fā)生PCD 有關(guān)[4]。
半胱氨酸天冬氨酸特異性蛋白酶(cysteinyl aspartate specific proteinase,Caspase),是一組與細(xì)胞因子成熟和細(xì)胞凋亡有關(guān)的蛋白,是富含半胱氨酸的一類蛋白酶家族,它們的活性位點(diǎn)均包含半胱氨酸殘基,能夠在靶蛋白的特異天冬氨酸殘基部位進(jìn)行切割,從而造成細(xì)胞凋亡。Caspase蛋白家族是細(xì)胞自殺機(jī)制的主要“執(zhí)行者”,Caspase蛋白家族一旦被激活后便不可逆的啟動(dòng)細(xì)胞死亡程序的執(zhí)行階段[5]。Caspase以前體形式合成,Caspase前體是由兩個(gè)亞單位組成的異二聚體,每個(gè)有活性的Caspase均來自于兩個(gè)前體的加工與結(jié)合,其后再形成異四聚體。Caspase活化經(jīng)兩次裂解,裂解位點(diǎn)均在天冬氨酸羥基端肽鍵,蛋白酶前體被切斷成三部份,H2N-端是抑制區(qū)域被移去,另一端COOH-端斷裂成一大一小亞單位稱為死亡區(qū)域,在每個(gè)二聚體內(nèi)大小亞單位相嵌形成一個(gè)以p片層組成的核心,兩側(cè)有α螺旋,兩大兩小亞單位再結(jié)合成活化酶,該四聚體在分子對(duì)應(yīng)的兩端有兩個(gè)活性位點(diǎn),可作用于其自身和其他Caspase酶原,按順序依次激活Caspase,形成信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制的酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)[6-7]。這種連鎖反應(yīng)的進(jìn)行有賴于Caspase的調(diào)節(jié)蛋白、輔助因子、反饋關(guān)系和閾限等控制。
Caspase有多種,多數(shù)和凋亡有關(guān),少數(shù)和炎癥有關(guān)[8]。根據(jù)Caspase在級(jí)聯(lián)反應(yīng)上下游的位置及功能的不同可將Caspase家族大致分為兩種類型:I型Caspase,又稱為啟動(dòng)型Caspase(Initiator Caspase),包括Caspase-2、Caspase-8、Caspase-9、Caspase-10等,位于Caspase級(jí)聯(lián)反應(yīng)的最上游,能在其他蛋白輔助因子的參與下發(fā)生自我活化并激活下游的Caspase;Ⅱ型Caspase,又稱為執(zhí)行型Caspase(Executioner Caspase),包括Caspase-3、Caspase-6、Caspase-7等,其作用在于特異性地裂解底物使細(xì)胞發(fā)生生化及形態(tài)學(xué)改變,最終導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。除此之外,還有一類Caspase包括Caspase-1、Caspase-4、Caspase-5、Caspase-13、Caspase-14等,主要參與細(xì)胞因子介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)并在死亡受體介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡途徑中起輔助作用[9]。
Caspase的研究源于線蟲(C.elegans)細(xì)胞程序化死亡的研究,是哺乳動(dòng)物PCD 啟動(dòng)和執(zhí)行階段的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,植物中雖然沒有分離出caspase基因,但是在植物細(xì)胞死亡過程中檢測(cè)到caspase活性的提高,已有證據(jù)表明植物細(xì)胞凋亡過程中發(fā)生半胱氨酸蛋白酶的活化,推測(cè)其分子結(jié)構(gòu)與動(dòng)物不同,在PCD中執(zhí)行的功能也可能不同[10]。用動(dòng)物Caspase活性分析試劑盒檢測(cè)到湖北海棠根系存在Caspase-3或Caspase-7活性[11];研究蘋果砧木新疆野蘋果和平邑甜茶細(xì)胞程序性死亡時(shí),通過蛋白免疫印跡實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)干旱脅迫條件下兩種蘋果葉片都有類Caspase-3蛋白酶的發(fā)生,而根中沒有,通過Western bolt檢測(cè)出類Caspase-3的分子量大約是40KD,比動(dòng)物的類Caspase-3的分子量(32KD)大8KD 左右[12]。
序列分析表明,在擬南芥基因組中,沒有編碼Caspase酶類的基因,但是在正在死亡的植物細(xì)胞中可以檢測(cè)到Caspase活性的升高,說明植物細(xì)胞程序性死亡過程依靠的是具有Caspase酶活性的其它種類的蛋白酶?;蚪M序列比對(duì)表明,植物中的某些序列編碼的蛋白酶與Caspase在空間結(jié)構(gòu)上具有一定的相似性,而且常用的Caspase酶類抑制劑可抑制其活性。在用menadione誘導(dǎo)煙草原生質(zhì)體細(xì)胞程序性死亡的研究中發(fā)現(xiàn),Caspase的抑制劑Ac-DEVD-CHO 和Ac-YVAD-CHO 可以阻止DNA 的斷裂和PARP(poly-(ADP-ribose)polymerase)的降解[13]。目前,植物中已鑒定出來的半胱氨酸蛋白酶可以分為三類,其中豆類天冬氨酸蛋白內(nèi)切酶(1egumain)家族的液泡加工酶(vacuolar processing enzymes,VPEs)和metacaspase屬于半胱氨酸內(nèi)肽酶,它們?cè)诎被嵝蛄屑翱臻g結(jié)構(gòu)上與Caspase具有相似性,是Caspase的同系物;絲氨酸內(nèi)肽酶(saspases)屬于枯草桿菌絲氨酸蛋白酶,可以裂解人工合成的Caspase底物。最近的研究表明,VPEs、metacaspase和saspases在植物細(xì)胞程序性死亡過程中均起到類似Caspase酶類的關(guān)鍵性調(diào)控作用,參與調(diào)控植物PCD。
與動(dòng)物細(xì)胞凋亡重要組分Caspase相似,植物半胱氨酸蛋白酶也參與植物細(xì)胞死亡的調(diào)控。Poly(ADP-ribose)polymerase(PARP)參與H2O2誘導(dǎo)的植物PCD,而植物PARP的降解依賴于細(xì)胞色素C釋放到胞質(zhì)中,可被特異的Caspase-3抑制劑所抑制[14]。
動(dòng)植物中的半胱氨酸蛋白酶的區(qū)別主要有以下兩點(diǎn):(1)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的定位不同,植物半胱氨酸蛋白酶定位于液泡和細(xì)胞壁,葉綠體中的半胱氨酸蛋白酶可以降解Rubisco,而動(dòng)物Caspase蛋白酶活性僅存在于細(xì)胞質(zhì)中,而不存在于液泡中;(2)同源性較低,研究表明,植物中的半胱氨酸蛋白酶從基因編碼到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能與動(dòng)物Caspase蛋白家族相比均呈現(xiàn)出較低的同源性,所以對(duì)植物中是否真正存在與動(dòng)物相似的由半胱氨酸蛋白家族介導(dǎo)的PCD 調(diào)控與執(zhí)行機(jī)制還存在爭(zhēng)議。
盡管對(duì)于半胱氨酸蛋白酶如何被生長(zhǎng)發(fā)育或外部刺激信號(hào)激活,以及其如何參與調(diào)控細(xì)胞死亡的具體過程還不清楚,但關(guān)于半胱氨酸蛋白酶,已經(jīng)從許多植物中成功的分離出其編碼基因,根據(jù)植物半胱氨酸蛋白酶的基因表達(dá)特點(diǎn)可將其分為三類。
2.3.1 存在于植物正常發(fā)育過程中或在植物某些特殊時(shí)期表達(dá)的半胱氨酸蛋白酶
Carne和Moore從中華獼猴桃(Actinidia chinensis)果實(shí)中分離到了一種半胱氨酸蛋白酶,并得到了其氨基酸序列,即actinidain[15]。Mbeguie等在研究杏樹果實(shí)成熟時(shí)發(fā)現(xiàn)一個(gè)編碼半胱氨酸蛋白酶基因高度表達(dá),并成功提取其mRNA,為今后的研究提供了基礎(chǔ)[16]。Lee等分離到水稻半胱氨酸蛋白酶基因OsCP1,通過表達(dá)模式分析發(fā)現(xiàn)OsCP1基因在水稻花藥絨氈層及未成熟的花藥中表達(dá),T-DNA 插入突變體分析發(fā)現(xiàn)其主要參與水稻花粉發(fā)育過程[17]。嚴(yán)秀蕊等在水稻發(fā)育過程中發(fā)現(xiàn)半胱氨酸蛋白酶相關(guān)基因OsCP2,其也在水稻花藥絨氈層及未成熟的花藥中表達(dá),且只在花粉發(fā)育的空泡花粉時(shí)期到成熟時(shí)期進(jìn)行表達(dá)[18]。張紅巖等采用SSH(Suppression subtractive hybridization)和Race-PCR(Rapid-amplification of cDNA ends)技術(shù)克隆得到來自甘藍(lán)型油菜(Brassica napus L.)矮化突變體‘NDF-1’的一個(gè)半胱氨酸蛋白酶相關(guān)基因Bncp5,相對(duì)定量RT-PCR 檢測(cè)表明此基因具有組織表達(dá)特異性[19]。Tripathi在玫瑰花瓣脫落過程中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄激活一個(gè)37KD 的伴隨乙烯反應(yīng)的半胱氨酸蛋白酶基因RbCP1,該基因與蛋白質(zhì)的降解過程聯(lián)系密切[20]。張國(guó)林等在花生果種皮中發(fā)現(xiàn)一個(gè)半胱氨酸蛋白酶基因AhPSG13,RT-PCR 檢測(cè)表明該基因在果種皮中特異表達(dá)[21]。
2.3.2 在生物脅迫和非生物脅迫條件下誘導(dǎo)表達(dá)的半胱氨酸蛋白酶
在對(duì)擬南芥的逆境研究中發(fā)現(xiàn)了RD(responsive to dehydration)系列基因,包括rd19A 和rd21A 以及rd29A/cor78/lit78[22]。RD 系列基因已經(jīng)成為逆境研究中的重點(diǎn),對(duì)于逆境信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)路徑的交叉研究具有重要意義。臧慶偉以水分脅迫24h的cDNA 文庫中WSI-V-F10克隆的EST 為基礎(chǔ),通過RACE方法獲得了小麥半胱氨酸蛋白酶基因TaCP(AY841792)[23]。朱家紅從橡膠樹膠乳中克隆了一個(gè)半胱氨酸蛋白酶基因HbCP1(DQ642886),半定量RT-PCR 結(jié)果顯示,乙烯和傷害誘導(dǎo)膠乳HbCP1基因的表達(dá),推測(cè)膠乳中的HbCP1 蛋白可能具有防御功能[24]。曹慧等在蘋果屬植物八棱海棠中也克隆到了Caspase基因[25]。
2.3.3 在衰老的植物器官表達(dá)量增加或在衰老時(shí)期特異表達(dá)的半胱氨酸蛋白酶
由于衰老也是一種主動(dòng)的、內(nèi)在因子調(diào)控的有序過程,并且與細(xì)胞死亡相關(guān),有時(shí)將衰老視為程序化死亡過程[26]。在各種衰老的植物器官中分離到了許多編碼半胱氨酸蛋白酶的基因,它們被稱作衰老相關(guān)基因SAG(senescence associated genes),如擬南芥的SAG2和SAG12,玉米的See1和See2,油菜的LSC7和LSC790[27],番茄的Cyp23[28]和煙草的NTCP223[29],這些基因在衰老的葉片中均被上調(diào)。王勇等在研究大豆葉片衰老過程中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)半胱氨酸蛋白酶相關(guān)基因,其在衰老的葉片中特異性表達(dá)[30]。沈法富等從遼棉9號(hào)衰老葉片中克隆了編碼半胱氨酸蛋白酶的cDNA,命名為Ghcysp(AY604196),基因表達(dá)分析表明,該基因在棉花的根、下胚軸、花、胚珠和幼葉中不表達(dá),而在棉花的衰老葉片中特異性表達(dá)[31]。朱海生等在草莓中克隆島半胱氨酸蛋白酶基因FaCP,并發(fā)現(xiàn)隨著衰老程度的增加,F(xiàn)aCP 基因表達(dá)量逐漸增加,特別在衰老后期,顯著上升[32]?;ㄒ嘶ò晁ダ线^程中半胱氨酸蛋白酶比對(duì)照也有顯著表達(dá)[33]。
半胱氨酸蛋白酶作為一類重要的蛋白酶家族,廣泛參與植物的各種生理過程。半胱氨酸蛋白酶參與貯藏蛋白的降解,在響應(yīng)逆境脅迫時(shí)負(fù)責(zé)蛋白的周轉(zhuǎn);參與響應(yīng)病菌侵襲時(shí)的超敏反應(yīng);參與木質(zhì)部分化和器官衰老引發(fā)的PCD。半胱氨酸蛋白酶基因不僅與植物的衰老相關(guān),同時(shí)也參與信號(hào)傳導(dǎo)響應(yīng)外界環(huán)境中的生物和非生物脅迫[14,34]但在植物響應(yīng)非生物脅迫和生物脅迫以及器官分化和衰老的過程中,半胱氨酸蛋白酶的功能仍不夠明確,caspase酶類在植物中的真正功能還不清楚,有關(guān)植物細(xì)胞程序性死亡蛋白酶的研究尚處于起始階段,但隨著動(dòng)物細(xì)胞凋亡研究的深入,將會(huì)進(jìn)一步揭示植物細(xì)胞程序性死亡中caspase酶類作用機(jī)理和機(jī)制。
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