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        PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質(zhì)粒的構(gòu)建

        2014-12-31 00:00:00胡樂林
        醫(yī)學(xué)信息 2014年16期

        摘要:目的 構(gòu)建含PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質(zhì)粒。方法 ①通過生物信息學(xué)方法,查詢PRDX5基因啟動子核酸序列;②使用PCR擴增人PRDX5基因啟動子片段,將啟動子插入到pGL3-Basic載體中,構(gòu)建含PRDX5基因啟動子片段的熒光素酶報告質(zhì)粒;③雙酶切及測序確定PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質(zhì)粒擴增正確。結(jié)果 PCR擴增的PRDX5啟動子片段插入到載體中,經(jīng)測序證實正確。結(jié)論 成功構(gòu)建含PRDX5啟動子的熒光素酶報告質(zhì)粒。

        關(guān)鍵詞:PRDX5;啟動子;熒光素酶報告基因

        Construction of Luciferase Reporter Plasmid PRDX5 Gene Promoter

        HU Le-lin

        (School of Medicine,The Anhui University of Science and Technology,Huainan 232001,Anhui,China)

        Abstract:ObjectiveTo construct a pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid and to vertifying its luciferase activity. Methods①search the nucleic acid sequence of the promoter PRDX5 by bioinformatics analysis.②Methods of PCR was performed to amplify the promoter PRDX5. the promoter PRDX5 was inserted into pGL3-Basic cloning vector to construct luciferase reporter plasmid with the promoter PRDX5.③pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was verified by double-enzyme cleavage and sequencing method.ResultspGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was identified to be correct by double-enzyme cleavage and sequencing method.Conclusion A pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was successfully constructed.

        Key words:PRDX5;Promoter;Luciferase reporter plasmid;Reactive oxygen species

        PRDX5是Peroxiredoxins(PRDXs)過氧化物酶家族蛋白的一種,研究顯示在它廣泛表達(dá)于哺乳動物的各種細(xì)胞,定位于細(xì)胞質(zhì)、過氧化物酶體和線粒體中,但在許多細(xì)胞中PRDX5主要定位于線粒體,它與組織過氧化物、過氧化亞硝基陰離子有高的親和力[1]。Masaki shiota[2]等人發(fā)現(xiàn)在外源過氧化氫處理或組織缺氧情況下人類前列腺癌PC3細(xì)胞PRDX5表達(dá)增高。研究還顯示人類定位于線粒體的PRDX5能保護線粒體DNA免受過氧化氫的損傷。并且PRDX5能夠抑制p53誘導(dǎo)的活性氧簇的產(chǎn)生和細(xì)胞凋亡[3]。

        1材料與方法

        1.1實驗材料

        1.1.1 菌種、質(zhì)粒和細(xì)胞系大腸桿菌tans-5α購自Trans-Gene(全式金)公司;載體質(zhì)粒pGL3-Basic,由本室保存。

        1.1.2 DNA 重組所用工具酶及試劑BglII、MluI 等限制性內(nèi)切酶,Taq DNA Polymerase,T4 DNA Ligase購自New England Lab和Promega 公司。大提質(zhì)粒試劑盒購自威格拉斯儀器有限公司。其它常規(guī)試劑均為進口分裝或國產(chǎn)分析純。

        1.2方法

        1.2.1用PCR和酶切的方法得到目的片段利用DNA提取試劑盒在U2OS細(xì)胞中提取全基因組細(xì)胞作為模板,根據(jù)已知PRDX5cDNA序列,由生物信息學(xué)方法自UCSC數(shù)據(jù)庫分析其可能的轉(zhuǎn)錄起始位點,選擇TSS上游約1200bp下游約200bp范圍作為其可能的啟動子序列進行引物設(shè)計。預(yù)計擴增片段長度為1400bp。我們使用軟件DNAMAN分析其上可能存在的限制性內(nèi)切酶位點,結(jié)合載體質(zhì)粒pGL3-Basic上的限制性內(nèi)切酶位點,選擇分別在上、下游引物末端,添加BglII、MluI限制性內(nèi)切酶位點序列。見表1。

        1.2.2目的片段與相應(yīng)載體的連接將擴增好的目的片段和PGL3-basic-Luc進行同樣的雙酶切鑒定,回收酶切產(chǎn)物,并進行質(zhì)粒連接反應(yīng)。在10μl的反應(yīng)體系中加入載體、插入片段、T4DNA ligase、T4DNA ligase buffer。載體與插入片段的摩爾數(shù)之比控制在1:3,且二者的總量控制在300ng~500ng之間,置于4℃冰箱連接16h。目的片段和PGL3-basic-Luc通過BglII、MluI酶切位點連接重組質(zhì)粒PGL3-PRDX5-promoter-Luc。

        1.2.3篩選陽性質(zhì)粒并測序?qū)⑦B接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coli DH5ɑ感受態(tài)細(xì)胞,提取質(zhì)粒酶切鑒定,酶切正確的質(zhì)粒送至公司測序確定。

        2結(jié)果

        2.1生物信息學(xué)方法預(yù)測PRDX5啟動子序列根據(jù)已知的PRDX5 cDNA序列,在UCSC Genome Bioinformatics(http://genome.ucsc.edu/)數(shù)據(jù)庫中,預(yù)測其可能的轉(zhuǎn)錄起始位點。根據(jù)預(yù)測的轉(zhuǎn)錄起始位點,將其上游約1200bp下游約200bp范圍作為可能的啟動子序列。

        2.2 PCR方法擴增預(yù)測序列根據(jù)預(yù)測啟動子的序列設(shè)計引物,利用DNA提取試劑盒在U2OS細(xì)胞中提取全基因組細(xì)胞作為模板,用PCR試劑盒擴增出約1.4kb的目的條帶。見圖1。

        圖1PCR擴增PRDX5promoter結(jié)果

        2.3構(gòu)建pGL3-PRDX5-promoter-Luc熒光素酶報告基因質(zhì)粒將擴增好的目的片段和PGL3-basic-Luc進行同樣的雙酶切鑒定,回收酶切產(chǎn)物,并進行質(zhì)粒連接反應(yīng)。再將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌中,接種在帶氨芐西林的LB固體培養(yǎng)基中,37℃孵育過夜后。挑出陽性克隆,提取質(zhì)粒并進行酶切鑒定。圖2為0.8%的瓊脂糖凝膠結(jié)果,可看出在相應(yīng)的大小條帶上出現(xiàn)陽性結(jié)果。

        圖2PRDX5啟動子片段連接入熒光素酶報告質(zhì)粒pGL3-Basic酶切鑒定。挑選的克隆擴增后所提質(zhì)粒進行KpnI、NheI限制性內(nèi)切酶雙酶切。

        2.4篩選陽性質(zhì)粒并測序?qū)⑦B接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coli DH5ɑ感受態(tài)細(xì)胞,提取質(zhì)粒酶切鑒定,酶切正確的質(zhì)粒送至公司測序確定。

        3討論

        PRDX5是Peroxiredoxins過氧化物酶家族蛋白的一種,但在許多細(xì)胞中PRDX5主要定位于線粒體。在氧化應(yīng)激情況下PRDXs家族蛋白能將H2O2轉(zhuǎn)化為水,清除ROS,抵抗ROS對細(xì)胞的損害[4]。Yuan Zhou等在哺乳動物細(xì)胞中首次證實PRDX5能發(fā)揮抗氧化劑功能,抑制p53誘導(dǎo)產(chǎn)生的細(xì)胞內(nèi)ROS。PRDX5的晶體結(jié)構(gòu)研究顯示,與PRDXs家族的其它成員相比,PRDX5具有更強的清除ROS的能力。大量研究顯示活性氧簇水平與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),因此可以推測PRDX5可能與腫瘤的發(fā)生相關(guān)。如果PRDX5與腫瘤的發(fā)生相關(guān),那么研究PRDX5的轉(zhuǎn)錄激活將是很有意義的。在本研究中,我們克隆出PRDX5的啟動子熒光素酶報告質(zhì)粒,并檢測了其活性。

        參考文獻:

        [1]Banmeyer I, Marchand C, Verhaeghe C, et al. Overexpression of human peroxiredoxin 5 in subcellular compartments of Chinese hamster ovary cells: effects on cytotoxicity and DNA damage caused by peroxides[J]. Free Radic Biol Med,2004,36(1):65-77.

        [2]Shiota M, Izumi H, Miyamoto N, et al. Ets regulates peroxiredoxin1 and 5 expressions through their interaction with the high-mobility group protein B1[J]. Cancer Sci,2008,99(10):1950-1959.

        [3]Zhou Y, Kok K H, Chun A C, et al. Mouse peroxiredoxin V is a thioredoxin peroxidase that inhibits p53-induced apoptosis[J]. Biochem Biophys Res Commun. 2000, 268(3): 921-927.

        [4] Dubuisson M, Vander S D, Clippe A, et al. Human peroxiredoxin 5 is a peroxynitrite reductase[J]. FEBS Lett. 2004, 571(1-3): 161-165.

        編輯/哈濤

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