趙琳琳,王江元,艾 清(吉林大學(xué)第一醫(yī)院二部檢驗科,長春 130031)
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科瑪嘉顯色培養(yǎng)和API20C AUX鑒定酵母樣真菌的臨床價值
趙琳琳,王江元,艾 清△(吉林大學(xué)第一醫(yī)院二部檢驗科,長春 130031)
目的 探討科瑪嘉顯色培養(yǎng)和API20C AUX(簡稱API20C)鑒定酵母樣真菌的對比研究。方法 收集該院微生物室2012~2013年無菌體液標(biāo)本分離出的酵母樣真菌121株,對所有菌株進行科瑪嘉顯色培養(yǎng)鑒定和API20C鑒定。通過基因序列分析法將真菌準確鑒定到種。結(jié)果 顯色培養(yǎng)基除13株無法鑒定、8株鑒定錯誤外其余菌株均鑒定正確,正確率為92.59% (100/108)。API20C除5株鑒定錯誤、4株無鑒定結(jié)果外其余菌株均鑒定正確,正確率為92.56%(112/121);其中對顯色培養(yǎng)能鑒定菌株的正確率為95.37%(103/108),對顯色培養(yǎng)無法鑒定菌株的正確率為69.23%(9/13)。結(jié)論 科瑪嘉顯色培養(yǎng)和API20C方法對大多數(shù)臨床分離菌株能夠準確鑒定到種,API20C對少見真菌和顯色不典型菌種的鑒定有待進一步驗證。
酵母菌; API20C AUX; 顯色培養(yǎng); 序列分析; DNA
近年來,由于廣譜抗菌藥物的不規(guī)范使用、免疫抑制劑的廣泛應(yīng)用,真菌引起的感染逐年上升[1-2]。有報道顯示白色酵母樣真菌的藥物敏感性高于非白色酵母樣真菌,不同菌種的酵母樣真菌對抗真菌藥物的敏感性和耐藥性不同,所以真菌的準確鑒定對指導(dǎo)臨床用藥尤為重要[3-5]。臨床工作中常用的真菌鑒定方法有科瑪嘉顯色培養(yǎng)法、API20C AUX(簡稱API20C)等生化反應(yīng)鑒定卡,本研究以分子生物學(xué)方法為“金標(biāo)準”,對科瑪嘉顯色培養(yǎng)和API20C鑒定酵母樣真菌的能力進行評估[6-7]。報道如下。
1.1 一般資料 收集該院微生物室2012年1月至2013年12月無菌體液和血液標(biāo)本中分離出的酵母樣真菌共121株(已剔除同一患者同一部位或不同部位標(biāo)本反復(fù)檢出的相同菌株),干濾紙片法-80 ℃保存。
1.2 質(zhì)控菌株 選取3株標(biāo)準菌株作為質(zhì)控菌株:白色假絲酵母菌(ATCC90028)、光滑球擬假絲酵母菌(ATCC90030)、熱帶假絲酵母菌(ATCC1463),標(biāo)準菌株均購自衛(wèi)生部臨床檢驗中心。
1.3 儀器與試劑 LD5-10B低溫離心機(美國賽默飛世爾科技),T-100 PCR儀(美國Bio-rad公司),BC-J80S隔水式恒溫培養(yǎng)箱(上海博訊醫(yī)療設(shè)備廠)。PCR擴增試劑盒(上海生工),科瑪嘉顯色培養(yǎng)基(法國梅里埃),API20C AUX鑒定卡(法國梅里埃)。
1.4 真菌顯色培養(yǎng)鑒定 所有菌株接種于沙氏培養(yǎng)基后36 ℃培養(yǎng)24 h,重復(fù)1次上述操作,使真菌充分復(fù)蘇并分離出單個菌落。挑取沙氏培養(yǎng)基上的單個菌落接種于科瑪嘉顯色培養(yǎng)基,36 ℃培養(yǎng)72 h后判定結(jié)果(每24 h觀察1次顯色情況):綠色、翠綠色菌落為白色假絲酵母菌;藍灰色、鐵灰色菌落為熱帶假絲酵母菌;粉紅色模糊有微毛菌落為克柔假絲酵母菌;紫紅色光滑菌落為光滑球擬假絲酵母菌;顯色不典型和白色菌落為無法鑒定的其他假絲酵母菌。
1.5 真菌API20C鑒定 配制所有菌株的菌懸液(2.0 Mac),取100 μL菌懸液至API C Medium培養(yǎng)基,混均后加入API20C真菌鑒定試劑條,29 ℃培養(yǎng)48~72 h后與陰性孔對照,閱讀生化譜。生化譜輸入API20C 3.0系統(tǒng)進行結(jié)果判讀:鑒定百分率≥80%且T≥0為“可接受的鑒定”,鑒定百分率<80%為“無鑒定結(jié)果”。
1.6 分子生物學(xué)鑒定 采用直接煮沸法提取真菌DNA,選取真菌通用引物ITS1、ITS4進行PCR擴增[6-7]。PCR體系為50 μL:PCR Master 25 μL,模板DNA 2 μL,上、下游引物各2 μL,無菌雙蒸水至50 μL。PCR擴增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,35個循環(huán);最后72 ℃延伸8 min。DNA擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后送上海生工測序,測序結(jié)果提交GenBank數(shù)據(jù)庫進行序列分析,從而將所有菌株準確鑒定到種。
2.1 質(zhì)量控制 3株標(biāo)準菌株白色假絲酵母菌(ATCC 90028)、光滑球擬假絲酵母菌(ATCC 90030)、熱帶假絲酵母菌(ATCC 1463)通過科瑪嘉顯色培養(yǎng)、API20C、基因序列分析法均能準確鑒定至種。見圖1。
2.2 顯色培養(yǎng)鑒定結(jié)果 顯色培養(yǎng)基僅能鑒定4種常見的酵母樣真菌,有13株無法鑒定,鑒定率為89.26%(108/121),與國內(nèi)有關(guān)文獻報道一致[8]。其中108株菌株的鑒定結(jié)果中有8株與基因序列分析結(jié)果不符,正確率為92.59%(100/108)。
2.3 API20C鑒定結(jié)果 13株顯色無法鑒定菌株經(jīng)API20C鑒定,除1株近平滑假絲酵母菌和2株葡萄牙假絲酵母菌鑒定錯誤、1株白色假絲酵母菌無鑒定結(jié)果外,其余菌株均鑒定正確,正確率為69.23%(9/13)。108株顯色鑒定至種菌株經(jīng)API20C鑒定,除1株白色假絲酵母菌和1株熱帶假絲酵母菌鑒定錯誤、1株季也蒙假絲酵母菌和2株熱帶假絲酵母菌無鑒定結(jié)果外,其余菌株均鑒定正確,正確率為95.37%(103/108)。API20C的總正確率為92.56%(112/121),接近國內(nèi)相關(guān)文獻報道[9]。見表1。
注:1表示白色假絲酵母菌(ATCC 90028);2表示熱帶假絲酵母菌(ATCC 1463);3表示光滑球擬假絲酵母菌(ATCC 90030)。
圖1 標(biāo)準菌株顯色結(jié)果
注:括號內(nèi)為菌株數(shù)。
本研究以分子生物學(xué)方法鑒定結(jié)果為金標(biāo)準,對科瑪嘉顯色培養(yǎng)和API20C的鑒定能力進行評估。從菌種庫中選取的少見菌種的菌株比例常較臨床分離菌株高,這與臨床實際情況不符。本研究菌株收集2012年1月至2013年12月臨床無菌體液和血液標(biāo)本中分離出的不同患者的全部酵母樣真菌,在菌種構(gòu)成上與臨床符合,因此得出的結(jié)果更能反映顯色培養(yǎng)和API20C在臨床應(yīng)用中的價值。
顯色培養(yǎng)基鑒定結(jié)果顯示,8株菌株顯色培養(yǎng)錯誤鑒定,顯色培養(yǎng)可鑒定菌種內(nèi)的2株常見菌株無法鑒定,可能原因:(1)個人顏色辨別能力不同。如藍灰色、藍紫色、紫紅色辨別的差異。(2)常見菌株在科瑪嘉顯色培養(yǎng)基上顯色不典型。如本組顯白色的白色假絲酵母菌和顯橘紅色的光滑球擬假絲酵母菌,這2株菌株在顯色培養(yǎng)基可鑒定至菌種,但顯色培養(yǎng)基均無法鑒定。(3)少見菌株顯出與常見菌株相似的顏色。如1株葡萄假絲酵母菌和1株季也蒙假絲酵母菌均顯示紫紅色,易錯誤鑒定為光滑球擬假絲酵母菌;1株阿薩希絲孢酵母顯出綠色,易錯誤鑒定為白色假絲酵母菌。API20C鑒定結(jié)果表明,有9株菌株鑒定錯誤或無鑒定結(jié)果,其中包括6株常見菌株(2株白色假絲酵母菌、3株熱帶假絲酵母菌和1株近平滑假絲酵母菌),原因可能為:(1)廣譜抗菌藥物、免疫抑制劑的應(yīng)用使菌株的生化反應(yīng)不再典型。(2)菌株的生長狀態(tài)不同,生化反應(yīng)結(jié)果不同??片敿物@色培養(yǎng)基鑒定正確率為92.59%,API20C鑒定酵母樣真菌的總正確率為92.56%,說明科瑪嘉顯色培養(yǎng)基和API20C能夠?qū)⒋蠖鄶?shù)臨床分離菌株準確鑒定到種。但是臨床工作中對顯色培養(yǎng)可以鑒定的菌株不再進行API20C的鑒定,所以應(yīng)該更加注重API20C對顯色無法鑒定菌株的鑒定能力的評估。本研究中顯色無法鑒定的13株菌株經(jīng)API20C鑒定,3株鑒定錯誤,1株無鑒定結(jié)果,鑒定正確率僅為69.23%(9/13),低于API20C的總鑒定正確率。但本研究中顯色無法鑒定菌株標(biāo)本量少,所以API20C對臨床分離的顯色無法鑒定的少見真菌和顯色不典型菌株的鑒定能力有待進一步驗證。
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10.3969/j.issn.1672-9455.2015.11.044
A
1672-9455(2015)11-1602-02
2014-12-25
2015-02-15)
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