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        肉鴨消化道酵母益生菌的分離與鑒定

        2015-01-21 01:17:38王學(xué)東彭思源龔阿瓊胡先勤鄭紅生
        飼料工業(yè) 2015年22期
        關(guān)鍵詞:酵母菌

        ■張 霞 王學(xué)東 李 彪 彭思源 龔阿瓊胡先勤 鄭紅生

        (1.武漢輕工大學(xué),湖北武漢 430023;2.安琪酵母股份有限公司,湖北宜昌 443003;3.武漢市永生鴨業(yè)有限公司,湖北武漢 430077)

        “鴨脖”是武漢的一張名片。但當(dāng)前為了得到更好的經(jīng)濟(jì)效益,養(yǎng)殖戶“購(gòu)一批鴨,拉一車(chē)藥”的現(xiàn)象令消費(fèi)者“恐懼”。藥物的濫用,導(dǎo)致病源微生物耐藥性(drug resistance)不斷增加,而養(yǎng)殖戶往往又通過(guò)加大用藥量或使用高效力藥品加以應(yīng)對(duì),最終導(dǎo)致惡性循環(huán)。研究發(fā)現(xiàn),從生物防控角度,利用“以菌(益生菌)治菌(致病菌)”的原理預(yù)防疾病,可減少各養(yǎng)殖環(huán)節(jié)的用藥。

        國(guó)內(nèi)外均在積極尋找抗生素代替品,其中活性益生菌(probiotics)是最具前途的安全生物制劑之一。而酵母菌(saccharomyces cerevisiae)作為益生菌已被許多國(guó)家和地區(qū)允許用于動(dòng)物養(yǎng)殖。酵母菌是一種典型的兼性厭氧型真菌,能夠調(diào)節(jié)胃腸道功能,抑制病原菌。且酵母在胃腸道內(nèi)能保持代謝活性,向腸道分泌多種營(yíng)養(yǎng)代謝產(chǎn)物,如蛋白質(zhì)、脂肪、糖及B族維生素等,也可以促進(jìn)小腸吸收氨基酸[1]。酵母細(xì)胞壁內(nèi)層含葡聚糖,這些大分子能激發(fā)非特異性和特異性免疫反應(yīng),激活T細(xì)胞、B細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞[2]。同時(shí)酵母菌有耐受細(xì)菌類(lèi)抗生素作用。理想的益生菌菌株最好來(lái)自于腸道。

        本研究旨在從肉鴨消化道內(nèi)分離篩選出酵母益生菌,通過(guò)26S rDNA分子方法、形態(tài)學(xué)和生理生化試驗(yàn)等鑒定酵母菌的種屬,為開(kāi)發(fā)高抗性、專(zhuān)一型的酵母益生菌制劑奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品來(lái)源

        從宜昌肉鴨場(chǎng)、農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)(武漢江夏區(qū))、散養(yǎng)農(nóng)戶(武漢水邊散養(yǎng))、武漢肉鴨場(chǎng)4個(gè)地方分別選取生長(zhǎng)良好、健康、表現(xiàn)及精神狀態(tài)好的6只肉鴨(共計(jì)24只)。

        1.1.2 培養(yǎng)基

        麥芽汁培養(yǎng)基、高氏(Gorodkowa)瓊脂培養(yǎng)基、YPD培養(yǎng)基、馬鈴薯瓊脂培養(yǎng)基、糖發(fā)酵基礎(chǔ)培養(yǎng)基、同化碳源基礎(chǔ)培養(yǎng)基、同化氮源基礎(chǔ)培養(yǎng)基、類(lèi)淀粉化合物液體培養(yǎng)基、無(wú)維生素基礎(chǔ)培養(yǎng)基、尿素分解培養(yǎng)基、無(wú)機(jī)鹽葡萄糖培養(yǎng)基、高滲透壓培養(yǎng)基。

        糖發(fā)酵培養(yǎng)基:D-葡萄糖、麥芽糖、半乳糖、乳糖、蜜二糖、蔗糖。

        同化碳源培養(yǎng)基:乙醇、麥芽糖、纖維二糖、水楊苷、DL-乳酸、D-阿拉伯糖、棉子糖。

        同化氮源培養(yǎng)基:硝酸鉀、L-賴(lài)氨酸、尸胺。

        無(wú)維生素培養(yǎng)基:分別為不含有煙酸、吡哆醇、硫胺素的基礎(chǔ)培養(yǎng)基。

        以上培養(yǎng)基均為國(guó)產(chǎn)的化學(xué)純或者分析純?cè)噭?/p>

        1.1.3 試劑

        山梨醇(Biosharp)、酵母基因組DNA提取試劑盒(Tiangen Biotech)、Lyticase(Tiangen Biotech)、瓊脂糖、呂氏堿性美蘭染色、克酚紅等均為國(guó)產(chǎn)。

        1.1.4 儀器設(shè)備

        單人單面凈化工作臺(tái)(SW-CJ-1FD,蘇州凈化設(shè)備有限公司)、恒溫恒濕培養(yǎng)箱(LRHS-150-Ⅱ,上海躍進(jìn)醫(yī)療器械有限公司)、電泳儀(DYY-8C,北京市六一儀器廠)、PCR儀(TC-XP,BIO-RAD)、凝膠成像儀(Gel DocTMEZ,BIO-RAD)。

        1.2 方法

        1.2.1 肉鴨消化道酵母菌的采集與保存

        按照解剖學(xué)位置,依次從肉鴨的腺胃、十二指腸、空腸、回腸、盲腸和結(jié)腸6個(gè)部位提取消化道內(nèi)容物,裝入封口袋后4℃保存。

        1.2.2 酵母菌的分離純化

        取6個(gè)部位消化道樣品用平板稀釋法在麥芽汁瓊脂平板上于28℃條件下培養(yǎng)2 d,挑取單菌落進(jìn)一步用平板劃線法純化2~3次。之后挑取少量純化后的菌體接種于YPD瓊脂斜面上,于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3 d,然后將其放入4℃冰箱中保存?zhèn)溆肹3]。

        1.2.3 酵母菌的26S rDNA序列分析[4]

        1.2.3.1 酵母基因組DNA提取

        用酵母基因組DNA提取試劑盒進(jìn)行26S rDNA的提取。

        1.2.3.2 酵母菌26S rDNA片段擴(kuò)增和測(cè)序

        用于26S rDNA PCR反應(yīng)引物:

        上游引物 NL1:5'-GCATATCAATAAGCGGAG?GAAAAG-3';

        下游引物NL4:5'-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3'。

        PCR反應(yīng)體系為50 μl,每管加入10× Taq Buffer 5 μl;20 μmol/l上下游引物各1 μl,2.5 mol/l dNTP 4 μl,模板 DNA 10 μl,5.0 U/μl Taq 0.5 μl。

        反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性45 s;55℃退火60 s;72℃延伸70 s,共進(jìn)行30個(gè)PCR循環(huán),最后再72℃繼續(xù)延伸10 min,4℃保藏。

        測(cè)序:將純化后的PCR產(chǎn)物送到北京奧科鼎盛生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,所得到的序列與Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)的基因序列進(jìn)行同源性比較。

        1.2.4 酵母菌的生理生化鑒定

        1.2.4.1 酵母菌的形態(tài)學(xué)鑒定

        依據(jù)田輝艷等[5]的方法進(jìn)行菌落特征觀察、細(xì)胞形態(tài)觀察、擲孢子的形成觀察、菌絲形成觀察和子囊孢子的形成觀察試驗(yàn)。

        1.2.4.2 酵母菌的生理生化鑒定[5-7]

        采用糖發(fā)酵試驗(yàn)、碳源同化試驗(yàn)、氮源同化試驗(yàn)、類(lèi)淀粉化合物形成試驗(yàn)、抗放線菌酮試驗(yàn)、無(wú)維生素生長(zhǎng)試驗(yàn)、尿素水解試驗(yàn)和耐高滲透壓試驗(yàn)進(jìn)行酵母菌種屬的鑒定。

        2 結(jié)果

        2.1 肉鴨消化道酵母菌分離結(jié)果

        不同地區(qū)肉鴨的消化道各個(gè)部位分離的酵母菌見(jiàn)表1??梢?jiàn)從宜昌肉鴨場(chǎng)肉鴨消化道6個(gè)部位分離出10株酵母菌;農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)肉鴨消化道6個(gè)部位分離出6株酵母菌;散養(yǎng)農(nóng)戶肉鴨消化道6個(gè)部位分離出12株酵母菌;武漢肉鴨場(chǎng)肉鴨消化道6個(gè)部位分離出7株酵母菌。本次總共分離得到了35株酵母菌。

        2.2 酵母菌26S rDNA分子鑒定結(jié)果

        2.2.1 酵母菌26S rDNA PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果

        用酵母基因組DNA提取試劑盒提取酵母菌株的26S rDNA,使用引物NL1、NL4對(duì)酵母菌株進(jìn)行26S rDNA的PCR擴(kuò)增,結(jié)果見(jiàn)圖1~圖4。從圖中可以看出,擴(kuò)增所得的產(chǎn)物大多在500~600 bp之間。

        表1 不同地域肉鴨消化道酵母菌分布情況(株)

        圖1 宜昌養(yǎng)殖場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA擴(kuò)增電泳圖譜

        圖2 農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA擴(kuò)增電泳圖譜

        圖3 散養(yǎng)農(nóng)戶肉鴨消化道酵母菌26S rDNA擴(kuò)增電泳圖譜

        圖4 武漢養(yǎng)殖場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA擴(kuò)增電泳圖譜

        2.2.2 肉鴨各腸段的酵母菌株26S rDNA序列測(cè)序結(jié)果分析

        將測(cè)序所得基因序列利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Blast軟件進(jìn)行基因序列同源性分析,結(jié)果見(jiàn)表2~表5。

        表2顯示,從宜昌肉鴨場(chǎng)6只肉鴨消化道分離的10株酵母菌中,Candida albicans6株、Cryptococcus arboriformis1株、Kazachstania bovina2株、Candida parapsilosis1株。

        表3顯示,從農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)的6只肉鴨消化道分離的6株酵母菌中,Candida albicans2株、Candida parapsilo?sis2株、Lodderomyces elongisporus1株、Kodamaea ohmeri1株。

        表4顯示,從散養(yǎng)農(nóng)戶的6只肉鴨消化道分離的12株酵母菌中,Candida albicans1株、Cryptococcus arboriformis1株、Kazachstania bovina2株、Candida parapsilosis4株、Saccharomyces cerevisiae4株。

        表5顯示,從武漢肉鴨場(chǎng)6只肉鴨消化道分離的7株酵母菌中,Candida glabrata2株、Candida albicans1株、Saccharomyces cerevisiae3株,Lodderomyces elongispo?rus1株。

        表2 宜昌肉鴨場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA測(cè)序結(jié)果分析

        表3 農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA測(cè)序結(jié)果分析

        表4 散養(yǎng)農(nóng)戶肉鴨消化道酵母菌26S rDNA測(cè)序結(jié)果分析

        表5 武漢肉鴨場(chǎng)肉鴨消化道酵母菌26S rDNA測(cè)序結(jié)果分析

        綜合表2~表5可知,分離出的35株酵母菌長(zhǎng)度在500~650 bp之間,與模式菌株的基因序列同源性都在99%或100%。其中Candida albicans10株、Crypto?coccus arboriformis2株、Kazachstania bovina4株、Candida parapsilosis7株、Lodderomyces elongisporus2株、Kodamaea ohmeri 1株、Candida glabrata2株、Sac?charomyces cerevisiae7株。

        由于目前的飼用酵母菌株中,只有釀酒酵母屬(Saccharomyces cerevisiae)是可以安全使用的,所以將分離的7株釀酒酵母編號(hào)為Y-1、Y-2、Y-3、Y-4、Y-5、Y-6、Y-7進(jìn)行進(jìn)一步的鑒定。

        2.2.3 釀酒酵母菌株菌落形態(tài)及生理生化鑒定結(jié)果(見(jiàn)表6、表7)

        由表6可知,Y-1、Y-2、Y-3、Y-4、Y-5、Y-6、Y-7菌株菌落都為乳白色,菌株大多為圓形或卵圓形,其無(wú)性繁殖方式為出芽生殖;Y-2、Y-4、Y-6、Y-7菌株均有假菌絲,都不產(chǎn)生擲孢子;子囊內(nèi)有1~2個(gè)光滑的圓形或卵圓形子囊孢子。

        表6 7株釀酒酵母的形態(tài)學(xué)特征

        表7 7株釀酒酵母的生理生化試驗(yàn)結(jié)果

        從表7可知,7株菌都能發(fā)酵D-葡萄糖、麥芽糖和蔗糖,都不能發(fā)酵乳糖。只有Y-4不能發(fā)酵半乳糖,其他菌株都能發(fā)酵,而Y-2和Y-6不能發(fā)酵蜜二糖,其他菌株都能發(fā)酵。碳源同化實(shí)驗(yàn)中都不能同化纖維二糖、水楊苷、D-阿拉伯糖、木糖醇、檸檬酸鹽和甲醇,Y-4不能同化乙醇,能同化蔗糖,其他菌株相反;只有Y-3菌株能同化D-半乳糖,其他菌株不能,麥芽糖、DL-乳酸、棉子糖都是有些菌株可以同化,有些不能同化。氮源同化試驗(yàn)中,7株菌都不能同化硝酸鉀、L-賴(lài)氨酸、尸胺。無(wú)維生素試驗(yàn)生長(zhǎng)試驗(yàn)中,無(wú)煙酸試驗(yàn)都顯陽(yáng)性,無(wú)吡哆醇試驗(yàn)中Y-2、Y-3、Y-6顯陽(yáng)性,其他幾株菌顯陰性;無(wú)硫胺素試驗(yàn)則是Y-2、Y-4、Y-5顯陽(yáng)性,其他顯陰性。另外,在0.01%放線菌酮試驗(yàn)、類(lèi)淀粉化合物形成試驗(yàn)、尿素分解試驗(yàn)和50%D-葡萄糖生長(zhǎng)試驗(yàn)中,7株菌都顯陰性。

        根據(jù)《Yeasts Characteristies and Identification》[8]中所提供的檢索方法來(lái)進(jìn)行生理生化鑒定,其形態(tài)學(xué)、生理生化特性符合釀酒酵母屬特性。

        3 討論

        酵母益生菌是重要的飼用益生菌之一,其耐受腸道pH值變化,能調(diào)節(jié)腸道環(huán)境微生態(tài)平衡,提高動(dòng)物機(jī)體免疫能力。一般認(rèn)為,理想的益生菌菌株最佳來(lái)源為原籍動(dòng)物腸道。國(guó)內(nèi)關(guān)于腸道酵母益生菌的分離、鑒定的研究較少。魏亞松等[9]從水貂腸道分離出了2株酵母菌;胡秀彩等[10]和呂愛(ài)軍等[11]都從斑馬魚(yú)腸道中分離出酵母菌;張可毅等[12]將雞腸道分離的一株假絲酵母經(jīng)批量培養(yǎng)后飼喂肉雞,對(duì)肉雞生長(zhǎng)具有促進(jìn)作用;田輝艷等[5]、周平[3]等分離了豬腸道酵母菌。而對(duì)肉鴨腸道酵母益生菌的分離、鑒定研究未見(jiàn)報(bào)道。本研究從4個(gè)不同地域采集健康成年肉鴨消化道6個(gè)腸段(胃、十二指腸、空腸、回腸、盲腸、結(jié)腸)內(nèi)容物分離酵母菌,共分離出了35株酵母菌。

        經(jīng)常能從宿主體內(nèi)分離到的菌株,而且數(shù)目較多,被稱(chēng)為常住菌,又叫原籍菌群。反之,不能經(jīng)常從機(jī)體分離出來(lái)的菌株為過(guò)路菌。本研究從4個(gè)不同地域肉鴨消化道采集的樣品,胃中雖都分離出了酵母菌,但是數(shù)量很少,其他消化道如十二指腸只有從散養(yǎng)農(nóng)戶肉鴨消化道采集的樣品分離出了酵母菌,回腸從宜昌肉鴨場(chǎng)、農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)、散養(yǎng)農(nóng)戶肉鴨消化道采集的樣品都分離出酵母菌,但從武漢肉鴨場(chǎng)采集的樣品未分離出酵母菌,結(jié)腸只有從宜昌肉鴨場(chǎng)肉鴨消化道采集的樣品才分離出酵母菌,其他幾個(gè)地域采集的樣品都未分離出酵母菌,且數(shù)量都很少,證明酵母菌能耐受肉鴨消化道環(huán)境,但是在消化道中為過(guò)路菌。

        Kurztman等[13-14]測(cè)定了所有已知酵母種類(lèi)的26S rDNA的D1/D2區(qū)域序列,發(fā)現(xiàn)這段區(qū)域序列變異性較高,且同一菌種在這個(gè)區(qū)域替代率一般不大于1%,而不同種的菌株差異更大,由此可以將絕大部分種區(qū)分開(kāi)。趙麗麗等[15]從葡萄、蘋(píng)果等樣品中分離出的18株酵母進(jìn)行26S rDNA D1/D2區(qū)域堿基序列分析,與基因庫(kù)中的基因序列進(jìn)行比對(duì),同源性99%或100%,說(shuō)明此方法可以實(shí)現(xiàn)酵母菌種級(jí)水平鑒定。楊艷艷等[16]從工業(yè)污水處理池中分離耐堿酵母菌,通過(guò)26S rDNA 5’端D1/D2區(qū)基因序列分析,同源性為99.8%。

        本試驗(yàn)對(duì)分離的酵母菌進(jìn)行26Sr DNA的D1/D2區(qū)段基因序列測(cè)定,與Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)基因序列進(jìn)行比對(duì),同源性均在99%或100%。分離出的35株酵母菌分別為Candida albicans10株、Cryptococcus arbori?formis2株、Kazachstania bovina4株、Candida parapsi?losis7株、Lodderomyces elongisporus2株、Kodamaea ohmeri1株、Candida glabrata2株、Saccharomyces cerevisiae7株。對(duì)7株釀酒酵母進(jìn)行形態(tài)學(xué)和生理生化試驗(yàn),進(jìn)一步驗(yàn)證26S rDNA的分析結(jié)果。根據(jù)農(nóng)業(yè)部《飼料添加劑品種目錄(2013)》征求意見(jiàn)稿中所列釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是屬于允許添加的飼用微生物。

        4 結(jié)論

        從4個(gè)不同地域的肉鴨消化道的6個(gè)部位共分離出35株酵母菌,其中有7株為釀酒酵母菌,這些菌株可作為肉鴨專(zhuān)用飼用酵母益生菌的備選菌株。

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