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        兩類(lèi)蘇云金芽胞桿菌Cry1Ac蛋白殺玉米螟活性的比較

        2015-01-27 18:30:51田宇曦,劉曉艷,張志剛,楊自文
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年23期
        關(guān)鍵詞:蘇云金芽胞玉米螟

        田宇曦,劉曉艷,張志剛,楊自文

        摘要:通過(guò)PCR技術(shù)將2種不同來(lái)源的蘇云金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis,簡(jiǎn)稱(chēng)Bt)cry1Ac蛋白基因克隆到大腸桿菌pGEX-6P-1表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化到宿主菌BL21,采用IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),并用親和層析法進(jìn)行融合蛋白的純化,純化后的蛋白質(zhì)進(jìn)行玉米螟的室內(nèi)生物測(cè)定試驗(yàn)。結(jié)果表明,來(lái)自Bt菌株NBIN-866的Cry1Ac蛋白殺玉米螟的LC50為65.39 μg/mL,來(lái)自Bt菌株NBIC-380的Cry1Ac蛋白殺玉米螟的LC50為15.07 μg/mL,后者具有更高的殺蟲(chóng)活性。氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)來(lái)自菌株NBIC-380的Cry1Ac氨基酸序列的71位和393位都為絲氨酸S,而NBIN-866的都為脯氨酸P,推測(cè)這兩個(gè)位點(diǎn)的氨基酸的變化可能是影響毒性大小的重要因素。

        關(guān)鍵詞:蘇云金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis);Cry1Ac;融合蛋白;玉米螟;活性比較中圖分類(lèi)號(hào):S188 ? ? ? ? ? ?中圖分類(lèi)號(hào):S476 ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A ? ? ? ?文章編號(hào):0439-8114(2014)23-5742-03

        DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2014.23.029

        蘇云金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis,簡(jiǎn)稱(chēng)Bt)是一種土壤革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌,具有較廣的殺蟲(chóng)譜。其主要的殺蟲(chóng)活性物質(zhì)是殺蟲(chóng)晶體蛋白(Insecticidal crystal protein,ICP)[1]。蘇云金芽胞桿菌殺蟲(chóng)晶體蛋白對(duì)鱗翅目、雙翅目、鞘翅目等500多種昆蟲(chóng)及線蟲(chóng)等原生動(dòng)物有毒殺活性[2]。目前關(guān)于Cry蛋白中Cry1Ac蛋白結(jié)構(gòu)以及功能方面的研究,國(guó)內(nèi)外均有報(bào)道,如在Cry1Ac蛋白末端融合其他蛋白以提高殺蟲(chóng)活性[3-5]或者將另一種蛋白與其一起共表達(dá)來(lái)提高殺蟲(chóng)活性[6]。本研究通過(guò)克隆表達(dá)兩類(lèi)不同來(lái)源的Cry1Ac蛋白,生物測(cè)定發(fā)現(xiàn)對(duì)玉米螟的殺蟲(chóng)活性差異較大,從一級(jí)結(jié)構(gòu)上分析了可能影響毒性大小的氨基酸位點(diǎn),為后續(xù)該蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究提供理論基礎(chǔ)。

        1 ?材料與方法

        1.1 ?材料

        菌種:分離自土壤的兩株含有cry1Ac基因的蘇云金芽胞桿菌菌株NBIC-380和NBIN-866以及大腸桿菌菌株DH5α和BL21保存于湖北省生物農(nóng)藥工程研究中心;pGEX-6P-1購(gòu)自Invitrogen公司;T4連接酶、Ex Taq酶、Bam HI、Sal I、Hind Ⅲ、DNA Marker(各條帶大小依次為23 130、9 416、6 557、4 361、2 322、2 027、564 bp)、即用型蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)(各條帶大小依次為200、116、97.2、66.4、44.3、29.0、20.1、14.3、6.5 kDa)、pMD19-T Simple Vector購(gòu)自TaKaRa公司;透析袋和透析夾購(gòu)自伯樂(lè)生命醫(yī)學(xué)(上海)有限公司;SDS-PAGE凝膠制備試劑盒購(gòu)自北京莊盟國(guó)際生物基因科技有限公司;基因組DNA提取試劑盒(樹(shù)脂型)購(gòu)自上海賽百盛基因技術(shù)有限公司;細(xì)菌蛋白抽提GST瓊脂糖凝膠和快速瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒購(gòu)自北京賽馳生物科技有限公司;其他化學(xué)試劑均為分析純。

        1.2 ?方法

        1.2.1 ?克隆 ?用細(xì)菌總基因組提取試劑盒抽提蘇云金芽胞桿菌NBIC-380和NBIN-866的總基因組,對(duì)于NBIC-380的Cry1Ac,以菌株NBIC-380總基因組為模板,采用引物Cry1A-F:GGATCCATGGATAACAATCCGAACATC,下劃線處是Bam HI酶切位點(diǎn)和Cry1A-R:GTCGACTACACGAACAATCTAAGTCAG,下劃線處是Sal I酶切位點(diǎn)),在PCR條件(94 ℃、1 min;94 ℃、30 s,60 ℃、30 s,72 ℃、150 s,25個(gè)循環(huán);72 ℃、5min;16 ℃、5 min)下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物命名為2-Cry1Ac;對(duì)于菌株NBIN-866的Cry1Ac,以菌株NBIC-866總基因組為模板,采用引物Cry1A-F和Cry1A-R,在PCR條件(94 ℃、1 min;94 ℃、30 s,49 ℃、30 s,72 ℃、150 s,25個(gè)循環(huán);72 ℃、5 min;16 ℃、5 min)下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物命名為5-Cry1Ac。將PCR產(chǎn)物割膠,用快速瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒純化,先連入pMD19-T Simple Vector進(jìn)行TA克隆,通過(guò)藍(lán)白斑篩選、PCR驗(yàn)證和雙酶切驗(yàn)證挑選正確的轉(zhuǎn)化子,送去上海生工生物工程股份有限公司測(cè)序,將正確的轉(zhuǎn)化子通過(guò)Bam HI和Sal Ⅰ雙酶切下來(lái)連入同樣酶雙酶切處理完全的pGEX-6P-1表達(dá)載體,通過(guò)PCR和單酶切驗(yàn)證后將正確的轉(zhuǎn)化子的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入宿主菌BL21。

        1.2.2 ?融合蛋白表達(dá)與純化 ?在28 ℃、IPTG終濃度為0.5 mmol/L、誘導(dǎo)5 h進(jìn)行重組蛋白的表達(dá),參照北京康為世紀(jì)生物科技有限公司細(xì)菌GST融合蛋白抽提說(shuō)明書(shū),采用GST標(biāo)簽的親和層析純化方法純化融合蛋白,通過(guò)SDS-PAGE檢測(cè),將純化的目的條帶較濃雜帶較少的純化液于4 ℃用透析袋透析過(guò)夜,透析緩沖液采用1倍的磷酸緩沖液。透析后的蛋白質(zhì)采用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒進(jìn)行濃度測(cè)定。

        1.2.3 ?生測(cè)試驗(yàn) ?將透析后的蛋白質(zhì)參照文獻(xiàn)[7]進(jìn)行玉米螟的室內(nèi)生物測(cè)定試驗(yàn)。采用LD50數(shù)據(jù)處理軟件統(tǒng)計(jì)兩種蛋白質(zhì)的LC50。

        2 ?結(jié)果與分析

        2.1 ?pGEX-6P-1-Cry1Ac原核表達(dá)載體的構(gòu)建結(jié)果

        通過(guò)PCR擴(kuò)增獲得了2個(gè)分別來(lái)自Bt NBIC-380和NBIN-866的2.4 kb的cry1Ac基因片段(圖1A),將TA克隆得到的轉(zhuǎn)化子進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證、雙酶切驗(yàn)證(圖1B)以及測(cè)序驗(yàn)證,結(jié)果表明該轉(zhuǎn)化子是陽(yáng)性克隆。將陽(yáng)性克隆重組質(zhì)粒上兩個(gè)基因片段雙切下來(lái)連入用相同的酶切過(guò)的pGEX-6P-1表達(dá)載體上,通過(guò)PCR驗(yàn)證和單酶切驗(yàn)證(圖1C)表明,2個(gè)基因成功地克隆到了pGEX-6P-1表達(dá)載體上。

        2.2 ?大腸桿菌誘導(dǎo)表達(dá)與純化結(jié)果

        在28 ℃用0.5 mmol/L IPTG誘導(dǎo)5 h,用親和層析法純化得到了融合蛋白(圖2),融合蛋白分子量大小約為118 kDa。用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒對(duì)以上純化并透析過(guò)的融合蛋白進(jìn)行濃度測(cè)定,帶有GST標(biāo)簽的2-Cry1Ac和5-Cry1Ac的濃度分別為190 mg/mL和199 μg/mL。

        2.3 ?室內(nèi)生物測(cè)定試驗(yàn)結(jié)果

        將帶有GST標(biāo)簽的2-Cry1Ac和5-Cry1Ac稀釋成3個(gè)濃度進(jìn)行玉米螟的室內(nèi)生物測(cè)定試驗(yàn),采用LD50數(shù)據(jù)處理軟件統(tǒng)計(jì)得到兩種蛋白質(zhì)的LC50分別為15.07和65.39 μg/mL??梢?jiàn),2-Cry1Ac殺玉米螟的活性是5-Cry1Ac的4倍以上。

        2.4 ?兩種蛋白質(zhì)氨基酸序列的比對(duì)結(jié)果

        因?yàn)?-Cry1Ac殺玉米螟活性是5-Cry1Ac的4倍以上,采用MegAlign軟件將兩種蛋白質(zhì)的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)以期找到毒性更高的原因。由圖3可知,在兩種蛋白質(zhì)的核心功能域[2]里,2-Cry1Ac(來(lái)自菌株NBIC-380的Cry1Ac)氨基酸序列的71位為S、393位為S,而5-Cry1Ac(NBIN-866的)分別為P、P,其余序列完全一樣。通過(guò)在MMDB數(shù)據(jù)庫(kù)找到已經(jīng)報(bào)道的Cry1Ac的3D結(jié)構(gòu)(MMDB ID:110041),找到了2-Cry1Ac/5-Cry1Ac氨基酸序列上相應(yīng)的71位和393位,由圖4可知,兩個(gè)氨基酸位點(diǎn)都是突出在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的表面。P和S都是中性氨基酸,不過(guò)P是非極性氨基酸,而S是極性氨基酸,這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域上的71和393位由P變成S后,使蛋白質(zhì)殺玉米螟的活性提高了3倍多,原因還需要進(jìn)一步分析。

        3 ?小結(jié)與討論

        從2個(gè)來(lái)源的Bt NBIC-380和NBIN-866里PCR分別得到了2-Cry1Ac和5-Cry1Ac,將其克隆到pGEX-6P-1表達(dá)載體上,然后利用大腸桿菌進(jìn)行表達(dá),并進(jìn)行融合蛋白的親和層析柱純化,純化的兩種蛋白質(zhì)中NBIC-380的2-Cry1Ac殺玉米螟的活性約是NBIN-866的5-Cry1Ac的4倍。分析這兩種蛋白質(zhì)的氨基酸序列可知,2-Cry1Ac氨基酸序列的71位為S、393位為S,而5-Cry1Ac分別為P、P,其余序列完全一樣。71位氨基酸位于內(nèi)毒素N內(nèi),393位氨基酸位于內(nèi)毒素M上(http://www.rcsb.org/pdb/protein/P05068? evtc= Suggest& evta= UniProtGene%20Names&evtl=OtherOptions),兩個(gè)氨基酸位點(diǎn)都是突出在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的表面,P和S都是中性氨基酸,不過(guò)P是非極性氨基酸,而S是極性氨基酸,這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域上的71和393位由P變成S后,使蛋白質(zhì)殺玉米螟的活性提高了3倍,推測(cè)這兩個(gè)位點(diǎn)的氨基酸的變化可能是影響毒性大小的重要因素,接下來(lái)將針對(duì)這兩個(gè)氨基酸位點(diǎn)展開(kāi)進(jìn)一步研究。

        參考文獻(xiàn):

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        [3] TANG Y,TONG J Y,ZHANG Y L,et al. Preliminary comparing the toxicities of the hybrid cry1Acs fused with different heterogenous genes provided guidance for the fusion expression of Cry proteins[J]. World J Microbiol Biotechnol,2012,28:397-400.

        [4] YAN F,CHENG X,DING X Z,et al. Improved insecticidal toxicity by fusing Cry1Ac of Bacillus thuringiensis with Av3 of Anemonia viridis[J]. Curr Microbiol,2014,68:604-609.

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        [7] 張志剛,楊自文,王開(kāi)梅,等.新型新殺蟲(chóng)劑的高通量篩選方法研究[J].湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,49(12):3045-3048.

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