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        基于Map Reduce的并行小波聚類

        2014-12-26 06:22:22歐炳華
        科技視界 2014年30期
        關(guān)鍵詞:鍵值海量小波

        歐炳華

        (桂林電子科技大學(xué)數(shù)學(xué)與計(jì)算科學(xué)學(xué)院,廣西 桂林541004)

        0 前言

        互聯(lián)網(wǎng)的快速發(fā)展帶來了大量數(shù)據(jù),依靠單機(jī)技術(shù)已經(jīng)很難處理如此海量的數(shù)據(jù),并行技術(shù)是處理海量數(shù)據(jù)的重要方法。鑒于小波在時(shí)頻域上的局部化分析能力,以及小波聚類算法在數(shù)據(jù)處理中的良好表現(xiàn),研究多機(jī)并行環(huán)境下的小波聚類算法具有重要意義。

        1 MapReduce編程模型

        MapReduce是海量數(shù)據(jù)分布式并行運(yùn)算的編程模型[1]。該模型把海量數(shù)據(jù)運(yùn)算問題分成多個(gè)數(shù)據(jù)塊并行運(yùn)算問題[2],而在并行運(yùn)算中的任務(wù)啟動(dòng)、任務(wù)調(diào)度、網(wǎng)絡(luò)通信等復(fù)雜問題,都由MapReduce編程模型解決,使用者只需編寫map和reduce函數(shù)代碼就可以運(yùn)算海量數(shù)據(jù)。圖1是MapReduce編程模型,輸入數(shù)據(jù)集被劃分成多個(gè)分片(split),每個(gè)分片(split)被分配到指定的Map任務(wù)節(jié)點(diǎn),Map任務(wù)節(jié)點(diǎn)讀取指定分片(split)內(nèi)容并解析成鍵值對(duì)<k1,v1>,map函數(shù)代碼處理每一條鍵值對(duì)<k1,v1>,獲得另一組鍵值對(duì)[3]<k2,v2>,按照k2排序后把鍵值對(duì)復(fù)制到Reduce任務(wù)節(jié)點(diǎn)。Reduce任務(wù)節(jié)點(diǎn)合并所有從Map任務(wù)節(jié)點(diǎn)復(fù)制過來的數(shù)據(jù),得到<k2,list<v2>>,然后執(zhí)行reduce函數(shù)代碼,把運(yùn)算結(jié)果存儲(chǔ)到分布式文件系統(tǒng)(HDFS)[3]。

        圖1 MapReduce編程模型

        2 小波聚類算法

        小波變換是在克服傅里葉變換和窗口傅里葉變換缺陷的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種新的變換[4]。在不違背測(cè)不準(zhǔn)原理的情況下,因提供了一種靈活可變的時(shí)頻窗而被廣泛應(yīng)用于非平穩(wěn)信號(hào)處理中[5]。聚類是數(shù)據(jù)挖掘的重要技術(shù)[6],依據(jù)數(shù)據(jù)本身屬性劃分?jǐn)?shù)據(jù)集。常用的聚類算法有K-means算法、BIRCH算法、DBSCAN算法和小波聚類算法等。

        小波聚類是基于小波變換的聚類算法[7-8],該算法有許多優(yōu)點(diǎn),例如能夠處理離群值、發(fā)現(xiàn)任意形狀的簇等。在小波聚類算法中,數(shù)據(jù)等同于信號(hào),通過應(yīng)用小波變換,數(shù)據(jù)被分解為不同頻率的子波段,根據(jù)波段頻率的不同,數(shù)據(jù)點(diǎn)被劃分為高頻部分的數(shù)據(jù)點(diǎn)和低頻部分的數(shù)據(jù)點(diǎn),其中高頻部分的數(shù)據(jù)點(diǎn)是聚類邊界,低頻部分的數(shù)據(jù)點(diǎn)是聚類本身。

        小波聚類算法分為三個(gè)階段。第一階段是量化特征空間,該階段又分為構(gòu)造網(wǎng)格單元、確定數(shù)據(jù)對(duì)象落入的網(wǎng)格單元和匯總每個(gè)網(wǎng)格單元中數(shù)據(jù)對(duì)象形成特征空間。第二階段是在特征空間上應(yīng)用小波變換,獲得新特征空間,在新特征空間上檢測(cè)連通單元(簇),并給連通單元(簇)分配類標(biāo)簽。第三階段是構(gòu)造新特征空間單元與舊特征空間單元之間的映射關(guān)系,并把每個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象標(biāo)明類標(biāo)簽。圖2是小波聚類流程圖。

        圖2 小波聚類流程圖

        3 并行小波聚類算法

        小波聚類算法處理海量數(shù)據(jù)需要耗費(fèi)大量的運(yùn)行時(shí)間。因此,本文在此基礎(chǔ)上,結(jié)合MapReduce編程模型,提出了基于MapReduce的并行小波聚類算法,達(dá)到快速聚類目的。并行小波聚類算法在涉及到海量數(shù)據(jù)的階段使用了4個(gè)MapReduce編程模型。第一階段量化特征空間使用了3個(gè)MapReduce編程模型,由于第二階段不涉及到海量數(shù)據(jù),所以不使用MapReduce編程模型,第三階段使用一個(gè)MapReduce編程模型。圖3是并行小波聚類算法流程。

        圖3 并行小波聚類算法流程

        第一個(gè)MapReduce輸入一個(gè)d維特征空間含有N個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象O={o1,o2,…,oN}的數(shù)據(jù)集,其中oi=<o(jì)i1,oi2,…,oid>,1≤i≤N。Map函數(shù)獲取每個(gè)分片數(shù)據(jù)集每個(gè)維的最大值pt=<pt1,pt2,…,ptd>和最小值qt=<qt1,qt2,…,qtd>,1≤t≤T,T是Mapper任務(wù)節(jié)點(diǎn)數(shù),ptj是第t個(gè)分片數(shù)據(jù)集第j維的最大值,qtj是第t個(gè)分片數(shù)據(jù)集第j維的最小值,1≤j≤d。reduce在map函數(shù)返回的結(jié)果中獲取最大值max=<max1,max2,…,maxd>和最小值min=<min1,min2,…,mind>,maxj是ptj的最大值,minj是qtj的最小值,1≤t≤T,1≤j≤d。返回max和min。完成這個(gè)MapReduce后,計(jì)算網(wǎng)格單元間隔距離d,本文假設(shè)所有維都是劃分m個(gè)間隔。

        第二個(gè)MapReduce和第一個(gè)MapReduce輸入相同。map函數(shù)確定數(shù)據(jù)對(duì)象oi=<o(jì)i1,oi2,…,oid>落入的網(wǎng)格單元ci=<ci1,ci2,…,cid>,其中,floor()表示取上整,1≤cij≤m,1≤i≤N,1≤j≤d。Reduce不執(zhí)行任何操作,最后輸出鍵值對(duì)<o(jì)i,ci>。

        第三個(gè)MapReduce輸入鍵值對(duì)<o(jì)i,ci>,1≤i≤N。map函數(shù)將<o(jì)i,ci>變?yōu)殒I值對(duì)<ci,1>。使用combiner排序。reduce函數(shù)將相同的鍵ck=<ck1,ck2,…,ckd>對(duì)應(yīng)的值相加,得到落入單元ck數(shù)據(jù)對(duì)象的數(shù)量sum_k,1≤ckj≤m,1≤k≤md,md是特征空間單元數(shù)目。輸出鍵值對(duì)<ck,sum_k>。完成MapReduce后,對(duì)特征空間實(shí)施l次小波變換,獲得新特征空間單元ch=<ch1,ch2,…,chd>,1≤ckj≤,檢測(cè)連通單元和標(biāo)類,得到?ω,?ch,ch∈ω?lch=ωn,其中ω是簇,ωn是簇序號(hào),lch是單元ch的標(biāo)類。

        第四個(gè)MapReduce輸入鍵值對(duì)<o(jì)i,ci>,1≤i≤N。map函數(shù)獲取單元根據(jù)數(shù)據(jù)對(duì)象oi映射到cf,cf映射到ch,ch映射到ωn,得到oi映射到ωn,ωn是簇序號(hào),map函數(shù)輸出鍵值對(duì)<o(jì)i,ωn>。Reduce不執(zhí)行任何操作。

        4 實(shí)驗(yàn)分析

        實(shí)驗(yàn)使用5臺(tái)配置相同的電腦,CPU型號(hào)是G1620,內(nèi)存容量是2GB,操作系統(tǒng)是ubuntu 14.04LTS,采用hadoop-1.2.1版本,jdk版本是jdk-8u11-linux-x64。使用加速比評(píng)價(jià)并行小波聚類性能,計(jì)算公式是是串行算法(單節(jié)點(diǎn))消耗的時(shí)間,Tp是并行p個(gè)節(jié)點(diǎn)消耗的時(shí)間,理想的加速比是線性加速比[9]。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來源于合成的2.75GB數(shù)據(jù),分別計(jì)算任務(wù)節(jié)點(diǎn)是1、2、3、4的加速比。圖4是實(shí)驗(yàn)結(jié)果。結(jié)果表明:在相同規(guī)模數(shù)據(jù)情況下,增加節(jié)點(diǎn)數(shù)可以提高加速比,從而顯著地減少程序運(yùn)行時(shí)間;根據(jù)實(shí)驗(yàn)得到的加速比,可以確定實(shí)際加速比在較好的狀態(tài),并沒有達(dá)到理想狀態(tài),原因在于MapReduce框架存在通信、任務(wù)啟動(dòng)、任務(wù)調(diào)度、故障處理等時(shí)間開銷,任務(wù)節(jié)點(diǎn)數(shù)越多,實(shí)際加速比與理想加速比差距越大。

        圖4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        5 結(jié)束語

        本文應(yīng)用MapReduce并行運(yùn)算模型,結(jié)合小波聚類算法特點(diǎn),設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了基于MapReduce的并行小波聚類算法,通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證并行小波聚類算法性能,結(jié)果表明:并行小波聚類算法具有較好的加速比。

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        [2]董西成.Hadoop技術(shù)內(nèi)幕:深入解析MapReduce架構(gòu)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)原理[M].北京:機(jī)械工業(yè)出版社,2013.

        [3][美]懷特.Hadoop權(quán)威指南[M].2版.周敏奇,王曉玲,金澈清,等,譯.北京:清華大學(xué)出版社,2011.

        [4]蔣英春.小波分析基本原理[M].天津:天津大學(xué)出版社,2012.

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        [8]Sheikholeslami,G.,Chattrjee,S.and A.Zhang.Wavecluster:a wavelet-based clustering approach for spatial data in very large databases[J].The VLDB Journal,2000,8(3-4):289-304.

        [9]張雪萍,龔康莉,趙廣才.基于MapReduce的K-Medoids并行算法[J].計(jì)算機(jī)應(yīng)用,2013,33(4):1023-1025.

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