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        基于MATLAB的細(xì)菌圖像處理方法研究

        2017-05-16 01:18:25鹽城工業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院董榮偉
        河北農(nóng)機(jī) 2017年4期
        關(guān)鍵詞:直方圖圖像處理灰度

        鹽城工業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院 董榮偉

        基于MATLAB的細(xì)菌圖像處理方法研究

        鹽城工業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院 董榮偉

        針對(duì)干擾細(xì)菌圖像成像的因素較多,導(dǎo)致無(wú)法直接獲取或定量分析細(xì)菌數(shù)量的問(wèn)題,本文重點(diǎn)研究基于MATLAB的細(xì)菌圖像處理方法,包括:細(xì)菌圖像去除背景、彩色圖像灰度化、圖像分割、特征提取等,通過(guò)對(duì)比分析處理效果,選定合適的處理方法,從而為后續(xù)細(xì)菌定性或定量分析提供一定的技術(shù)支持。

        細(xì)菌圖像;MATLAB;圖像處理

        引言

        隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)的飛速發(fā)展,各行各業(yè)出現(xiàn)眾多新技術(shù)識(shí)別或檢測(cè)物件的缺陷,其中由于細(xì)菌(大腸桿菌)體積小、易培養(yǎng)的特點(diǎn),頻繁被用來(lái)檢測(cè)物件缺陷,利用穿透物件的細(xì)菌量的多少來(lái)評(píng)判物件的損壞程度,故需要定量分析細(xì)菌;此外,由于MATLAB可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)可視化,用戶可通過(guò)使用函數(shù)工具箱自由設(shè)計(jì)、編寫(xiě)命令流,實(shí)現(xiàn)圖像處理的自由化和交互式操作[1],本文利用MATLAB對(duì)細(xì)菌SEM圖像的處理方法進(jìn)行研究,旨在為后續(xù)細(xì)菌定量分析奠定基礎(chǔ)。

        1 圖像預(yù)處理

        1.1 圖像去背景處理

        顯微鏡獲取的細(xì)菌圖像通常會(huì)存在細(xì)菌顏色與背景顏色相近、顯微鏡的污漬斑點(diǎn)、背景強(qiáng)度不平衡等問(wèn)題,需要借助代數(shù)運(yùn)算將目標(biāo)物體與背景區(qū)分開(kāi)來(lái),并去除背景,本文經(jīng)過(guò)對(duì)比分析,選用減法運(yùn)算進(jìn)行處理,效果如圖1所示。

        圖1 去除背景后的圖像

        1.2 圖像灰度化與圖像反轉(zhuǎn)

        CCD攝像頭拍攝的圖像為rgb圖像,參考本文顯微圖像的具體情況,本文選用加權(quán)平均法對(duì)rgb彩色圖像灰度化[2];同時(shí)為了獲得較好的視覺(jué)效果,需要對(duì)目標(biāo)區(qū)域作進(jìn)一步增強(qiáng)處理,本文采用圖像反轉(zhuǎn)處理方法,處理后效果如圖2所示。

        圖2 灰度化與圖像反轉(zhuǎn)后的圖像

        1.3 圖像灰度增強(qiáng)

        提取細(xì)菌特征前必須獲取具有二值化圖像。一般細(xì)菌圖像的目標(biāo)物體與背景灰度差別不大,不利于目標(biāo)物體的分割。常用的圖像灰度增強(qiáng)的方法有線性灰度變換、分段線性灰度變換、直方圖均衡化等,經(jīng)過(guò)對(duì)比分析,采用直方圖均衡化方法增強(qiáng)圖像中目標(biāo)物體與背景的灰度差別,效果如圖3所示。

        圖3 經(jīng)灰度直方圖均衡后的圖像

        2 圖像二值化

        二值化處理過(guò)程中首先需要確定閾值T,通過(guò)閾值計(jì)算方法確定一個(gè)閾值,然后對(duì)圖像像素進(jìn)行掃描,當(dāng)像素值小于等于該閾值時(shí),將該像素的灰度值設(shè)置為0,否則灰度值設(shè)置為1。在灰度圖像中黑色用0表示,白色用255表示,閾值T就是一個(gè)分界點(diǎn),比它大就是白,比它小就是黑。本設(shè)計(jì)中以0表示背景,1表示目標(biāo)圖像。圖像的光線變化比較大,采用Ostu算法[3]計(jì)算圖像二值化閾值后效果如圖4所示。

        圖4 二值化效果圖

        3 圖像特征提取

        本文采用基于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的方法進(jìn)行邊界提取,數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的基本運(yùn)算方法是膨脹與腐蝕,并結(jié)合區(qū)域填充算法對(duì)圖像做進(jìn)一步處理,效果如圖5所示。細(xì)菌的幾何特征參數(shù)包括目標(biāo)物體的周長(zhǎng)、形狀因子等,且都是以圖像邊界的提取為基礎(chǔ),本文依據(jù)形態(tài)學(xué)算法中的邊界提取計(jì)算方法,完成邊界提取,效果如圖6所示。

        圖5 區(qū)域填充效果圖

        圖6 邊界提取效果圖

        4 結(jié)束語(yǔ)

        本文主要介紹了對(duì)細(xì)菌圖像的處理方法,首先對(duì)細(xì)菌顯微圖像進(jìn)行預(yù)處理,包括細(xì)菌圖像去除背景、圖像灰度化和圖像反轉(zhuǎn)、圖像灰度增強(qiáng),之后對(duì)細(xì)菌圖像進(jìn)行分割與特征提取,并取得了很好的效果,可以滿足后續(xù)細(xì)菌定量分析的需求。

        [1]鄧巍,丁為民,張浩.MATLAB在圖像處理和分析中的應(yīng)用[J].農(nóng)機(jī)化研究,2006(06):194~198.

        [2]吳國(guó)瑞.基于圖像處理的雜草種類識(shí)別技術(shù)研究[D].西北農(nóng)林科技大學(xué),2009.

        [3]茍中魁,張少軍,李忠富等.一種Otsu閾值法的推廣—Otsu雙閾值法[J].機(jī)械,2004(07):12~14.

        董榮偉,男,1989年出生,江蘇鹽城人,碩士研究生,研究方向:計(jì)算機(jī)智能控制及無(wú)線傳感網(wǎng)絡(luò)。

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