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        40周齡母雞體尺性狀的主基因+多基因混合遺傳分析

        2015-03-15 12:32:04王克華竇套存沈曼曼
        江蘇農(nóng)業(yè)學報 2015年5期
        關鍵詞:胸寬體尺周齡

        馬 猛, 王克華, 曲 亮, 竇套存, 沈曼曼

        (1.江蘇省家禽科學研究所,江蘇 揚州 225003;2.揚州翔龍禽業(yè)發(fā)展有限公司,江蘇 揚州 225200)

        雞的體尺性狀與眾多重要的經(jīng)濟性狀關系密切。目前,對雞體尺的研究多集中在其與屠宰性能、生長發(fā)育規(guī)律的關系上[1-3]。與其他數(shù)量性狀一樣,影響雞體尺性狀的因素較多,其中遺傳因素和環(huán)境是主要影響因素。對雞體尺性狀的非遺傳因素影響已有較多報道[4-6]。但是,目前關于體尺性狀的分子遺傳機理研究較少。以往多采用傳統(tǒng)的方法進行體尺性狀的分子遺傳研究,然而傳統(tǒng)的方法有一定的局限性,不能解析單個基因座位的遺傳效應[7]。蓋鈞鎰等[8]、Zhang 等[9]、Wang 等[10]提出的主基因 +多基因混合遺傳分析方法不僅能夠鑒別主基因,而且對多基因也可以進行檢測,并估計出相應的遺傳參數(shù)。本研究以綠殼蛋雞黑羽純系和白來航雞資源群體為材料,應用主基因+多基因混合遺傳模型分析軟件對40周齡母雞的體尺性狀進行研究,探討雞40周齡體尺性狀的遺傳規(guī)律,確定最適模型。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        試驗以黑羽綠殼蛋雞純系為親本P1,以白來航雞為親本P2,其中P1共109 只,P2共78 只,F(xiàn)1(P1♂ ×P2♀、P2♂×P1♀)代564 只,F(xiàn)2[(P1♂ ×P2♀)♂ ×(P1♂ ×P2♀)♀、(P2♂ ×P1♀)♂ ×(P2♂ ×P1♀)♀]代1 915只。試驗動物均飼養(yǎng)于揚州翔龍禽業(yè)發(fā)展有限公司,飼養(yǎng)管理條件一致,試驗過程中每只雞均單籠飼養(yǎng)。

        1.2 測定內容與方法

        測定每個世代所有母雞在40周齡時的體尺性狀,包括脛圍、脛長、龍骨長、體斜長、胸角和胸寬6項指標。其中脛長、龍骨長、體斜長、胸角和胸寬的測定均按照《家禽生產(chǎn)性能名詞術語和度量統(tǒng)計方法》[11]進行測定,脛圍的測定方法為用細線繞雞左脛中間部位3圈,然后用直尺量取3圈的總周長,除以3即為每只雞的脛圍。

        1.3 數(shù)據(jù)的處理

        試驗所有數(shù)據(jù)均采用Excel 2003進行統(tǒng)計,用SPSS17.0進行正反交群體間的t檢驗,用南京農(nóng)業(yè)大學研發(fā)的SEA-G4F2軟件包進行主基因+多基因混合遺傳模型分析。

        數(shù)據(jù)進行分析前對F1代和F2代的數(shù)據(jù)進行正反交之間的比較,如果正反交之間的差異顯著,則需要消除正反交效應。

        正交效應=正交群體平均值-群體平均值

        反交效應=反交群體平均值-群體平均值

        用于分離分析的數(shù)據(jù)=原數(shù)據(jù)-正反交效應

        1.4 遺傳模型簡介

        利用P1、P2、F1和F23個世代進行分離分析的遺傳模型共有5大類24個遺傳模型,其具體對應的解釋見表1。

        表1 各個遺傳模型對應的解釋Table 1 Explain ation for of each genetic model

        1.5 統(tǒng)計與分析

        應用蓋鈞鎰等[8]提出的主基因+多基因混合遺傳模型來進行分離分析,通過極大似然法和IECM算法對混合分布中的有關成分分布參數(shù)做出估計,然后對24個模型中AIC(Akaike,s information criterion)值進行比較,選擇其中AIC值較小的相對應的模型進行適合性檢驗,然后確定出最適模型,根據(jù)最適模型的分析結果,估計其相應的一階遺傳參數(shù)和二階遺傳參數(shù)。具體的最適模型的選擇和遺傳參數(shù)估計參照文獻[8]。適合性檢驗共有5個統(tǒng)計量,即均勻性檢驗檢驗 nW2和Kolmigorov 檢驗 Dn。

        2 結果與分析

        2.1 40周齡母雞體尺性狀的表型特征值及F2代的次數(shù)分布

        6個體尺性狀的表型特征值見表2,由表2可知,每個性狀的F2代的極差均大于P1、P2和F1代,說明每個性狀在F2代都有較好的分離。6個體尺性狀中除脛長F1代的均值介于兩個親本之間外,其他5個性狀的F1均值均高于或低于親本,說明這些性狀均發(fā)生了超親遺傳的現(xiàn)象。6個性狀F2代的峰度均大于0,說明各個性狀的F2代分布均比正態(tài)分布要陡峭,而6個性狀中除了脛圍F2代的偏度大于0外,其他5個性狀的偏度均小于0,說明脛圍F2代的分布右邊較為分散,其他性狀的F2代分布則左邊比較分散,且龍骨長F2代的分散程度更高。

        圖1為40周齡母雞6個體尺性狀F2代的次數(shù)分布,由圖1可知,脛圍F2代的分布呈現(xiàn)單峰的偏態(tài)分布,脛長F2代的次數(shù)分布呈現(xiàn)單峰分布,其他性狀F2代的次數(shù)分布則呈現(xiàn)出多峰分布,這也說明每個性狀在F2代都出現(xiàn)了較好的分離,且每個性狀均屬于主基因控制的性狀。

        表2 40周齡母雞6個體尺性狀每個世代對應的表型特征值Table 2 Phenotypic value of six body size traits in each generation

        圖1 40周齡母雞體尺性狀F2代的次數(shù)分布Fig.1 Frequency distribution of body size traits in F2 at 40-week old

        2.2 40周齡母雞6個體尺性狀的最適模型的確定及適合性檢驗

        40周齡母雞6個體尺性狀的各個模型所對應的AIC值見表3,根據(jù)候選模型的選擇標準,在24個模型中選取AIC值較小的模型作為候選模型進行適合性檢驗。由表3可知,脛圍、脛長、胸角和胸寬的24個模型中E和E-1的AIC值較小,因此選模型E和E-1作為這4個性狀的候選模型,龍骨長和體斜長的24個模型中模型E的AIC值均要遠遠小于其他模型,因此模型E作為龍骨長和體斜長的候選模型。最適模型的確定是根據(jù)適合性檢驗的統(tǒng)計量顯著的個數(shù)進行,選擇達到顯著性的統(tǒng)計量個數(shù)最少的模型作為最適模型,若候選模型的顯著統(tǒng)計量個數(shù)相同,則選取AIC值較小的作為最適模型。6個性狀的候選模型的適合性檢驗統(tǒng)計量達到顯著性的個數(shù)見表4。由表4可知,脛圍、脛長、胸角和胸寬的候選模型E和E-1的檢驗統(tǒng)計量達到顯著的個數(shù)均相等,因此選擇AIC值較小的E-1作為4個性狀的最適模型,即2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因混合遺傳模型。龍骨長和體斜長的候選模型檢驗統(tǒng)計量顯著個數(shù)分別為1和6,最適模型均為E模型,即2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因混合遺傳模型。最適模型的適合性檢驗見表5。

        表3 40周齡母雞6個體尺性狀各個模型所對應的AIC值Table 3 AIC values of six body size traits of 40-year-old hens by each-model

        表4 候選模型所對應的適合性檢驗的統(tǒng)計量的顯著個數(shù)Table 4 Significant numbers of statistics in adaption test for candidate models

        表5 最適模型的適合性檢驗Table 5 Test of adaption for the best model

        2.3 最適模型的遺傳參數(shù)估計

        40周齡母雞6個性狀的最適模型的遺傳參數(shù)估計見表6。由表6可知,在一階遺傳參數(shù)的估計中,脛圍、脛長、胸角和胸寬的2對主基因的加性效應均為正向效應,龍骨長和體斜長的2對主基因的加性效應為負向效應,6個性狀中除了胸角的2對主基因的顯性效應為負向效應外,其他性狀的主基因的顯性效應均為正向效應。6個性狀中除了體斜長外,其他5個性狀的主基因的加性效應和顯性效應基本可以與加加效應、顯顯效應和加顯效應、顯加效應相互抵消,體斜長的|da|>|db|,ha>hb,說明第1對主基因的加性效應和顯性效應均大于第2對主基因。在二階遺傳參數(shù)的估計中,脛圍、脛長、胸角和胸寬的群體方差分別為0.216、0.988、72.356和0.849,主基因所對應的方差分別為0.131、0.605、40.245和0.504,主基因的遺傳率分別為 60.89%、61.24%、55.62%和59.43%,龍骨長和體斜長的群體方差為0.461和0.919,主基因的方差為0.076和0.283,主基因遺傳率分別為16.52%和30.76%,龍骨長對應的多基因的方差為0.033,多基因遺傳率為7.20%。

        表6 40周齡母雞6個性狀最適模型的遺傳參數(shù)估計Table 6 Estimations of genetic parameters of best model for each trait

        3 討論

        王春娥等[12]的研究結果表明,運用主基因+多基因混合遺傳分析軟件檢測到的主基因的對數(shù)與用QTL定位檢測出來的主基因對數(shù)是一致的。蓋均鎰等[13]認為用單個世代的分析效果沒有多世代的分析效果好,原因是加性遺傳參數(shù)體現(xiàn)在兩個純合的親本均值差異上,而顯性遺傳參數(shù)在親本與F1代的均值差異中就可以體現(xiàn)出來。目前,對主基因+多基因混合遺傳分析軟件的應用大多集中在植物數(shù)量性狀的研究上[14-17],動物數(shù)量性狀上的研究則有王克華[18]、曲亮[19-20]等應用主基因 +多基因混合遺傳模型對雞12周齡體質量、雞40周齡蛋質量、冠長、冠高和冠厚的研究,確定雞12周齡體質量的最適模型為E-6模型,雞40周齡蛋質量、冠長、冠高和冠厚的最適模型均為E模型。

        本研究結果表明,40周齡母雞體尺性狀中的脛圍、脛長、胸角和胸寬的最適模型均為E-1模型,即2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因混合遺傳模型,龍骨長和體斜長的最適模型均為E模型,即2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因混合遺傳模型,脛圍、脛長和胸寬的2對主基因的加性效應值和顯性效應值均為正值,龍骨長和體斜長的2對主基因的加性效應值為負值,顯性效應值為正值,說明脛圍、脛長、胸角和胸寬越大,而龍骨長和體斜長越小的個體對后代的影響越大。本研究結果顯示40周齡母雞的脛圍、脛長、胸角和胸寬的主基因遺傳率均高于50%,每個性狀的主基因效應均遠遠大于多基因的遺傳效應,因此,在對40周齡母雞的脛圍、脛長、胸角和胸寬等性狀進行遺傳改良的過程中要注重對主基因的選擇,40周齡母雞的龍骨長和體斜長的主基因與多基因的遺傳率之和均小于50%,這說明非遺傳因素對這2個性狀的影響較大,在后期的選育過程中,要注重改善環(huán)境條件,降低非遺傳因素對龍骨長和體斜長的影響。

        雖然主基因+多基因混合遺傳模型的應用比較廣泛,但是其本身還存在一定的局限性,只能夠將主基因的對數(shù)為1~3的檢測出來。在動物數(shù)量性狀上開展主基因+多基因的應用,不僅可以豐富動物數(shù)量性狀的研究方法,而且可以較好地了解性狀本身的內在遺傳規(guī)律,能為與主基因緊密連鎖的分子標記的發(fā)掘和分子標記輔助選擇奠定一定的理論基礎。

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