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        高溫木質(zhì)素分解菌的分離、篩選及鑒定

        2015-03-19 06:43:56亮,林寧,闞
        安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年33期
        關(guān)鍵詞:產(chǎn)酶過(guò)氧化物初篩

        張 亮,林 寧,闞 立

        (1.南京師范大學(xué)泰州學(xué)院化學(xué)與生物工程學(xué)院,江蘇泰州225300;2.泰州機(jī)電高等職業(yè)技術(shù)學(xué)校,江蘇泰州225300)

        木質(zhì)素是由苯丙烷結(jié)構(gòu)單元通過(guò)醚鍵和碳碳鍵連接而成的聚酚類(lèi)三維網(wǎng)狀高分子芳香族化合物,是構(gòu)成植物細(xì)胞的主要物質(zhì),約占植物體干重的20%。它是非常豐富的碳素資源[1]。據(jù)估測(cè),全球每年可產(chǎn)生約6×1014t木質(zhì)素,主要存在于農(nóng)作物廢棄秸桿和工業(yè)造紙材料中。木質(zhì)素分子空間三維結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜,在自然界中很難被微生物分解利用[2]。因此,高效降解木質(zhì)素,使其資源化,日益引起人們的重視。

        目前,木質(zhì)素的微生物分解是由真菌、細(xì)菌等各種微生物群落共同作用的結(jié)果[3]。其中,木質(zhì)素的微生物分解研究主要集中在以白腐真菌為代表的真菌上。白腐真菌能夠分泌胞外氧化酶降解木質(zhì)素,包括木質(zhì)素過(guò)氧化物酶(Lignin peroxidase,LiP)、錳過(guò)氧化物酶(Manganesedependent peroxidase,MnP)和漆酶(Laccase),因此,它被認(rèn)為是最主要的木質(zhì)素降解微生物。雖然白腐真菌具有較好的分解效果,但是它生長(zhǎng)緩慢、產(chǎn)酶量低的特點(diǎn)使其難以推廣到工業(yè)化生產(chǎn)應(yīng)用。因此,有必要尋找新途徑來(lái)實(shí)現(xiàn)木質(zhì)素的快速分解。在木質(zhì)素的降解過(guò)程中,細(xì)菌發(fā)揮一些關(guān)鍵性作用,如支鏈的改性、環(huán)開(kāi)裂和解聚等,并且由于細(xì)菌的生長(zhǎng)周期短,易培養(yǎng),適合大規(guī)模生產(chǎn)應(yīng)用。因此,細(xì)菌在木質(zhì)素分解中的作用不容忽視[4]。

        在細(xì)菌分解木質(zhì)素的研究中,對(duì)木質(zhì)素有降解能力較強(qiáng)的細(xì)菌主要包括鏈霉菌(Streptomyces)、節(jié)桿菌(Arthrobacter)、小單孢菌(Micromonospora)等放線(xiàn)菌,還有假單胞菌(Pseudomonas)、黃桿菌(Flavobacterium)等非絲狀細(xì)菌[5]。這些細(xì)菌能夠分解不同聚合形態(tài)的木質(zhì)素,在木質(zhì)素降解的不同階段發(fā)揮作用。但是,白腐菌、黃孢原毛平革菌、部分細(xì)菌等屬于低溫木質(zhì)素降解菌。雖然降解木質(zhì)素能力強(qiáng),但農(nóng)作物秸稈發(fā)酵溫度較高。這些菌在高溫條件下不易存活,在此特殊環(huán)境中對(duì)木質(zhì)素的降解率非常低,因此篩選高溫、產(chǎn)酶活性強(qiáng)、發(fā)酵周期短的木質(zhì)素分解菌具有重要意義。以新鮮馬糞為供試材料,筆者篩選出高溫木質(zhì)素分解菌,并且對(duì)其產(chǎn)酶活性進(jìn)行測(cè)定,通過(guò)16SrDNA測(cè)序?qū)δ康木赀M(jìn)行鑒定,以期為木質(zhì)素分解菌的選育和菌劑的制備提供菌種資源。

        1 材料與方法

        1.1 菌種來(lái)源 對(duì)采自泰州市動(dòng)物園新鮮的馬糞進(jìn)行分離、獲取。

        1.2 培養(yǎng)基 菌種篩選培養(yǎng)基(BM培養(yǎng)基)組成為:酵母浸出液 10 g,葡萄糖 20 g,木質(zhì)素 2.5 g,瓊脂 15 g,水 1 000 ml,pH 7.0。產(chǎn)酶培養(yǎng)基(LB液體培養(yǎng)基)組成為:酵母膏5 g,胰蛋白胨 10 g,氯化鈉10 g,水 1 000 ml,pH 7.0。

        1.3 菌種的分離與篩選

        1.3.1 初篩。將采集到的樣品在LB培養(yǎng)基中富集后,采用平板梯度稀釋法,吸取0.2 ml菌懸液均勻涂布在BM培養(yǎng)基上,在55℃條件下培養(yǎng)2~3 d,觀察透明圈的大小,并且記錄其直徑。

        1.3.2 復(fù)篩。挑取產(chǎn)生透明圈直徑較大菌株的一個(gè)單菌落,接種到產(chǎn)酶培養(yǎng)基中培養(yǎng)過(guò)夜后,離心,上清液即為粗酶液,在BM培養(yǎng)基中打若干小孔,每個(gè)孔加入100μl粗酶液,55℃培養(yǎng)4 h,然后用濃度1%三氯化鐵和鐵氰化鉀按照1∶1配制(現(xiàn)配現(xiàn)用),染色約30 min,用濃度0.9%生理鹽水脫色,觀察透明圈的大小,并且記錄。篩選出4株透明圈直徑較大的菌株,保存于LB固體培養(yǎng)基中,備用。

        1.4 粗酶液的制備及活性測(cè)定 從LB固體培養(yǎng)基挑取菌種,接種于50 ml的LB培養(yǎng)基中,55℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜。從種子培養(yǎng)基中吸取5μl,轉(zhuǎn)接于5 ml種子培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至OD到0.6左右。12 000 r/min,離心5 min,上清液即為粗酶液,4℃保藏,備用,測(cè)定相關(guān)酶活[6]。

        (1)漆酶的測(cè)定。向20 ml的反應(yīng)體系中加入18.6 ml的50 mmoL/L的乙酸-乙酸鈉緩沖液(pH 4.5),將其在25℃預(yù)熱10 min后,加入0.4 ml的10 mmol/L的愈創(chuàng)木酚和1 ml的粗酶液,在反應(yīng)溫度為25℃時(shí)測(cè)定465 nm處吸光度的增加。每分鐘內(nèi)氧化1.0μmol愈創(chuàng)木酚所需酶量為一個(gè)酶活力單位。

        (2)木質(zhì)素過(guò)氧化物酶的測(cè)定。向3 ml反應(yīng)體系中加入1.5 ml 125 mmol/L 酒石酸(pH 3.0)、10 mmoL/L 藜蘆醇1.0 ml、10 mmol/L 過(guò)氧化氫0.1 ml、粗酶液0.4 ml,加入過(guò)氧化氫后啟動(dòng)反應(yīng),在310 nm處測(cè)定吸光度的增加。每分鐘內(nèi)氧化1.0μmol藜蘆醇所需酶量為一個(gè)酶活力單位。

        (3)錳過(guò)氧化物酶的測(cè)定。反應(yīng)體系中含有50 mmol/L乳酸鈉緩沖液(pH 4.5)3.4 ml、1.6 mmol/L 硫酸錳溶液 0.1 ml、粗酶液0.4 ml,預(yù)熱至 37 ℃ 后加入 1.6 mmol/L 雙氧水0.1 ml啟動(dòng)反應(yīng),在室溫條件下測(cè)定240 nm處紫外光反應(yīng)3 min時(shí)OD的改變。每分鐘內(nèi)氧化1.0μmol的Mn2+轉(zhuǎn)化成Mn3+所需酶量為一個(gè)酶活力單位。

        1.5 目的菌株的鑒定 采用CTAB法提取細(xì)菌總DNA[7];分別利用細(xì)菌16SrDNA通用引物F27/R1492進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系(20μl):DNA模板3μl;PCR樣液10μl;27F(20 μmol/L)0.8 μl;1495F(20 μmol/L)0.8 μl;ddH2O5.4 μl。PCR條件為:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,52℃退火30 s,72 ℃ 延伸 1.5 min,30 個(gè)循環(huán),72 ℃ 延伸 10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)試劑盒純化后,送南京金斯瑞生物科技有限公司測(cè)序。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌株的初篩 利用BM培養(yǎng)基初篩和復(fù)篩后,從馬糞中分離出產(chǎn)生透明圈較大的4株細(xì)菌。透明圈直徑見(jiàn)表1,其中X-2的透明圈直徑最大,其透明圈直徑與菌落直徑比值也最大。

        表1 所篩菌株的透明圈直徑

        2.2 菌株的復(fù)篩 對(duì)4株菌株漆酶、過(guò)氧化物酶和錳過(guò)氧化物酶3種酶活進(jìn)行測(cè)定。由表2可知,菌株M-2產(chǎn)漆酶和錳過(guò)氧化物酶活性最強(qiáng),M-4菌株產(chǎn)過(guò)氧化物酶活性最強(qiáng)。因此,選擇M-2菌株進(jìn)行后續(xù)種屬鑒定。

        2.3 目的菌株的鑒定 通過(guò)對(duì)M-2菌株的16SrDNA序列進(jìn)行比對(duì)后,發(fā)現(xiàn)該菌株的16SrDNA序列與假單胞菌屬的綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)同源性最高,序列相似性為85%(圖1)。因此,最終確定M-2菌株為假單胞菌屬的綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)。

        表2 高溫木質(zhì)素分解菌的產(chǎn)酶活性 U/ml

        3 討論

        通過(guò)初篩和復(fù)篩,從馬糞中獲得4株具有分解木質(zhì)素的菌株,其中M-2的產(chǎn)酶活性較強(qiáng)。經(jīng)16SrDNA遺傳學(xué)鑒定,確定M-2為假單胞菌屬的綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)。菌株M-2在高溫條件下具有生長(zhǎng)速度快和產(chǎn)酶活性強(qiáng)的能力。有研究表明,在沒(méi)有外界添加任何外源碳氮源,將分離獲得的芽孢桿菌接種到秸稈木質(zhì)素中進(jìn)行堆積發(fā)酵,表現(xiàn)出較強(qiáng)的降解作用。通過(guò)玉米秸稈16 d的發(fā)酵,木質(zhì)素降解率可達(dá)24%[8]。

        我國(guó)每年產(chǎn)生大量的農(nóng)作物秸稈。這些秸稈資源僅有很少部分作為動(dòng)物飼料、人造板原料和食用菌栽培基質(zhì)原料[9-10],其余大部分資源被農(nóng)民就地焚燒、四處堆放。這不僅造成生物資源的極大浪費(fèi),而且嚴(yán)重破壞生態(tài)環(huán)境[11]。秸稈中含有大量的木質(zhì)素和纖維素,在常溫下難以降解。因此,后續(xù)可以將分離獲得的高溫木質(zhì)素分解中用于農(nóng)作物秸稈的堆積發(fā)酵,從而快速、高效、無(wú)污染地處理農(nóng)作物秸稈。

        [1]李成翠,李術(shù)娜,朱寶成.高活性木質(zhì)素降解菌株T-8的分離、篩選與鑒定[J].河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2010,33(6):57 -62.

        [2]曲音波.木質(zhì)纖維素降解酶系的基礎(chǔ)和技術(shù)研究進(jìn)展[J].山東大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版),2011,46(10):160 -169.

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        [4]曲音波.木質(zhì)纖維素降解酶與生物煉制[M].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2011.

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